Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397JEH4

Protein Details
Accession A0A397JEH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-113VQRLTPEEREQRRQRYRQRQLERQVQRENHydrophilic
310-334VEKYCNTRWRNKWMRELENNRQRQGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MVIAKRRNDCVDEAIKQKNEALSEIVERELSREEKDPNYEVTYTLKDLNRVKDHLDLIKHHVWIRDNILVDNGRTVFNIPTRRTVQRLTPEEREQRRQRYRQRQLERQVQRENQNPVTVRLPASNSATTSPSATVGTPPRHRRRSNETPQSFSQAVSPRRSPEQGTPRVVTPPNNWDQLQNLRTFYQPLQPLDFNLINQQLAEAHLTASDSSDSSDTDTEDEMANAVLDYLEDNLHNHTSLRVDPFYGDGTQDPLQWMLHFEKVARSNAWDEAKKIRKYATYLEDDAEEWHDEINANDMADWAAWRAGFVEKYCNTRWRNKWMRELENNRQRQGETVDAYYARFRRLVKRVEINVNQHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.49
3 0.47
4 0.47
5 0.42
6 0.36
7 0.32
8 0.28
9 0.22
10 0.24
11 0.24
12 0.22
13 0.2
14 0.18
15 0.18
16 0.21
17 0.2
18 0.2
19 0.23
20 0.27
21 0.3
22 0.35
23 0.36
24 0.35
25 0.37
26 0.34
27 0.31
28 0.31
29 0.29
30 0.26
31 0.3
32 0.28
33 0.31
34 0.36
35 0.43
36 0.44
37 0.43
38 0.44
39 0.43
40 0.45
41 0.44
42 0.43
43 0.38
44 0.4
45 0.42
46 0.42
47 0.39
48 0.4
49 0.37
50 0.36
51 0.38
52 0.35
53 0.31
54 0.29
55 0.3
56 0.28
57 0.25
58 0.25
59 0.21
60 0.17
61 0.16
62 0.17
63 0.16
64 0.2
65 0.28
66 0.26
67 0.32
68 0.37
69 0.4
70 0.42
71 0.43
72 0.44
73 0.46
74 0.52
75 0.51
76 0.53
77 0.58
78 0.64
79 0.67
80 0.7
81 0.68
82 0.72
83 0.75
84 0.79
85 0.81
86 0.83
87 0.87
88 0.88
89 0.89
90 0.88
91 0.87
92 0.88
93 0.85
94 0.82
95 0.79
96 0.75
97 0.72
98 0.69
99 0.66
100 0.58
101 0.54
102 0.48
103 0.42
104 0.38
105 0.33
106 0.27
107 0.22
108 0.22
109 0.2
110 0.22
111 0.2
112 0.19
113 0.19
114 0.19
115 0.17
116 0.17
117 0.14
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.13
122 0.17
123 0.23
124 0.3
125 0.39
126 0.48
127 0.56
128 0.59
129 0.62
130 0.66
131 0.71
132 0.74
133 0.75
134 0.69
135 0.66
136 0.64
137 0.62
138 0.53
139 0.42
140 0.36
141 0.33
142 0.34
143 0.32
144 0.33
145 0.3
146 0.32
147 0.33
148 0.3
149 0.32
150 0.37
151 0.4
152 0.42
153 0.41
154 0.39
155 0.41
156 0.4
157 0.35
158 0.28
159 0.27
160 0.27
161 0.28
162 0.28
163 0.24
164 0.25
165 0.29
166 0.29
167 0.24
168 0.22
169 0.2
170 0.2
171 0.22
172 0.2
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.22
177 0.21
178 0.21
179 0.23
180 0.23
181 0.17
182 0.16
183 0.16
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.12
228 0.15
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.1
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.15
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.19
250 0.23
251 0.26
252 0.23
253 0.24
254 0.24
255 0.29
256 0.35
257 0.3
258 0.29
259 0.36
260 0.44
261 0.44
262 0.44
263 0.42
264 0.4
265 0.42
266 0.47
267 0.45
268 0.42
269 0.42
270 0.4
271 0.37
272 0.34
273 0.31
274 0.26
275 0.19
276 0.13
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.11
295 0.13
296 0.14
297 0.22
298 0.23
299 0.29
300 0.34
301 0.41
302 0.43
303 0.51
304 0.57
305 0.6
306 0.68
307 0.7
308 0.76
309 0.77
310 0.82
311 0.82
312 0.85
313 0.85
314 0.84
315 0.83
316 0.76
317 0.69
318 0.6
319 0.53
320 0.49
321 0.45
322 0.38
323 0.33
324 0.34
325 0.32
326 0.33
327 0.36
328 0.32
329 0.28
330 0.28
331 0.3
332 0.36
333 0.44
334 0.51
335 0.53
336 0.61
337 0.66
338 0.72
339 0.77