Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HTF4

Protein Details
Accession A0A397HTF4    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MIKSKRGRKPKVKPSETNTENNHydrophilic
32-51TKATTITRRGRKPINPIENNHydrophilic
59-83EATTSTTSRRGPKRKNETNDTNTANHydrophilic
1020-1070VENGGSSKASRRKKRKARAKRSRERRTARFRQVCNKDTKKRIERAMTQRMYHydrophilic
1164-1184DHLKAIASKRQAKRRPIDGSCHydrophilic
1209-1229HQDCFARWKRSKSVYQKVTCVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-13SKRGRKPKVK
858-862RRKKA
904-912GKRKAAKNK
1015-1049GKGKAVENGGSSKASRRKKRKARAKRSRERRTARF
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MIKSKRGRKPKVKPSETNTENNTGNIEPTVITKATTITRRGRKPINPIENNIEVDSQTEATTSTTSRRGPKRKNETNDTNTANSIGANIVDATNTQPTITLRRGRSKGKINVTNEASTNINSETNNVGTSNSNGTNVDTTNTQPTITLRKGRSKGKINVTNEAPTKINSETNNASTTNSNGANIVDTTNTQPTITLRKGRSKGKINVTNEAPTNINSETNNAGTANSNGANIVDTTNTQPTITLRGGRSKGKINVTNEASTNINSETNNVGTSNSNGTNVDTTNTQPTITLRRGRSKGKINVTNEAPANINSETNNAGTANSNGDTTNTQPTITLRRGRSKGKINATNEAPANINSETNNAGTANSNGTNVDTTNTQPTITLRRGRSKGKINATNEAPTNINSETDNVGTSNSNGTNVNTQPTITLRRGRSKGKINVTNEASTNINSETNNVGTSNSNGTNVDTTNTQPTITLRRGRSKGKINVTNEAPTNINSETNNVGTSNSNGTNVDTTNTQLTITLRGGRSKGKINVTNEASTNINSETNNVGTSNSNGTNVNTQPTITLRRGRSKGKINVTNEAPTNINSETNNVGTSNSNGTNVDTTNTQPTITLRGGRSKGKINVTNEASTNINSETNNVGTSNSNGTNVDTTNTQPTITLRRGRSKGKINVTNEAPTNINSETNNVGTSNSNGTNVDTTNTQLTITLRGGRSKGKINVTNEASTNINSETNNVGTSNSNGTNVDTTNTQPTITLRRGRSKGKINVTNEAPTNINSETNNAVTSNSNGTNVNTTNTQPTITLRRGRSKGKINVTSEAPSNINSEATSNEITENLSTGHSVKRKVEDIPSDSDSEKKAQTSRRKKAKGITNIIAGGSSTERNTVENGEGSSTALGKRKAAESEDGSEGKRKAAKNKDGLPATNGKGKETVNEEGSSTAKRKGKEAAVNEEGSSTAKSAASGKGKETVNEGGSSTAKGREKEAAVNEEGSSTAKGKGKAVEDEGASTALGSEEGSSTTKGKGKAVENGGSSKASRRKKRKARAKRSRERRTARFRQVCNKDTKKRIERAMTQRMYLIDRKEVNPTQREYSVLGPTGSVYTAVISKTVSCSCPDYQKGFHCKHILFVFLKVLKVDMNSNLIYQKALVTKELRLIFDKSPTIFLPSKRFVDHLKAIASKRQAKRRPIDGSCPICYEPLNNNERLVWCQSGCGNNLHQDCFARWKRSKSVYQKVTCVYCRTEWKDVYVEHRLYTSRLFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.88
3 0.83
4 0.8
5 0.74
6 0.69
7 0.6
8 0.51
9 0.47
10 0.36
11 0.32
12 0.24
13 0.2
14 0.14
15 0.15
16 0.18
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.17
21 0.23
22 0.28
23 0.33
24 0.39
25 0.48
26 0.55
27 0.63
28 0.69
29 0.7
30 0.75
31 0.79
32 0.8
33 0.77
34 0.75
35 0.74
36 0.7
37 0.65
38 0.56
39 0.46
40 0.35
41 0.29
42 0.26
43 0.19
44 0.14
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.13
50 0.15
51 0.2
52 0.25
53 0.35
54 0.45
55 0.54
56 0.63
57 0.72
58 0.79
59 0.84
60 0.88
61 0.89
62 0.89
63 0.86
64 0.84
65 0.78
66 0.69
67 0.6
68 0.51
69 0.41
70 0.3
71 0.24
72 0.16
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.1
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.13
84 0.15
85 0.21
86 0.28
87 0.34
88 0.37
89 0.47
90 0.54
91 0.59
92 0.66
93 0.7
94 0.72
95 0.74
96 0.76
97 0.71
98 0.74
99 0.71
100 0.65
101 0.56
102 0.49
103 0.4
104 0.32
105 0.29
106 0.22
107 0.2
108 0.16
109 0.18
110 0.18
111 0.18
112 0.18
113 0.16
114 0.16
115 0.15
116 0.17
117 0.2
118 0.18
119 0.19
120 0.18
121 0.2
122 0.21
123 0.2
124 0.19
125 0.16
126 0.17
127 0.21
128 0.21
129 0.19
130 0.18
131 0.21
132 0.27
133 0.31
134 0.38
135 0.37
136 0.47
137 0.54
138 0.61
139 0.67
140 0.69
141 0.72
142 0.75
143 0.78
144 0.73
145 0.74
146 0.69
147 0.67
148 0.6
149 0.54
150 0.44
151 0.36
152 0.35
153 0.29
154 0.3
155 0.24
156 0.28
157 0.3
158 0.31
159 0.32
160 0.3
161 0.29
162 0.25
163 0.26
164 0.25
165 0.21
166 0.19
167 0.17
168 0.16
169 0.16
170 0.16
171 0.14
172 0.1
173 0.11
174 0.14
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.15
179 0.17
180 0.25
181 0.29
182 0.34
183 0.37
184 0.47
185 0.54
186 0.61
187 0.67
188 0.69
189 0.72
190 0.75
191 0.78
192 0.73
193 0.74
194 0.69
195 0.65
196 0.56
197 0.49
198 0.39
199 0.31
200 0.3
201 0.23
202 0.21
203 0.17
204 0.18
205 0.19
206 0.18
207 0.18
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.08
221 0.09
222 0.12
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.15
228 0.2
229 0.21
230 0.23
231 0.23
232 0.3
233 0.35
234 0.38
235 0.41
236 0.43
237 0.48
238 0.51
239 0.56
240 0.52
241 0.57
242 0.57
243 0.56
244 0.49
245 0.45
246 0.38
247 0.32
248 0.29
249 0.22
250 0.2
251 0.16
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.17
260 0.2
261 0.18
262 0.19
263 0.18
264 0.2
265 0.21
266 0.2
267 0.19
268 0.16
269 0.17
270 0.21
271 0.21
272 0.19
273 0.18
274 0.2
275 0.25
276 0.31
277 0.37
278 0.38
279 0.47
280 0.53
281 0.6
282 0.66
283 0.7
284 0.72
285 0.74
286 0.76
287 0.71
288 0.72
289 0.67
290 0.63
291 0.54
292 0.45
293 0.36
294 0.28
295 0.26
296 0.19
297 0.18
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.13
302 0.13
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.11
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.19
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.19
319 0.25
320 0.3
321 0.37
322 0.37
323 0.47
324 0.53
325 0.6
326 0.66
327 0.69
328 0.71
329 0.72
330 0.74
331 0.67
332 0.68
333 0.62
334 0.58
335 0.48
336 0.41
337 0.32
338 0.25
339 0.24
340 0.18
341 0.17
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.12
357 0.1
358 0.11
359 0.1
360 0.12
361 0.17
362 0.18
363 0.17
364 0.18
365 0.2
366 0.25
367 0.31
368 0.37
369 0.38
370 0.47
371 0.53
372 0.6
373 0.66
374 0.69
375 0.71
376 0.72
377 0.74
378 0.67
379 0.68
380 0.63
381 0.57
382 0.48
383 0.41
384 0.32
385 0.25
386 0.24
387 0.18
388 0.16
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.12
393 0.12
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.15
404 0.16
405 0.18
406 0.15
407 0.15
408 0.14
409 0.16
410 0.21
411 0.2
412 0.27
413 0.32
414 0.41
415 0.48
416 0.54
417 0.61
418 0.66
419 0.72
420 0.74
421 0.76
422 0.71
423 0.74
424 0.71
425 0.65
426 0.56
427 0.49
428 0.4
429 0.32
430 0.29
431 0.22
432 0.2
433 0.16
434 0.18
435 0.18
436 0.18
437 0.18
438 0.16
439 0.16
440 0.15
441 0.17
442 0.2
443 0.18
444 0.19
445 0.18
446 0.2
447 0.21
448 0.2
449 0.19
450 0.16
451 0.17
452 0.21
453 0.21
454 0.19
455 0.18
456 0.2
457 0.25
458 0.31
459 0.37
460 0.38
461 0.47
462 0.53
463 0.6
464 0.66
465 0.7
466 0.72
467 0.74
468 0.76
469 0.71
470 0.72
471 0.69
472 0.65
473 0.56
474 0.48
475 0.39
476 0.31
477 0.3
478 0.23
479 0.21
480 0.17
481 0.17
482 0.17
483 0.16
484 0.17
485 0.13
486 0.14
487 0.13
488 0.15
489 0.19
490 0.18
491 0.19
492 0.18
493 0.2
494 0.21
495 0.2
496 0.19
497 0.14
498 0.14
499 0.13
500 0.13
501 0.11
502 0.1
503 0.1
504 0.11
505 0.11
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.18
510 0.22
511 0.25
512 0.3
513 0.36
514 0.4
515 0.47
516 0.49
517 0.57
518 0.57
519 0.56
520 0.49
521 0.45
522 0.38
523 0.32
524 0.29
525 0.22
526 0.2
527 0.16
528 0.18
529 0.18
530 0.18
531 0.18
532 0.16
533 0.16
534 0.15
535 0.17
536 0.2
537 0.18
538 0.19
539 0.18
540 0.19
541 0.22
542 0.21
543 0.21
544 0.16
545 0.15
546 0.14
547 0.16
548 0.21
549 0.2
550 0.27
551 0.32
552 0.41
553 0.48
554 0.54
555 0.61
556 0.66
557 0.72
558 0.74
559 0.76
560 0.71
561 0.72
562 0.69
563 0.65
564 0.56
565 0.48
566 0.39
567 0.31
568 0.3
569 0.23
570 0.21
571 0.17
572 0.17
573 0.17
574 0.16
575 0.17
576 0.13
577 0.14
578 0.13
579 0.15
580 0.19
581 0.18
582 0.19
583 0.18
584 0.2
585 0.21
586 0.2
587 0.19
588 0.16
589 0.17
590 0.21
591 0.21
592 0.19
593 0.18
594 0.19
595 0.23
596 0.23
597 0.26
598 0.23
599 0.31
600 0.35
601 0.38
602 0.41
603 0.43
604 0.48
605 0.51
606 0.56
607 0.52
608 0.57
609 0.57
610 0.56
611 0.49
612 0.45
613 0.38
614 0.32
615 0.29
616 0.22
617 0.2
618 0.16
619 0.18
620 0.18
621 0.18
622 0.18
623 0.16
624 0.16
625 0.15
626 0.17
627 0.2
628 0.18
629 0.19
630 0.18
631 0.2
632 0.21
633 0.2
634 0.19
635 0.16
636 0.17
637 0.21
638 0.21
639 0.19
640 0.18
641 0.2
642 0.25
643 0.31
644 0.37
645 0.38
646 0.47
647 0.53
648 0.6
649 0.66
650 0.7
651 0.72
652 0.74
653 0.76
654 0.71
655 0.72
656 0.69
657 0.65
658 0.56
659 0.48
660 0.39
661 0.31
662 0.3
663 0.23
664 0.21
665 0.17
666 0.17
667 0.17
668 0.16
669 0.17
670 0.13
671 0.14
672 0.13
673 0.15
674 0.19
675 0.18
676 0.19
677 0.18
678 0.2
679 0.21
680 0.2
681 0.19
682 0.14
683 0.14
684 0.13
685 0.13
686 0.11
687 0.1
688 0.1
689 0.11
690 0.11
691 0.15
692 0.15
693 0.16
694 0.18
695 0.22
696 0.25
697 0.3
698 0.36
699 0.4
700 0.47
701 0.49
702 0.57
703 0.57
704 0.56
705 0.49
706 0.45
707 0.38
708 0.32
709 0.29
710 0.22
711 0.2
712 0.16
713 0.18
714 0.18
715 0.18
716 0.18
717 0.16
718 0.16
719 0.15
720 0.17
721 0.2
722 0.18
723 0.19
724 0.18
725 0.2
726 0.21
727 0.2
728 0.19
729 0.16
730 0.17
731 0.21
732 0.21
733 0.19
734 0.18
735 0.2
736 0.25
737 0.31
738 0.37
739 0.38
740 0.47
741 0.53
742 0.6
743 0.66
744 0.7
745 0.72
746 0.74
747 0.76
748 0.71
749 0.72
750 0.69
751 0.65
752 0.56
753 0.48
754 0.39
755 0.31
756 0.3
757 0.23
758 0.21
759 0.17
760 0.18
761 0.17
762 0.16
763 0.16
764 0.12
765 0.12
766 0.11
767 0.12
768 0.13
769 0.12
770 0.13
771 0.13
772 0.13
773 0.15
774 0.15
775 0.15
776 0.13
777 0.14
778 0.15
779 0.15
780 0.15
781 0.13
782 0.15
783 0.2
784 0.26
785 0.33
786 0.37
787 0.47
788 0.53
789 0.6
790 0.66
791 0.7
792 0.72
793 0.73
794 0.74
795 0.67
796 0.64
797 0.59
798 0.51
799 0.42
800 0.35
801 0.26
802 0.19
803 0.18
804 0.15
805 0.13
806 0.11
807 0.11
808 0.09
809 0.11
810 0.11
811 0.1
812 0.09
813 0.09
814 0.1
815 0.09
816 0.09
817 0.07
818 0.07
819 0.07
820 0.08
821 0.13
822 0.16
823 0.19
824 0.21
825 0.24
826 0.26
827 0.28
828 0.33
829 0.34
830 0.34
831 0.36
832 0.36
833 0.34
834 0.32
835 0.32
836 0.27
837 0.24
838 0.22
839 0.19
840 0.22
841 0.29
842 0.4
843 0.49
844 0.57
845 0.65
846 0.7
847 0.72
848 0.76
849 0.77
850 0.76
851 0.73
852 0.66
853 0.59
854 0.54
855 0.49
856 0.4
857 0.3
858 0.21
859 0.14
860 0.11
861 0.08
862 0.09
863 0.1
864 0.1
865 0.11
866 0.12
867 0.12
868 0.12
869 0.13
870 0.12
871 0.12
872 0.11
873 0.11
874 0.1
875 0.11
876 0.14
877 0.14
878 0.14
879 0.16
880 0.18
881 0.2
882 0.22
883 0.24
884 0.23
885 0.26
886 0.29
887 0.28
888 0.27
889 0.29
890 0.27
891 0.26
892 0.28
893 0.27
894 0.33
895 0.42
896 0.5
897 0.53
898 0.6
899 0.65
900 0.63
901 0.61
902 0.55
903 0.51
904 0.45
905 0.42
906 0.35
907 0.28
908 0.28
909 0.27
910 0.27
911 0.26
912 0.27
913 0.24
914 0.25
915 0.24
916 0.22
917 0.23
918 0.22
919 0.19
920 0.23
921 0.24
922 0.24
923 0.26
924 0.31
925 0.38
926 0.42
927 0.46
928 0.47
929 0.47
930 0.48
931 0.45
932 0.39
933 0.32
934 0.25
935 0.2
936 0.12
937 0.09
938 0.08
939 0.09
940 0.11
941 0.17
942 0.22
943 0.23
944 0.24
945 0.29
946 0.3
947 0.3
948 0.31
949 0.29
950 0.25
951 0.24
952 0.23
953 0.19
954 0.19
955 0.19
956 0.17
957 0.19
958 0.21
959 0.21
960 0.23
961 0.26
962 0.28
963 0.32
964 0.35
965 0.33
966 0.31
967 0.31
968 0.29
969 0.24
970 0.22
971 0.18
972 0.15
973 0.12
974 0.15
975 0.18
976 0.19
977 0.22
978 0.26
979 0.28
980 0.3
981 0.32
982 0.3
983 0.27
984 0.27
985 0.25
986 0.21
987 0.17
988 0.14
989 0.1
990 0.07
991 0.06
992 0.05
993 0.05
994 0.05
995 0.06
996 0.08
997 0.09
998 0.1
999 0.14
1000 0.18
1001 0.19
1002 0.22
1003 0.27
1004 0.29
1005 0.36
1006 0.41
1007 0.42
1008 0.4
1009 0.41
1010 0.4
1011 0.35
1012 0.32
1013 0.32
1014 0.35
1015 0.4
1016 0.48
1017 0.57
1018 0.66
1019 0.76
1020 0.86
1021 0.89
1022 0.92
1023 0.94
1024 0.95
1025 0.96
1026 0.96
1027 0.96
1028 0.96
1029 0.95
1030 0.94
1031 0.93
1032 0.92
1033 0.91
1034 0.92
1035 0.9
1036 0.85
1037 0.85
1038 0.85
1039 0.82
1040 0.82
1041 0.81
1042 0.79
1043 0.79
1044 0.83
1045 0.82
1046 0.8
1047 0.82
1048 0.8
1049 0.79
1050 0.8
1051 0.82
1052 0.73
1053 0.65
1054 0.6
1055 0.53
1056 0.49
1057 0.43
1058 0.36
1059 0.33
1060 0.34
1061 0.35
1062 0.41
1063 0.44
1064 0.47
1065 0.49
1066 0.5
1067 0.47
1068 0.45
1069 0.45
1070 0.39
1071 0.38
1072 0.35
1073 0.31
1074 0.26
1075 0.21
1076 0.21
1077 0.2
1078 0.17
1079 0.13
1080 0.09
1081 0.08
1082 0.09
1083 0.09
1084 0.09
1085 0.09
1086 0.1
1087 0.14
1088 0.16
1089 0.16
1090 0.17
1091 0.22
1092 0.24
1093 0.33
1094 0.37
1095 0.38
1096 0.41
1097 0.49
1098 0.57
1099 0.55
1100 0.59
1101 0.58
1102 0.53
1103 0.55
1104 0.51
1105 0.48
1106 0.4
1107 0.38
1108 0.39
1109 0.34
1110 0.35
1111 0.28
1112 0.27
1113 0.22
1114 0.22
1115 0.23
1116 0.17
1117 0.2
1118 0.19
1119 0.21
1120 0.21
1121 0.2
1122 0.19
1123 0.16
1124 0.17
1125 0.17
1126 0.18
1127 0.21
1128 0.22
1129 0.24
1130 0.31
1131 0.34
1132 0.32
1133 0.32
1134 0.35
1135 0.33
1136 0.36
1137 0.38
1138 0.32
1139 0.32
1140 0.3
1141 0.34
1142 0.34
1143 0.36
1144 0.4
1145 0.42
1146 0.44
1147 0.42
1148 0.44
1149 0.42
1150 0.46
1151 0.48
1152 0.43
1153 0.43
1154 0.46
1155 0.46
1156 0.5
1157 0.55
1158 0.56
1159 0.58
1160 0.64
1161 0.67
1162 0.71
1163 0.77
1164 0.8
1165 0.82
1166 0.78
1167 0.79
1168 0.78
1169 0.76
1170 0.69
1171 0.65
1172 0.56
1173 0.47
1174 0.42
1175 0.37
1176 0.34
1177 0.37
1178 0.39
1179 0.36
1180 0.37
1181 0.39
1182 0.4
1183 0.4
1184 0.37
1185 0.32
1186 0.26
1187 0.28
1188 0.31
1189 0.32
1190 0.32
1191 0.32
1192 0.31
1193 0.35
1194 0.38
1195 0.37
1196 0.36
1197 0.34
1198 0.34
1199 0.4
1200 0.44
1201 0.46
1202 0.49
1203 0.55
1204 0.62
1205 0.68
1206 0.76
1207 0.76
1208 0.8
1209 0.8
1210 0.8
1211 0.79
1212 0.76
1213 0.75
1214 0.7
1215 0.64
1216 0.58
1217 0.54
1218 0.58
1219 0.58
1220 0.6
1221 0.54
1222 0.54
1223 0.55
1224 0.53
1225 0.54
1226 0.53
1227 0.48
1228 0.4
1229 0.41
1230 0.38
1231 0.35