FuNGI

A0A397JHN7

Protein Details

Accession

A0A397JHN7

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
505-534	NVKPKLTVEKPKPKSKQKQVSPKTSPPNKA	Hydrophilic
642-661	NTSSSKKRSRSSNVQKPTPV	Hydrophilic
731-751	DLIRTFKNRIREDSRNRDRLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
481-535	SEKGKSPSKSKVVKTATPKNRAPANVKPKLTVEKPKPKSKQKQVSPKTSPPNKAK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 13.499

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTSPNRPSPTSVRPSNPSNPQNPQNALTNSNRSPTPGRPPTTVRTSLVHNQNNQNINVPVPPLPCPQPPRPIAPNLAVRPPRPPAGRFPVRNMAQASQPQLTLKAEFIITPSSLVGKKKINIMRLKSGQPVDLTKFNAPIKLHRRDPDAPTQNGGINNNNNNNNNMIIMNNRPTQNTVAAPINNKPTSEVTLTAIAPYAGARQNKKNLFKKKTTQVFLADPKTRELKAEEHIPWVLEDFGGENVFVGSYIGGDTAKYCVFLKQVDKLRFVPVHRFYEFQRKIKHKILTIEEAEEQMARAKKMESDRWMMRKFGKVTEAEDITAKEGIYDPKSSIKTVENEEDLFGSDEEHRPSREGFDEEMDYDEIFEDDEEDLPDDANPLIDDETKEVGKLKAKVKHPFELDNQTSDEEEKLTSEGKQMKKLIRTHDDNDAYESDRESNPYATESDVTDSEDTSSISKQSSTTGPSSNKASPVMKTEKISEKGKSPSKSKVVKTATPKNRAPANVKPKLTVEKPKPKSKQKQVSPKTSPPNKAKSAETVNKPKLQTEKFSKLQIDNQKTLSKEITQKAKPVKPPTTTTTPTPTPMSKVTSVSTPTSKFTSVPTPTSTSKPSTTTNTPNASPTIVPEKRALSSDPTSSEIENTSSSKKRSRSSNVQKPTPVTTPTSARSANTSPNSLTSPEEGGPSKKQKISKTSSISRQPGTSSAPSGSNLITEREIKELILTKNVKVNDLIRTFKNRIREDSRNRDRLLSITKEIAVYKEGYLALK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.69
3	0.72
4	0.7
5	0.68
6	0.69
7	0.69
8	0.72
9	0.68
10	0.62
11	0.61
12	0.56
13	0.54
14	0.52
15	0.52
16	0.47
17	0.47
18	0.44
19	0.4
20	0.42
21	0.43
22	0.47
23	0.48
24	0.5
25	0.52
26	0.58
27	0.61
28	0.64
29	0.62
30	0.54
31	0.48
32	0.5
33	0.53
34	0.58
35	0.57
36	0.55
37	0.58
38	0.63
39	0.66
40	0.6
41	0.55
42	0.46
43	0.41
44	0.35
45	0.3
46	0.26
47	0.23
48	0.26
49	0.26
50	0.3
51	0.35
52	0.41
53	0.45
54	0.51
55	0.53
56	0.57
57	0.58
58	0.59
59	0.57
60	0.56
61	0.59
62	0.53
63	0.59
64	0.55
65	0.51
66	0.51
67	0.5
68	0.51
69	0.47
70	0.47
71	0.46
72	0.52
73	0.61
74	0.59
75	0.61
76	0.64
77	0.61
78	0.63
79	0.57
80	0.49
81	0.45
82	0.46
83	0.43
84	0.34
85	0.33
86	0.29
87	0.28
88	0.28
89	0.23
90	0.19
91	0.16
92	0.15
93	0.14
94	0.15
95	0.15
96	0.13
97	0.12
98	0.12
99	0.14
100	0.17
101	0.19
102	0.23
103	0.26
104	0.28
105	0.36
106	0.41
107	0.46
108	0.51
109	0.55
110	0.6
111	0.6
112	0.61
113	0.59
114	0.56
115	0.5
116	0.44
117	0.43
118	0.37
119	0.36
120	0.36
121	0.31
122	0.35
123	0.34
124	0.36
125	0.32
126	0.38
127	0.42
128	0.47
129	0.52
130	0.5
131	0.57
132	0.58
133	0.62
134	0.64
135	0.63
136	0.56
137	0.52
138	0.49
139	0.45
140	0.42
141	0.38
142	0.33
143	0.31
144	0.36
145	0.4
146	0.44
147	0.42
148	0.4
149	0.39
150	0.34
151	0.28
152	0.23
153	0.17
154	0.14
155	0.16
156	0.2
157	0.23
158	0.24
159	0.24
160	0.26
161	0.28
162	0.28
163	0.25
164	0.24
165	0.24
166	0.25
167	0.27
168	0.28
169	0.34
170	0.32
171	0.31
172	0.3
173	0.27
174	0.29
175	0.28
176	0.25
177	0.2
178	0.22
179	0.22
180	0.19
181	0.17
182	0.13
183	0.11
184	0.1
185	0.11
186	0.13
187	0.18
188	0.22
189	0.28
190	0.37
191	0.45
192	0.54
193	0.6
194	0.66
195	0.7
196	0.74
197	0.77
198	0.78
199	0.8
200	0.74
201	0.68
202	0.62
203	0.61
204	0.59
205	0.57
206	0.52
207	0.44
208	0.43
209	0.43
210	0.39
211	0.34
212	0.3
213	0.26
214	0.25
215	0.31
216	0.29
217	0.29
218	0.29
219	0.27
220	0.24
221	0.21
222	0.18
223	0.1
224	0.09
225	0.06
226	0.07
227	0.06
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.06
242	0.06
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.11
247	0.14
248	0.16
249	0.22
250	0.31
251	0.34
252	0.37
253	0.37
254	0.41
255	0.41
256	0.41
257	0.42
258	0.4
259	0.42
260	0.39
261	0.39
262	0.36
263	0.44
264	0.48
265	0.45
266	0.48
267	0.47
268	0.53
269	0.59
270	0.61
271	0.54
272	0.54
273	0.53
274	0.5
275	0.46
276	0.42
277	0.35
278	0.31
279	0.26
280	0.2
281	0.15
282	0.13
283	0.13
284	0.11
285	0.12
286	0.12
287	0.16
288	0.21
289	0.26
290	0.26
291	0.31
292	0.37
293	0.44
294	0.45
295	0.43
296	0.41
297	0.43
298	0.41
299	0.36
300	0.35
301	0.28
302	0.29
303	0.3
304	0.28
305	0.22
306	0.2
307	0.18
308	0.15
309	0.14
310	0.12
311	0.08
312	0.09
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.17
318	0.18
319	0.18
320	0.19
321	0.2
322	0.21
323	0.23
324	0.25
325	0.21
326	0.2
327	0.2
328	0.18
329	0.15
330	0.13
331	0.1
332	0.08
333	0.08
334	0.1
335	0.12
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.14
340	0.14
341	0.15
342	0.15
343	0.14
344	0.15
345	0.15
346	0.14
347	0.15
348	0.13
349	0.11
350	0.09
351	0.08
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.1
377	0.14
378	0.19
379	0.24
380	0.29
381	0.35
382	0.43
383	0.46
384	0.5
385	0.48
386	0.47
387	0.45
388	0.46
389	0.42
390	0.35
391	0.32
392	0.27
393	0.25
394	0.21
395	0.18
396	0.1
397	0.09
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.11
403	0.18
404	0.19
405	0.24
406	0.28
407	0.32
408	0.38
409	0.41
410	0.44
411	0.45
412	0.48
413	0.45
414	0.5
415	0.48
416	0.42
417	0.4
418	0.34
419	0.29
420	0.24
421	0.22
422	0.16
423	0.13
424	0.14
425	0.13
426	0.13
427	0.11
428	0.12
429	0.12
430	0.1
431	0.11
432	0.1
433	0.1
434	0.1
435	0.11
436	0.1
437	0.09
438	0.1
439	0.09
440	0.09
441	0.08
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.09
446	0.08
447	0.1
448	0.12
449	0.14
450	0.16
451	0.21
452	0.22
453	0.24
454	0.28
455	0.27
456	0.27
457	0.27
458	0.26
459	0.22
460	0.26
461	0.3
462	0.28
463	0.28
464	0.31
465	0.35
466	0.39
467	0.41
468	0.36
469	0.36
470	0.41
471	0.47
472	0.47
473	0.44
474	0.47
475	0.52
476	0.58
477	0.55
478	0.57
479	0.55
480	0.56
481	0.61
482	0.64
483	0.64
484	0.64
485	0.64
486	0.6
487	0.59
488	0.57
489	0.55
490	0.54
491	0.55
492	0.55
493	0.54
494	0.5
495	0.49
496	0.5
497	0.5
498	0.5
499	0.49
500	0.53
501	0.59
502	0.67
503	0.73
504	0.78
505	0.83
506	0.84
507	0.85
508	0.83
509	0.88
510	0.86
511	0.88
512	0.85
513	0.83
514	0.83
515	0.8
516	0.79
517	0.76
518	0.75
519	0.7
520	0.66
521	0.59
522	0.55
523	0.56
524	0.55
525	0.56
526	0.58
527	0.57
528	0.59
529	0.58
530	0.55
531	0.54
532	0.49
533	0.5
534	0.49
535	0.52
536	0.49
537	0.53
538	0.53
539	0.48
540	0.53
541	0.55
542	0.53
543	0.47
544	0.48
545	0.47
546	0.44
547	0.44
548	0.38
549	0.33
550	0.34
551	0.37
552	0.42
553	0.41
554	0.47
555	0.53
556	0.57
557	0.6
558	0.61
559	0.63
560	0.58
561	0.62
562	0.61
563	0.61
564	0.57
565	0.53
566	0.51
567	0.46
568	0.44
569	0.42
570	0.37
571	0.32
572	0.33
573	0.33
574	0.29
575	0.29
576	0.27
577	0.27
578	0.29
579	0.28
580	0.3
581	0.27
582	0.27
583	0.28
584	0.27
585	0.24
586	0.24
587	0.3
588	0.29
589	0.3
590	0.31
591	0.34
592	0.35
593	0.39
594	0.4
595	0.35
596	0.34
597	0.34
598	0.35
599	0.36
600	0.41
601	0.44
602	0.48
603	0.48
604	0.46
605	0.45
606	0.42
607	0.37
608	0.3
609	0.26
610	0.3
611	0.27
612	0.28
613	0.29
614	0.3
615	0.3
616	0.32
617	0.3
618	0.26
619	0.28
620	0.29
621	0.28
622	0.29
623	0.29
624	0.28
625	0.27
626	0.22
627	0.2
628	0.19
629	0.19
630	0.22
631	0.26
632	0.3
633	0.36
634	0.41
635	0.45
636	0.52
637	0.59
638	0.64
639	0.7
640	0.77
641	0.79
642	0.8
643	0.79
644	0.73
645	0.69
646	0.62
647	0.54
648	0.48
649	0.43
650	0.41
651	0.39
652	0.41
653	0.37
654	0.33
655	0.35
656	0.34
657	0.39
658	0.36
659	0.37
660	0.32
661	0.34
662	0.35
663	0.31
664	0.3
665	0.23
666	0.23
667	0.21
668	0.23
669	0.23
670	0.25
671	0.32
672	0.38
673	0.43
674	0.44
675	0.5
676	0.54
677	0.62
678	0.66
679	0.68
680	0.69
681	0.71
682	0.75
683	0.78
684	0.77
685	0.69
686	0.63
687	0.56
688	0.5
689	0.47
690	0.41
691	0.34
692	0.3
693	0.29
694	0.28
695	0.28
696	0.24
697	0.21
698	0.19
699	0.19
700	0.2
701	0.22
702	0.22
703	0.23
704	0.24
705	0.21
706	0.24
707	0.28
708	0.27
709	0.32
710	0.33
711	0.32
712	0.38
713	0.39
714	0.36
715	0.33
716	0.34
717	0.34
718	0.37
719	0.4
720	0.39
721	0.47
722	0.5
723	0.5
724	0.57
725	0.53
726	0.56
727	0.6
728	0.66
729	0.68
730	0.74
731	0.82
732	0.8
733	0.77
734	0.72
735	0.65
736	0.61
737	0.58
738	0.53
739	0.47
740	0.42
741	0.41
742	0.39
743	0.39
744	0.34
745	0.28
746	0.23
747	0.2
748	0.2

A0A397JHN7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer