Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397H386

Protein Details
Accession A0A397H386    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-107RQKQLKETFSNKKKKPTLNKERSISDHydrophilic
403-422MPPARKQKTSNEKKPCGYNNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR008676  MRG  
IPR038217  MRG_C_sf  
IPR026541  MRG_dom  
IPR025995  Tudor-knot  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF05712  MRG  
PF11717  Tudor-knot  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS51640  MRG  
CDD cd18983  CBD_MSL3_like  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MTQAGNKDTKLNFSENEVVLCFHGPLLYEAKILKAENWGSNDSGSGDKGPHYFVHYKGWKKTWDEWVPEERVVKHNEANLARQKQLKETFSNKKKKPTLNKERSISDTDEISSTNKRQKIGTTPEMKKNVQSKRTIFAPDHQNNTQDRQQSSNDEIQEGASAEQNEEHQFEDSMKRDEEIKDDKEEMKGIDENNNDNVNDSQNQQRSKKRSRMEDEEEEEDEYMNRLEIKISIPESLKCKLIDDWENVTKSHSLLKLPRTPNVVDILNHYVEYKRKNLLPNTNISSSSSSSSSSKIEKGDIYTEVANGLQIYFEKTLGNILLYSTERQQYVDIRKQYIEKENAEIYGAEHLLRLFVELPRLLAHSHLDKTATETLEEHLEDFLKFLQKKEEQYFVNEYDRNGMPPARKQKTSNEKKPCGYNNASNNSEGWVCGNCGTSNTPGWRAGETPDQKLCNACGLYYAKYKSHRPSSLWNSQRGKAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.36
3 0.37
4 0.31
5 0.28
6 0.25
7 0.25
8 0.19
9 0.12
10 0.11
11 0.1
12 0.12
13 0.15
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.18
18 0.21
19 0.2
20 0.19
21 0.22
22 0.26
23 0.28
24 0.32
25 0.33
26 0.31
27 0.3
28 0.3
29 0.24
30 0.22
31 0.18
32 0.15
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.18
37 0.18
38 0.23
39 0.26
40 0.26
41 0.36
42 0.41
43 0.48
44 0.53
45 0.57
46 0.57
47 0.59
48 0.65
49 0.65
50 0.65
51 0.63
52 0.62
53 0.63
54 0.61
55 0.57
56 0.54
57 0.46
58 0.43
59 0.42
60 0.4
61 0.36
62 0.35
63 0.4
64 0.38
65 0.43
66 0.46
67 0.46
68 0.46
69 0.48
70 0.46
71 0.47
72 0.53
73 0.5
74 0.48
75 0.53
76 0.6
77 0.65
78 0.74
79 0.71
80 0.74
81 0.78
82 0.8
83 0.82
84 0.83
85 0.84
86 0.84
87 0.88
88 0.83
89 0.79
90 0.74
91 0.67
92 0.59
93 0.49
94 0.4
95 0.32
96 0.27
97 0.23
98 0.21
99 0.21
100 0.22
101 0.28
102 0.29
103 0.3
104 0.31
105 0.34
106 0.41
107 0.45
108 0.49
109 0.52
110 0.56
111 0.63
112 0.67
113 0.64
114 0.61
115 0.61
116 0.61
117 0.57
118 0.59
119 0.53
120 0.52
121 0.55
122 0.53
123 0.46
124 0.44
125 0.48
126 0.46
127 0.49
128 0.46
129 0.47
130 0.44
131 0.48
132 0.45
133 0.4
134 0.36
135 0.34
136 0.35
137 0.34
138 0.37
139 0.37
140 0.32
141 0.27
142 0.26
143 0.22
144 0.2
145 0.17
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.15
159 0.16
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.19
164 0.2
165 0.24
166 0.26
167 0.26
168 0.25
169 0.28
170 0.28
171 0.27
172 0.27
173 0.22
174 0.18
175 0.18
176 0.16
177 0.19
178 0.19
179 0.2
180 0.22
181 0.23
182 0.2
183 0.19
184 0.19
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.19
189 0.22
190 0.28
191 0.32
192 0.39
193 0.45
194 0.53
195 0.6
196 0.59
197 0.64
198 0.66
199 0.7
200 0.7
201 0.68
202 0.63
203 0.57
204 0.52
205 0.43
206 0.35
207 0.26
208 0.19
209 0.12
210 0.08
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.12
221 0.14
222 0.17
223 0.18
224 0.19
225 0.16
226 0.17
227 0.16
228 0.19
229 0.21
230 0.21
231 0.24
232 0.26
233 0.27
234 0.26
235 0.26
236 0.22
237 0.19
238 0.2
239 0.16
240 0.15
241 0.19
242 0.25
243 0.32
244 0.33
245 0.36
246 0.36
247 0.35
248 0.33
249 0.32
250 0.27
251 0.19
252 0.21
253 0.21
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.15
258 0.17
259 0.19
260 0.19
261 0.18
262 0.22
263 0.28
264 0.34
265 0.41
266 0.41
267 0.44
268 0.46
269 0.45
270 0.41
271 0.37
272 0.33
273 0.25
274 0.24
275 0.18
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.17
280 0.16
281 0.18
282 0.17
283 0.18
284 0.17
285 0.18
286 0.19
287 0.17
288 0.17
289 0.15
290 0.14
291 0.13
292 0.11
293 0.1
294 0.07
295 0.06
296 0.04
297 0.04
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.07
307 0.06
308 0.08
309 0.09
310 0.11
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.21
317 0.28
318 0.34
319 0.36
320 0.36
321 0.37
322 0.39
323 0.43
324 0.44
325 0.42
326 0.36
327 0.36
328 0.35
329 0.33
330 0.31
331 0.26
332 0.18
333 0.15
334 0.14
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.09
341 0.07
342 0.08
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.14
351 0.16
352 0.17
353 0.18
354 0.18
355 0.17
356 0.22
357 0.26
358 0.23
359 0.19
360 0.19
361 0.19
362 0.21
363 0.21
364 0.16
365 0.12
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.17
371 0.18
372 0.19
373 0.27
374 0.3
375 0.37
376 0.41
377 0.45
378 0.39
379 0.44
380 0.48
381 0.43
382 0.45
383 0.4
384 0.36
385 0.35
386 0.34
387 0.3
388 0.27
389 0.27
390 0.25
391 0.32
392 0.43
393 0.44
394 0.48
395 0.5
396 0.59
397 0.66
398 0.73
399 0.75
400 0.75
401 0.76
402 0.77
403 0.82
404 0.78
405 0.76
406 0.71
407 0.7
408 0.68
409 0.68
410 0.65
411 0.56
412 0.5
413 0.43
414 0.37
415 0.28
416 0.21
417 0.14
418 0.14
419 0.14
420 0.16
421 0.14
422 0.16
423 0.19
424 0.2
425 0.24
426 0.27
427 0.29
428 0.3
429 0.31
430 0.3
431 0.29
432 0.3
433 0.34
434 0.35
435 0.38
436 0.41
437 0.41
438 0.41
439 0.42
440 0.39
441 0.36
442 0.32
443 0.26
444 0.26
445 0.27
446 0.31
447 0.36
448 0.38
449 0.37
450 0.42
451 0.51
452 0.54
453 0.61
454 0.63
455 0.6
456 0.67
457 0.7
458 0.75
459 0.74
460 0.74
461 0.7