Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JM93

Protein Details
Accession A0A397JM93    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-52MTFTDRQQKSYKKTMKMTKENFRESENWKIKLEKLERRRSRQLYQETRPRLNHydrophilic
122-145RTIEEARQSRRSRRNSNNNQPLEIHydrophilic
316-346SEDEIKVKPKTKRKIKKKKYEKIFLNPKNEVBasic
410-434EVETLRKNLKKFKRKVENNEYEGKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-335KVKPKTKRKIKKKKY
399-424PERNKGKKRIIEVETLRKNLKKFKRK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MTFTDRQQKSYKKTMKMTKENFRESENWKIKLEKLERRRSRQLYQETRPRLNLNQALEEINWNIRTRENSLTRSPVSFSVQTSIETTRENSPEQSNDEESGSELSEREFQERVREFENYRTRTIEEARQSRRSRRNSNNNQPLEIEQEENNEEPLVENNIIDILALRSKKFRGNGTQDPVEWLKNYEKTARMNGWTDDQRKERIYTVLDDAVDKWYNEIYTATYGDENNERELEKLKQQPGESVDQYAARFKKLIRKGAPAMQNAEKLYHFKKGLRKGMLPIISMHNPEDIATVIELAQHYEEAEDLEEGLEPEESEDEIKVKPKTKRKIKKKKYEKIFLNPKNEVIKMSEEIIQPALARNLRKIENEEGFEYESDSSPTPQRPVSPERQKDPEKQIEPERNKGKKRIIEVETLRKNLKKFKRKVENNEYEGKKNDEYEGDEGDEGEEGDEGEDDDDEDDEDEEGEDEEYHNEIVNIESED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.82
3 0.84
4 0.86
5 0.85
6 0.86
7 0.85
8 0.77
9 0.72
10 0.68
11 0.62
12 0.64
13 0.61
14 0.55
15 0.5
16 0.51
17 0.51
18 0.55
19 0.59
20 0.58
21 0.61
22 0.68
23 0.75
24 0.81
25 0.86
26 0.83
27 0.82
28 0.82
29 0.82
30 0.81
31 0.81
32 0.83
33 0.8
34 0.78
35 0.75
36 0.7
37 0.63
38 0.62
39 0.58
40 0.51
41 0.47
42 0.43
43 0.4
44 0.36
45 0.34
46 0.27
47 0.25
48 0.24
49 0.21
50 0.2
51 0.22
52 0.24
53 0.27
54 0.34
55 0.36
56 0.39
57 0.43
58 0.48
59 0.47
60 0.45
61 0.43
62 0.37
63 0.36
64 0.33
65 0.29
66 0.26
67 0.25
68 0.24
69 0.25
70 0.24
71 0.2
72 0.19
73 0.2
74 0.23
75 0.25
76 0.25
77 0.26
78 0.27
79 0.29
80 0.31
81 0.33
82 0.3
83 0.28
84 0.27
85 0.24
86 0.21
87 0.19
88 0.16
89 0.12
90 0.1
91 0.09
92 0.14
93 0.15
94 0.17
95 0.17
96 0.17
97 0.26
98 0.29
99 0.31
100 0.28
101 0.31
102 0.3
103 0.39
104 0.48
105 0.42
106 0.41
107 0.41
108 0.39
109 0.39
110 0.41
111 0.39
112 0.38
113 0.44
114 0.48
115 0.55
116 0.59
117 0.65
118 0.7
119 0.72
120 0.74
121 0.75
122 0.81
123 0.82
124 0.89
125 0.89
126 0.82
127 0.74
128 0.65
129 0.56
130 0.49
131 0.4
132 0.3
133 0.2
134 0.2
135 0.21
136 0.19
137 0.18
138 0.13
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.05
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.12
155 0.15
156 0.19
157 0.22
158 0.26
159 0.32
160 0.4
161 0.47
162 0.51
163 0.51
164 0.47
165 0.47
166 0.44
167 0.35
168 0.27
169 0.22
170 0.2
171 0.21
172 0.23
173 0.23
174 0.25
175 0.27
176 0.31
177 0.31
178 0.29
179 0.29
180 0.28
181 0.3
182 0.32
183 0.33
184 0.34
185 0.34
186 0.35
187 0.34
188 0.35
189 0.31
190 0.27
191 0.25
192 0.23
193 0.23
194 0.21
195 0.19
196 0.18
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.13
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.14
220 0.14
221 0.18
222 0.23
223 0.25
224 0.28
225 0.28
226 0.3
227 0.31
228 0.33
229 0.27
230 0.22
231 0.2
232 0.18
233 0.18
234 0.21
235 0.18
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.23
240 0.28
241 0.36
242 0.35
243 0.4
244 0.43
245 0.48
246 0.53
247 0.46
248 0.44
249 0.38
250 0.37
251 0.31
252 0.3
253 0.24
254 0.21
255 0.21
256 0.22
257 0.21
258 0.23
259 0.3
260 0.37
261 0.45
262 0.46
263 0.46
264 0.43
265 0.48
266 0.46
267 0.39
268 0.32
269 0.28
270 0.26
271 0.25
272 0.22
273 0.16
274 0.14
275 0.14
276 0.12
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.07
306 0.08
307 0.12
308 0.16
309 0.23
310 0.3
311 0.39
312 0.5
313 0.6
314 0.7
315 0.77
316 0.85
317 0.89
318 0.92
319 0.94
320 0.94
321 0.93
322 0.93
323 0.9
324 0.89
325 0.89
326 0.86
327 0.83
328 0.74
329 0.68
330 0.62
331 0.54
332 0.44
333 0.35
334 0.31
335 0.24
336 0.24
337 0.24
338 0.2
339 0.21
340 0.2
341 0.18
342 0.15
343 0.15
344 0.17
345 0.16
346 0.16
347 0.19
348 0.23
349 0.26
350 0.28
351 0.32
352 0.34
353 0.36
354 0.38
355 0.36
356 0.33
357 0.31
358 0.29
359 0.25
360 0.2
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.17
366 0.2
367 0.21
368 0.21
369 0.25
370 0.29
371 0.36
372 0.45
373 0.51
374 0.56
375 0.59
376 0.67
377 0.69
378 0.71
379 0.73
380 0.73
381 0.66
382 0.65
383 0.68
384 0.7
385 0.7
386 0.71
387 0.72
388 0.7
389 0.73
390 0.75
391 0.74
392 0.7
393 0.72
394 0.72
395 0.66
396 0.66
397 0.67
398 0.7
399 0.68
400 0.66
401 0.63
402 0.57
403 0.57
404 0.57
405 0.61
406 0.61
407 0.63
408 0.7
409 0.77
410 0.83
411 0.9
412 0.91
413 0.9
414 0.85
415 0.86
416 0.79
417 0.73
418 0.66
419 0.6
420 0.51
421 0.43
422 0.4
423 0.33
424 0.33
425 0.31
426 0.3
427 0.26
428 0.24
429 0.22
430 0.2
431 0.17
432 0.13
433 0.1
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.1