Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JIJ5

Protein Details
Accession A0A397JIJ5    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-135VFCVATIKVIKRRRKRQSKTSEKSENWKIKSEKLERRRSRQLYRETRPRLNHydrophilic
205-228RTIEEARRSRRSRRNSNNNQPLEIHydrophilic
446-493ESEDEIKVKPKTKRKIKKKKYESESSDEEIPVKKEKVKKKEVEVDPIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-124IKRRRKRQSKTSEKSENWKIKSEKLERRRSR
452-465KVKPKTKRKIKKKK
478-484KKEKVKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 9, mito 6, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MPGLVKHLYARIVESTYKSTLATRIRNQLCIRKNDIWKFIWNTNVEGTRRSEHIRGGLMGSTDKSMVEPSRNRRTINLILETAIVFCVATIKVIKRRRKRQSKTSEKSENWKIKSEKLERRRSRQLYRETRPRLNLNQALEEINWNIRTRENSLTRSPVSFSVQTSRETTRENSPEQSNDEESGSELSEREFQERVREFEQYRTRTIEEARRSRRSRRNSNNNQPLEIVEEENIEEQEGLREYLQEFEIEIEQEENNKEPIVENNIMDILALRSKKFRGDGTQDPVEWLKNYEKTARMNGWTDDQRKERIYTVLDDAADEWYNEVYTQTYGIGNDEWPTWIRLKELFLEQFCNRRWMNKWTKELEKLKQQPGESVDQYAARFKKIIRKGAPAMQNAEKLYHFKKGLRKGMLPIISMHNPEDIATVIELAQHYEEAEDLEEGLEPEESEDEIKVKPKTKRKIKKKKYESESSDEEIPVKKEKVKKKEVEVDPIEELTKKMNELTIKLAKTERPQTLQKRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.29
4 0.29
5 0.26
6 0.25
7 0.29
8 0.35
9 0.4
10 0.42
11 0.51
12 0.53
13 0.6
14 0.64
15 0.66
16 0.66
17 0.65
18 0.66
19 0.65
20 0.71
21 0.71
22 0.72
23 0.66
24 0.66
25 0.64
26 0.6
27 0.58
28 0.5
29 0.45
30 0.44
31 0.47
32 0.41
33 0.38
34 0.39
35 0.35
36 0.37
37 0.39
38 0.35
39 0.32
40 0.36
41 0.35
42 0.32
43 0.31
44 0.29
45 0.25
46 0.24
47 0.21
48 0.18
49 0.15
50 0.13
51 0.12
52 0.14
53 0.16
54 0.23
55 0.3
56 0.38
57 0.49
58 0.53
59 0.53
60 0.53
61 0.57
62 0.57
63 0.56
64 0.52
65 0.42
66 0.38
67 0.38
68 0.35
69 0.28
70 0.19
71 0.12
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.06
76 0.08
77 0.11
78 0.16
79 0.25
80 0.35
81 0.45
82 0.53
83 0.64
84 0.74
85 0.82
86 0.87
87 0.89
88 0.91
89 0.93
90 0.92
91 0.91
92 0.9
93 0.83
94 0.82
95 0.81
96 0.79
97 0.7
98 0.7
99 0.62
100 0.58
101 0.64
102 0.66
103 0.66
104 0.67
105 0.75
106 0.75
107 0.81
108 0.85
109 0.84
110 0.83
111 0.82
112 0.82
113 0.82
114 0.83
115 0.85
116 0.81
117 0.8
118 0.76
119 0.74
120 0.69
121 0.67
122 0.63
123 0.55
124 0.5
125 0.44
126 0.4
127 0.33
128 0.29
129 0.21
130 0.19
131 0.18
132 0.16
133 0.15
134 0.16
135 0.19
136 0.21
137 0.28
138 0.31
139 0.34
140 0.36
141 0.41
142 0.4
143 0.39
144 0.36
145 0.3
146 0.29
147 0.26
148 0.24
149 0.25
150 0.25
151 0.26
152 0.28
153 0.28
154 0.26
155 0.27
156 0.28
157 0.3
158 0.33
159 0.33
160 0.34
161 0.34
162 0.35
163 0.35
164 0.35
165 0.29
166 0.25
167 0.23
168 0.19
169 0.17
170 0.15
171 0.12
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.23
181 0.25
182 0.28
183 0.25
184 0.29
185 0.28
186 0.35
187 0.44
188 0.38
189 0.38
190 0.37
191 0.36
192 0.34
193 0.37
194 0.36
195 0.37
196 0.43
197 0.48
198 0.55
199 0.58
200 0.66
201 0.71
202 0.72
203 0.75
204 0.76
205 0.8
206 0.82
207 0.89
208 0.89
209 0.82
210 0.73
211 0.62
212 0.51
213 0.43
214 0.33
215 0.22
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.13
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.11
262 0.13
263 0.15
264 0.16
265 0.19
266 0.25
267 0.31
268 0.35
269 0.37
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.28
274 0.21
275 0.18
276 0.15
277 0.16
278 0.17
279 0.2
280 0.23
281 0.24
282 0.28
283 0.28
284 0.27
285 0.26
286 0.26
287 0.28
288 0.31
289 0.32
290 0.33
291 0.33
292 0.34
293 0.34
294 0.35
295 0.31
296 0.28
297 0.26
298 0.23
299 0.23
300 0.22
301 0.2
302 0.18
303 0.17
304 0.15
305 0.14
306 0.11
307 0.09
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.15
331 0.16
332 0.2
333 0.23
334 0.22
335 0.27
336 0.27
337 0.31
338 0.31
339 0.34
340 0.29
341 0.3
342 0.34
343 0.39
344 0.48
345 0.5
346 0.57
347 0.57
348 0.63
349 0.68
350 0.71
351 0.66
352 0.66
353 0.66
354 0.65
355 0.64
356 0.58
357 0.53
358 0.5
359 0.5
360 0.4
361 0.33
362 0.28
363 0.25
364 0.25
365 0.28
366 0.25
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.3
371 0.35
372 0.44
373 0.42
374 0.49
375 0.52
376 0.58
377 0.63
378 0.56
379 0.54
380 0.49
381 0.47
382 0.4
383 0.38
384 0.31
385 0.29
386 0.28
387 0.3
388 0.28
389 0.3
390 0.38
391 0.46
392 0.54
393 0.55
394 0.56
395 0.53
396 0.59
397 0.56
398 0.49
399 0.41
400 0.38
401 0.35
402 0.34
403 0.3
404 0.23
405 0.2
406 0.19
407 0.17
408 0.12
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.11
438 0.17
439 0.21
440 0.28
441 0.36
442 0.46
443 0.56
444 0.66
445 0.75
446 0.81
447 0.88
448 0.92
449 0.94
450 0.95
451 0.95
452 0.93
453 0.93
454 0.89
455 0.85
456 0.81
457 0.73
458 0.65
459 0.55
460 0.49
461 0.41
462 0.36
463 0.35
464 0.32
465 0.34
466 0.4
467 0.49
468 0.57
469 0.64
470 0.69
471 0.73
472 0.8
473 0.8
474 0.82
475 0.76
476 0.7
477 0.62
478 0.55
479 0.47
480 0.37
481 0.31
482 0.26
483 0.23
484 0.19
485 0.18
486 0.21
487 0.23
488 0.25
489 0.33
490 0.36
491 0.35
492 0.37
493 0.4
494 0.41
495 0.46
496 0.53
497 0.51
498 0.5
499 0.59