Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JDM5

Protein Details
Accession A0A397JDM5    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MPPKKKPLFPKSKKNKKDIIEPYPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-17PKKKPLFPKSKKNKK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
Amino Acid Sequences MPPKKKPLFPKSKKNKKDIIEPYPSIRKVPFIKKDIEFDCPHRVNTGSPERDRATKLIYNAMIRAIPNPNNIQKIDVLIIASSVEHNIFRNSNCLVNNHYKDQIRSRVFNLADSNNPEFVNDVVNGKISPENVAVMTAEEMASSEKKRKNAIELKKSEQKIIRQEPDLIPIKLDGDGSLGTAMSGCGPTVWIEREQVNKFSERVDDDYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.87
3 0.82
4 0.83
5 0.81
6 0.79
7 0.77
8 0.71
9 0.69
10 0.69
11 0.64
12 0.56
13 0.46
14 0.44
15 0.43
16 0.5
17 0.52
18 0.47
19 0.53
20 0.54
21 0.6
22 0.55
23 0.54
24 0.47
25 0.43
26 0.49
27 0.44
28 0.42
29 0.36
30 0.35
31 0.3
32 0.35
33 0.4
34 0.37
35 0.37
36 0.42
37 0.42
38 0.44
39 0.44
40 0.38
41 0.34
42 0.3
43 0.3
44 0.31
45 0.31
46 0.28
47 0.27
48 0.26
49 0.21
50 0.18
51 0.19
52 0.18
53 0.18
54 0.2
55 0.25
56 0.27
57 0.3
58 0.3
59 0.28
60 0.24
61 0.23
62 0.2
63 0.16
64 0.12
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.07
75 0.09
76 0.09
77 0.12
78 0.12
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.19
83 0.26
84 0.28
85 0.28
86 0.31
87 0.3
88 0.31
89 0.35
90 0.39
91 0.33
92 0.33
93 0.32
94 0.34
95 0.33
96 0.33
97 0.3
98 0.23
99 0.23
100 0.25
101 0.25
102 0.2
103 0.19
104 0.17
105 0.15
106 0.13
107 0.13
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.04
127 0.05
128 0.06
129 0.08
130 0.09
131 0.17
132 0.2
133 0.24
134 0.29
135 0.31
136 0.39
137 0.47
138 0.56
139 0.59
140 0.61
141 0.66
142 0.69
143 0.68
144 0.65
145 0.6
146 0.57
147 0.56
148 0.6
149 0.57
150 0.51
151 0.55
152 0.5
153 0.52
154 0.51
155 0.41
156 0.32
157 0.27
158 0.26
159 0.21
160 0.2
161 0.13
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.11
177 0.14
178 0.15
179 0.17
180 0.21
181 0.3
182 0.33
183 0.36
184 0.35
185 0.36
186 0.35
187 0.34
188 0.35
189 0.31