Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HM26

Protein Details
Accession A0A397HM26    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MSKSRSNIERNARRREKRRQCLVNGRKCPRAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-18RRREKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.832, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MSKSRSNIERNARRREKRRQCLVNGRKCPRAPNRFILYRTWHQNHTFKNSQNPIDMRSLSKKIAEQWKNEPLKVKSFWDRLAAEEKLKAPYRTTADILSGLEMSISKHLSEDTSMTFVNATVSSQKKFFMGNSEKSSIKAENEIPSFVFIPSESQPHVPEKKQNNLIFEDPTLNTPDTYKWEEITSLSPESEILNYDSYGSDDEENHCFSTLYYNFTGPQISNNSIDPMLIQYNTNLNVYLTSPYSSSNYKDEDSTFAEDDRLYLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.89
3 0.89
4 0.89
5 0.92
6 0.9
7 0.89
8 0.9
9 0.92
10 0.91
11 0.9
12 0.86
13 0.84
14 0.77
15 0.77
16 0.76
17 0.76
18 0.72
19 0.7
20 0.73
21 0.71
22 0.7
23 0.67
24 0.64
25 0.62
26 0.65
27 0.59
28 0.56
29 0.56
30 0.61
31 0.6
32 0.61
33 0.6
34 0.54
35 0.6
36 0.61
37 0.57
38 0.57
39 0.53
40 0.47
41 0.45
42 0.43
43 0.37
44 0.37
45 0.38
46 0.32
47 0.33
48 0.31
49 0.34
50 0.43
51 0.44
52 0.42
53 0.46
54 0.55
55 0.56
56 0.56
57 0.56
58 0.48
59 0.49
60 0.47
61 0.45
62 0.43
63 0.43
64 0.43
65 0.41
66 0.39
67 0.35
68 0.38
69 0.34
70 0.28
71 0.27
72 0.26
73 0.26
74 0.29
75 0.27
76 0.23
77 0.27
78 0.29
79 0.3
80 0.3
81 0.25
82 0.22
83 0.23
84 0.21
85 0.16
86 0.12
87 0.09
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.18
117 0.22
118 0.26
119 0.3
120 0.32
121 0.32
122 0.32
123 0.34
124 0.26
125 0.21
126 0.18
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.18
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.13
135 0.11
136 0.07
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.12
142 0.14
143 0.19
144 0.23
145 0.23
146 0.3
147 0.34
148 0.41
149 0.48
150 0.49
151 0.46
152 0.46
153 0.46
154 0.39
155 0.34
156 0.29
157 0.2
158 0.19
159 0.19
160 0.16
161 0.14
162 0.13
163 0.14
164 0.16
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.21
172 0.19
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.15
192 0.17
193 0.16
194 0.16
195 0.14
196 0.13
197 0.2
198 0.19
199 0.21
200 0.21
201 0.21
202 0.22
203 0.23
204 0.24
205 0.16
206 0.2
207 0.2
208 0.21
209 0.22
210 0.22
211 0.24
212 0.22
213 0.22
214 0.17
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.17
221 0.19
222 0.19
223 0.16
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.15
232 0.18
233 0.2
234 0.22
235 0.24
236 0.26
237 0.27
238 0.29
239 0.28
240 0.29
241 0.31
242 0.33
243 0.29
244 0.26
245 0.26
246 0.23