Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HYE2

Protein Details
Accession A0A397HYE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-87GSSSVLGKRKANKNTKGKRKKAKNRNEPEKRAARLIKTCNKKNKKRIERALIEFLHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-78GKRKANKNTKGKRKKAKNRNEPEKRAARLIKTCNKKNKKRI
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MKLLDYTNLLGFQLRSREIETMDNFERDNGEGSSSVLGKRKANKNTKGKRKKAKNRNEPEKRAARLIKTCNKKNKKRIERALIEFLHLVDFKEINPTHHEYSVLGPTGHVYTAVITTTVSCSCPDFALGFHCKHLFFVFLKVLKINSNCYLVCQKALITPELRFIFKKSSKIVLPNEKEIEKLKAIASIKRKPIDGNCSVCMEPLNNGQKLIWCQSGCGNNVHQDCFTEWTTQKWESNETEDEDEGESEDNVSILKKRMLIEKEEINQQNDYLLNKKFGVVEEHIESNIMEHNRHDDNENESENR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.24
4 0.26
5 0.26
6 0.32
7 0.31
8 0.32
9 0.34
10 0.33
11 0.3
12 0.29
13 0.29
14 0.23
15 0.23
16 0.16
17 0.15
18 0.13
19 0.14
20 0.16
21 0.15
22 0.17
23 0.2
24 0.23
25 0.26
26 0.35
27 0.44
28 0.51
29 0.6
30 0.68
31 0.74
32 0.81
33 0.88
34 0.89
35 0.91
36 0.91
37 0.93
38 0.94
39 0.93
40 0.94
41 0.94
42 0.94
43 0.95
44 0.95
45 0.91
46 0.9
47 0.87
48 0.79
49 0.76
50 0.7
51 0.65
52 0.63
53 0.64
54 0.64
55 0.65
56 0.71
57 0.73
58 0.79
59 0.82
60 0.84
61 0.86
62 0.88
63 0.89
64 0.91
65 0.9
66 0.88
67 0.84
68 0.82
69 0.71
70 0.61
71 0.51
72 0.41
73 0.32
74 0.24
75 0.18
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.22
83 0.26
84 0.27
85 0.27
86 0.28
87 0.2
88 0.23
89 0.24
90 0.2
91 0.15
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.09
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.12
115 0.15
116 0.15
117 0.16
118 0.17
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.14
123 0.11
124 0.14
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.16
134 0.18
135 0.17
136 0.19
137 0.21
138 0.18
139 0.17
140 0.14
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.17
148 0.18
149 0.19
150 0.17
151 0.17
152 0.24
153 0.26
154 0.29
155 0.26
156 0.29
157 0.31
158 0.37
159 0.42
160 0.43
161 0.43
162 0.44
163 0.44
164 0.4
165 0.39
166 0.35
167 0.31
168 0.22
169 0.2
170 0.16
171 0.18
172 0.19
173 0.23
174 0.29
175 0.32
176 0.38
177 0.38
178 0.39
179 0.37
180 0.41
181 0.43
182 0.42
183 0.4
184 0.36
185 0.37
186 0.36
187 0.33
188 0.29
189 0.21
190 0.17
191 0.2
192 0.24
193 0.21
194 0.22
195 0.22
196 0.24
197 0.26
198 0.28
199 0.24
200 0.19
201 0.19
202 0.24
203 0.28
204 0.27
205 0.27
206 0.25
207 0.28
208 0.3
209 0.3
210 0.25
211 0.22
212 0.22
213 0.23
214 0.23
215 0.22
216 0.21
217 0.23
218 0.28
219 0.3
220 0.32
221 0.29
222 0.33
223 0.3
224 0.34
225 0.33
226 0.31
227 0.3
228 0.27
229 0.26
230 0.22
231 0.2
232 0.15
233 0.13
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.11
242 0.14
243 0.16
244 0.18
245 0.27
246 0.3
247 0.34
248 0.37
249 0.41
250 0.43
251 0.49
252 0.51
253 0.46
254 0.43
255 0.38
256 0.35
257 0.3
258 0.29
259 0.25
260 0.23
261 0.24
262 0.24
263 0.25
264 0.24
265 0.24
266 0.27
267 0.25
268 0.27
269 0.28
270 0.29
271 0.27
272 0.26
273 0.24
274 0.19
275 0.22
276 0.18
277 0.16
278 0.16
279 0.21
280 0.24
281 0.26
282 0.28
283 0.25
284 0.3
285 0.35