Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397IUA4

Protein Details
Accession A0A397IUA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-161RETFIYRKKICPKPKRERKRKTWLIVSVDQINKNRTKSKKKSKPTPGNPISPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-130RKKICPKPKRERKRK
142-153KNRTKSKKKSKP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.5, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
Amino Acid Sequences MNEQTRSSLVFINSNDSNLKMKNHVVNDIQQLSQLPFPPTIKPSELISFAEGSSIPARAPNAFIIYRKLFIQNSKNNGYTFPMTVISTMASKCWKLEPDNVKKEYKRIARETFIYRKKICPKPKRERKRKTWLIVSVDQINKNRTKSKKKSKPTPGNPISPSTFVNSEKEHIITSQSQPSNIVTNSTTEYVQQQNQQSTLTTESRLESLISDLDLFKERTDVYDSRNESSNNSFGSNLEFNFFPIQNENLNNLPNENQSGIDIFDSRNLNTPYFNVATFPNEPFINQNNQNNNNPLIFFSSLYNPVGNKELNDNNSFNNNFFYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.26
4 0.28
5 0.25
6 0.28
7 0.26
8 0.31
9 0.36
10 0.38
11 0.41
12 0.41
13 0.43
14 0.48
15 0.46
16 0.4
17 0.34
18 0.33
19 0.29
20 0.29
21 0.27
22 0.21
23 0.23
24 0.24
25 0.27
26 0.28
27 0.31
28 0.3
29 0.28
30 0.29
31 0.29
32 0.3
33 0.27
34 0.27
35 0.23
36 0.2
37 0.2
38 0.16
39 0.15
40 0.13
41 0.12
42 0.1
43 0.11
44 0.13
45 0.12
46 0.14
47 0.13
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.24
52 0.25
53 0.25
54 0.25
55 0.27
56 0.26
57 0.31
58 0.39
59 0.41
60 0.46
61 0.49
62 0.5
63 0.46
64 0.45
65 0.42
66 0.35
67 0.28
68 0.23
69 0.19
70 0.17
71 0.16
72 0.15
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.16
81 0.19
82 0.2
83 0.29
84 0.38
85 0.46
86 0.55
87 0.58
88 0.61
89 0.58
90 0.6
91 0.6
92 0.57
93 0.54
94 0.53
95 0.54
96 0.51
97 0.55
98 0.58
99 0.59
100 0.58
101 0.57
102 0.51
103 0.54
104 0.6
105 0.65
106 0.68
107 0.68
108 0.72
109 0.77
110 0.86
111 0.9
112 0.92
113 0.93
114 0.93
115 0.94
116 0.92
117 0.88
118 0.85
119 0.81
120 0.76
121 0.69
122 0.61
123 0.56
124 0.49
125 0.45
126 0.39
127 0.35
128 0.32
129 0.32
130 0.37
131 0.38
132 0.47
133 0.54
134 0.63
135 0.69
136 0.76
137 0.84
138 0.87
139 0.9
140 0.88
141 0.89
142 0.82
143 0.79
144 0.71
145 0.64
146 0.54
147 0.44
148 0.37
149 0.27
150 0.24
151 0.18
152 0.19
153 0.16
154 0.16
155 0.15
156 0.15
157 0.13
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.2
163 0.2
164 0.19
165 0.2
166 0.2
167 0.21
168 0.19
169 0.18
170 0.11
171 0.12
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.14
177 0.15
178 0.17
179 0.2
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.23
184 0.2
185 0.19
186 0.21
187 0.17
188 0.15
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.17
208 0.17
209 0.19
210 0.26
211 0.28
212 0.28
213 0.32
214 0.31
215 0.28
216 0.31
217 0.3
218 0.23
219 0.22
220 0.21
221 0.17
222 0.21
223 0.2
224 0.17
225 0.16
226 0.14
227 0.15
228 0.18
229 0.18
230 0.14
231 0.15
232 0.16
233 0.18
234 0.2
235 0.21
236 0.2
237 0.21
238 0.2
239 0.19
240 0.19
241 0.17
242 0.18
243 0.16
244 0.14
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.14
252 0.16
253 0.16
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.25
259 0.25
260 0.25
261 0.25
262 0.18
263 0.17
264 0.22
265 0.24
266 0.24
267 0.21
268 0.2
269 0.2
270 0.24
271 0.27
272 0.3
273 0.34
274 0.41
275 0.47
276 0.53
277 0.57
278 0.56
279 0.55
280 0.48
281 0.41
282 0.35
283 0.3
284 0.25
285 0.21
286 0.2
287 0.22
288 0.23
289 0.24
290 0.25
291 0.21
292 0.22
293 0.25
294 0.23
295 0.2
296 0.25
297 0.3
298 0.34
299 0.38
300 0.38
301 0.37
302 0.44
303 0.44
304 0.37