Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GG16

Protein Details
Accession A0A397GG16    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-100EIKKHSRKEGPSKRVNKHRPMEBasic
184-206AYEKELKRKKQLKGERKKAELERBasic
234-269QKKNPKAIDKVIEKRRKRNAAKEHKRMPFKRQKIDKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-107KKHSRKEGPSKRVNKHRPMEMSSKKPV
186-269EKELKRKKQLKGERKKAELERVVKGKNPFYIKKSDEKKLELIDKFDKLQKKNPKAIDKVIEKRRKRNAAKEHKRMPFKRQKIDK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MDSSSSKNLGRIKNVDSSSKNLGRIKNVDSRSNAEEKSEFVSDSSDSSNSEDTSDASSSGEEEHENSSEEENSSEEQEEIKKHSRKEGPSKRVNKHRPMEMSSKKPVGRFRQVVEVVSPKKRDPRFGDLSGKLNEDLFEKSYSFLNEYKLSEIEEIQKQIKEEKNPIKKQNLQKLLSKSQSKLAYEKELKRKKQLKGERKKAELERVVKGKNPFYIKKSDEKKLELIDKFDKLQKKNPKAIDKVIEKRRKRNAAKEHKRMPFKRQKIDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.54
3 0.49
4 0.49
5 0.5
6 0.5
7 0.52
8 0.49
9 0.51
10 0.51
11 0.52
12 0.53
13 0.53
14 0.52
15 0.52
16 0.5
17 0.52
18 0.49
19 0.5
20 0.44
21 0.39
22 0.35
23 0.31
24 0.31
25 0.27
26 0.22
27 0.17
28 0.18
29 0.15
30 0.16
31 0.17
32 0.13
33 0.13
34 0.15
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.1
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.13
65 0.14
66 0.18
67 0.26
68 0.29
69 0.3
70 0.39
71 0.44
72 0.5
73 0.6
74 0.65
75 0.66
76 0.71
77 0.8
78 0.8
79 0.84
80 0.85
81 0.83
82 0.78
83 0.75
84 0.7
85 0.66
86 0.67
87 0.64
88 0.61
89 0.56
90 0.56
91 0.51
92 0.5
93 0.52
94 0.49
95 0.51
96 0.48
97 0.45
98 0.47
99 0.46
100 0.43
101 0.38
102 0.37
103 0.32
104 0.33
105 0.33
106 0.26
107 0.33
108 0.34
109 0.39
110 0.39
111 0.43
112 0.46
113 0.49
114 0.54
115 0.48
116 0.5
117 0.44
118 0.39
119 0.3
120 0.24
121 0.2
122 0.14
123 0.13
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.14
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.16
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.14
142 0.16
143 0.16
144 0.17
145 0.17
146 0.22
147 0.25
148 0.25
149 0.32
150 0.4
151 0.48
152 0.55
153 0.61
154 0.63
155 0.67
156 0.73
157 0.74
158 0.73
159 0.66
160 0.65
161 0.66
162 0.65
163 0.64
164 0.59
165 0.5
166 0.47
167 0.49
168 0.44
169 0.41
170 0.37
171 0.39
172 0.43
173 0.5
174 0.54
175 0.59
176 0.61
177 0.68
178 0.73
179 0.7
180 0.73
181 0.76
182 0.76
183 0.79
184 0.86
185 0.84
186 0.8
187 0.81
188 0.76
189 0.74
190 0.71
191 0.65
192 0.61
193 0.58
194 0.55
195 0.52
196 0.51
197 0.46
198 0.44
199 0.47
200 0.45
201 0.42
202 0.5
203 0.48
204 0.54
205 0.57
206 0.59
207 0.58
208 0.57
209 0.57
210 0.55
211 0.6
212 0.52
213 0.51
214 0.48
215 0.45
216 0.44
217 0.45
218 0.46
219 0.42
220 0.5
221 0.55
222 0.59
223 0.65
224 0.71
225 0.74
226 0.73
227 0.77
228 0.76
229 0.75
230 0.76
231 0.78
232 0.79
233 0.77
234 0.81
235 0.83
236 0.85
237 0.84
238 0.84
239 0.85
240 0.86
241 0.9
242 0.91
243 0.91
244 0.89
245 0.91
246 0.86
247 0.85
248 0.85
249 0.84