Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JQA6

Protein Details
Accession A0A397JQA6    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-42VAWRARFVKKYCNTRWKNKWMRELENNHQRQHydrophilic
108-127VNEIEPRKQKDKKKVVESSDHydrophilic
132-159EEEKERKPKKTILKKKKKETKVTFDPAHBasic
326-351IKTEITPKKKSKKKEVIKMVKGNKEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-150KERKPKKTILKKKKKE
332-366PKKKSKKKEVIKMVKGNKEKKAFFEALRKPKKKEI
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MEIVANDMADWVAWRARFVKKYCNTRWKNKWMRELENNHQRQGETIDAYYARFKRLVKRVEINVNQHKRLFIKGLLPHIAPLITMQTSGTLAAALELAQAYEEGLDMVNEIEPRKQKDKKKVVESSDEEEEEEEKERKPKKTILKKKKKETKVTFDPAHNLNDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYCNRGNNRDNSSQNNWNNRNNRNNQNNNRETHTCFKYGKEGHISWDCPARKNNSDNFAHAKLVEIEEESEKEEDKLLQHFLDAYDAYLGKRERDDSSDEDIPIKRPRETNIPEPKPNLNTFGLPKTTNVSVPKVIKTEITPKKKSKKKEVIKMVKGNKEKKAFFEALRKPKKKEIKLADQEYSLKTTALKCNVAVGVYTVPTIVDSGAAISIITCDIMEQLGYEIEEASKSIILPVTGKKTQPLGVICDLPITIQGQTIPIDVEETKEEFSELIENTDEESINKSDIETEEFEEDDEEIIFKTTTVEKHDDKSDEDTVPVFLSEKLNKNELDIGQLNNHQLQKFDKLIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.18
3 0.27
4 0.35
5 0.38
6 0.46
7 0.52
8 0.63
9 0.71
10 0.77
11 0.78
12 0.81
13 0.88
14 0.88
15 0.9
16 0.88
17 0.88
18 0.86
19 0.86
20 0.85
21 0.84
22 0.83
23 0.83
24 0.78
25 0.71
26 0.65
27 0.56
28 0.47
29 0.43
30 0.37
31 0.29
32 0.26
33 0.26
34 0.24
35 0.25
36 0.31
37 0.28
38 0.26
39 0.27
40 0.3
41 0.36
42 0.45
43 0.51
44 0.51
45 0.58
46 0.63
47 0.69
48 0.73
49 0.73
50 0.75
51 0.75
52 0.71
53 0.64
54 0.6
55 0.52
56 0.49
57 0.43
58 0.36
59 0.36
60 0.37
61 0.41
62 0.42
63 0.4
64 0.36
65 0.33
66 0.29
67 0.21
68 0.17
69 0.14
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.13
99 0.18
100 0.24
101 0.33
102 0.41
103 0.49
104 0.59
105 0.69
106 0.73
107 0.79
108 0.81
109 0.78
110 0.79
111 0.75
112 0.7
113 0.63
114 0.54
115 0.44
116 0.36
117 0.31
118 0.23
119 0.21
120 0.17
121 0.15
122 0.22
123 0.29
124 0.33
125 0.37
126 0.44
127 0.51
128 0.61
129 0.7
130 0.74
131 0.79
132 0.85
133 0.91
134 0.93
135 0.92
136 0.92
137 0.91
138 0.89
139 0.88
140 0.86
141 0.8
142 0.72
143 0.67
144 0.58
145 0.51
146 0.41
147 0.31
148 0.26
149 0.27
150 0.24
151 0.25
152 0.23
153 0.22
154 0.24
155 0.3
156 0.33
157 0.29
158 0.36
159 0.39
160 0.44
161 0.46
162 0.45
163 0.4
164 0.34
165 0.34
166 0.28
167 0.2
168 0.17
169 0.16
170 0.17
171 0.22
172 0.28
173 0.32
174 0.33
175 0.35
176 0.39
177 0.41
178 0.45
179 0.4
180 0.38
181 0.36
182 0.43
183 0.46
184 0.46
185 0.49
186 0.5
187 0.51
188 0.53
189 0.55
190 0.54
191 0.55
192 0.59
193 0.57
194 0.58
195 0.62
196 0.63
197 0.67
198 0.65
199 0.69
200 0.69
201 0.74
202 0.76
203 0.79
204 0.77
205 0.69
206 0.67
207 0.6
208 0.54
209 0.51
210 0.45
211 0.39
212 0.35
213 0.34
214 0.37
215 0.36
216 0.35
217 0.34
218 0.31
219 0.32
220 0.35
221 0.35
222 0.27
223 0.33
224 0.31
225 0.27
226 0.3
227 0.31
228 0.32
229 0.36
230 0.4
231 0.39
232 0.39
233 0.39
234 0.41
235 0.37
236 0.32
237 0.27
238 0.23
239 0.17
240 0.16
241 0.13
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.13
271 0.15
272 0.19
273 0.19
274 0.24
275 0.26
276 0.25
277 0.25
278 0.25
279 0.26
280 0.28
281 0.25
282 0.22
283 0.22
284 0.24
285 0.31
286 0.35
287 0.42
288 0.48
289 0.52
290 0.52
291 0.54
292 0.55
293 0.49
294 0.46
295 0.4
296 0.3
297 0.26
298 0.26
299 0.26
300 0.25
301 0.21
302 0.21
303 0.19
304 0.19
305 0.2
306 0.2
307 0.2
308 0.22
309 0.24
310 0.26
311 0.24
312 0.24
313 0.21
314 0.21
315 0.29
316 0.34
317 0.4
318 0.45
319 0.52
320 0.62
321 0.68
322 0.74
323 0.74
324 0.76
325 0.77
326 0.8
327 0.83
328 0.84
329 0.86
330 0.87
331 0.84
332 0.81
333 0.79
334 0.75
335 0.72
336 0.69
337 0.61
338 0.55
339 0.55
340 0.49
341 0.45
342 0.49
343 0.5
344 0.54
345 0.63
346 0.64
347 0.61
348 0.67
349 0.73
350 0.7
351 0.71
352 0.69
353 0.69
354 0.74
355 0.76
356 0.69
357 0.62
358 0.57
359 0.49
360 0.42
361 0.31
362 0.22
363 0.18
364 0.2
365 0.24
366 0.26
367 0.25
368 0.23
369 0.25
370 0.25
371 0.23
372 0.19
373 0.15
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.03
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.11
413 0.15
414 0.21
415 0.24
416 0.25
417 0.26
418 0.28
419 0.31
420 0.33
421 0.31
422 0.3
423 0.3
424 0.31
425 0.28
426 0.26
427 0.23
428 0.17
429 0.16
430 0.12
431 0.09
432 0.08
433 0.09
434 0.09
435 0.1
436 0.11
437 0.1
438 0.08
439 0.11
440 0.1
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.14
445 0.13
446 0.14
447 0.11
448 0.12
449 0.14
450 0.12
451 0.13
452 0.13
453 0.13
454 0.14
455 0.15
456 0.15
457 0.11
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.14
462 0.13
463 0.14
464 0.16
465 0.19
466 0.17
467 0.19
468 0.19
469 0.2
470 0.2
471 0.17
472 0.16
473 0.12
474 0.1
475 0.08
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.1
481 0.13
482 0.16
483 0.22
484 0.28
485 0.3
486 0.35
487 0.41
488 0.41
489 0.4
490 0.43
491 0.42
492 0.37
493 0.35
494 0.31
495 0.25
496 0.23
497 0.21
498 0.16
499 0.13
500 0.18
501 0.24
502 0.31
503 0.34
504 0.38
505 0.38
506 0.39
507 0.43
508 0.38
509 0.38
510 0.33
511 0.32
512 0.32
513 0.35
514 0.36
515 0.35
516 0.39
517 0.32
518 0.32
519 0.33
520 0.36