Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JRK2

Protein Details
Accession A0A397JRK2    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-155QPDDNKRFSKKESKKSKPPPILPPLEDHydrophilic
213-233PLPNHDRTKPRRRSEDHAGLRBasic
670-692VTSESEKKSKKKSTRFWPVKGAPHydrophilic
890-909AYLYYRKDKNTRKIEVCEKLHydrophilic
933-952STNNHYSKPQNQQNQGHNVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-146FSKKESKKSKP
193-199SPKRGKG
677-681KSKKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006607  DM15  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MVSPTIAQPDSSLAGSSVSNVNLIKPTSAKLITTETEINRSITIRSPVPESPKEQINNNEEFEEHSQENEQPPKKIIPPPAPIPSVNVWQVRMNAKKVTEVTFNSNDKEKEVVNNNKKIETREIDQKEQPDDNKRFSKKESKKSKPPPILPPLEDQTSWPAPAEVLIKDKEKEHVDSSEKKQPNDNGTKKEESPKRGKGKWIPYTPIITHNTPLPNHDRTKPRRRSEDHAGLREHKSSEKVINTETVTHTVPNNNNPNRRRASVPTPTREHNRRYSQSGDNHIGHHSNGGSSYRGGRRGGRGRSYNGTRGPPRSASAPYTSGYVQQYNNMYGTKIGVVYDIEILKYYILQQIEYYFSIDNLCKDIFLRNNMDMEGYVPIALLAGFNRVKALTMDLDLVREALLNSYIVEVNEDKVRKREGWDFWLLPKQYDTVEQQVMEDFNNSGQTTTTITDAVNNLPQSPQNMLSLQSEQTRQYETQNYISLDEDKENREMPIIPEGSSENGSPVSNPWIVQTKKRRTSSSPTNKLSREIPKQVISNNDEELFQFDEDWTGDSRNNTVQKYYATSEEEDEDDDEFDDDTVASILIVTQKKKDKSHVQFERKAMNDEIGEMINEGLYHYEHDIHKQKCSGGLIGTKKVDIVSEEQFASIVSSAKSKDGLSGANISNKTVTSESEKKSKKKSTRFWPVKGAPQGHNSNSKNNHKNVPDTRQYFAQDAVGWVLGDQPYHPPEGSSPVNSPLSHSNGVTHNCSDQLSSSVDLARSFPSFQHPSHELLRENGFIQHKYYKYHAKALKERKRQGVGQSQEMNTLFRFWSHFLREHFNKRMYSEFKKLAVEDSTANYRYGLECLFRFYSYGLEKKYRQDLFDDFQELTLNDYENGYLYGLEKFWAYLYYRKDKNTRKIEVCEKLNQCVEKYKNIEDFRIAHKPSHAHSTNNHYSKPQNQQNQGHNVTSSSTSNNELPTSSSLGNSSHPVASVENFPPLTVTASR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.15
4 0.14
5 0.13
6 0.15
7 0.14
8 0.16
9 0.18
10 0.19
11 0.2
12 0.18
13 0.2
14 0.24
15 0.25
16 0.24
17 0.23
18 0.28
19 0.27
20 0.3
21 0.34
22 0.3
23 0.33
24 0.34
25 0.32
26 0.28
27 0.28
28 0.26
29 0.25
30 0.28
31 0.26
32 0.27
33 0.31
34 0.34
35 0.41
36 0.44
37 0.44
38 0.44
39 0.49
40 0.5
41 0.51
42 0.55
43 0.53
44 0.53
45 0.49
46 0.45
47 0.37
48 0.39
49 0.37
50 0.33
51 0.27
52 0.24
53 0.24
54 0.27
55 0.34
56 0.38
57 0.39
58 0.36
59 0.39
60 0.43
61 0.47
62 0.51
63 0.53
64 0.53
65 0.56
66 0.6
67 0.64
68 0.62
69 0.56
70 0.53
71 0.48
72 0.44
73 0.43
74 0.38
75 0.33
76 0.33
77 0.38
78 0.41
79 0.43
80 0.41
81 0.41
82 0.39
83 0.43
84 0.43
85 0.42
86 0.4
87 0.38
88 0.41
89 0.44
90 0.46
91 0.43
92 0.46
93 0.43
94 0.38
95 0.37
96 0.3
97 0.3
98 0.38
99 0.46
100 0.49
101 0.56
102 0.57
103 0.6
104 0.61
105 0.58
106 0.56
107 0.51
108 0.47
109 0.5
110 0.54
111 0.54
112 0.56
113 0.57
114 0.54
115 0.54
116 0.54
117 0.54
118 0.53
119 0.54
120 0.6
121 0.6
122 0.59
123 0.61
124 0.67
125 0.67
126 0.72
127 0.75
128 0.76
129 0.82
130 0.88
131 0.92
132 0.91
133 0.89
134 0.88
135 0.87
136 0.84
137 0.76
138 0.71
139 0.65
140 0.57
141 0.5
142 0.41
143 0.38
144 0.32
145 0.3
146 0.24
147 0.2
148 0.16
149 0.18
150 0.19
151 0.14
152 0.16
153 0.19
154 0.21
155 0.23
156 0.24
157 0.28
158 0.29
159 0.31
160 0.3
161 0.34
162 0.37
163 0.44
164 0.49
165 0.53
166 0.54
167 0.51
168 0.55
169 0.54
170 0.58
171 0.61
172 0.62
173 0.59
174 0.62
175 0.65
176 0.62
177 0.66
178 0.63
179 0.61
180 0.63
181 0.65
182 0.68
183 0.67
184 0.73
185 0.73
186 0.76
187 0.77
188 0.74
189 0.7
190 0.64
191 0.65
192 0.58
193 0.56
194 0.5
195 0.42
196 0.36
197 0.36
198 0.37
199 0.32
200 0.35
201 0.33
202 0.35
203 0.38
204 0.44
205 0.49
206 0.54
207 0.65
208 0.7
209 0.73
210 0.77
211 0.79
212 0.8
213 0.8
214 0.81
215 0.79
216 0.75
217 0.7
218 0.65
219 0.62
220 0.57
221 0.48
222 0.4
223 0.34
224 0.31
225 0.32
226 0.31
227 0.31
228 0.29
229 0.31
230 0.3
231 0.3
232 0.28
233 0.25
234 0.21
235 0.2
236 0.21
237 0.23
238 0.25
239 0.31
240 0.39
241 0.43
242 0.52
243 0.53
244 0.6
245 0.58
246 0.58
247 0.54
248 0.51
249 0.53
250 0.54
251 0.6
252 0.59
253 0.59
254 0.61
255 0.66
256 0.66
257 0.63
258 0.62
259 0.63
260 0.6
261 0.61
262 0.61
263 0.6
264 0.59
265 0.6
266 0.57
267 0.48
268 0.45
269 0.42
270 0.38
271 0.3
272 0.26
273 0.19
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.17
280 0.19
281 0.22
282 0.24
283 0.26
284 0.33
285 0.41
286 0.47
287 0.48
288 0.49
289 0.5
290 0.56
291 0.57
292 0.55
293 0.51
294 0.51
295 0.48
296 0.48
297 0.47
298 0.41
299 0.38
300 0.35
301 0.33
302 0.29
303 0.28
304 0.27
305 0.23
306 0.23
307 0.22
308 0.23
309 0.22
310 0.22
311 0.19
312 0.2
313 0.22
314 0.21
315 0.22
316 0.18
317 0.16
318 0.13
319 0.14
320 0.11
321 0.09
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.1
343 0.1
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.15
352 0.16
353 0.19
354 0.22
355 0.21
356 0.22
357 0.22
358 0.22
359 0.17
360 0.15
361 0.12
362 0.08
363 0.07
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.03
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.11
378 0.07
379 0.08
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.15
402 0.18
403 0.18
404 0.21
405 0.27
406 0.27
407 0.31
408 0.36
409 0.34
410 0.34
411 0.4
412 0.36
413 0.29
414 0.26
415 0.21
416 0.17
417 0.19
418 0.18
419 0.16
420 0.17
421 0.16
422 0.16
423 0.16
424 0.16
425 0.13
426 0.11
427 0.07
428 0.06
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.11
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.15
460 0.16
461 0.15
462 0.17
463 0.2
464 0.2
465 0.22
466 0.23
467 0.23
468 0.21
469 0.21
470 0.2
471 0.16
472 0.16
473 0.15
474 0.13
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.12
479 0.12
480 0.11
481 0.15
482 0.14
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.14
487 0.14
488 0.13
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.07
493 0.08
494 0.1
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.17
499 0.19
500 0.26
501 0.36
502 0.42
503 0.5
504 0.54
505 0.56
506 0.54
507 0.61
508 0.65
509 0.66
510 0.66
511 0.62
512 0.64
513 0.61
514 0.58
515 0.55
516 0.51
517 0.47
518 0.42
519 0.42
520 0.39
521 0.4
522 0.39
523 0.39
524 0.34
525 0.3
526 0.25
527 0.22
528 0.2
529 0.18
530 0.18
531 0.13
532 0.11
533 0.09
534 0.07
535 0.08
536 0.08
537 0.09
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.09
542 0.1
543 0.14
544 0.18
545 0.17
546 0.18
547 0.18
548 0.18
549 0.21
550 0.21
551 0.19
552 0.17
553 0.17
554 0.18
555 0.17
556 0.16
557 0.14
558 0.13
559 0.1
560 0.09
561 0.08
562 0.07
563 0.06
564 0.06
565 0.05
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.03
571 0.03
572 0.03
573 0.09
574 0.11
575 0.12
576 0.17
577 0.24
578 0.29
579 0.31
580 0.38
581 0.44
582 0.5
583 0.6
584 0.65
585 0.68
586 0.7
587 0.71
588 0.71
589 0.61
590 0.57
591 0.46
592 0.37
593 0.28
594 0.22
595 0.2
596 0.13
597 0.12
598 0.08
599 0.08
600 0.06
601 0.05
602 0.05
603 0.04
604 0.04
605 0.05
606 0.05
607 0.1
608 0.1
609 0.16
610 0.25
611 0.26
612 0.28
613 0.29
614 0.29
615 0.28
616 0.3
617 0.25
618 0.19
619 0.24
620 0.25
621 0.28
622 0.27
623 0.24
624 0.23
625 0.22
626 0.19
627 0.14
628 0.14
629 0.13
630 0.14
631 0.14
632 0.14
633 0.14
634 0.13
635 0.12
636 0.09
637 0.08
638 0.06
639 0.08
640 0.09
641 0.1
642 0.11
643 0.11
644 0.12
645 0.12
646 0.13
647 0.12
648 0.17
649 0.18
650 0.22
651 0.22
652 0.2
653 0.2
654 0.19
655 0.19
656 0.15
657 0.15
658 0.18
659 0.25
660 0.28
661 0.36
662 0.43
663 0.47
664 0.56
665 0.64
666 0.66
667 0.69
668 0.76
669 0.77
670 0.82
671 0.85
672 0.81
673 0.81
674 0.76
675 0.74
676 0.71
677 0.65
678 0.57
679 0.56
680 0.56
681 0.49
682 0.54
683 0.47
684 0.48
685 0.52
686 0.58
687 0.58
688 0.57
689 0.61
690 0.54
691 0.62
692 0.61
693 0.6
694 0.6
695 0.55
696 0.54
697 0.51
698 0.5
699 0.42
700 0.36
701 0.29
702 0.2
703 0.18
704 0.16
705 0.12
706 0.1
707 0.09
708 0.1
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.11
713 0.12
714 0.14
715 0.14
716 0.12
717 0.13
718 0.19
719 0.21
720 0.19
721 0.2
722 0.23
723 0.26
724 0.25
725 0.27
726 0.26
727 0.29
728 0.28
729 0.26
730 0.25
731 0.27
732 0.3
733 0.3
734 0.27
735 0.22
736 0.22
737 0.22
738 0.19
739 0.15
740 0.15
741 0.14
742 0.13
743 0.14
744 0.14
745 0.15
746 0.15
747 0.15
748 0.14
749 0.14
750 0.14
751 0.14
752 0.2
753 0.23
754 0.23
755 0.28
756 0.29
757 0.32
758 0.36
759 0.39
760 0.32
761 0.32
762 0.34
763 0.29
764 0.27
765 0.29
766 0.27
767 0.24
768 0.26
769 0.3
770 0.29
771 0.31
772 0.36
773 0.4
774 0.41
775 0.49
776 0.5
777 0.53
778 0.61
779 0.69
780 0.74
781 0.74
782 0.78
783 0.78
784 0.79
785 0.74
786 0.73
787 0.72
788 0.66
789 0.63
790 0.62
791 0.54
792 0.52
793 0.48
794 0.41
795 0.31
796 0.28
797 0.2
798 0.15
799 0.18
800 0.16
801 0.22
802 0.25
803 0.31
804 0.32
805 0.41
806 0.48
807 0.54
808 0.58
809 0.57
810 0.55
811 0.52
812 0.57
813 0.55
814 0.55
815 0.54
816 0.52
817 0.49
818 0.5
819 0.48
820 0.43
821 0.38
822 0.33
823 0.26
824 0.25
825 0.28
826 0.26
827 0.26
828 0.22
829 0.21
830 0.2
831 0.2
832 0.18
833 0.15
834 0.14
835 0.19
836 0.21
837 0.2
838 0.2
839 0.19
840 0.23
841 0.25
842 0.31
843 0.3
844 0.35
845 0.38
846 0.44
847 0.53
848 0.5
849 0.46
850 0.45
851 0.46
852 0.44
853 0.46
854 0.42
855 0.33
856 0.3
857 0.31
858 0.26
859 0.23
860 0.19
861 0.15
862 0.13
863 0.13
864 0.12
865 0.11
866 0.12
867 0.09
868 0.08
869 0.09
870 0.1
871 0.09
872 0.1
873 0.09
874 0.09
875 0.09
876 0.12
877 0.13
878 0.18
879 0.26
880 0.35
881 0.4
882 0.46
883 0.55
884 0.62
885 0.7
886 0.74
887 0.76
888 0.74
889 0.78
890 0.81
891 0.8
892 0.75
893 0.75
894 0.68
895 0.65
896 0.63
897 0.57
898 0.5
899 0.51
900 0.49
901 0.48
902 0.5
903 0.5
904 0.54
905 0.54
906 0.54
907 0.5
908 0.5
909 0.48
910 0.53
911 0.47
912 0.41
913 0.43
914 0.44
915 0.43
916 0.49
917 0.45
918 0.39
919 0.43
920 0.51
921 0.56
922 0.57
923 0.55
924 0.49
925 0.52
926 0.56
927 0.62
928 0.61
929 0.61
930 0.65
931 0.72
932 0.77
933 0.81
934 0.77
935 0.68
936 0.59
937 0.5
938 0.43
939 0.37
940 0.31
941 0.24
942 0.21
943 0.23
944 0.25
945 0.26
946 0.25
947 0.22
948 0.23
949 0.23
950 0.26
951 0.23
952 0.21
953 0.21
954 0.21
955 0.23
956 0.23
957 0.23
958 0.19
959 0.19
960 0.2
961 0.2
962 0.21
963 0.24
964 0.23
965 0.26
966 0.25
967 0.24
968 0.24
969 0.23