Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HJH2

Protein Details
Accession A0A397HJH2    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-156IYGLVSRNPKKRKKGTNNNDNNKPNGHydrophilic
349-374AIKRFMIDNKRKKAKNLKNPNVLQTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-144PKKRKK
359-361RKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00075  RNase_H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50879  RNASE_H_1  
Amino Acid Sequences MGEKGITLKKTKIEELPQAPGGGSYDLKSFMENREWYNRNRDNFRCRGVMFLEQLMNASLTQCIPWQQVKGRPSKGVQPKWYNEVVDEYNKRKEELRFQDKINPFNTLRKIGANEIKRFQTIVTKKESDLIYGLVSRNPKKRKKGTNNNDNNKPNGRREETPSLVIQHLIQETIEGEIRSPLIPCEECELKDTTPLRDSRIVLKNEAKKCLIRTDINQIRKSINQQVDTSVYATHKNLLVQEVSTGKKINDLKAELSQYAQIVFYTDGSLLKNQEQENQKEKRREDKMGIGLAISPEGYDERILDFSARITGPASSSRAELWAILMALEIAPSNTKIKIYTDSASAIAAIKRFMIDNKRKKAKNLKNPNVLQTISDKCNGKRIIFELNKVEAHTGIFLNEKADSLVKEGANSNSWIKINPEFLQRRVNFEWENQSIDTDINIRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.56
3 0.58
4 0.54
5 0.49
6 0.44
7 0.37
8 0.31
9 0.24
10 0.19
11 0.14
12 0.14
13 0.15
14 0.16
15 0.17
16 0.17
17 0.2
18 0.27
19 0.29
20 0.32
21 0.4
22 0.44
23 0.47
24 0.55
25 0.58
26 0.58
27 0.65
28 0.68
29 0.68
30 0.71
31 0.72
32 0.67
33 0.6
34 0.56
35 0.51
36 0.48
37 0.41
38 0.37
39 0.33
40 0.27
41 0.28
42 0.23
43 0.2
44 0.14
45 0.12
46 0.09
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.12
51 0.15
52 0.19
53 0.23
54 0.29
55 0.36
56 0.42
57 0.5
58 0.52
59 0.53
60 0.53
61 0.57
62 0.62
63 0.63
64 0.66
65 0.66
66 0.65
67 0.66
68 0.67
69 0.58
70 0.48
71 0.44
72 0.38
73 0.37
74 0.4
75 0.38
76 0.42
77 0.42
78 0.43
79 0.42
80 0.44
81 0.46
82 0.51
83 0.55
84 0.52
85 0.54
86 0.62
87 0.61
88 0.62
89 0.53
90 0.48
91 0.41
92 0.44
93 0.46
94 0.4
95 0.37
96 0.35
97 0.36
98 0.36
99 0.42
100 0.42
101 0.42
102 0.43
103 0.43
104 0.4
105 0.38
106 0.32
107 0.35
108 0.32
109 0.32
110 0.35
111 0.35
112 0.35
113 0.4
114 0.4
115 0.31
116 0.27
117 0.23
118 0.17
119 0.17
120 0.18
121 0.15
122 0.2
123 0.25
124 0.32
125 0.41
126 0.48
127 0.56
128 0.65
129 0.74
130 0.8
131 0.86
132 0.88
133 0.9
134 0.92
135 0.91
136 0.91
137 0.83
138 0.76
139 0.73
140 0.66
141 0.61
142 0.58
143 0.54
144 0.47
145 0.52
146 0.55
147 0.49
148 0.47
149 0.42
150 0.37
151 0.32
152 0.29
153 0.21
154 0.16
155 0.14
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.17
176 0.19
177 0.16
178 0.22
179 0.22
180 0.2
181 0.23
182 0.24
183 0.25
184 0.26
185 0.27
186 0.3
187 0.36
188 0.36
189 0.35
190 0.41
191 0.45
192 0.45
193 0.47
194 0.4
195 0.34
196 0.35
197 0.35
198 0.33
199 0.27
200 0.26
201 0.34
202 0.39
203 0.44
204 0.44
205 0.41
206 0.39
207 0.38
208 0.39
209 0.36
210 0.33
211 0.29
212 0.28
213 0.28
214 0.28
215 0.27
216 0.23
217 0.17
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.09
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.17
235 0.19
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.24
240 0.26
241 0.28
242 0.22
243 0.21
244 0.19
245 0.15
246 0.13
247 0.11
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.1
257 0.1
258 0.12
259 0.16
260 0.15
261 0.22
262 0.26
263 0.31
264 0.38
265 0.44
266 0.49
267 0.52
268 0.55
269 0.58
270 0.58
271 0.58
272 0.54
273 0.54
274 0.52
275 0.47
276 0.45
277 0.35
278 0.3
279 0.25
280 0.2
281 0.12
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.11
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.11
300 0.13
301 0.15
302 0.13
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.12
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.13
325 0.17
326 0.21
327 0.21
328 0.21
329 0.22
330 0.22
331 0.21
332 0.19
333 0.16
334 0.14
335 0.13
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.15
341 0.24
342 0.33
343 0.43
344 0.53
345 0.63
346 0.65
347 0.73
348 0.8
349 0.8
350 0.81
351 0.82
352 0.82
353 0.83
354 0.84
355 0.82
356 0.75
357 0.65
358 0.55
359 0.5
360 0.45
361 0.38
362 0.39
363 0.36
364 0.32
365 0.41
366 0.42
367 0.37
368 0.36
369 0.36
370 0.41
371 0.4
372 0.45
373 0.42
374 0.43
375 0.42
376 0.39
377 0.37
378 0.27
379 0.24
380 0.21
381 0.16
382 0.13
383 0.14
384 0.13
385 0.14
386 0.13
387 0.13
388 0.12
389 0.14
390 0.13
391 0.15
392 0.2
393 0.19
394 0.21
395 0.23
396 0.25
397 0.25
398 0.27
399 0.26
400 0.25
401 0.26
402 0.25
403 0.26
404 0.27
405 0.31
406 0.32
407 0.4
408 0.4
409 0.43
410 0.52
411 0.5
412 0.53
413 0.51
414 0.54
415 0.47
416 0.47
417 0.53
418 0.45
419 0.48
420 0.4
421 0.37
422 0.31
423 0.29
424 0.25
425 0.22