Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GBT9

Protein Details
Accession A0A397GBT9    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-328NTWWKNKWLRELKNNRQRLGHydrophilic
392-414MVNEIEPRKRKGKKKIVESSDEEHydrophilic
418-445EEEERKPKKTVLKKKKKETKITFDPAHNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
398-406PRKRKGKKK
422-435RKPKKTVLKKKKKE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MRKEKYDFYCLGSSSSGNAKRNYTAKRRNDCVNEVIKQKNEALSEIVERELFREEKDPNYKVTYTLKDLNRIKDHLDLIKHHVWIPNTLESTPRNSTRRTVQRLTPEEREQRRQLYRQHRLERQIQRENQNPVTVRLPASNSITTSPSATVGTFGTTPRYRRRSNETPQSFSQAVSPRRSPEQVTPHFNLLNQQLAEVHLTASDSSDSSDTDTEDEMANTIIDYLEDNLHNHTSLRVDPFYGDGTQDPLQWMIHFEKVTCSNAWDEAKKIRKYVTYLEDDVEEWYDEINPNDMADWATWKAGFVEKYCNTWWKNKWLRELKNNRQRLGETIDAYYARFKRLVKRVDINVDQHKQLFIKGLLPHIAPLVTMQAPATLAAALEKAQAYEEGLDMVNEIEPRKRKGKKKIVESSDEEDEEEEEERKPKKTVLKKKKKETKITFDPAHNLDDLAKKFKKMQLNLIQKMEKLTMQVNQQPNYRSQGNNRDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.33
3 0.35
4 0.35
5 0.38
6 0.38
7 0.43
8 0.5
9 0.57
10 0.59
11 0.62
12 0.68
13 0.74
14 0.76
15 0.79
16 0.79
17 0.75
18 0.72
19 0.7
20 0.65
21 0.63
22 0.63
23 0.57
24 0.52
25 0.5
26 0.46
27 0.39
28 0.35
29 0.3
30 0.26
31 0.27
32 0.25
33 0.23
34 0.2
35 0.18
36 0.18
37 0.21
38 0.19
39 0.17
40 0.22
41 0.23
42 0.31
43 0.39
44 0.39
45 0.38
46 0.43
47 0.42
48 0.4
49 0.45
50 0.41
51 0.39
52 0.46
53 0.45
54 0.49
55 0.54
56 0.59
57 0.57
58 0.54
59 0.51
60 0.48
61 0.48
62 0.44
63 0.43
64 0.38
65 0.4
66 0.42
67 0.41
68 0.38
69 0.38
70 0.34
71 0.34
72 0.35
73 0.33
74 0.31
75 0.3
76 0.31
77 0.29
78 0.34
79 0.35
80 0.38
81 0.35
82 0.36
83 0.4
84 0.46
85 0.55
86 0.57
87 0.57
88 0.56
89 0.63
90 0.68
91 0.7
92 0.67
93 0.65
94 0.66
95 0.68
96 0.69
97 0.64
98 0.65
99 0.66
100 0.65
101 0.67
102 0.68
103 0.72
104 0.74
105 0.78
106 0.76
107 0.75
108 0.79
109 0.79
110 0.77
111 0.76
112 0.73
113 0.71
114 0.71
115 0.72
116 0.64
117 0.6
118 0.52
119 0.45
120 0.4
121 0.35
122 0.29
123 0.25
124 0.24
125 0.22
126 0.24
127 0.23
128 0.21
129 0.21
130 0.21
131 0.19
132 0.18
133 0.16
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.15
143 0.17
144 0.22
145 0.3
146 0.37
147 0.39
148 0.43
149 0.53
150 0.56
151 0.63
152 0.69
153 0.66
154 0.65
155 0.63
156 0.63
157 0.54
158 0.45
159 0.41
160 0.37
161 0.36
162 0.35
163 0.36
164 0.33
165 0.35
166 0.37
167 0.34
168 0.34
169 0.39
170 0.41
171 0.46
172 0.45
173 0.45
174 0.43
175 0.41
176 0.37
177 0.28
178 0.26
179 0.19
180 0.17
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.12
185 0.1
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.07
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.11
239 0.09
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.13
244 0.16
245 0.18
246 0.15
247 0.15
248 0.13
249 0.16
250 0.18
251 0.16
252 0.16
253 0.21
254 0.3
255 0.3
256 0.31
257 0.3
258 0.3
259 0.32
260 0.37
261 0.35
262 0.32
263 0.32
264 0.31
265 0.29
266 0.27
267 0.24
268 0.19
269 0.12
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.19
292 0.2
293 0.23
294 0.25
295 0.31
296 0.3
297 0.37
298 0.39
299 0.42
300 0.5
301 0.52
302 0.6
303 0.64
304 0.69
305 0.72
306 0.79
307 0.79
308 0.8
309 0.81
310 0.73
311 0.66
312 0.59
313 0.53
314 0.48
315 0.41
316 0.33
317 0.27
318 0.27
319 0.24
320 0.23
321 0.25
322 0.2
323 0.18
324 0.2
325 0.21
326 0.28
327 0.37
328 0.42
329 0.43
330 0.49
331 0.52
332 0.57
333 0.59
334 0.56
335 0.56
336 0.53
337 0.48
338 0.42
339 0.38
340 0.31
341 0.27
342 0.25
343 0.17
344 0.2
345 0.2
346 0.22
347 0.22
348 0.22
349 0.21
350 0.18
351 0.17
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.1
383 0.15
384 0.19
385 0.25
386 0.34
387 0.43
388 0.51
389 0.61
390 0.71
391 0.74
392 0.81
393 0.86
394 0.84
395 0.83
396 0.8
397 0.74
398 0.69
399 0.6
400 0.49
401 0.39
402 0.32
403 0.25
404 0.2
405 0.16
406 0.12
407 0.18
408 0.2
409 0.22
410 0.24
411 0.28
412 0.37
413 0.46
414 0.56
415 0.62
416 0.71
417 0.79
418 0.88
419 0.93
420 0.93
421 0.94
422 0.93
423 0.92
424 0.91
425 0.9
426 0.85
427 0.78
428 0.74
429 0.66
430 0.58
431 0.47
432 0.37
433 0.32
434 0.33
435 0.31
436 0.34
437 0.34
438 0.33
439 0.39
440 0.45
441 0.51
442 0.48
443 0.56
444 0.58
445 0.67
446 0.71
447 0.73
448 0.69
449 0.61
450 0.59
451 0.51
452 0.41
453 0.34
454 0.3
455 0.27
456 0.31
457 0.39
458 0.43
459 0.45
460 0.49
461 0.49
462 0.49
463 0.51
464 0.5
465 0.47
466 0.49