Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397IMW4

Protein Details
Accession A0A397IMW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
493-527LDVEMKNYKNKKKTRSIMKKIVKTKRQPSIINKLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
501-518KNKKKTRSIMKKIVKTKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
Amino Acid Sequences MINRKRIEQLNKTIAKITKIYNQKIEEIINFVKNKGITEPPQLRHRLYHKQWQPVQLSLNTLLPPKFPPLLVQIQRGNLSPEGPPRNRNTDVESKDQLLINLDRSDNNNNLELKREKPNEEDQDIEAYNNKNLRQFLQQIYEEIEPVPQLIAEKNMATFNGDRKRVVFGVYLKKELREWYCKWSKDYNAHIWVELQTTFIENYCTDDWREQLQEKLRTKRANFNAGHTFPYFIQRLLSDIKVIVKTHKSADLATAYKKAKVYEQERSELKRYLKKTFKYESSNTESSDSKFDDLVKRFNKLFQEQPCEPSNNVYQPLQLRGKCYNCEEIEHFARDFIVKTHKSADLATAYKKAKVYEQERSELKRYLKKTFKYESSNTESSDSKFDDLVKRFNKLFQEQPCEPSNNVYQPLQLRGKCYNCEEIEHFARDYEYEAHEAIRNKFDTQVNLIKKSERTTRQPTIILKPNQSAPVPKIVELEVLVDFEEDPYTNYDLDVEMKNYKNKKKTRSIMKKIVKTKRQPSIINKLEPYNISEDILQMQASAKIGQLLNAAVNIITNKLRKRLGLEIDRSSKVTVIVANGDQEQALHWLKIYKTYTQGWELLYIYK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.56
3 0.51
4 0.45
5 0.43
6 0.48
7 0.53
8 0.54
9 0.54
10 0.53
11 0.52
12 0.51
13 0.44
14 0.41
15 0.39
16 0.37
17 0.35
18 0.32
19 0.33
20 0.3
21 0.3
22 0.29
23 0.32
24 0.29
25 0.38
26 0.47
27 0.49
28 0.57
29 0.6
30 0.58
31 0.59
32 0.62
33 0.63
34 0.61
35 0.66
36 0.65
37 0.71
38 0.74
39 0.75
40 0.71
41 0.64
42 0.63
43 0.54
44 0.5
45 0.42
46 0.39
47 0.32
48 0.32
49 0.28
50 0.24
51 0.24
52 0.25
53 0.25
54 0.21
55 0.23
56 0.25
57 0.35
58 0.37
59 0.42
60 0.41
61 0.43
62 0.44
63 0.42
64 0.39
65 0.3
66 0.28
67 0.24
68 0.29
69 0.35
70 0.37
71 0.42
72 0.45
73 0.52
74 0.54
75 0.53
76 0.51
77 0.52
78 0.53
79 0.54
80 0.51
81 0.46
82 0.45
83 0.43
84 0.36
85 0.31
86 0.28
87 0.24
88 0.24
89 0.23
90 0.22
91 0.25
92 0.29
93 0.28
94 0.28
95 0.3
96 0.3
97 0.29
98 0.34
99 0.34
100 0.33
101 0.4
102 0.42
103 0.41
104 0.43
105 0.52
106 0.53
107 0.53
108 0.51
109 0.43
110 0.42
111 0.39
112 0.34
113 0.29
114 0.23
115 0.23
116 0.24
117 0.24
118 0.24
119 0.25
120 0.27
121 0.29
122 0.33
123 0.34
124 0.37
125 0.37
126 0.34
127 0.36
128 0.34
129 0.28
130 0.22
131 0.18
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.14
146 0.2
147 0.27
148 0.28
149 0.28
150 0.28
151 0.33
152 0.31
153 0.31
154 0.27
155 0.26
156 0.35
157 0.36
158 0.41
159 0.37
160 0.38
161 0.37
162 0.39
163 0.38
164 0.35
165 0.35
166 0.4
167 0.48
168 0.49
169 0.52
170 0.53
171 0.53
172 0.53
173 0.58
174 0.56
175 0.54
176 0.52
177 0.48
178 0.42
179 0.37
180 0.31
181 0.24
182 0.16
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.08
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.16
195 0.18
196 0.21
197 0.18
198 0.22
199 0.29
200 0.36
201 0.42
202 0.48
203 0.52
204 0.55
205 0.57
206 0.62
207 0.6
208 0.61
209 0.55
210 0.53
211 0.55
212 0.49
213 0.49
214 0.4
215 0.35
216 0.26
217 0.3
218 0.24
219 0.16
220 0.16
221 0.13
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.11
226 0.11
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.17
231 0.17
232 0.18
233 0.19
234 0.22
235 0.2
236 0.19
237 0.21
238 0.21
239 0.21
240 0.2
241 0.25
242 0.23
243 0.24
244 0.25
245 0.23
246 0.23
247 0.29
248 0.33
249 0.35
250 0.37
251 0.4
252 0.42
253 0.46
254 0.45
255 0.43
256 0.42
257 0.4
258 0.4
259 0.44
260 0.49
261 0.49
262 0.53
263 0.54
264 0.56
265 0.56
266 0.55
267 0.53
268 0.52
269 0.5
270 0.43
271 0.4
272 0.34
273 0.29
274 0.28
275 0.22
276 0.16
277 0.15
278 0.16
279 0.2
280 0.21
281 0.27
282 0.26
283 0.28
284 0.27
285 0.3
286 0.32
287 0.28
288 0.33
289 0.3
290 0.37
291 0.35
292 0.38
293 0.37
294 0.35
295 0.32
296 0.29
297 0.27
298 0.21
299 0.22
300 0.19
301 0.19
302 0.18
303 0.23
304 0.26
305 0.24
306 0.25
307 0.28
308 0.31
309 0.31
310 0.32
311 0.32
312 0.28
313 0.29
314 0.28
315 0.27
316 0.28
317 0.27
318 0.24
319 0.18
320 0.18
321 0.16
322 0.14
323 0.11
324 0.16
325 0.15
326 0.16
327 0.2
328 0.2
329 0.21
330 0.21
331 0.22
332 0.18
333 0.19
334 0.19
335 0.23
336 0.23
337 0.24
338 0.25
339 0.23
340 0.23
341 0.29
342 0.33
343 0.35
344 0.37
345 0.4
346 0.42
347 0.46
348 0.45
349 0.43
350 0.42
351 0.4
352 0.4
353 0.44
354 0.49
355 0.49
356 0.53
357 0.54
358 0.56
359 0.56
360 0.55
361 0.53
362 0.52
363 0.5
364 0.43
365 0.4
366 0.34
367 0.29
368 0.28
369 0.22
370 0.16
371 0.15
372 0.16
373 0.2
374 0.21
375 0.27
376 0.26
377 0.28
378 0.27
379 0.3
380 0.32
381 0.28
382 0.33
383 0.3
384 0.37
385 0.35
386 0.38
387 0.37
388 0.35
389 0.32
390 0.29
391 0.27
392 0.21
393 0.22
394 0.19
395 0.19
396 0.18
397 0.23
398 0.26
399 0.24
400 0.25
401 0.28
402 0.31
403 0.31
404 0.32
405 0.32
406 0.28
407 0.29
408 0.28
409 0.27
410 0.28
411 0.27
412 0.25
413 0.19
414 0.19
415 0.16
416 0.17
417 0.15
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.14
422 0.18
423 0.22
424 0.22
425 0.24
426 0.24
427 0.23
428 0.29
429 0.3
430 0.28
431 0.3
432 0.36
433 0.36
434 0.39
435 0.39
436 0.37
437 0.38
438 0.4
439 0.43
440 0.42
441 0.45
442 0.5
443 0.56
444 0.57
445 0.6
446 0.6
447 0.59
448 0.62
449 0.59
450 0.53
451 0.49
452 0.48
453 0.47
454 0.43
455 0.39
456 0.32
457 0.36
458 0.33
459 0.31
460 0.29
461 0.26
462 0.26
463 0.22
464 0.21
465 0.12
466 0.11
467 0.1
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.06
473 0.07
474 0.1
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.19
484 0.22
485 0.3
486 0.38
487 0.45
488 0.52
489 0.59
490 0.66
491 0.71
492 0.77
493 0.81
494 0.84
495 0.86
496 0.88
497 0.89
498 0.89
499 0.89
500 0.9
501 0.88
502 0.87
503 0.86
504 0.84
505 0.82
506 0.81
507 0.8
508 0.8
509 0.78
510 0.75
511 0.68
512 0.62
513 0.58
514 0.5
515 0.45
516 0.38
517 0.31
518 0.25
519 0.23
520 0.21
521 0.19
522 0.18
523 0.15
524 0.1
525 0.1
526 0.11
527 0.12
528 0.12
529 0.1
530 0.14
531 0.14
532 0.15
533 0.15
534 0.14
535 0.14
536 0.14
537 0.14
538 0.09
539 0.1
540 0.09
541 0.1
542 0.14
543 0.19
544 0.23
545 0.29
546 0.32
547 0.33
548 0.38
549 0.44
550 0.5
551 0.54
552 0.57
553 0.59
554 0.63
555 0.63
556 0.59
557 0.51
558 0.42
559 0.33
560 0.28
561 0.21
562 0.18
563 0.19
564 0.19
565 0.2
566 0.2
567 0.19
568 0.17
569 0.15
570 0.14
571 0.16
572 0.17
573 0.14
574 0.15
575 0.2
576 0.2
577 0.29
578 0.31
579 0.3
580 0.34
581 0.39
582 0.43
583 0.42
584 0.45
585 0.37
586 0.38