FuNGI

A0A397ITC6

Protein Details

Accession

A0A397ITC6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-27	MMMTHTMKQTRKRVDTQKKNGLMQRG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf
Pfam	View protein in Pfam PF00505 HMG_box

Amino Acid Sequences

MMMMTHTMKQTRKRVDTQKKNGLMQRGQQKIKLTINKPRGCLPPLPLPYPPEIDLQKMVAKLASKPKLARFPNAFIMYRNEYVHYLKSKDLHLSMTELSPMIAASWKQEPEYVKDAYTQLSSEAEKLYVRVAANAQPEIKYKFPSQQRHPTFNDFSSQDTNIMTTPRKNNDITRTLINNNFTKYEDIVSEYNRLLESSSPTFLESKGFPRTSSSSSSITRSRNSLEEAHHNLSINHNNNNNNNISTNNINEQPTFDTHLIKQQQQQQQQQQGNWYIPETSYFPWPSKFSNNEPSSLRDTIQQSHISSTNIITCEDLGITFPEPPIIGQLPPSPALDTPCSENELSFSPTCPNCIRRHFYDHQPFSFSPALENQETSTIHHSTNFYPPSPVSPVQPFTDESSHSPNFGGEFEVSDITNDLYYVIDSALSSGSYTIPTSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.81
3	0.86
4	0.88
5	0.89
6	0.86
7	0.85
8	0.81
9	0.79
10	0.74
11	0.71
12	0.7
13	0.69
14	0.65
15	0.61
16	0.61
17	0.59
18	0.63
19	0.64
20	0.61
21	0.62
22	0.69
23	0.71
24	0.67
25	0.67
26	0.64
27	0.59
28	0.57
29	0.52
30	0.52
31	0.52
32	0.53
33	0.49
34	0.46
35	0.45
36	0.44
37	0.4
38	0.36
39	0.32
40	0.31
41	0.3
42	0.29
43	0.29
44	0.25
45	0.24
46	0.2
47	0.2
48	0.23
49	0.32
50	0.35
51	0.37
52	0.41
53	0.47
54	0.55
55	0.57
56	0.6
57	0.56
58	0.55
59	0.59
60	0.59
61	0.53
62	0.45
63	0.48
64	0.44
65	0.41
66	0.37
67	0.3
68	0.27
69	0.29
70	0.33
71	0.31
72	0.28
73	0.28
74	0.3
75	0.31
76	0.33
77	0.32
78	0.28
79	0.24
80	0.25
81	0.23
82	0.21
83	0.19
84	0.15
85	0.13
86	0.11
87	0.1
88	0.07
89	0.08
90	0.07
91	0.09
92	0.14
93	0.15
94	0.15
95	0.19
96	0.2
97	0.24
98	0.28
99	0.27
100	0.23
101	0.25
102	0.25
103	0.23
104	0.22
105	0.16
106	0.13
107	0.14
108	0.14
109	0.13
110	0.12
111	0.12
112	0.11
113	0.11
114	0.11
115	0.12
116	0.12
117	0.12
118	0.13
119	0.17
120	0.19
121	0.2
122	0.2
123	0.18
124	0.21
125	0.23
126	0.23
127	0.22
128	0.22
129	0.28
130	0.35
131	0.43
132	0.49
133	0.56
134	0.61
135	0.65
136	0.68
137	0.67
138	0.62
139	0.54
140	0.5
141	0.4
142	0.37
143	0.33
144	0.29
145	0.23
146	0.19
147	0.19
148	0.14
149	0.16
150	0.15
151	0.17
152	0.22
153	0.25
154	0.29
155	0.3
156	0.34
157	0.39
158	0.41
159	0.39
160	0.37
161	0.37
162	0.36
163	0.38
164	0.36
165	0.31
166	0.29
167	0.27
168	0.24
169	0.22
170	0.19
171	0.17
172	0.14
173	0.15
174	0.14
175	0.14
176	0.16
177	0.14
178	0.14
179	0.13
180	0.13
181	0.1
182	0.1
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.13
188	0.13
189	0.13
190	0.14
191	0.11
192	0.13
193	0.19
194	0.19
195	0.18
196	0.21
197	0.24
198	0.25
199	0.28
200	0.27
201	0.25
202	0.26
203	0.29
204	0.31
205	0.3
206	0.28
207	0.26
208	0.24
209	0.22
210	0.24
211	0.23
212	0.21
213	0.25
214	0.29
215	0.29
216	0.28
217	0.27
218	0.25
219	0.25
220	0.3
221	0.26
222	0.24
223	0.26
224	0.29
225	0.3
226	0.33
227	0.3
228	0.24
229	0.23
230	0.19
231	0.17
232	0.15
233	0.15
234	0.14
235	0.16
236	0.16
237	0.15
238	0.16
239	0.16
240	0.16
241	0.18
242	0.17
243	0.16
244	0.16
245	0.23
246	0.25
247	0.26
248	0.29
249	0.34
250	0.41
251	0.47
252	0.54
253	0.53
254	0.59
255	0.6
256	0.56
257	0.52
258	0.48
259	0.41
260	0.34
261	0.27
262	0.19
263	0.15
264	0.16
265	0.14
266	0.12
267	0.16
268	0.17
269	0.18
270	0.2
271	0.22
272	0.23
273	0.28
274	0.31
275	0.32
276	0.41
277	0.41
278	0.42
279	0.42
280	0.43
281	0.41
282	0.38
283	0.33
284	0.28
285	0.29
286	0.29
287	0.31
288	0.31
289	0.26
290	0.28
291	0.29
292	0.24
293	0.22
294	0.2
295	0.19
296	0.16
297	0.16
298	0.13
299	0.11
300	0.11
301	0.1
302	0.09
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.11
312	0.11
313	0.1
314	0.12
315	0.15
316	0.16
317	0.18
318	0.18
319	0.16
320	0.16
321	0.19
322	0.19
323	0.18
324	0.2
325	0.2
326	0.22
327	0.21
328	0.2
329	0.18
330	0.19
331	0.22
332	0.18
333	0.18
334	0.21
335	0.21
336	0.26
337	0.28
338	0.31
339	0.34
340	0.42
341	0.48
342	0.47
343	0.56
344	0.58
345	0.64
346	0.7
347	0.69
348	0.63
349	0.63
350	0.57
351	0.54
352	0.52
353	0.41
354	0.33
355	0.3
356	0.33
357	0.28
358	0.28
359	0.23
360	0.24
361	0.24
362	0.24
363	0.25
364	0.21
365	0.21
366	0.24
367	0.25
368	0.24
369	0.32
370	0.33
371	0.29
372	0.31
373	0.31
374	0.32
375	0.36
376	0.35
377	0.31
378	0.34
379	0.36
380	0.35
381	0.37
382	0.34
383	0.32
384	0.35
385	0.32
386	0.3
387	0.35
388	0.33
389	0.32
390	0.3
391	0.26
392	0.23
393	0.21
394	0.2
395	0.12
396	0.13
397	0.14
398	0.15
399	0.14
400	0.14
401	0.14
402	0.12
403	0.12
404	0.1
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.07
413	0.08
414	0.07
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.09

A0A397ITC6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer