Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HNC8

Protein Details
Accession A0A397HNC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-359DKSLKDTKNNIKVKKLKEKKSSVLSSKKNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-358NNKVRKLKEKESILSAKKKQHDEKGTGDKSLKDAKKDTGDKSLKDTKKGTGDKSLKDAKKNTGDKSLKDTKNNIKVKKLKEKKSSVLSSKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MGEIPTLNRELIEKAVTILLKYVSKQNEKNENELITDPIQFVWLIVSTHKFSDENKAKPINIPLKHPLYNSSTEICLITKDPQKDFKELVINQEAKNVKKVIGLSKLRKKYHPYEAKRLLCDSYDLFLADDRVINYLPKLLGKKFFEKKKQPIPVNLKDQKNFKKEIFKACNSTYMHFRPGTCLAIKIGTTDMTALQILENIEMGVSKIVDKIPKKWLNIQSLNIKTNTSTSLPIFNVLPHHISYEKKRKHDDEKDIGDKFMKDDKNNNKVRKLKEKESILSAKKKQHDEKGTGDKSLKDAKKDTGDKSLKDTKKGTGDKSLKDAKKNTGDKSLKDTKNNIKVKKLKEKKSSVLSSKKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.19
3 0.19
4 0.17
5 0.17
6 0.17
7 0.18
8 0.19
9 0.25
10 0.3
11 0.38
12 0.43
13 0.51
14 0.58
15 0.6
16 0.64
17 0.61
18 0.54
19 0.49
20 0.44
21 0.39
22 0.3
23 0.28
24 0.22
25 0.17
26 0.16
27 0.13
28 0.12
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.14
34 0.15
35 0.16
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.29
40 0.35
41 0.36
42 0.41
43 0.45
44 0.44
45 0.46
46 0.55
47 0.52
48 0.47
49 0.48
50 0.49
51 0.51
52 0.53
53 0.5
54 0.45
55 0.41
56 0.43
57 0.39
58 0.33
59 0.28
60 0.25
61 0.26
62 0.21
63 0.18
64 0.15
65 0.19
66 0.23
67 0.27
68 0.3
69 0.38
70 0.41
71 0.44
72 0.44
73 0.42
74 0.45
75 0.41
76 0.44
77 0.43
78 0.42
79 0.38
80 0.43
81 0.42
82 0.34
83 0.38
84 0.32
85 0.25
86 0.25
87 0.28
88 0.27
89 0.33
90 0.4
91 0.45
92 0.53
93 0.61
94 0.62
95 0.65
96 0.66
97 0.64
98 0.67
99 0.68
100 0.66
101 0.68
102 0.75
103 0.74
104 0.69
105 0.64
106 0.54
107 0.43
108 0.38
109 0.29
110 0.2
111 0.15
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.14
127 0.15
128 0.21
129 0.24
130 0.33
131 0.39
132 0.47
133 0.53
134 0.6
135 0.67
136 0.7
137 0.75
138 0.71
139 0.73
140 0.74
141 0.71
142 0.73
143 0.72
144 0.67
145 0.61
146 0.66
147 0.64
148 0.59
149 0.55
150 0.48
151 0.5
152 0.49
153 0.56
154 0.55
155 0.5
156 0.5
157 0.48
158 0.52
159 0.43
160 0.4
161 0.36
162 0.3
163 0.31
164 0.27
165 0.26
166 0.23
167 0.24
168 0.24
169 0.19
170 0.17
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.11
175 0.1
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.12
198 0.13
199 0.17
200 0.27
201 0.33
202 0.35
203 0.42
204 0.48
205 0.52
206 0.54
207 0.55
208 0.54
209 0.53
210 0.53
211 0.45
212 0.38
213 0.29
214 0.27
215 0.25
216 0.18
217 0.15
218 0.14
219 0.17
220 0.17
221 0.18
222 0.17
223 0.15
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.13
228 0.15
229 0.16
230 0.19
231 0.27
232 0.36
233 0.41
234 0.45
235 0.52
236 0.57
237 0.65
238 0.72
239 0.72
240 0.71
241 0.73
242 0.73
243 0.67
244 0.61
245 0.53
246 0.43
247 0.36
248 0.34
249 0.31
250 0.26
251 0.35
252 0.43
253 0.51
254 0.6
255 0.63
256 0.64
257 0.68
258 0.73
259 0.75
260 0.73
261 0.71
262 0.71
263 0.73
264 0.67
265 0.67
266 0.68
267 0.64
268 0.65
269 0.63
270 0.62
271 0.62
272 0.68
273 0.68
274 0.69
275 0.7
276 0.66
277 0.69
278 0.72
279 0.66
280 0.62
281 0.56
282 0.48
283 0.44
284 0.49
285 0.43
286 0.38
287 0.39
288 0.41
289 0.49
290 0.54
291 0.52
292 0.53
293 0.56
294 0.52
295 0.56
296 0.6
297 0.54
298 0.55
299 0.54
300 0.5
301 0.54
302 0.59
303 0.55
304 0.56
305 0.59
306 0.56
307 0.61
308 0.65
309 0.6
310 0.62
311 0.63
312 0.61
313 0.65
314 0.68
315 0.64
316 0.65
317 0.65
318 0.61
319 0.64
320 0.66
321 0.62
322 0.62
323 0.66
324 0.66
325 0.71
326 0.77
327 0.74
328 0.73
329 0.76
330 0.79
331 0.81
332 0.81
333 0.81
334 0.83
335 0.86
336 0.85
337 0.86
338 0.86
339 0.85