Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HCS5

Protein Details
Accession A0A397HCS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
389-409YSILQLKKRRYWPKNIPHDITHydrophilic
535-558EGTIADRTKKRKNRDSNNLEHNLIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5.5, cyto_mito 4, mito 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029526  PGBD  
Pfam View protein in Pfam  
PF13843  DDE_Tnp_1_7  
Amino Acid Sequences MGRISPNIKEDAKVTVLDSVVGEGIARPLVGDMWKTKRISATVLRVAPGINRWVISLDANPEIEFEVSAGRMKYVSVTNNNLNNENNNVPEEPIISEPETSISSDSEQDEEETHVSNRNEVLWTNADVTIDSRRVGRSYSGVPIVHISDIEHASPRQFFERFLPVEYIMSTVISSTNEHARASERLWKDLTWMEFMRFIGILTIMTYVQCSDICDYWSTVQDTGGVALEFGQYMSHRRFRDIVKYLKLTDVPTDDDDPFHFARKFHNAFNENLAKAITPGSFLCIDESMCQWMGKIDKGPFQRKIPRKPHPFGCEFKTVADARVNLLVQLDPCEPPEHANKKKFSEYSATIATMLRLTEPWFNSGRTIIADSWFGSVNACTTLYKHGFYSILQLKKRRYWPKNIPHDITDALGSAYGSFVSRTGKFDDVDLTLCSIRDRKNIVLLASCSTTNLKTEITRYIKGHGNVKFRRPAIFDEYNEYRSAIDIFNNLRDNALSYHDVLTTKCSENRILAFYFSAVEANSYSAYCQFVPEMEGTIADRTKKRKNRDSNNLEHNLISINNDSTNSQIKGKYIQRHCISCHKRTSTSCSCSIPRAMCTNCWANHIHNSYNIVRTSESQDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.21
4 0.2
5 0.19
6 0.14
7 0.12
8 0.11
9 0.1
10 0.07
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.08
17 0.1
18 0.13
19 0.19
20 0.25
21 0.32
22 0.33
23 0.35
24 0.38
25 0.39
26 0.43
27 0.44
28 0.46
29 0.48
30 0.49
31 0.47
32 0.43
33 0.42
34 0.37
35 0.31
36 0.26
37 0.2
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.19
42 0.19
43 0.18
44 0.18
45 0.19
46 0.19
47 0.18
48 0.18
49 0.17
50 0.16
51 0.13
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.13
61 0.17
62 0.22
63 0.26
64 0.32
65 0.38
66 0.44
67 0.46
68 0.46
69 0.43
70 0.39
71 0.38
72 0.34
73 0.29
74 0.26
75 0.24
76 0.22
77 0.21
78 0.19
79 0.17
80 0.16
81 0.17
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.11
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.19
102 0.19
103 0.2
104 0.2
105 0.19
106 0.2
107 0.18
108 0.21
109 0.17
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.16
115 0.18
116 0.18
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.19
124 0.18
125 0.2
126 0.23
127 0.26
128 0.25
129 0.24
130 0.25
131 0.24
132 0.2
133 0.17
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.13
140 0.15
141 0.16
142 0.17
143 0.18
144 0.17
145 0.18
146 0.2
147 0.28
148 0.27
149 0.28
150 0.29
151 0.25
152 0.25
153 0.24
154 0.2
155 0.13
156 0.12
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.16
167 0.18
168 0.19
169 0.2
170 0.27
171 0.23
172 0.25
173 0.27
174 0.26
175 0.26
176 0.28
177 0.27
178 0.23
179 0.23
180 0.21
181 0.21
182 0.21
183 0.2
184 0.15
185 0.14
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.06
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.16
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.08
221 0.12
222 0.18
223 0.19
224 0.21
225 0.25
226 0.27
227 0.36
228 0.4
229 0.43
230 0.42
231 0.45
232 0.43
233 0.42
234 0.41
235 0.32
236 0.27
237 0.22
238 0.19
239 0.18
240 0.2
241 0.18
242 0.17
243 0.16
244 0.18
245 0.16
246 0.18
247 0.17
248 0.15
249 0.19
250 0.27
251 0.29
252 0.27
253 0.35
254 0.34
255 0.33
256 0.39
257 0.39
258 0.3
259 0.28
260 0.26
261 0.18
262 0.16
263 0.16
264 0.1
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.13
283 0.13
284 0.18
285 0.25
286 0.31
287 0.33
288 0.38
289 0.46
290 0.51
291 0.59
292 0.64
293 0.68
294 0.71
295 0.73
296 0.75
297 0.72
298 0.69
299 0.62
300 0.57
301 0.51
302 0.43
303 0.37
304 0.34
305 0.28
306 0.24
307 0.23
308 0.19
309 0.14
310 0.16
311 0.15
312 0.11
313 0.11
314 0.1
315 0.08
316 0.1
317 0.1
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.12
323 0.21
324 0.27
325 0.33
326 0.4
327 0.43
328 0.45
329 0.51
330 0.49
331 0.43
332 0.4
333 0.36
334 0.33
335 0.31
336 0.27
337 0.23
338 0.22
339 0.2
340 0.14
341 0.11
342 0.07
343 0.06
344 0.08
345 0.11
346 0.12
347 0.14
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.12
354 0.14
355 0.11
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.1
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.13
370 0.15
371 0.15
372 0.15
373 0.16
374 0.16
375 0.16
376 0.23
377 0.24
378 0.29
379 0.32
380 0.37
381 0.4
382 0.46
383 0.56
384 0.59
385 0.58
386 0.62
387 0.69
388 0.74
389 0.81
390 0.81
391 0.75
392 0.66
393 0.62
394 0.52
395 0.42
396 0.32
397 0.21
398 0.13
399 0.11
400 0.09
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.09
408 0.1
409 0.12
410 0.15
411 0.18
412 0.17
413 0.18
414 0.2
415 0.17
416 0.18
417 0.16
418 0.14
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.15
423 0.17
424 0.2
425 0.24
426 0.24
427 0.3
428 0.32
429 0.31
430 0.31
431 0.3
432 0.27
433 0.24
434 0.22
435 0.17
436 0.17
437 0.16
438 0.13
439 0.14
440 0.13
441 0.13
442 0.16
443 0.24
444 0.27
445 0.31
446 0.31
447 0.34
448 0.38
449 0.4
450 0.44
451 0.42
452 0.47
453 0.48
454 0.54
455 0.57
456 0.52
457 0.53
458 0.49
459 0.47
460 0.46
461 0.47
462 0.41
463 0.42
464 0.44
465 0.42
466 0.4
467 0.35
468 0.26
469 0.2
470 0.21
471 0.14
472 0.12
473 0.14
474 0.16
475 0.2
476 0.23
477 0.22
478 0.2
479 0.2
480 0.21
481 0.18
482 0.2
483 0.16
484 0.16
485 0.17
486 0.19
487 0.19
488 0.18
489 0.2
490 0.21
491 0.22
492 0.23
493 0.25
494 0.25
495 0.28
496 0.3
497 0.3
498 0.27
499 0.25
500 0.22
501 0.2
502 0.19
503 0.15
504 0.13
505 0.09
506 0.09
507 0.08
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.1
513 0.12
514 0.11
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.13
519 0.13
520 0.14
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.16
525 0.17
526 0.2
527 0.25
528 0.29
529 0.4
530 0.48
531 0.57
532 0.64
533 0.73
534 0.8
535 0.86
536 0.88
537 0.88
538 0.89
539 0.84
540 0.75
541 0.64
542 0.53
543 0.44
544 0.34
545 0.27
546 0.19
547 0.15
548 0.15
549 0.16
550 0.16
551 0.17
552 0.23
553 0.23
554 0.24
555 0.25
556 0.26
557 0.33
558 0.41
559 0.48
560 0.49
561 0.57
562 0.6
563 0.63
564 0.66
565 0.69
566 0.69
567 0.67
568 0.7
569 0.66
570 0.67
571 0.67
572 0.72
573 0.71
574 0.69
575 0.66
576 0.63
577 0.59
578 0.56
579 0.58
580 0.52
581 0.46
582 0.49
583 0.46
584 0.42
585 0.46
586 0.49
587 0.43
588 0.44
589 0.42
590 0.38
591 0.45
592 0.47
593 0.43
594 0.39
595 0.43
596 0.43
597 0.46
598 0.43
599 0.36
600 0.33
601 0.33