Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JF82

Protein Details
Accession A0A397JF82    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-90RTVQRLTPEEREQRRQRYQQRRLERQIQRENQNPVHydrophilic
258-292RTVQRLTPEEREQRRQRYQQRRLERQIQRENQNPVHydrophilic
603-629AEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHBasic
926-952AEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
607-620RKPKKTVLKKKKKE
930-943RKPKKTVLKKKKKE
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MVIAKRRNNCVDEAIKQKNEALSEIDHLDLIKHHVWIRDNILVDNGRTVFNIPTRRTVQRLTPEEREQRRQRYQQRRLERQIQRENQNPVTVRLPASSSTTTSPSATAVSPRRSPEQGTPRVITPPNNWDQLQNIRTFYQPLQPLDFNLINQQLAEAHLTASDSSDSSDTDTEDEMANAKDKPPSVTIWCLLAETQKEIILLMVIAKRRNNCVDEAIKQKNEALSEIDHLDLIKHHVWIRDNILVDNGRTVFNIPTRRTVQRLTPEEREQRRQRYQQRRLERQIQRENQNPVTVRLPASSSTTTSPSATVGTFGTTPRHRRRSNETPQSFSQAVSPRRSPEQGTPRVITPPNNWDQLQNIRTFYQPLQPLDFNLINQQLAEAHLTASDSSDSSDTDTKDEMANAVLDYLEDNLHNHTSLRVDPFYGDGTQDPLQWMLHFEKVARSNAWDEAKKIRKYAIYLKDNAEEWHDEINANDMADWAAWKAGFVEKYCNTRWRNKWMRELENNRQRQGETVDAYYARFRRLVKRVEINVNQHKRLFIKGLLPHIVPLITMQAPGTLAAALELAQAYEEGLDMVNEIEPHKQKGKKKVVESSDEEEEEEAEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQAVSPRRSPEQGTPRVITPPNNWDQLQNIRTFYQPLQPLDFNLINQQLAEAHLTASDSSDSSDTDTKDEMANAVLDYLEDNLHNHTSLRVDPFYGDGTQDPLQWMLHFEKVARSNAWDEAKKIRKYAIYLKDNAEEWHDEINANDMADWAAWKAGFVEKYCNTRWRNKWMRELENNRQRQGETVDAYYARFRRLVKRVEINVNQHKRLFIKGLLPHIVPLITMQAPGTLAAALELAQAYEEGLDMVNEIEPHKQKGKKKVVESSDEEEEEEAEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYRNRGNNRDNSSQNNWNNRNNRNNX
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.54
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.42
7 0.37
8 0.31
9 0.24
10 0.25
11 0.26
12 0.23
13 0.2
14 0.18
15 0.17
16 0.15
17 0.18
18 0.17
19 0.19
20 0.21
21 0.26
22 0.3
23 0.34
24 0.38
25 0.38
26 0.37
27 0.35
28 0.37
29 0.34
30 0.31
31 0.31
32 0.26
33 0.22
34 0.21
35 0.22
36 0.21
37 0.25
38 0.33
39 0.31
40 0.38
41 0.43
42 0.48
43 0.51
44 0.51
45 0.53
46 0.55
47 0.6
48 0.6
49 0.62
50 0.66
51 0.72
52 0.75
53 0.77
54 0.76
55 0.78
56 0.81
57 0.84
58 0.85
59 0.87
60 0.89
61 0.89
62 0.91
63 0.91
64 0.9
65 0.91
66 0.88
67 0.88
68 0.88
69 0.87
70 0.84
71 0.81
72 0.8
73 0.73
74 0.71
75 0.62
76 0.54
77 0.49
78 0.43
79 0.37
80 0.3
81 0.28
82 0.23
83 0.27
84 0.25
85 0.24
86 0.24
87 0.26
88 0.26
89 0.25
90 0.24
91 0.19
92 0.19
93 0.18
94 0.23
95 0.27
96 0.32
97 0.36
98 0.39
99 0.43
100 0.44
101 0.47
102 0.49
103 0.52
104 0.55
105 0.56
106 0.55
107 0.52
108 0.56
109 0.55
110 0.5
111 0.44
112 0.44
113 0.44
114 0.46
115 0.44
116 0.39
117 0.41
118 0.45
119 0.44
120 0.38
121 0.35
122 0.32
123 0.33
124 0.35
125 0.32
126 0.3
127 0.32
128 0.32
129 0.35
130 0.34
131 0.34
132 0.37
133 0.36
134 0.29
135 0.28
136 0.27
137 0.21
138 0.2
139 0.19
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.1
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.16
169 0.19
170 0.19
171 0.22
172 0.25
173 0.29
174 0.28
175 0.27
176 0.26
177 0.24
178 0.22
179 0.22
180 0.19
181 0.17
182 0.17
183 0.15
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.13
192 0.17
193 0.2
194 0.22
195 0.28
196 0.34
197 0.35
198 0.35
199 0.41
200 0.44
201 0.48
202 0.55
203 0.58
204 0.54
205 0.52
206 0.52
207 0.47
208 0.42
209 0.37
210 0.31
211 0.24
212 0.25
213 0.26
214 0.23
215 0.2
216 0.18
217 0.17
218 0.15
219 0.18
220 0.17
221 0.19
222 0.21
223 0.26
224 0.3
225 0.34
226 0.38
227 0.38
228 0.37
229 0.35
230 0.37
231 0.34
232 0.31
233 0.31
234 0.26
235 0.22
236 0.21
237 0.22
238 0.21
239 0.25
240 0.33
241 0.31
242 0.38
243 0.43
244 0.48
245 0.51
246 0.51
247 0.53
248 0.55
249 0.6
250 0.6
251 0.62
252 0.66
253 0.72
254 0.75
255 0.77
256 0.76
257 0.78
258 0.81
259 0.84
260 0.85
261 0.87
262 0.89
263 0.89
264 0.91
265 0.91
266 0.9
267 0.91
268 0.88
269 0.88
270 0.88
271 0.87
272 0.84
273 0.81
274 0.8
275 0.73
276 0.71
277 0.62
278 0.54
279 0.49
280 0.43
281 0.37
282 0.3
283 0.28
284 0.23
285 0.27
286 0.25
287 0.24
288 0.24
289 0.26
290 0.26
291 0.24
292 0.23
293 0.18
294 0.17
295 0.15
296 0.13
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.15
302 0.19
303 0.28
304 0.37
305 0.46
306 0.48
307 0.53
308 0.62
309 0.67
310 0.73
311 0.75
312 0.69
313 0.65
314 0.64
315 0.64
316 0.55
317 0.44
318 0.39
319 0.36
320 0.37
321 0.36
322 0.36
323 0.33
324 0.37
325 0.38
326 0.37
327 0.39
328 0.45
329 0.49
330 0.53
331 0.53
332 0.51
333 0.56
334 0.55
335 0.5
336 0.44
337 0.44
338 0.44
339 0.46
340 0.44
341 0.39
342 0.41
343 0.45
344 0.44
345 0.38
346 0.35
347 0.32
348 0.33
349 0.35
350 0.32
351 0.3
352 0.32
353 0.32
354 0.35
355 0.34
356 0.34
357 0.37
358 0.36
359 0.29
360 0.28
361 0.27
362 0.21
363 0.2
364 0.19
365 0.14
366 0.14
367 0.15
368 0.1
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.11
380 0.14
381 0.13
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.11
388 0.08
389 0.08
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.13
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.14
412 0.12
413 0.11
414 0.08
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.12
423 0.1
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.15
428 0.18
429 0.2
430 0.18
431 0.18
432 0.18
433 0.22
434 0.26
435 0.22
436 0.21
437 0.28
438 0.36
439 0.36
440 0.35
441 0.33
442 0.31
443 0.34
444 0.41
445 0.42
446 0.38
447 0.4
448 0.41
449 0.4
450 0.39
451 0.36
452 0.28
453 0.2
454 0.16
455 0.14
456 0.13
457 0.11
458 0.1
459 0.12
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.06
473 0.08
474 0.08
475 0.14
476 0.16
477 0.2
478 0.22
479 0.29
480 0.31
481 0.38
482 0.43
483 0.48
484 0.55
485 0.56
486 0.64
487 0.64
488 0.68
489 0.68
490 0.72
491 0.71
492 0.71
493 0.68
494 0.6
495 0.54
496 0.46
497 0.39
498 0.33
499 0.27
500 0.19
501 0.16
502 0.16
503 0.15
504 0.16
505 0.17
506 0.15
507 0.13
508 0.14
509 0.15
510 0.22
511 0.28
512 0.33
513 0.35
514 0.41
515 0.44
516 0.5
517 0.53
518 0.53
519 0.56
520 0.55
521 0.52
522 0.45
523 0.43
524 0.36
525 0.33
526 0.28
527 0.2
528 0.21
529 0.22
530 0.25
531 0.26
532 0.25
533 0.23
534 0.21
535 0.19
536 0.12
537 0.1
538 0.08
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.03
551 0.04
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.04
565 0.04
566 0.05
567 0.09
568 0.1
569 0.14
570 0.2
571 0.26
572 0.32
573 0.42
574 0.52
575 0.55
576 0.59
577 0.65
578 0.63
579 0.64
580 0.63
581 0.56
582 0.48
583 0.42
584 0.36
585 0.28
586 0.23
587 0.17
588 0.12
589 0.08
590 0.06
591 0.07
592 0.11
593 0.14
594 0.17
595 0.18
596 0.21
597 0.3
598 0.39
599 0.5
600 0.58
601 0.66
602 0.73
603 0.83
604 0.89
605 0.9
606 0.9
607 0.88
608 0.87
609 0.85
610 0.83
611 0.76
612 0.68
613 0.63
614 0.54
615 0.46
616 0.36
617 0.26
618 0.2
619 0.22
620 0.2
621 0.21
622 0.2
623 0.18
624 0.2
625 0.26
626 0.29
627 0.26
628 0.32
629 0.35
630 0.4
631 0.43
632 0.43
633 0.38
634 0.32
635 0.33
636 0.27
637 0.19
638 0.16
639 0.14
640 0.14
641 0.14
642 0.2
643 0.24
644 0.26
645 0.28
646 0.3
647 0.32
648 0.34
649 0.37
650 0.41
651 0.45
652 0.51
653 0.54
654 0.52
655 0.51
656 0.56
657 0.55
658 0.5
659 0.44
660 0.44
661 0.44
662 0.46
663 0.44
664 0.39
665 0.41
666 0.45
667 0.44
668 0.38
669 0.35
670 0.32
671 0.33
672 0.35
673 0.32
674 0.3
675 0.32
676 0.32
677 0.35
678 0.34
679 0.34
680 0.37
681 0.36
682 0.29
683 0.28
684 0.27
685 0.21
686 0.2
687 0.19
688 0.14
689 0.14
690 0.15
691 0.1
692 0.08
693 0.08
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.09
698 0.08
699 0.09
700 0.09
701 0.09
702 0.11
703 0.14
704 0.13
705 0.14
706 0.14
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.11
711 0.08
712 0.08
713 0.06
714 0.06
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.05
722 0.07
723 0.07
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.09
728 0.11
729 0.13
730 0.12
731 0.12
732 0.12
733 0.13
734 0.14
735 0.12
736 0.11
737 0.08
738 0.12
739 0.12
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.1
744 0.1
745 0.12
746 0.1
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.15
751 0.18
752 0.2
753 0.18
754 0.18
755 0.18
756 0.22
757 0.26
758 0.22
759 0.21
760 0.28
761 0.36
762 0.36
763 0.35
764 0.33
765 0.31
766 0.34
767 0.41
768 0.42
769 0.38
770 0.4
771 0.41
772 0.4
773 0.39
774 0.36
775 0.28
776 0.2
777 0.16
778 0.14
779 0.13
780 0.11
781 0.1
782 0.12
783 0.1
784 0.09
785 0.08
786 0.07
787 0.06
788 0.06
789 0.06
790 0.04
791 0.04
792 0.04
793 0.04
794 0.04
795 0.06
796 0.08
797 0.08
798 0.14
799 0.16
800 0.2
801 0.22
802 0.29
803 0.31
804 0.38
805 0.43
806 0.48
807 0.55
808 0.56
809 0.64
810 0.64
811 0.68
812 0.68
813 0.72
814 0.71
815 0.71
816 0.68
817 0.6
818 0.54
819 0.46
820 0.39
821 0.33
822 0.27
823 0.19
824 0.16
825 0.16
826 0.15
827 0.16
828 0.17
829 0.15
830 0.13
831 0.14
832 0.15
833 0.22
834 0.28
835 0.33
836 0.35
837 0.41
838 0.44
839 0.5
840 0.53
841 0.53
842 0.56
843 0.55
844 0.52
845 0.45
846 0.43
847 0.36
848 0.33
849 0.28
850 0.2
851 0.21
852 0.22
853 0.25
854 0.26
855 0.25
856 0.23
857 0.21
858 0.19
859 0.12
860 0.1
861 0.08
862 0.06
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.06
868 0.06
869 0.04
870 0.04
871 0.04
872 0.04
873 0.03
874 0.04
875 0.03
876 0.03
877 0.03
878 0.03
879 0.03
880 0.03
881 0.03
882 0.03
883 0.03
884 0.03
885 0.03
886 0.03
887 0.04
888 0.04
889 0.05
890 0.09
891 0.1
892 0.14
893 0.2
894 0.26
895 0.32
896 0.42
897 0.52
898 0.55
899 0.59
900 0.65
901 0.63
902 0.64
903 0.63
904 0.56
905 0.48
906 0.42
907 0.36
908 0.28
909 0.23
910 0.17
911 0.12
912 0.08
913 0.06
914 0.07
915 0.11
916 0.14
917 0.17
918 0.18
919 0.21
920 0.3
921 0.39
922 0.5
923 0.58
924 0.66
925 0.73
926 0.83
927 0.89
928 0.9
929 0.9
930 0.88
931 0.87
932 0.85
933 0.83
934 0.76
935 0.68
936 0.63
937 0.54
938 0.46
939 0.36
940 0.26
941 0.2
942 0.22
943 0.2
944 0.21
945 0.2
946 0.18
947 0.2
948 0.26
949 0.29
950 0.26
951 0.32
952 0.35
953 0.4
954 0.43
955 0.43
956 0.38
957 0.32
958 0.33
959 0.27
960 0.2
961 0.18
962 0.2
963 0.23
964 0.3
965 0.38
966 0.44
967 0.48
968 0.53
969 0.6
970 0.62
971 0.67
972 0.65
973 0.66
974 0.67
975 0.73
976 0.77
977 0.76
978 0.76
979 0.77
980 0.75
981 0.74
982 0.73
983 0.72
984 0.71
985 0.72
986 0.71
987 0.72
988 0.76