FuNGI

A0A397GFC8

Protein Details

Accession

A0A397GFC8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-48	FANSNQSHNNRNSKNKWNNNNNNNAQHP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
601-634	DKEKGKQKETEEEKVKEKEKVKEKVKEKEKEKDK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain IPR025852 SM_dom_ATX
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD PF14438 SM-ATX

Amino Acid Sequences

MSSATVRPKGGRRQEGGYQSFANSNQSHNNRNSKNKWNNNNNNNAQHPANSVPRSQTIPPTTQPSNNYHNTNNTSHATPSGTNSFKPIELVVHDEVSANHMHDRMLYLLSNFVGINVVVTVKTGIKYQGLFHAAYTEGELGVVLKLARKVLTKAEEKNQSNRVIPTYIIPHRDVMEILACNVDFSTSSDKPVSEREGFRIDTDITGNRNEIRERELHKWTPDESGETMKGLEDDVSPESNSASWDQFAANEQLFGLTTDFNEEFYTTKLDRSRADFKERERQAIAIANEINKTTSTNTHILEERGYVVEESQMDEEEKYGAVVRNRDPSKYTPPALRKLQEQHQSQSPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQGSTTPVVKKQETVKESNKDVKPKPVEESKQNIKQVPPSVTSIAPSSSLPKIPPFVPNALNGSLAPNASLAPNPSLAPNPSLAPNTSLAPNASLAPNASLAPNASLTPNPSLAPNASLAPNPSLAHFRITEPAMAALNSHTQKKSGTDSEAQIVTTFRKFATNEKERLQQRKQAIVKKEMDGKVAELKKWRLEFKLNKPLPQDLIPILTKDKSKQLELELAVKSAAEMTKKENDKEKGKQKETEEEKVKEKEKVKEKVKEKEKEKDKEQETNKTKDDENKLKEKSNAPNTSEFTPPIIKIEDEKSQKSNGESKVTSDKPTSTADKAPPQFPPSRTHITAHSNPHTTSHTTSHTTSTSTQFKLNVKASEWKPNPNATPNTTGDKRSPGSSPFFGNRQLKKNSATLKDGFNPFQKGKPLANPSSIPPTWPFGYRPFRHHFSVTNNYDDDIYSQAAVNQGFGFATYPVAAPYRYPAGTQFVGVPPMPMQQTTPIQYMQQGFVPGMPFTTAPMPPTGGPPTMYSPQIPPVMPQHFSSQGFPSPGRTPMVPAGMHPQIYQPYQNPHGLPPMIRYPHDMVSHVPPNGVMMGQRPMMMDPHYVQTENAPMEVMQVSDQTTNQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.72
3	0.67
4	0.61
5	0.52
6	0.45
7	0.44
8	0.39
9	0.37
10	0.29
11	0.29
12	0.35
13	0.39
14	0.45
15	0.5
16	0.59
17	0.61
18	0.7
19	0.74
20	0.75
21	0.81
22	0.83
23	0.86
24	0.87
25	0.9
26	0.89
27	0.91
28	0.89
29	0.85
30	0.78
31	0.72
32	0.62
33	0.53
34	0.47
35	0.42
36	0.42
37	0.38
38	0.37
39	0.36
40	0.38
41	0.41
42	0.4
43	0.44
44	0.41
45	0.43
46	0.45
47	0.48
48	0.49
49	0.49
50	0.51
51	0.48
52	0.51
53	0.52
54	0.53
55	0.5
56	0.54
57	0.54
58	0.52
59	0.51
60	0.46
61	0.42
62	0.38
63	0.36
64	0.31
65	0.27
66	0.29
67	0.32
68	0.31
69	0.29
70	0.32
71	0.32
72	0.28
73	0.28
74	0.24
75	0.19
76	0.18
77	0.24
78	0.22
79	0.21
80	0.2
81	0.2
82	0.19
83	0.19
84	0.18
85	0.13
86	0.13
87	0.13
88	0.13
89	0.13
90	0.15
91	0.14
92	0.15
93	0.15
94	0.13
95	0.14
96	0.14
97	0.15
98	0.12
99	0.11
100	0.1
101	0.09
102	0.08
103	0.07
104	0.07
105	0.06
106	0.07
107	0.08
108	0.09
109	0.1
110	0.11
111	0.13
112	0.15
113	0.16
114	0.18
115	0.23
116	0.25
117	0.24
118	0.23
119	0.23
120	0.21
121	0.2
122	0.2
123	0.13
124	0.1
125	0.1
126	0.09
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.06
131	0.08
132	0.1
133	0.11
134	0.14
135	0.15
136	0.18
137	0.24
138	0.31
139	0.36
140	0.4
141	0.48
142	0.55
143	0.57
144	0.62
145	0.62
146	0.59
147	0.56
148	0.52
149	0.47
150	0.38
151	0.35
152	0.31
153	0.32
154	0.33
155	0.33
156	0.32
157	0.3
158	0.3
159	0.31
160	0.27
161	0.21
162	0.2
163	0.16
164	0.15
165	0.15
166	0.13
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.07
171	0.09
172	0.17
173	0.16
174	0.19
175	0.21
176	0.21
177	0.23
178	0.27
179	0.3
180	0.28
181	0.3
182	0.31
183	0.35
184	0.36
185	0.35
186	0.33
187	0.27
188	0.22
189	0.23
190	0.21
191	0.18
192	0.19
193	0.2
194	0.19
195	0.21
196	0.22
197	0.21
198	0.22
199	0.26
200	0.3
201	0.35
202	0.4
203	0.42
204	0.44
205	0.45
206	0.43
207	0.41
208	0.37
209	0.35
210	0.29
211	0.28
212	0.26
213	0.23
214	0.22
215	0.17
216	0.16
217	0.12
218	0.12
219	0.07
220	0.09
221	0.1
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.11
227	0.12
228	0.12
229	0.11
230	0.1
231	0.11
232	0.1
233	0.11
234	0.13
235	0.14
236	0.12
237	0.11
238	0.11
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.09
243	0.06
244	0.06
245	0.1
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.17
253	0.13
254	0.17
255	0.2
256	0.23
257	0.25
258	0.31
259	0.39
260	0.39
261	0.47
262	0.48
263	0.49
264	0.57
265	0.56
266	0.54
267	0.46
268	0.42
269	0.35
270	0.37
271	0.32
272	0.26
273	0.25
274	0.22
275	0.21
276	0.21
277	0.19
278	0.13
279	0.14
280	0.12
281	0.13
282	0.17
283	0.2
284	0.2
285	0.22
286	0.24
287	0.24
288	0.23
289	0.2
290	0.17
291	0.14
292	0.13
293	0.1
294	0.09
295	0.1
296	0.09
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.08
304	0.08
305	0.07
306	0.08
307	0.11
308	0.13
309	0.17
310	0.19
311	0.28
312	0.29
313	0.3
314	0.31
315	0.33
316	0.4
317	0.41
318	0.42
319	0.4
320	0.45
321	0.51
322	0.54
323	0.51
324	0.48
325	0.48
326	0.54
327	0.55
328	0.53
329	0.49
330	0.5
331	0.51
332	0.47
333	0.51
334	0.48
335	0.46
336	0.48
337	0.52
338	0.52
339	0.57
340	0.65
341	0.63
342	0.64
343	0.65
344	0.67
345	0.67
346	0.67
347	0.66
348	0.63
349	0.63
350	0.62
351	0.6
352	0.55
353	0.48
354	0.42
355	0.36
356	0.31
357	0.26
358	0.24
359	0.2
360	0.23
361	0.26
362	0.25
363	0.27
364	0.31
365	0.37
366	0.37
367	0.42
368	0.45
369	0.46
370	0.5
371	0.56
372	0.53
373	0.53
374	0.51
375	0.53
376	0.51
377	0.48
378	0.48
379	0.48
380	0.48
381	0.47
382	0.53
383	0.52
384	0.54
385	0.55
386	0.52
387	0.45
388	0.46
389	0.45
390	0.4
391	0.34
392	0.29
393	0.28
394	0.26
395	0.25
396	0.21
397	0.16
398	0.14
399	0.12
400	0.12
401	0.12
402	0.13
403	0.13
404	0.13
405	0.15
406	0.15
407	0.18
408	0.18
409	0.2
410	0.2
411	0.21
412	0.23
413	0.21
414	0.21
415	0.17
416	0.16
417	0.13
418	0.12
419	0.1
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.1
431	0.1
432	0.1
433	0.1
434	0.11
435	0.12
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.09
446	0.08
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.08
461	0.09
462	0.1
463	0.09
464	0.09
465	0.1
466	0.09
467	0.1
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.09
472	0.1
473	0.1
474	0.11
475	0.1
476	0.1
477	0.11
478	0.11
479	0.13
480	0.13
481	0.12
482	0.14
483	0.14
484	0.14
485	0.11
486	0.12
487	0.1
488	0.09
489	0.08
490	0.06
491	0.11
492	0.12
493	0.14
494	0.13
495	0.14
496	0.15
497	0.16
498	0.2
499	0.17
500	0.2
501	0.2
502	0.21
503	0.23
504	0.23
505	0.21
506	0.17
507	0.15
508	0.13
509	0.11
510	0.1
511	0.08
512	0.11
513	0.11
514	0.17
515	0.26
516	0.32
517	0.35
518	0.37
519	0.45
520	0.47
521	0.55
522	0.52
523	0.49
524	0.46
525	0.51
526	0.54
527	0.54
528	0.53
529	0.53
530	0.52
531	0.48
532	0.52
533	0.44
534	0.4
535	0.33
536	0.29
537	0.29
538	0.28
539	0.27
540	0.24
541	0.25
542	0.28
543	0.31
544	0.32
545	0.27
546	0.35
547	0.42
548	0.47
549	0.56
550	0.53
551	0.53
552	0.53
553	0.52
554	0.45
555	0.38
556	0.31
557	0.2
558	0.22
559	0.19
560	0.18
561	0.17
562	0.17
563	0.16
564	0.16
565	0.22
566	0.21
567	0.22
568	0.23
569	0.23
570	0.27
571	0.27
572	0.3
573	0.24
574	0.22
575	0.2
576	0.18
577	0.15
578	0.11
579	0.11
580	0.07
581	0.08
582	0.12
583	0.19
584	0.22
585	0.24
586	0.31
587	0.36
588	0.42
589	0.5
590	0.56
591	0.58
592	0.61
593	0.64
594	0.6
595	0.63
596	0.63
597	0.63
598	0.61
599	0.54
600	0.55
601	0.55
602	0.54
603	0.51
604	0.5
605	0.5
606	0.51
607	0.58
608	0.61
609	0.64
610	0.69
611	0.72
612	0.76
613	0.77
614	0.74
615	0.74
616	0.76
617	0.74
618	0.73
619	0.72
620	0.67
621	0.67
622	0.66
623	0.67
624	0.63
625	0.62
626	0.58
627	0.51
628	0.49
629	0.48
630	0.52
631	0.5
632	0.5
633	0.52
634	0.53
635	0.54
636	0.57
637	0.55
638	0.56
639	0.56
640	0.57
641	0.51
642	0.54
643	0.52
644	0.5
645	0.46
646	0.37
647	0.3
648	0.26
649	0.22
650	0.19
651	0.18
652	0.15
653	0.16
654	0.19
655	0.24
656	0.26
657	0.29
658	0.29
659	0.3
660	0.32
661	0.33
662	0.36
663	0.32
664	0.35
665	0.32
666	0.33
667	0.39
668	0.4
669	0.39
670	0.34
671	0.31
672	0.27
673	0.31
674	0.32
675	0.26
676	0.3
677	0.32
678	0.38
679	0.4
680	0.4
681	0.39
682	0.4
683	0.43
684	0.4
685	0.41
686	0.39
687	0.44
688	0.43
689	0.42
690	0.42
691	0.44
692	0.48
693	0.5
694	0.49
695	0.44
696	0.42
697	0.43
698	0.41
699	0.36
700	0.33
701	0.29
702	0.28
703	0.28
704	0.29
705	0.3
706	0.28
707	0.27
708	0.27
709	0.29
710	0.31
711	0.29
712	0.29
713	0.31
714	0.34
715	0.38
716	0.4
717	0.36
718	0.33
719	0.41
720	0.42
721	0.47
722	0.47
723	0.47
724	0.46
725	0.49
726	0.5
727	0.49
728	0.51
729	0.44
730	0.48
731	0.43
732	0.47
733	0.44
734	0.43
735	0.38
736	0.39
737	0.36
738	0.32
739	0.32
740	0.29
741	0.32
742	0.32
743	0.34
744	0.32
745	0.33
746	0.39
747	0.45
748	0.47
749	0.49
750	0.52
751	0.51
752	0.51
753	0.56
754	0.55
755	0.52
756	0.51
757	0.45
758	0.46
759	0.48
760	0.49
761	0.46
762	0.42
763	0.43
764	0.4
765	0.41
766	0.41
767	0.39
768	0.38
769	0.43
770	0.46
771	0.44
772	0.47
773	0.44
774	0.42
775	0.46
776	0.43
777	0.37
778	0.3
779	0.32
780	0.29
781	0.3
782	0.29
783	0.3
784	0.4
785	0.42
786	0.48
787	0.5
788	0.53
789	0.55
790	0.55
791	0.51
792	0.49
793	0.56
794	0.51
795	0.48
796	0.44
797	0.4
798	0.38
799	0.33
800	0.26
801	0.17
802	0.15
803	0.11
804	0.11
805	0.11
806	0.14
807	0.13
808	0.13
809	0.11
810	0.1
811	0.09
812	0.1
813	0.1
814	0.07
815	0.08
816	0.07
817	0.07
818	0.08
819	0.1
820	0.1
821	0.09
822	0.13
823	0.17
824	0.17
825	0.17
826	0.18
827	0.23
828	0.23
829	0.24
830	0.23
831	0.2
832	0.22
833	0.22
834	0.21
835	0.16
836	0.19
837	0.19
838	0.16
839	0.16
840	0.19
841	0.24
842	0.26
843	0.28
844	0.25
845	0.25
846	0.29
847	0.31
848	0.26
849	0.24
850	0.21
851	0.19
852	0.19
853	0.2
854	0.15
855	0.14
856	0.13
857	0.11
858	0.12
859	0.16
860	0.15
861	0.15
862	0.16
863	0.18
864	0.17
865	0.22
866	0.23
867	0.21
868	0.21
869	0.23
870	0.27
871	0.28
872	0.29
873	0.27
874	0.26
875	0.3
876	0.33
877	0.3
878	0.27
879	0.32
880	0.35
881	0.35
882	0.35
883	0.35
884	0.37
885	0.39
886	0.39
887	0.35
888	0.34
889	0.36
890	0.35
891	0.34
892	0.31
893	0.32
894	0.32
895	0.29
896	0.29
897	0.3
898	0.35
899	0.29
900	0.28
901	0.32
902	0.32
903	0.33
904	0.28
905	0.28
906	0.27
907	0.3
908	0.33
909	0.3
910	0.34
911	0.38
912	0.43
913	0.41
914	0.39
915	0.43
916	0.41
917	0.38
918	0.35
919	0.4
920	0.39
921	0.38
922	0.42
923	0.39
924	0.43
925	0.44
926	0.4
927	0.34
928	0.39
929	0.44
930	0.39
931	0.35
932	0.28
933	0.27
934	0.26
935	0.23
936	0.16
937	0.12
938	0.16
939	0.17
940	0.18
941	0.17
942	0.17
943	0.19
944	0.2
945	0.21
946	0.2
947	0.25
948	0.26
949	0.26
950	0.25
951	0.26
952	0.3
953	0.27
954	0.25
955	0.2
956	0.17
957	0.19
958	0.19
959	0.17
960	0.11
961	0.11
962	0.13

A0A397GFC8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer