Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397G222

Protein Details
Accession A0A397G222    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61VALRSKVKGKPIKNMAPRRMHydrophilic
104-128MSQEEDKKKSEKKKEDSKQTINIEKHydrophilic
585-612VPKNEPRPFLRKFKIQRSKQDRPPDLMMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-117KKSEKKK
Subcellular Location(s) mito 16.5, mito_nucl 13.5, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPGFFRWLSLKYPHIVETVKKSPRNKTDFLYLDINAFFHVALRSKVKGKPIKNMAPRRMLGKVFAEMDTAFNITDPQVLIYIAMDGVAPRAKMNEQRSRRFMSQEEDKKKSEKKKEDSKQTINIEKPIIEKSIIEQSTKSGFFVPVDNVSISAGTEFMQAANEAIKFYIYQRLNGKHRNIQIIFNDSKVAGEGEHKVFRFLNAQRNHPNYNSKHKHVVCGGDADFIMYALLTHEPSLRILRPGLEGKDIILHINKLRKHIIHDMIQQEGETSTEINEDNIIDDFVCIAFLLGNDFLPRLTHLGETRVDLLYDAYSRYFKQEKQYITKKDGTLNLKMFLKFLVQLSKLKPGTIRRGSSFPEEIVKDETIIAKRANDYLKTICWTFQYYNGDCPSWRYFYAHHRPPTIPEILKHVKVENFDQTFKKDLPLRPFEQLICILPPNANYLVPAPFRPLFTNPDSPLKEYFPKTFKTSNHKALLPFVDEEHLIQAMKPGYTLLKKEDTLRDMLNGRTHIYAGRYSASYSAVFSLCSGRCRVPNFPISSVVFGKLLYDGPMLKSIEPPVDEFQKINRNCVAMVQYQLPFVPKNEPRPFLRKFKIQRSKQDRPPDLMM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.35
4 0.35
5 0.35
6 0.39
7 0.44
8 0.49
9 0.53
10 0.58
11 0.64
12 0.71
13 0.74
14 0.7
15 0.65
16 0.67
17 0.63
18 0.62
19 0.56
20 0.46
21 0.42
22 0.37
23 0.33
24 0.23
25 0.2
26 0.14
27 0.11
28 0.14
29 0.13
30 0.17
31 0.2
32 0.24
33 0.3
34 0.34
35 0.42
36 0.48
37 0.51
38 0.58
39 0.64
40 0.7
41 0.74
42 0.81
43 0.79
44 0.79
45 0.75
46 0.7
47 0.66
48 0.57
49 0.51
50 0.44
51 0.4
52 0.33
53 0.32
54 0.29
55 0.23
56 0.23
57 0.19
58 0.17
59 0.12
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.07
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.11
80 0.15
81 0.23
82 0.31
83 0.4
84 0.47
85 0.55
86 0.61
87 0.66
88 0.66
89 0.63
90 0.57
91 0.54
92 0.56
93 0.58
94 0.61
95 0.59
96 0.59
97 0.61
98 0.66
99 0.68
100 0.68
101 0.69
102 0.7
103 0.76
104 0.83
105 0.87
106 0.89
107 0.86
108 0.85
109 0.81
110 0.79
111 0.71
112 0.65
113 0.55
114 0.47
115 0.41
116 0.35
117 0.29
118 0.22
119 0.19
120 0.18
121 0.25
122 0.25
123 0.24
124 0.21
125 0.22
126 0.27
127 0.27
128 0.25
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.19
133 0.19
134 0.15
135 0.17
136 0.16
137 0.15
138 0.14
139 0.13
140 0.11
141 0.08
142 0.07
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.17
158 0.16
159 0.2
160 0.27
161 0.35
162 0.42
163 0.49
164 0.53
165 0.51
166 0.55
167 0.6
168 0.54
169 0.52
170 0.47
171 0.47
172 0.42
173 0.36
174 0.32
175 0.23
176 0.21
177 0.17
178 0.14
179 0.07
180 0.09
181 0.13
182 0.15
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.2
187 0.21
188 0.26
189 0.26
190 0.32
191 0.32
192 0.38
193 0.45
194 0.5
195 0.52
196 0.48
197 0.52
198 0.48
199 0.56
200 0.56
201 0.52
202 0.57
203 0.54
204 0.55
205 0.5
206 0.48
207 0.38
208 0.36
209 0.32
210 0.24
211 0.23
212 0.18
213 0.14
214 0.11
215 0.09
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.16
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.17
237 0.16
238 0.14
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.19
243 0.2
244 0.21
245 0.24
246 0.24
247 0.28
248 0.34
249 0.35
250 0.35
251 0.39
252 0.37
253 0.34
254 0.33
255 0.28
256 0.21
257 0.17
258 0.12
259 0.07
260 0.06
261 0.04
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.12
306 0.14
307 0.16
308 0.23
309 0.28
310 0.32
311 0.4
312 0.48
313 0.49
314 0.52
315 0.55
316 0.49
317 0.47
318 0.49
319 0.44
320 0.41
321 0.38
322 0.36
323 0.33
324 0.32
325 0.28
326 0.22
327 0.19
328 0.14
329 0.14
330 0.15
331 0.14
332 0.18
333 0.19
334 0.27
335 0.26
336 0.26
337 0.28
338 0.29
339 0.37
340 0.4
341 0.41
342 0.36
343 0.39
344 0.41
345 0.41
346 0.37
347 0.28
348 0.26
349 0.23
350 0.22
351 0.22
352 0.2
353 0.15
354 0.15
355 0.17
356 0.14
357 0.16
358 0.15
359 0.13
360 0.14
361 0.17
362 0.19
363 0.17
364 0.19
365 0.19
366 0.2
367 0.21
368 0.21
369 0.18
370 0.17
371 0.2
372 0.18
373 0.22
374 0.27
375 0.26
376 0.31
377 0.32
378 0.3
379 0.27
380 0.31
381 0.28
382 0.24
383 0.23
384 0.2
385 0.21
386 0.31
387 0.41
388 0.45
389 0.45
390 0.47
391 0.47
392 0.49
393 0.51
394 0.46
395 0.38
396 0.31
397 0.35
398 0.35
399 0.37
400 0.34
401 0.32
402 0.29
403 0.29
404 0.32
405 0.31
406 0.3
407 0.31
408 0.31
409 0.31
410 0.32
411 0.3
412 0.32
413 0.31
414 0.33
415 0.38
416 0.43
417 0.44
418 0.43
419 0.45
420 0.4
421 0.36
422 0.33
423 0.26
424 0.21
425 0.18
426 0.16
427 0.14
428 0.15
429 0.15
430 0.15
431 0.13
432 0.12
433 0.13
434 0.17
435 0.17
436 0.17
437 0.19
438 0.19
439 0.21
440 0.23
441 0.24
442 0.26
443 0.3
444 0.36
445 0.34
446 0.41
447 0.42
448 0.42
449 0.41
450 0.4
451 0.41
452 0.38
453 0.42
454 0.37
455 0.38
456 0.41
457 0.45
458 0.47
459 0.5
460 0.56
461 0.58
462 0.59
463 0.59
464 0.55
465 0.54
466 0.5
467 0.43
468 0.36
469 0.27
470 0.23
471 0.2
472 0.2
473 0.15
474 0.13
475 0.1
476 0.09
477 0.13
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.11
482 0.15
483 0.19
484 0.21
485 0.22
486 0.26
487 0.27
488 0.33
489 0.39
490 0.37
491 0.37
492 0.35
493 0.35
494 0.33
495 0.34
496 0.33
497 0.28
498 0.27
499 0.25
500 0.24
501 0.22
502 0.22
503 0.21
504 0.18
505 0.19
506 0.17
507 0.18
508 0.18
509 0.18
510 0.16
511 0.15
512 0.16
513 0.14
514 0.13
515 0.13
516 0.19
517 0.18
518 0.21
519 0.23
520 0.24
521 0.29
522 0.33
523 0.38
524 0.39
525 0.45
526 0.48
527 0.47
528 0.49
529 0.46
530 0.45
531 0.41
532 0.36
533 0.28
534 0.22
535 0.21
536 0.16
537 0.15
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.14
542 0.2
543 0.2
544 0.2
545 0.22
546 0.22
547 0.25
548 0.25
549 0.26
550 0.26
551 0.3
552 0.31
553 0.29
554 0.33
555 0.39
556 0.39
557 0.4
558 0.39
559 0.35
560 0.34
561 0.37
562 0.35
563 0.28
564 0.31
565 0.31
566 0.28
567 0.28
568 0.29
569 0.27
570 0.24
571 0.23
572 0.29
573 0.31
574 0.4
575 0.48
576 0.52
577 0.56
578 0.63
579 0.68
580 0.69
581 0.7
582 0.7
583 0.72
584 0.77
585 0.82
586 0.82
587 0.87
588 0.86
589 0.89
590 0.88
591 0.9
592 0.85