Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JJK1

Protein Details
Accession A0A397JJK1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
370-403QSPIIKNPSKQTKPKGRPKGTKRIKASHEKGKLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
377-400PSKQTKPKGRPKGTKRIKASHEKG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031052  FHY3/FAR1  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTDADPAVHAAIRSTFLTTYPMHCTFHISQNLIKKLQKLLGKKFQEFSSKFYIVRNTLHKPFFESKWKDLINEYSEAQQYLNTLYNTKEAWAHPWTCRQFTAGLHASSPVESLNVWIKSYIFNSNISLCELADVIEKRQLSENRNHQLILWKAAIPCISTQISTSAFMFASIDKKLEEYLPPAILDLQKSEIYQCVFYDALQVNQEAINEFDQYNLLSDQCLEDIPDALCRHYFQIMLRTPITKFHLRLIPSRWYNKNKDPSREPFLVASKFEDENINIIPQSEIPFLTAIYQANPQDSITLHERLTDIQLYGKISGLAHKVTMKATRKKDIRIIHLLENYLKEEEQGESFVENVDNIEIEDCEIDKENQSPIIKNPSKQTKPKGRPKGTKRIKASHEKGKLFSSSLVINKQYKCSNCGDNGHNKRNCNRSMGIIIDFVQTGENSENSCK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.18
5 0.19
6 0.21
7 0.26
8 0.29
9 0.28
10 0.28
11 0.35
12 0.35
13 0.42
14 0.45
15 0.4
16 0.42
17 0.49
18 0.55
19 0.53
20 0.52
21 0.46
22 0.45
23 0.49
24 0.51
25 0.51
26 0.55
27 0.6
28 0.64
29 0.65
30 0.64
31 0.63
32 0.66
33 0.59
34 0.54
35 0.53
36 0.48
37 0.44
38 0.44
39 0.46
40 0.39
41 0.44
42 0.46
43 0.44
44 0.49
45 0.51
46 0.48
47 0.49
48 0.51
49 0.5
50 0.54
51 0.53
52 0.49
53 0.55
54 0.55
55 0.49
56 0.48
57 0.48
58 0.41
59 0.38
60 0.34
61 0.3
62 0.3
63 0.29
64 0.25
65 0.19
66 0.16
67 0.16
68 0.19
69 0.15
70 0.15
71 0.16
72 0.19
73 0.18
74 0.18
75 0.2
76 0.16
77 0.21
78 0.25
79 0.28
80 0.28
81 0.38
82 0.41
83 0.39
84 0.39
85 0.36
86 0.33
87 0.3
88 0.36
89 0.31
90 0.28
91 0.25
92 0.26
93 0.25
94 0.22
95 0.22
96 0.13
97 0.08
98 0.07
99 0.09
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.17
106 0.19
107 0.21
108 0.16
109 0.17
110 0.19
111 0.2
112 0.2
113 0.2
114 0.18
115 0.13
116 0.12
117 0.1
118 0.09
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.23
126 0.27
127 0.27
128 0.35
129 0.43
130 0.46
131 0.47
132 0.46
133 0.4
134 0.42
135 0.4
136 0.35
137 0.27
138 0.24
139 0.23
140 0.24
141 0.24
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.15
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.06
212 0.06
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.09
222 0.17
223 0.18
224 0.21
225 0.22
226 0.22
227 0.21
228 0.24
229 0.28
230 0.23
231 0.23
232 0.24
233 0.27
234 0.28
235 0.32
236 0.33
237 0.36
238 0.37
239 0.43
240 0.47
241 0.5
242 0.54
243 0.58
244 0.64
245 0.62
246 0.64
247 0.65
248 0.63
249 0.63
250 0.58
251 0.51
252 0.44
253 0.43
254 0.38
255 0.31
256 0.27
257 0.23
258 0.21
259 0.21
260 0.19
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.12
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.09
278 0.09
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.15
287 0.15
288 0.17
289 0.16
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.19
294 0.16
295 0.13
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.14
300 0.14
301 0.12
302 0.11
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.13
307 0.14
308 0.16
309 0.17
310 0.25
311 0.31
312 0.37
313 0.43
314 0.51
315 0.54
316 0.57
317 0.63
318 0.62
319 0.61
320 0.61
321 0.59
322 0.56
323 0.54
324 0.51
325 0.45
326 0.39
327 0.34
328 0.26
329 0.22
330 0.16
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.1
352 0.11
353 0.12
354 0.14
355 0.15
356 0.2
357 0.22
358 0.22
359 0.24
360 0.35
361 0.37
362 0.39
363 0.46
364 0.52
365 0.59
366 0.65
367 0.72
368 0.72
369 0.79
370 0.86
371 0.88
372 0.88
373 0.9
374 0.91
375 0.92
376 0.91
377 0.91
378 0.88
379 0.87
380 0.85
381 0.85
382 0.84
383 0.83
384 0.82
385 0.76
386 0.7
387 0.65
388 0.59
389 0.49
390 0.43
391 0.35
392 0.3
393 0.31
394 0.33
395 0.34
396 0.39
397 0.39
398 0.43
399 0.48
400 0.45
401 0.46
402 0.46
403 0.47
404 0.47
405 0.51
406 0.52
407 0.56
408 0.64
409 0.69
410 0.69
411 0.69
412 0.71
413 0.73
414 0.69
415 0.65
416 0.57
417 0.52
418 0.52
419 0.49
420 0.44
421 0.37
422 0.34
423 0.29
424 0.27
425 0.21
426 0.17
427 0.13
428 0.13
429 0.14
430 0.14