Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

K1X0J7

Protein Details
Accession K1X0J7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
423-447EAEAEHKRRVKQKKIERRGGKAPNGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-451HKRRVKQKKIERRGGKAPNGGPSR
511-545PRDNFRARGRGGDRGRGDRARGRGDRGDRGRGRGG
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 9.833, cysk 8, nucl 6.5, mito_nucl 4.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG mbe:MBM_02908  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MQDTVEEEPPLTRGLEALLGGLGELEDTAPAAATAIEQDAAAPEAPAVHEVQVQVDVPTPALSTKTGSTFPPKPLIPGLFLGVHLPGISSGAPSPVVANDERISEYVAPTPPATAPDAPIEESICTHIEQEKLFLLNSPVSIPGNIPSPAKDAPMQDSAPESLEKKSEPVPDIARPNVENTPVAAEDTLMSEVPLVEADPPVDGVATAEDEHPEWEIDSSPIESSSEDSSSDDSSSDESEEGDNVYKLMSPEEQARILMEGDGGSDDEGASKSKGTGTQLRTKNEVPDVVVPKPDVTITPEMPIVEVGNVEHIVESTLVIKAKISGEFRCLESGSVLCLEDRSVIGVVAEILGPVQKPLYSVLFTNAGEIAQAGLSLGTKVFYSEKHSTFVFTQALKAFKGSDASNLHDEEVGDEEMEFSDDEAEAEHKRRVKQKKIERRGGKAPNGGPSRGGHPLQQQHTPHDSSTGPSYDDAEDDGPYRPLARPIGFENSIGCGEAPQEGLPGSYGRPPRDNFRARGRGGDRGRGDRARGRGDRGDRGRGRGGYQDRRGGGQNQNSGHTLPPRPQTYTQPPASYPPPQYQQPAPQAINLSQAPPAPPSIPNFFMPPVAYNPQMPWPQFPMQPPFQQQQPYQNQHPQMPWQNPSAGQPPAGGAYINPAFMPGQWGQQRPGSQGGGADVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.11
4 0.1
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.06
10 0.04
11 0.04
12 0.04
13 0.03
14 0.04
15 0.04
16 0.04
17 0.04
18 0.04
19 0.04
20 0.04
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.06
25 0.07
26 0.07
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.11
37 0.11
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.14
52 0.17
53 0.18
54 0.21
55 0.28
56 0.32
57 0.36
58 0.4
59 0.38
60 0.38
61 0.43
62 0.42
63 0.37
64 0.33
65 0.32
66 0.25
67 0.25
68 0.22
69 0.17
70 0.14
71 0.11
72 0.1
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.12
84 0.12
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.17
89 0.17
90 0.19
91 0.16
92 0.17
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.18
97 0.19
98 0.17
99 0.18
100 0.2
101 0.17
102 0.17
103 0.19
104 0.21
105 0.2
106 0.2
107 0.19
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.15
115 0.16
116 0.16
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.15
124 0.15
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.18
136 0.19
137 0.2
138 0.22
139 0.2
140 0.23
141 0.27
142 0.26
143 0.22
144 0.23
145 0.22
146 0.21
147 0.2
148 0.17
149 0.14
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.2
154 0.24
155 0.24
156 0.28
157 0.3
158 0.34
159 0.38
160 0.38
161 0.36
162 0.31
163 0.32
164 0.3
165 0.28
166 0.22
167 0.18
168 0.19
169 0.17
170 0.16
171 0.13
172 0.11
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.08
237 0.09
238 0.12
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.11
246 0.08
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.08
261 0.09
262 0.12
263 0.2
264 0.23
265 0.33
266 0.38
267 0.4
268 0.43
269 0.43
270 0.42
271 0.37
272 0.32
273 0.25
274 0.26
275 0.27
276 0.24
277 0.23
278 0.2
279 0.19
280 0.18
281 0.16
282 0.11
283 0.11
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.1
292 0.06
293 0.06
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.11
311 0.13
312 0.12
313 0.15
314 0.16
315 0.17
316 0.17
317 0.16
318 0.13
319 0.11
320 0.11
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.06
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.06
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.05
369 0.06
370 0.13
371 0.19
372 0.2
373 0.22
374 0.22
375 0.23
376 0.23
377 0.26
378 0.21
379 0.16
380 0.17
381 0.18
382 0.19
383 0.17
384 0.17
385 0.14
386 0.12
387 0.14
388 0.12
389 0.15
390 0.16
391 0.19
392 0.21
393 0.2
394 0.2
395 0.18
396 0.18
397 0.13
398 0.13
399 0.1
400 0.08
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.07
405 0.06
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.06
412 0.07
413 0.1
414 0.13
415 0.16
416 0.21
417 0.3
418 0.39
419 0.48
420 0.57
421 0.66
422 0.74
423 0.81
424 0.86
425 0.85
426 0.82
427 0.82
428 0.8
429 0.75
430 0.7
431 0.62
432 0.61
433 0.56
434 0.5
435 0.41
436 0.34
437 0.32
438 0.3
439 0.28
440 0.22
441 0.26
442 0.33
443 0.34
444 0.4
445 0.38
446 0.38
447 0.42
448 0.41
449 0.35
450 0.3
451 0.28
452 0.23
453 0.24
454 0.2
455 0.16
456 0.15
457 0.17
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.12
465 0.1
466 0.1
467 0.11
468 0.11
469 0.14
470 0.17
471 0.17
472 0.18
473 0.21
474 0.28
475 0.27
476 0.27
477 0.24
478 0.22
479 0.21
480 0.19
481 0.15
482 0.09
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.13
494 0.18
495 0.2
496 0.26
497 0.28
498 0.35
499 0.44
500 0.5
501 0.49
502 0.55
503 0.61
504 0.56
505 0.63
506 0.59
507 0.59
508 0.55
509 0.58
510 0.52
511 0.49
512 0.54
513 0.48
514 0.49
515 0.45
516 0.48
517 0.49
518 0.47
519 0.47
520 0.49
521 0.51
522 0.57
523 0.56
524 0.6
525 0.54
526 0.56
527 0.57
528 0.5
529 0.47
530 0.46
531 0.5
532 0.5
533 0.52
534 0.54
535 0.49
536 0.5
537 0.51
538 0.49
539 0.47
540 0.45
541 0.46
542 0.41
543 0.43
544 0.42
545 0.39
546 0.36
547 0.34
548 0.3
549 0.3
550 0.36
551 0.37
552 0.41
553 0.43
554 0.49
555 0.53
556 0.59
557 0.57
558 0.53
559 0.51
560 0.51
561 0.52
562 0.49
563 0.44
564 0.42
565 0.43
566 0.43
567 0.47
568 0.47
569 0.51
570 0.52
571 0.55
572 0.49
573 0.46
574 0.46
575 0.42
576 0.42
577 0.34
578 0.28
579 0.22
580 0.23
581 0.21
582 0.19
583 0.21
584 0.17
585 0.19
586 0.22
587 0.26
588 0.28
589 0.28
590 0.3
591 0.28
592 0.28
593 0.27
594 0.25
595 0.25
596 0.26
597 0.26
598 0.24
599 0.25
600 0.31
601 0.35
602 0.34
603 0.33
604 0.35
605 0.38
606 0.41
607 0.45
608 0.45
609 0.45
610 0.51
611 0.52
612 0.5
613 0.5
614 0.53
615 0.51
616 0.54
617 0.59
618 0.6
619 0.62
620 0.66
621 0.66
622 0.64
623 0.64
624 0.62
625 0.61
626 0.6
627 0.56
628 0.52
629 0.5
630 0.46
631 0.48
632 0.44
633 0.36
634 0.3
635 0.27
636 0.25
637 0.23
638 0.22
639 0.17
640 0.11
641 0.17
642 0.17
643 0.17
644 0.15
645 0.15
646 0.15
647 0.15
648 0.21
649 0.14
650 0.22
651 0.28
652 0.31
653 0.33
654 0.39
655 0.41
656 0.39
657 0.44
658 0.37
659 0.31
660 0.29