FuNGI

A0A397G543

Protein Details

Accession

A0A397G543

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-60	PTMENIVKKRGRKPKANKEAQEPVV	Hydrophilic
79-106	DNAAPEKSVTKPRKPRAKKQVQEIHHDP	Hydrophilic
132-157	VPEVVNEKKPRKPRTKKQPHSGPLAI	Hydrophilic
215-239	PQELPVKKSRKPRTKKQEIPIEHPN	Hydrophilic
303-324	DEPGRKVPTKRGRPRKVDTKGS	Basic
337-359	DVSPKSPNPKRGRPRKEKPSEIL	Basic
378-398	ESTQKASSKRGRPRKMKQSET	Hydrophilic
421-446	EIRSLETPKKRRGRPKKENIKLTQDI	Hydrophilic
595-617	YEEHQRKKINTKETIRNDRKREE	Basic
644-687	VEEVEKWEKKQERKHKHADIEFTDYNQVARKKYKKMINNITPDR	Hydrophilic
731-752	VNNQISKREKFSRQKPINDDDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
43-52	KKRGRKPKAN
89-97	KPRKPRAKK
139-149	KKPRKPRTKKQ
221-230	KKSRKPRTKK
307-318	RKVPTKRGRPRK
342-354	SPNPKRGRPRKEK
385-394	SKRGRPRKMK
428-438	PKKRRGRPKKE

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR013260 mRNA_splic_SYF2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF08231 SYF2

Amino Acid Sequences

MPPKRKPTSETSQASNSKKHKLVENINDVKEAGSVPTMENIVKKRGRKPKANKEAQEPVVAENSSNPEGTASLSMQTSDNAAPEKSVTKPRKPRAKKQVQEIHHDPLSIENLLIHPHQEQKTGPVISDVSTVPEVVNEKKPRKPRTKKQPHSGPLAIDNLLIHTSQEPESVPVIQDSTDALKKPIMVRNENHSLEESINQEVDTSSKPPEIVTIPQELPVKKSRKPRTKKQEIPIEHPNAGNAISSVQSDTPDNFIANSSIHQITNIQIKPTESNEILEINNPKDTSLEKEKEDVNAQNTHVDEPGRKVPTKRGRPRKVDTKGSVNENDGLVGNTEDVSPKSPNPKRGRPRKEKPSEILPDGNGPESPINIVIKENDESTQKASSKRGRPRKMKQSETVPKEEHLVKPPATNIIEEKKDEEIRSLETPKKRRGRPKKENIKLTQDITSESVLPHEDKTEEVKKASLTTQQPDIKSGGSQPYFGNSLEVLASVSLNAKEQNQEKIPEAAKEVTEQTIINDRGQNEEKEKVKEKGKKLGEIMEEKVVKDEASSDDDSEQDSPVELTSSEIMKKRFDTLQKLRERRDQAEQINRKETYEEHQRKKINTKETIRNDRKREEAEKLLARKEAEEKGEDYERKQFWNYSVEEVEKWEKKQERKHKHADIEFTDYNQVARKKYKKMINNITPDRALYNEQKAASMSSNVFYRDANSLQYAGVENSPSKEAVDRLTEDVNNQISKREKFSRQKPINDDDDITYINERNRRFNDKIGRFYDKFTQETRENFERGTAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.69
3	0.64
4	0.63
5	0.64
6	0.62
7	0.61
8	0.62
9	0.68
10	0.69
11	0.74
12	0.73
13	0.69
14	0.66
15	0.57
16	0.48
17	0.38
18	0.29
19	0.19
20	0.12
21	0.12
22	0.12
23	0.14
24	0.15
25	0.15
26	0.2
27	0.22
28	0.3
29	0.35
30	0.41
31	0.49
32	0.58
33	0.66
34	0.72
35	0.8
36	0.82
37	0.87
38	0.91
39	0.87
40	0.86
41	0.86
42	0.78
43	0.72
44	0.62
45	0.53
46	0.47
47	0.41
48	0.32
49	0.25
50	0.28
51	0.23
52	0.22
53	0.2
54	0.16
55	0.16
56	0.17
57	0.17
58	0.12
59	0.12
60	0.13
61	0.14
62	0.14
63	0.14
64	0.15
65	0.13
66	0.14
67	0.15
68	0.14
69	0.14
70	0.15
71	0.18
72	0.2
73	0.3
74	0.36
75	0.44
76	0.55
77	0.64
78	0.74
79	0.8
80	0.86
81	0.88
82	0.91
83	0.88
84	0.88
85	0.88
86	0.82
87	0.82
88	0.76
89	0.72
90	0.62
91	0.55
92	0.44
93	0.37
94	0.35
95	0.26
96	0.21
97	0.14
98	0.13
99	0.15
100	0.15
101	0.13
102	0.12
103	0.2
104	0.22
105	0.24
106	0.24
107	0.26
108	0.33
109	0.32
110	0.3
111	0.25
112	0.24
113	0.22
114	0.24
115	0.19
116	0.15
117	0.15
118	0.15
119	0.12
120	0.14
121	0.16
122	0.17
123	0.26
124	0.32
125	0.37
126	0.44
127	0.54
128	0.62
129	0.71
130	0.78
131	0.8
132	0.83
133	0.89
134	0.92
135	0.94
136	0.94
137	0.89
138	0.87
139	0.79
140	0.7
141	0.63
142	0.55
143	0.44
144	0.34
145	0.28
146	0.2
147	0.17
148	0.14
149	0.1
150	0.08
151	0.1
152	0.1
153	0.11
154	0.11
155	0.12
156	0.13
157	0.14
158	0.13
159	0.12
160	0.12
161	0.11
162	0.1
163	0.1
164	0.13
165	0.15
166	0.15
167	0.15
168	0.16
169	0.18
170	0.24
171	0.28
172	0.3
173	0.33
174	0.35
175	0.42
176	0.49
177	0.48
178	0.44
179	0.4
180	0.35
181	0.3
182	0.3
183	0.24
184	0.17
185	0.16
186	0.14
187	0.13
188	0.11
189	0.12
190	0.11
191	0.11
192	0.12
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.15
197	0.16
198	0.17
199	0.18
200	0.22
201	0.21
202	0.26
203	0.3
204	0.28
205	0.29
206	0.35
207	0.37
208	0.37
209	0.47
210	0.54
211	0.6
212	0.69
213	0.76
214	0.79
215	0.85
216	0.89
217	0.88
218	0.88
219	0.82
220	0.8
221	0.79
222	0.73
223	0.63
224	0.54
225	0.44
226	0.34
227	0.29
228	0.22
229	0.13
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.08
234	0.07
235	0.08
236	0.09
237	0.1
238	0.11
239	0.11
240	0.11
241	0.1
242	0.11
243	0.11
244	0.1
245	0.1
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.12
250	0.12
251	0.13
252	0.21
253	0.21
254	0.19
255	0.18
256	0.2
257	0.22
258	0.23
259	0.25
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.18
264	0.17
265	0.18
266	0.19
267	0.16
268	0.17
269	0.16
270	0.15
271	0.15
272	0.16
273	0.18
274	0.24
275	0.26
276	0.25
277	0.28
278	0.29
279	0.3
280	0.33
281	0.29
282	0.24
283	0.24
284	0.23
285	0.23
286	0.23
287	0.21
288	0.19
289	0.17
290	0.15
291	0.15
292	0.21
293	0.22
294	0.24
295	0.25
296	0.33
297	0.43
298	0.53
299	0.6
300	0.65
301	0.7
302	0.77
303	0.84
304	0.84
305	0.82
306	0.8
307	0.74
308	0.71
309	0.65
310	0.62
311	0.55
312	0.46
313	0.4
314	0.3
315	0.27
316	0.18
317	0.14
318	0.1
319	0.08
320	0.07
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.08
326	0.09
327	0.11
328	0.21
329	0.25
330	0.34
331	0.41
332	0.51
333	0.59
334	0.69
335	0.78
336	0.78
337	0.85
338	0.86
339	0.88
340	0.85
341	0.78
342	0.77
343	0.7
344	0.63
345	0.55
346	0.44
347	0.37
348	0.31
349	0.27
350	0.18
351	0.14
352	0.11
353	0.09
354	0.09
355	0.08
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.07
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.09
364	0.11
365	0.11
366	0.12
367	0.16
368	0.16
369	0.18
370	0.24
371	0.31
372	0.38
373	0.47
374	0.56
375	0.61
376	0.69
377	0.77
378	0.81
379	0.83
380	0.8
381	0.75
382	0.76
383	0.75
384	0.71
385	0.66
386	0.56
387	0.47
388	0.45
389	0.42
390	0.34
391	0.29
392	0.28
393	0.23
394	0.23
395	0.23
396	0.24
397	0.22
398	0.2
399	0.18
400	0.19
401	0.2
402	0.19
403	0.21
404	0.2
405	0.21
406	0.21
407	0.2
408	0.16
409	0.17
410	0.2
411	0.22
412	0.25
413	0.29
414	0.35
415	0.43
416	0.5
417	0.55
418	0.63
419	0.7
420	0.76
421	0.8
422	0.86
423	0.88
424	0.88
425	0.9
426	0.84
427	0.81
428	0.73
429	0.64
430	0.56
431	0.45
432	0.38
433	0.3
434	0.26
435	0.17
436	0.14
437	0.13
438	0.1
439	0.1
440	0.09
441	0.09
442	0.08
443	0.09
444	0.14
445	0.19
446	0.19
447	0.19
448	0.2
449	0.19
450	0.2
451	0.21
452	0.23
453	0.21
454	0.22
455	0.29
456	0.32
457	0.32
458	0.32
459	0.31
460	0.25
461	0.22
462	0.22
463	0.21
464	0.18
465	0.19
466	0.17
467	0.18
468	0.19
469	0.19
470	0.17
471	0.1
472	0.1
473	0.09
474	0.09
475	0.07
476	0.05
477	0.05
478	0.04
479	0.06
480	0.05
481	0.06
482	0.07
483	0.08
484	0.12
485	0.14
486	0.19
487	0.21
488	0.23
489	0.24
490	0.28
491	0.28
492	0.25
493	0.26
494	0.22
495	0.19
496	0.19
497	0.19
498	0.14
499	0.14
500	0.13
501	0.12
502	0.18
503	0.19
504	0.19
505	0.21
506	0.2
507	0.25
508	0.28
509	0.29
510	0.24
511	0.29
512	0.31
513	0.34
514	0.38
515	0.38
516	0.44
517	0.5
518	0.52
519	0.55
520	0.56
521	0.55
522	0.53
523	0.53
524	0.5
525	0.45
526	0.43
527	0.39
528	0.36
529	0.31
530	0.3
531	0.24
532	0.19
533	0.15
534	0.15
535	0.1
536	0.14
537	0.15
538	0.15
539	0.15
540	0.15
541	0.17
542	0.16
543	0.14
544	0.09
545	0.08
546	0.08
547	0.07
548	0.07
549	0.06
550	0.07
551	0.08
552	0.1
553	0.13
554	0.16
555	0.18
556	0.2
557	0.21
558	0.23
559	0.28
560	0.32
561	0.39
562	0.44
563	0.53
564	0.6
565	0.66
566	0.67
567	0.7
568	0.7
569	0.64
570	0.64
571	0.62
572	0.6
573	0.65
574	0.68
575	0.65
576	0.66
577	0.62
578	0.53
579	0.46
580	0.4
581	0.36
582	0.39
583	0.44
584	0.44
585	0.51
586	0.56
587	0.6
588	0.68
589	0.69
590	0.67
591	0.66
592	0.68
593	0.7
594	0.75
595	0.82
596	0.82
597	0.84
598	0.81
599	0.76
600	0.74
601	0.71
602	0.66
603	0.61
604	0.58
605	0.57
606	0.57
607	0.56
608	0.53
609	0.49
610	0.44
611	0.4
612	0.38
613	0.35
614	0.3
615	0.29
616	0.27
617	0.29
618	0.36
619	0.35
620	0.32
621	0.36
622	0.35
623	0.35
624	0.36
625	0.34
626	0.3
627	0.36
628	0.35
629	0.31
630	0.32
631	0.31
632	0.29
633	0.31
634	0.36
635	0.33
636	0.33
637	0.37
638	0.41
639	0.47
640	0.58
641	0.64
642	0.67
643	0.73
644	0.82
645	0.83
646	0.85
647	0.83
648	0.81
649	0.74
650	0.72
651	0.63
652	0.54
653	0.47
654	0.38
655	0.33
656	0.3
657	0.29
658	0.26
659	0.35
660	0.41
661	0.46
662	0.55
663	0.63
664	0.65
665	0.72
666	0.79
667	0.78
668	0.82
669	0.79
670	0.76
671	0.68
672	0.6
673	0.5
674	0.42
675	0.38
676	0.33
677	0.33
678	0.33
679	0.32
680	0.32
681	0.32
682	0.32
683	0.28
684	0.26
685	0.21
686	0.19
687	0.21
688	0.21
689	0.21
690	0.19
691	0.2
692	0.21
693	0.21
694	0.2
695	0.2
696	0.19
697	0.18
698	0.19
699	0.18
700	0.15
701	0.15
702	0.15
703	0.14
704	0.16
705	0.18
706	0.17
707	0.16
708	0.17
709	0.17
710	0.19
711	0.23
712	0.23
713	0.25
714	0.28
715	0.28
716	0.27
717	0.3
718	0.31
719	0.29
720	0.27
721	0.3
722	0.34
723	0.36
724	0.43
725	0.46
726	0.52
727	0.6
728	0.7
729	0.75
730	0.77
731	0.83
732	0.83
733	0.82
734	0.78
735	0.71
736	0.64
737	0.55
738	0.49
739	0.4
740	0.34
741	0.29
742	0.26
743	0.28
744	0.31
745	0.3
746	0.37
747	0.42
748	0.5
749	0.51
750	0.57
751	0.63
752	0.66
753	0.73
754	0.7
755	0.73
756	0.66
757	0.66
758	0.66
759	0.6
760	0.55
761	0.49
762	0.5
763	0.46
764	0.5
765	0.54
766	0.51
767	0.47
768	0.43

A0A397G543

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer