Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HZL2

Protein Details
Accession A0A397HZL2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-164QYVFPNYKYRPGRNRRSGRNKPNRNGRSRNIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-162RPGRNRRSGRNKPNRNGRSR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTFQFVPVSLKTFDKSPLTSKEREDAFFEQDLKVESLLLNPACPIHLSKEKLTQPSSDSRQGRRFSDGEREDPPRPSNPFMIFLNNYGEGRRKIIPGENIKNISILAKEEWNKSDPSVHFLFEELADLAKKYFQYVFPNYKYRPGRNRRSGRNKPNRNGRSRNITSSPRSRMSTPTLTSPSQSEISQMPTPTLTSPSSTSPSTTSTSPSSDMSTPPSIILGSFINNLYENPLYDFILFDETGISETVEIFPEESNCLQPFNLPVTSVSSNDTVNFEVPAEFNLPVTSVSSNDTVNFEVPAEFNLPVTSVSSKDTVNFEIPAEFNLPVTSVLMNILDTVNSEIHTEFNLPVTSVLLNDDISDHTKDNFYENHQLSTPATNNNNIDMEFETSVPITEQHIILSNYENMNMYSENTEPHLIMNSNDITSQYQFLEDENNESYLDESNLIHLFQQTY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.34
4 0.42
5 0.46
6 0.49
7 0.5
8 0.53
9 0.52
10 0.51
11 0.5
12 0.44
13 0.43
14 0.41
15 0.4
16 0.32
17 0.3
18 0.3
19 0.25
20 0.22
21 0.17
22 0.14
23 0.13
24 0.19
25 0.18
26 0.15
27 0.14
28 0.15
29 0.14
30 0.15
31 0.16
32 0.17
33 0.25
34 0.29
35 0.33
36 0.41
37 0.47
38 0.52
39 0.52
40 0.48
41 0.45
42 0.5
43 0.53
44 0.53
45 0.53
46 0.55
47 0.61
48 0.63
49 0.61
50 0.58
51 0.53
52 0.48
53 0.52
54 0.48
55 0.44
56 0.45
57 0.48
58 0.46
59 0.48
60 0.48
61 0.44
62 0.44
63 0.43
64 0.44
65 0.41
66 0.41
67 0.37
68 0.4
69 0.35
70 0.32
71 0.33
72 0.28
73 0.26
74 0.24
75 0.27
76 0.22
77 0.25
78 0.25
79 0.23
80 0.24
81 0.3
82 0.37
83 0.42
84 0.47
85 0.5
86 0.5
87 0.49
88 0.46
89 0.4
90 0.33
91 0.23
92 0.19
93 0.14
94 0.17
95 0.21
96 0.24
97 0.26
98 0.27
99 0.27
100 0.26
101 0.32
102 0.26
103 0.28
104 0.27
105 0.25
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.14
110 0.15
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.12
120 0.14
121 0.21
122 0.28
123 0.36
124 0.39
125 0.47
126 0.46
127 0.53
128 0.56
129 0.57
130 0.61
131 0.63
132 0.69
133 0.72
134 0.81
135 0.83
136 0.87
137 0.9
138 0.9
139 0.91
140 0.91
141 0.89
142 0.91
143 0.89
144 0.87
145 0.84
146 0.79
147 0.78
148 0.71
149 0.69
150 0.63
151 0.61
152 0.57
153 0.57
154 0.57
155 0.51
156 0.49
157 0.44
158 0.43
159 0.43
160 0.43
161 0.36
162 0.36
163 0.36
164 0.34
165 0.33
166 0.3
167 0.27
168 0.22
169 0.2
170 0.17
171 0.14
172 0.18
173 0.19
174 0.18
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.13
179 0.15
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.14
184 0.17
185 0.16
186 0.17
187 0.15
188 0.18
189 0.18
190 0.17
191 0.17
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.07
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.11
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.15
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.15
301 0.16
302 0.17
303 0.16
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.09
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.12
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.16
351 0.16
352 0.19
353 0.2
354 0.22
355 0.3
356 0.31
357 0.32
358 0.31
359 0.32
360 0.3
361 0.33
362 0.31
363 0.28
364 0.28
365 0.31
366 0.31
367 0.33
368 0.32
369 0.27
370 0.26
371 0.21
372 0.22
373 0.18
374 0.17
375 0.15
376 0.13
377 0.14
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.17
385 0.17
386 0.18
387 0.2
388 0.22
389 0.2
390 0.21
391 0.21
392 0.17
393 0.18
394 0.18
395 0.16
396 0.14
397 0.15
398 0.15
399 0.17
400 0.18
401 0.16
402 0.16
403 0.18
404 0.17
405 0.16
406 0.2
407 0.19
408 0.18
409 0.19
410 0.19
411 0.18
412 0.19
413 0.21
414 0.16
415 0.16
416 0.16
417 0.16
418 0.21
419 0.19
420 0.22
421 0.22
422 0.22
423 0.21
424 0.21
425 0.21
426 0.16
427 0.17
428 0.14
429 0.12
430 0.14
431 0.15
432 0.15
433 0.15