FuNGI

A0A397JGB5

Protein Details

Accession

A0A397JGB5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
520-543	SDPCWQFRCSRKHIKKFRNSGIFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR010994 RuvA_2-like IPR000980 SH2 IPR036860 SH2_dom_sf IPR042066 Spt6_death-like IPR032706 Spt6_HHH IPR028088 Spt6_HTH_DNA-bd_dom IPR035420 Spt6_SH2 IPR035019 Spt6_SH2_N IPR028231 Spt6_YqgF IPR023323 Tex-like_dom_sf IPR023319 Tex-like_HTH_dom_sf IPR017072 TF_Spt6 IPR037027 YqgF/RNaseH-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14635 HHH_7 PF14641 HTH_44 PF14633 SH2_2 PF14639 YqgF
CDD	cd09918 SH2_Nterm_SPT6_like

Amino Acid Sequences

MLSYHFSSKNNETSNEGSNEENEGLLEVERKRIKRGRNMIISKISDGASHISEVNTSSDEPEFKRLKSDRLFREEETEECEDEIPEIPDEDEIIDDQLLESGFVGESDNENDSDNDYENENVHIHENEDYTKDYCDNDDDENEDDYEDNTNENYYESYYDDDGDDDDDENYNDECYQDYKDDDDYNESENDDEDYNESENDDDSDDDFEMEDSESRETSLDSNFSMRMKMIEEDNAIKTKDLPERMLLRPNIITDRKLTDEEITEATKIISDNFSEYYGCHRSSKLQAAINKVLKCLSQEFLEVPYIYSYRRYYIADFHKDFSISREILSRQNLWDIYDWEYEYRLLIENRELIQLKLLNRYYDNDDYNEYILNILNSSSSEETLSDLNDYILHVYSKRLAEAAIKDPSTHQHLKDYSFYIECLSKGTHELVKYMGVDVELFSRSLVEENPKLYQVTESEFGPSIAKEFSEFNPKEALTTATKLLSLDIAFDPLFRKYVRQNFIKRSMIIVNPLQEIDESDPCWQFRCSRKHIKKFRNSGIFAEMMSAEKKGQIEIKVVLENECKFFETLKKRIINNSSESNNNNNNNNNNRSWNKYRISAIKQAFNNELRPIMESWIKSRLNKFAERWIMTKTMENFENKLNVCHFRTSKMSRSEISRVAALSWGSGINCNTECVFLDENCNLADYLSFNNLRDNRDMEEFYKVIQFIRKNKPHVIVIRCFDGRTRYLLEIVQEVVDYYKLQGGDHIPVIAINNEVAKLHMSSPRAKKEFPNYNDLTRYCISLARMLQNPIGEYAVLEENIASIIHHPLQCLLSHEKLIECLQRGFINIINEIGVDFNKEMNRENKIDLLQYVSGLGPHKADDLIGKILTNGKNELEKRDHILKNYSMGNIVYTNCAGFIRVQSYRCGPFDNTRIHPRYYALASKMVRDSFDLDEEGDGVINDSCLKLWTRRLTSEPEKINDLVLDDYAKRLSKYHRFTSNLIMHNIKMELVRPYADPRRNFEIPSPEQVYEMEMEETYEMLNTELRDALTFNGNNKHGVTVRESSIQYASPITPPPSTPPPPPPKITSYSSFHQINYKEAIQNLANKSIGSYIIRPSSKGYGFISITWKIYSNIFQHVDIVEKEKYGDSIGKKLEVEGGKYVYSDLKELLKEYLEQKVQTAFDLMIHKRFFSSEEDSRRFIYLFMKTNTSKLAYGFCFDREIPGRFCFIYRMDQTSNIEVLKGSIRPEGYKFSGSVYPTLSHLVKAIKNLIGYKRKPLTAKSYLSFFAEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.45
3	0.41
4	0.33
5	0.3
6	0.32
7	0.27
8	0.23
9	0.16
10	0.14
11	0.13
12	0.12
13	0.16
14	0.13
15	0.22
16	0.29
17	0.3
18	0.39
19	0.45
20	0.54
21	0.6
22	0.69
23	0.71
24	0.75
25	0.8
26	0.78
27	0.8
28	0.74
29	0.64
30	0.57
31	0.46
32	0.36
33	0.32
34	0.27
35	0.19
36	0.18
37	0.17
38	0.15
39	0.15
40	0.16
41	0.16
42	0.15
43	0.14
44	0.15
45	0.16
46	0.2
47	0.21
48	0.29
49	0.31
50	0.29
51	0.39
52	0.4
53	0.47
54	0.52
55	0.6
56	0.6
57	0.65
58	0.69
59	0.61
60	0.65
61	0.58
62	0.5
63	0.47
64	0.4
65	0.33
66	0.29
67	0.28
68	0.21
69	0.19
70	0.2
71	0.15
72	0.13
73	0.13
74	0.12
75	0.12
76	0.12
77	0.11
78	0.1
79	0.08
80	0.09
81	0.08
82	0.08
83	0.07
84	0.09
85	0.08
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.08
92	0.07
93	0.09
94	0.11
95	0.13
96	0.12
97	0.14
98	0.14
99	0.15
100	0.16
101	0.16
102	0.15
103	0.15
104	0.16
105	0.15
106	0.17
107	0.16
108	0.15
109	0.16
110	0.16
111	0.15
112	0.17
113	0.18
114	0.17
115	0.19
116	0.2
117	0.19
118	0.2
119	0.2
120	0.19
121	0.19
122	0.2
123	0.21
124	0.21
125	0.22
126	0.22
127	0.23
128	0.24
129	0.22
130	0.19
131	0.17
132	0.14
133	0.16
134	0.14
135	0.12
136	0.11
137	0.11
138	0.11
139	0.11
140	0.12
141	0.1
142	0.11
143	0.11
144	0.14
145	0.14
146	0.14
147	0.14
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.12
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.12
157	0.11
158	0.11
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.11
163	0.13
164	0.13
165	0.15
166	0.16
167	0.2
168	0.22
169	0.22
170	0.25
171	0.24
172	0.25
173	0.24
174	0.22
175	0.19
176	0.17
177	0.18
178	0.13
179	0.12
180	0.11
181	0.12
182	0.13
183	0.12
184	0.12
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.09
190	0.09
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.12
206	0.13
207	0.13
208	0.12
209	0.14
210	0.16
211	0.16
212	0.16
213	0.15
214	0.14
215	0.15
216	0.16
217	0.16
218	0.17
219	0.19
220	0.22
221	0.25
222	0.26
223	0.25
224	0.23
225	0.23
226	0.26
227	0.29
228	0.29
229	0.28
230	0.31
231	0.37
232	0.4
233	0.47
234	0.41
235	0.38
236	0.36
237	0.36
238	0.38
239	0.35
240	0.33
241	0.28
242	0.31
243	0.31
244	0.31
245	0.3
246	0.24
247	0.24
248	0.25
249	0.24
250	0.21
251	0.18
252	0.17
253	0.15
254	0.14
255	0.12
256	0.11
257	0.1
258	0.1
259	0.12
260	0.13
261	0.14
262	0.13
263	0.13
264	0.18
265	0.21
266	0.22
267	0.21
268	0.21
269	0.26
270	0.32
271	0.4
272	0.39
273	0.4
274	0.42
275	0.48
276	0.55
277	0.56
278	0.51
279	0.43
280	0.39
281	0.34
282	0.33
283	0.28
284	0.22
285	0.17
286	0.17
287	0.17
288	0.19
289	0.2
290	0.18
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.14
295	0.17
296	0.16
297	0.16
298	0.18
299	0.19
300	0.19
301	0.27
302	0.36
303	0.41
304	0.42
305	0.42
306	0.41
307	0.4
308	0.38
309	0.33
310	0.3
311	0.21
312	0.2
313	0.22
314	0.23
315	0.27
316	0.3
317	0.29
318	0.24
319	0.28
320	0.27
321	0.25
322	0.25
323	0.22
324	0.22
325	0.22
326	0.21
327	0.17
328	0.18
329	0.16
330	0.14
331	0.14
332	0.13
333	0.12
334	0.12
335	0.14
336	0.16
337	0.17
338	0.22
339	0.21
340	0.18
341	0.21
342	0.23
343	0.23
344	0.27
345	0.27
346	0.25
347	0.25
348	0.28
349	0.31
350	0.32
351	0.32
352	0.26
353	0.27
354	0.27
355	0.26
356	0.23
357	0.17
358	0.13
359	0.11
360	0.1
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.1
372	0.1
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.07
382	0.08
383	0.13
384	0.13
385	0.13
386	0.12
387	0.12
388	0.15
389	0.19
390	0.23
391	0.23
392	0.22
393	0.22
394	0.23
395	0.26
396	0.29
397	0.29
398	0.25
399	0.28
400	0.3
401	0.32
402	0.35
403	0.34
404	0.29
405	0.26
406	0.25
407	0.2
408	0.19
409	0.16
410	0.15
411	0.13
412	0.11
413	0.12
414	0.15
415	0.15
416	0.15
417	0.15
418	0.14
419	0.15
420	0.15
421	0.13
422	0.11
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.09
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.06
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.11
435	0.13
436	0.15
437	0.16
438	0.17
439	0.17
440	0.16
441	0.16
442	0.13
443	0.14
444	0.14
445	0.13
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.13
450	0.12
451	0.1
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.09
456	0.11
457	0.2
458	0.21
459	0.21
460	0.24
461	0.24
462	0.23
463	0.22
464	0.23
465	0.15
466	0.17
467	0.16
468	0.14
469	0.14
470	0.13
471	0.13
472	0.11
473	0.08
474	0.09
475	0.08
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.1
481	0.12
482	0.09
483	0.12
484	0.17
485	0.26
486	0.32
487	0.39
488	0.46
489	0.51
490	0.59
491	0.61
492	0.54
493	0.48
494	0.45
495	0.38
496	0.34
497	0.29
498	0.23
499	0.2
500	0.19
501	0.16
502	0.13
503	0.13
504	0.12
505	0.11
506	0.1
507	0.12
508	0.14
509	0.13
510	0.15
511	0.15
512	0.18
513	0.26
514	0.33
515	0.39
516	0.5
517	0.6
518	0.69
519	0.78
520	0.83
521	0.84
522	0.85
523	0.86
524	0.83
525	0.75
526	0.66
527	0.59
528	0.48
529	0.38
530	0.3
531	0.21
532	0.13
533	0.11
534	0.1
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.11
540	0.11
541	0.13
542	0.15
543	0.16
544	0.16
545	0.17
546	0.17
547	0.17
548	0.16
549	0.16
550	0.15
551	0.14
552	0.12
553	0.13
554	0.19
555	0.24
556	0.28
557	0.33
558	0.38
559	0.38
560	0.44
561	0.48
562	0.44
563	0.41
564	0.41
565	0.36
566	0.34
567	0.35
568	0.34
569	0.35
570	0.34
571	0.33
572	0.31
573	0.35
574	0.38
575	0.4
576	0.36
577	0.36
578	0.36
579	0.39
580	0.42
581	0.43
582	0.4
583	0.39
584	0.41
585	0.42
586	0.45
587	0.46
588	0.44
589	0.43
590	0.41
591	0.4
592	0.4
593	0.35
594	0.31
595	0.24
596	0.22
597	0.16
598	0.17
599	0.15
600	0.13
601	0.14
602	0.13
603	0.14
604	0.21
605	0.22
606	0.23
607	0.25
608	0.29
609	0.31
610	0.34
611	0.34
612	0.34
613	0.39
614	0.38
615	0.37
616	0.33
617	0.3
618	0.27
619	0.29
620	0.23
621	0.2
622	0.2
623	0.2
624	0.19
625	0.18
626	0.22
627	0.19
628	0.19
629	0.18
630	0.19
631	0.2
632	0.23
633	0.22
634	0.2
635	0.27
636	0.29
637	0.34
638	0.36
639	0.37
640	0.34
641	0.38
642	0.39
643	0.35
644	0.32
645	0.26
646	0.21
647	0.19
648	0.18
649	0.14
650	0.1
651	0.07
652	0.07
653	0.06
654	0.07
655	0.07
656	0.08
657	0.08
658	0.09
659	0.08
660	0.08
661	0.09
662	0.1
663	0.11
664	0.1
665	0.13
666	0.12
667	0.12
668	0.12
669	0.12
670	0.09
671	0.08
672	0.07
673	0.06
674	0.07
675	0.09
676	0.1
677	0.1
678	0.15
679	0.18
680	0.2
681	0.2
682	0.21
683	0.19
684	0.21
685	0.22
686	0.18
687	0.19
688	0.17
689	0.16
690	0.16
691	0.14
692	0.13
693	0.16
694	0.19
695	0.25
696	0.35
697	0.4
698	0.43
699	0.47
700	0.5
701	0.5
702	0.53
703	0.5
704	0.45
705	0.41
706	0.41
707	0.37
708	0.34
709	0.29
710	0.26
711	0.21
712	0.19
713	0.2
714	0.16
715	0.17
716	0.18
717	0.17
718	0.15
719	0.14
720	0.11
721	0.08
722	0.08
723	0.07
724	0.06
725	0.05
726	0.05
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.09
731	0.1
732	0.11
733	0.11
734	0.11
735	0.09
736	0.09
737	0.1
738	0.08
739	0.07
740	0.05
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.06
745	0.06
746	0.06
747	0.08
748	0.12
749	0.14
750	0.21
751	0.28
752	0.37
753	0.38
754	0.39
755	0.42
756	0.48
757	0.56
758	0.52
759	0.54
760	0.47
761	0.49
762	0.52
763	0.47
764	0.42
765	0.33
766	0.31
767	0.22
768	0.22
769	0.19
770	0.19
771	0.2
772	0.2
773	0.22
774	0.22
775	0.23
776	0.21
777	0.21
778	0.17
779	0.15
780	0.11
781	0.08
782	0.09
783	0.08
784	0.07
785	0.07
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.04
791	0.04
792	0.06
793	0.09
794	0.1
795	0.1
796	0.11
797	0.12
798	0.13
799	0.16
800	0.18
801	0.16
802	0.17
803	0.17
804	0.16
805	0.17
806	0.19
807	0.18
808	0.16
809	0.15
810	0.16
811	0.16
812	0.17
813	0.16
814	0.17
815	0.15
816	0.14
817	0.13
818	0.11
819	0.11
820	0.1
821	0.09
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.08
826	0.09
827	0.1
828	0.14
829	0.17
830	0.22
831	0.22
832	0.23
833	0.24
834	0.24
835	0.24
836	0.21
837	0.2
838	0.16
839	0.14
840	0.14
841	0.11
842	0.11
843	0.11
844	0.11
845	0.09
846	0.09
847	0.09
848	0.08
849	0.09
850	0.08
851	0.1
852	0.11
853	0.11
854	0.1
855	0.11
856	0.17
857	0.18
858	0.19
859	0.18
860	0.17
861	0.23
862	0.25
863	0.3
864	0.28
865	0.28
866	0.32
867	0.4
868	0.41
869	0.37
870	0.42
871	0.37
872	0.37
873	0.37
874	0.32
875	0.24
876	0.22
877	0.2
878	0.17
879	0.16
880	0.13
881	0.11
882	0.1
883	0.1
884	0.09
885	0.09
886	0.08
887	0.09
888	0.13
889	0.16
890	0.17
891	0.19
892	0.24
893	0.27
894	0.27
895	0.28
896	0.26
897	0.29
898	0.34
899	0.39
900	0.4
901	0.46
902	0.48
903	0.46
904	0.45
905	0.4
906	0.38
907	0.35
908	0.34
909	0.27
910	0.31
911	0.3
912	0.32
913	0.34
914	0.31
915	0.27
916	0.24
917	0.25
918	0.19
919	0.2
920	0.18
921	0.14
922	0.14
923	0.14
924	0.12
925	0.09
926	0.07
927	0.06
928	0.05
929	0.05
930	0.05
931	0.05
932	0.05
933	0.07
934	0.09
935	0.11
936	0.18
937	0.26
938	0.3
939	0.33
940	0.37
941	0.44
942	0.49
943	0.54
944	0.52
945	0.47
946	0.46
947	0.43
948	0.41
949	0.32
950	0.26
951	0.19
952	0.14
953	0.13
954	0.1
955	0.11
956	0.13
957	0.14
958	0.13
959	0.16
960	0.24
961	0.32
962	0.39
963	0.46
964	0.52
965	0.55
966	0.57
967	0.63
968	0.63
969	0.58
970	0.54
971	0.48
972	0.39
973	0.36
974	0.34
975	0.25
976	0.18
977	0.15
978	0.15
979	0.14
980	0.15
981	0.15
982	0.22
983	0.3
984	0.36
985	0.38
986	0.41
987	0.47
988	0.48
989	0.48
990	0.47
991	0.47
992	0.44
993	0.48
994	0.46
995	0.38
996	0.37
997	0.36
998	0.32
999	0.23
1000	0.21
1001	0.14
1002	0.1
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.09
1006	0.08
1007	0.07
1008	0.06
1009	0.05
1010	0.07
1011	0.07
1012	0.08
1013	0.09
1014	0.1
1015	0.1
1016	0.1
1017	0.11
1018	0.16
1019	0.17
1020	0.2
1021	0.25
1022	0.26
1023	0.27
1024	0.27
1025	0.29
1026	0.25
1027	0.26
1028	0.28
1029	0.25
1030	0.26
1031	0.3
1032	0.3
1033	0.28
1034	0.27
1035	0.26
1036	0.21
1037	0.2
1038	0.19
1039	0.16
1040	0.19
1041	0.2
1042	0.2
1043	0.2
1044	0.25
1045	0.31
1046	0.35
1047	0.37
1048	0.45
1049	0.51
1050	0.56
1051	0.59
1052	0.58
1053	0.56
1054	0.57
1055	0.57
1056	0.52
1057	0.48
1058	0.46
1059	0.48
1060	0.45
1061	0.41
1062	0.42
1063	0.38
1064	0.36
1065	0.35
1066	0.35
1067	0.3
1068	0.29
1069	0.32
1070	0.28
1071	0.34
1072	0.33
1073	0.32
1074	0.29
1075	0.26
1076	0.27
1077	0.24
1078	0.24
1079	0.19
1080	0.18
1081	0.19
1082	0.26
1083	0.27
1084	0.27
1085	0.29
1086	0.34
1087	0.33
1088	0.34
1089	0.31
1090	0.29
1091	0.3
1092	0.32
1093	0.33
1094	0.29
1095	0.29
1096	0.27
1097	0.26
1098	0.21
1099	0.23
1100	0.26
1101	0.23
1102	0.29
1103	0.29
1104	0.29
1105	0.29
1106	0.28
1107	0.29
1108	0.25
1109	0.27
1110	0.2
1111	0.18
1112	0.19
1113	0.17
1114	0.18
1115	0.17
1116	0.22
1117	0.2
1118	0.26
1119	0.28
1120	0.3
1121	0.3
1122	0.3
1123	0.34
1124	0.3
1125	0.31
1126	0.27
1127	0.27
1128	0.24
1129	0.24
1130	0.25
1131	0.21
1132	0.2
1133	0.18
1134	0.17
1135	0.19
1136	0.19
1137	0.2
1138	0.21
1139	0.19
1140	0.21
1141	0.22
1142	0.28
1143	0.28
1144	0.27
1145	0.28
1146	0.3
1147	0.29
1148	0.27
1149	0.26
1150	0.18
1151	0.19
1152	0.26
1153	0.26
1154	0.29
1155	0.29
1156	0.29
1157	0.28
1158	0.28
1159	0.26
1160	0.25
1161	0.31
1162	0.33
1163	0.42
1164	0.46
1165	0.47
1166	0.49
1167	0.48
1168	0.42
1169	0.36
1170	0.33
1171	0.31
1172	0.34
1173	0.34
1174	0.4
1175	0.39
1176	0.41
1177	0.43
1178	0.4
1179	0.34
1180	0.28
1181	0.32
1182	0.26
1183	0.29
1184	0.28
1185	0.26
1186	0.27
1187	0.25
1188	0.31
1189	0.31
1190	0.34
1191	0.34
1192	0.35
1193	0.37
1194	0.33
1195	0.34
1196	0.3
1197	0.27
1198	0.31
1199	0.31
1200	0.36
1201	0.35
1202	0.39
1203	0.42
1204	0.43
1205	0.42
1206	0.34
1207	0.3
1208	0.24
1209	0.23
1210	0.22
1211	0.2
1212	0.18
1213	0.19
1214	0.21
1215	0.24
1216	0.27
1217	0.32
1218	0.32
1219	0.33
1220	0.31
1221	0.31
1222	0.34
1223	0.33
1224	0.32
1225	0.29
1226	0.26
1227	0.25
1228	0.3
1229	0.26
1230	0.22
1231	0.24
1232	0.27
1233	0.26
1234	0.29
1235	0.33
1236	0.3
1237	0.33
1238	0.38
1239	0.44
1240	0.48
1241	0.49
1242	0.54
1243	0.56
1244	0.59
1245	0.61
1246	0.61
1247	0.61
1248	0.61
1249	0.65
1250	0.58
1251	0.56
1252	0.52

A0A397JGB5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer