Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397J2A1

Protein Details
Accession A0A397J2A1    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-45VNEIEPRKQKGKKKVVESSDEEHydrophilic
49-76EEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNBasic
117-141NSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCHydrophilic
242-282VKTEITPKKKTKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRKKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-36KQKGKK
53-66RKPKKTVLKKKKKE
248-280PKKKTKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MQAPATLAAALEKAQAYEEGLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSDEEEEEEEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKIQLNLIQKMEKLTMQVNQQPNYRNRGNNRDNSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFKCGKEGHISWDCPDRKDNSDNSAHAKLVEVEEESEKEEDKLLQHLLEAYDAYLGKRERDDSSDEDTPIKRSRETNIPESKPSLNTFGLPKTTSVPVPKVVKTEITPKKKTKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRKKDFDIVEQLQNQPVGLSWADALEVPSIRKSFFEALRKPKEKEIKLADQEYSLKTTALKCNVAVGVYTVPTIVDSGAAISIVTRDAMEQLGYEIEEASKSIILPATGKKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.12
5 0.11
6 0.11
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.16
15 0.21
16 0.27
17 0.36
18 0.44
19 0.51
20 0.61
21 0.71
22 0.73
23 0.79
24 0.82
25 0.81
26 0.8
27 0.78
28 0.72
29 0.67
30 0.59
31 0.49
32 0.4
33 0.33
34 0.26
35 0.21
36 0.16
37 0.13
38 0.18
39 0.2
40 0.22
41 0.24
42 0.28
43 0.37
44 0.46
45 0.56
46 0.62
47 0.7
48 0.78
49 0.88
50 0.93
51 0.93
52 0.93
53 0.92
54 0.91
55 0.9
56 0.89
57 0.83
58 0.76
59 0.71
60 0.62
61 0.54
62 0.44
63 0.34
64 0.28
65 0.29
66 0.26
67 0.26
68 0.25
69 0.23
70 0.25
71 0.31
72 0.35
73 0.31
74 0.38
75 0.41
76 0.46
77 0.5
78 0.49
79 0.44
80 0.38
81 0.38
82 0.31
83 0.23
84 0.19
85 0.17
86 0.19
87 0.23
88 0.29
89 0.33
90 0.35
91 0.38
92 0.44
93 0.46
94 0.49
95 0.49
96 0.49
97 0.5
98 0.57
99 0.61
100 0.62
101 0.66
102 0.66
103 0.64
104 0.63
105 0.63
106 0.61
107 0.6
108 0.62
109 0.6
110 0.61
111 0.65
112 0.66
113 0.71
114 0.7
115 0.74
116 0.75
117 0.8
118 0.82
119 0.84
120 0.85
121 0.83
122 0.81
123 0.76
124 0.72
125 0.69
126 0.65
127 0.61
128 0.56
129 0.49
130 0.5
131 0.46
132 0.46
133 0.47
134 0.42
135 0.44
136 0.45
137 0.44
138 0.38
139 0.45
140 0.39
141 0.33
142 0.35
143 0.31
144 0.3
145 0.34
146 0.35
147 0.31
148 0.34
149 0.34
150 0.36
151 0.34
152 0.3
153 0.24
154 0.23
155 0.18
156 0.14
157 0.13
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.19
189 0.19
190 0.24
191 0.25
192 0.25
193 0.26
194 0.25
195 0.26
196 0.27
197 0.25
198 0.21
199 0.21
200 0.24
201 0.31
202 0.34
203 0.4
204 0.44
205 0.45
206 0.45
207 0.46
208 0.44
209 0.37
210 0.34
211 0.29
212 0.21
213 0.2
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.18
218 0.18
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.19
223 0.19
224 0.22
225 0.26
226 0.26
227 0.26
228 0.26
229 0.25
230 0.24
231 0.33
232 0.37
233 0.41
234 0.48
235 0.54
236 0.63
237 0.68
238 0.75
239 0.75
240 0.77
241 0.78
242 0.81
243 0.84
244 0.85
245 0.87
246 0.88
247 0.84
248 0.82
249 0.8
250 0.8
251 0.77
252 0.75
253 0.72
254 0.71
255 0.74
256 0.75
257 0.78
258 0.79
259 0.8
260 0.8
261 0.81
262 0.83
263 0.81
264 0.77
265 0.71
266 0.67
267 0.64
268 0.64
269 0.6
270 0.53
271 0.52
272 0.5
273 0.51
274 0.47
275 0.42
276 0.35
277 0.32
278 0.28
279 0.19
280 0.15
281 0.12
282 0.09
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.17
297 0.21
298 0.27
299 0.36
300 0.41
301 0.5
302 0.61
303 0.67
304 0.65
305 0.68
306 0.71
307 0.65
308 0.66
309 0.65
310 0.64
311 0.65
312 0.66
313 0.58
314 0.51
315 0.51
316 0.44
317 0.38
318 0.29
319 0.22
320 0.21
321 0.26
322 0.3
323 0.32
324 0.32
325 0.28
326 0.32
327 0.32
328 0.3
329 0.25
330 0.19
331 0.16
332 0.14
333 0.14
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.06
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.15