Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HIX4

Protein Details
Accession A0A397HIX4    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-251SEDEIKVKPKTKRRIKKKKYESESSDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-243KVKPKTKRRIKKKK
256-262KKEKTKK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001969  Aspartic_peptidase_AS  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0004190  F:aspartic-type endopeptidase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006508  P:proteolysis  
Pfam View protein in Pfam  
PF13975  gag-asp_proteas  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00141  ASP_PROTEASE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MALEEINWNIRSRENSLTRSPVSFSVQTSVDTTRENSPEQSNDEESVEEENIEEQELGGLREYLQEFEDEEEQEENNIEPIVENNIMDILALRSRKFRGDGTQDPVEWLKNYEKTARMNGWTDDQKKERIYTVLDDAADKWYNEIYTATYGNGDNRLPNWTEVKELFMLQFCNRKWMNKWTRELEKLKQQPGESVDQYAARFKKIIRKGAPEAEDLEEGLEPEESEDEIKVKPKTKRRIKKKKYESESSDEETPIKKEKTKKKEVEVDPIEELTKKMNELTIKLAKTEGPQYSNNIRPRNYDIECYNCGKKGHLKRDCRSTNQNNNYRNNGYPDNSFRNNNYQTNYRDNNNRNNNVPERNTPRNNFGNNNNQRESTSTQFRNNRNNQNQTPAHYVSIEDGNEYETDEEDREIIALWNEQLDSFGNPKETKKRPIEPELIYDYKTDPNNKKKKVQISSSKSKPMEWTPTKNNVRKPIIKPTGKVRNEEYTPKLLQGPELDIVKKLREQKIEITLPQLFKISSNEKRKVIEALRKPKEVSARFTNQEDSLRTTTLECDIVVNGYTVPATIDSGAATSIIARNTMEQLGFDIEEATNCKIISANGEKTESLGKIKDFPVEINDKVIPINMEVMETGAYHILLGNDWMMKAGASYDWSKQELTLNWRNQVIKTTASCKQNNTTLESIEEEYESEDEEQIQVLFQENYIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.43
3 0.48
4 0.54
5 0.53
6 0.51
7 0.48
8 0.42
9 0.41
10 0.38
11 0.34
12 0.31
13 0.29
14 0.29
15 0.29
16 0.28
17 0.23
18 0.23
19 0.24
20 0.26
21 0.29
22 0.3
23 0.31
24 0.33
25 0.35
26 0.37
27 0.4
28 0.36
29 0.35
30 0.33
31 0.3
32 0.26
33 0.25
34 0.21
35 0.15
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.12
40 0.1
41 0.07
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.14
54 0.17
55 0.19
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.11
64 0.1
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.08
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.18
81 0.21
82 0.25
83 0.27
84 0.29
85 0.33
86 0.4
87 0.46
88 0.49
89 0.52
90 0.48
91 0.48
92 0.46
93 0.39
94 0.31
95 0.27
96 0.26
97 0.26
98 0.28
99 0.31
100 0.35
101 0.37
102 0.43
103 0.44
104 0.42
105 0.41
106 0.4
107 0.42
108 0.46
109 0.45
110 0.46
111 0.45
112 0.47
113 0.46
114 0.46
115 0.42
116 0.36
117 0.35
118 0.32
119 0.33
120 0.3
121 0.28
122 0.26
123 0.24
124 0.26
125 0.24
126 0.2
127 0.17
128 0.15
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.15
139 0.17
140 0.16
141 0.14
142 0.15
143 0.18
144 0.18
145 0.2
146 0.22
147 0.2
148 0.23
149 0.22
150 0.24
151 0.22
152 0.21
153 0.2
154 0.18
155 0.19
156 0.18
157 0.25
158 0.22
159 0.29
160 0.29
161 0.32
162 0.35
163 0.44
164 0.52
165 0.53
166 0.6
167 0.6
168 0.67
169 0.71
170 0.72
171 0.67
172 0.67
173 0.66
174 0.64
175 0.61
176 0.54
177 0.49
178 0.48
179 0.48
180 0.38
181 0.32
182 0.28
183 0.25
184 0.26
185 0.28
186 0.25
187 0.19
188 0.2
189 0.21
190 0.29
191 0.34
192 0.43
193 0.42
194 0.49
195 0.53
196 0.59
197 0.59
198 0.51
199 0.46
200 0.39
201 0.33
202 0.26
203 0.21
204 0.13
205 0.11
206 0.1
207 0.07
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.13
217 0.16
218 0.23
219 0.3
220 0.39
221 0.5
222 0.59
223 0.69
224 0.76
225 0.84
226 0.88
227 0.92
228 0.94
229 0.93
230 0.9
231 0.9
232 0.85
233 0.79
234 0.74
235 0.67
236 0.57
237 0.47
238 0.41
239 0.32
240 0.28
241 0.27
242 0.24
243 0.25
244 0.32
245 0.42
246 0.51
247 0.6
248 0.65
249 0.67
250 0.75
251 0.74
252 0.75
253 0.68
254 0.61
255 0.51
256 0.45
257 0.37
258 0.27
259 0.24
260 0.15
261 0.13
262 0.1
263 0.09
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.19
268 0.23
269 0.22
270 0.22
271 0.23
272 0.21
273 0.22
274 0.26
275 0.22
276 0.2
277 0.21
278 0.25
279 0.3
280 0.36
281 0.41
282 0.4
283 0.39
284 0.38
285 0.42
286 0.45
287 0.4
288 0.37
289 0.32
290 0.33
291 0.35
292 0.35
293 0.31
294 0.27
295 0.26
296 0.25
297 0.31
298 0.36
299 0.43
300 0.49
301 0.56
302 0.57
303 0.68
304 0.7
305 0.67
306 0.68
307 0.67
308 0.69
309 0.7
310 0.73
311 0.7
312 0.69
313 0.68
314 0.61
315 0.52
316 0.45
317 0.39
318 0.32
319 0.28
320 0.29
321 0.3
322 0.3
323 0.3
324 0.28
325 0.33
326 0.36
327 0.35
328 0.33
329 0.33
330 0.34
331 0.4
332 0.4
333 0.36
334 0.4
335 0.42
336 0.49
337 0.51
338 0.5
339 0.46
340 0.49
341 0.5
342 0.46
343 0.44
344 0.41
345 0.4
346 0.46
347 0.48
348 0.45
349 0.46
350 0.47
351 0.47
352 0.44
353 0.42
354 0.46
355 0.48
356 0.52
357 0.47
358 0.42
359 0.39
360 0.39
361 0.37
362 0.31
363 0.31
364 0.28
365 0.34
366 0.41
367 0.47
368 0.53
369 0.58
370 0.64
371 0.65
372 0.7
373 0.64
374 0.65
375 0.61
376 0.55
377 0.52
378 0.43
379 0.35
380 0.27
381 0.26
382 0.19
383 0.2
384 0.16
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.08
410 0.09
411 0.12
412 0.13
413 0.17
414 0.26
415 0.3
416 0.38
417 0.43
418 0.5
419 0.54
420 0.6
421 0.64
422 0.57
423 0.56
424 0.54
425 0.48
426 0.41
427 0.35
428 0.29
429 0.27
430 0.28
431 0.31
432 0.33
433 0.42
434 0.51
435 0.56
436 0.61
437 0.64
438 0.7
439 0.7
440 0.71
441 0.71
442 0.7
443 0.75
444 0.74
445 0.75
446 0.66
447 0.6
448 0.55
449 0.49
450 0.51
451 0.47
452 0.49
453 0.47
454 0.57
455 0.65
456 0.66
457 0.67
458 0.66
459 0.67
460 0.68
461 0.66
462 0.66
463 0.67
464 0.65
465 0.62
466 0.62
467 0.65
468 0.6
469 0.58
470 0.51
471 0.49
472 0.49
473 0.52
474 0.46
475 0.41
476 0.39
477 0.37
478 0.35
479 0.28
480 0.26
481 0.22
482 0.21
483 0.18
484 0.2
485 0.19
486 0.18
487 0.19
488 0.19
489 0.22
490 0.27
491 0.3
492 0.32
493 0.35
494 0.38
495 0.46
496 0.48
497 0.44
498 0.41
499 0.4
500 0.36
501 0.34
502 0.29
503 0.2
504 0.18
505 0.23
506 0.26
507 0.31
508 0.4
509 0.45
510 0.46
511 0.48
512 0.48
513 0.5
514 0.5
515 0.5
516 0.51
517 0.56
518 0.59
519 0.61
520 0.6
521 0.57
522 0.59
523 0.53
524 0.5
525 0.48
526 0.49
527 0.49
528 0.5
529 0.49
530 0.42
531 0.42
532 0.37
533 0.34
534 0.3
535 0.27
536 0.26
537 0.23
538 0.22
539 0.21
540 0.19
541 0.13
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.06
560 0.05
561 0.06
562 0.08
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.1
567 0.12
568 0.14
569 0.13
570 0.11
571 0.12
572 0.13
573 0.13
574 0.12
575 0.11
576 0.1
577 0.11
578 0.13
579 0.13
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.12
584 0.12
585 0.19
586 0.23
587 0.26
588 0.28
589 0.3
590 0.3
591 0.3
592 0.34
593 0.28
594 0.25
595 0.22
596 0.21
597 0.24
598 0.26
599 0.29
600 0.26
601 0.25
602 0.29
603 0.31
604 0.3
605 0.29
606 0.29
607 0.25
608 0.24
609 0.24
610 0.19
611 0.14
612 0.17
613 0.13
614 0.12
615 0.12
616 0.12
617 0.11
618 0.1
619 0.1
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.07
625 0.07
626 0.08
627 0.08
628 0.09
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.08
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.1
637 0.13
638 0.17
639 0.2
640 0.22
641 0.23
642 0.23
643 0.28
644 0.3
645 0.36
646 0.42
647 0.43
648 0.46
649 0.5
650 0.51
651 0.47
652 0.47
653 0.42
654 0.38
655 0.37
656 0.39
657 0.41
658 0.48
659 0.5
660 0.5
661 0.53
662 0.54
663 0.53
664 0.53
665 0.49
666 0.42
667 0.4
668 0.38
669 0.33
670 0.27
671 0.24
672 0.18
673 0.17
674 0.16
675 0.16
676 0.13
677 0.12
678 0.12
679 0.12
680 0.12
681 0.1
682 0.1
683 0.09
684 0.1
685 0.1