Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JLV9

Protein Details
Accession A0A397JLV9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
154-177VRNEMYPKAGRRKRKDRWNIVSFEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
160-169PKAGRRKRKD
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
Amino Acid Sequences MSNVYENSSFLPTTIVNNDNALNMNDQIDPKTTAHMSNIASTFNNNNPDDSNVLDSSITKSKSKDFVPPVVNLQFPPVVDLVDLISKKSPDGRIPARAPNAFIIYRKVYVETARKNGHFLPMTTISSMASQSWENEVEKVKVEYRRIAKEALKVRNEMYPKAGRRKRKDRWNIVSFEPITSPQPTKQGVKRKNGGAQYRVIEMPASTPSPVMSSSSSIERPQKLRKTDVSSSQKLRKTDASLSLESSSSSSSSTSSSYSTAVGTSYSAINNVDNTEVSTFYDVNNTLSTVSSSSSPILDMVTTPPSYDINNTLSTSLSSPSSSSSSSSSSSSSHPSNSSVYYVYPSTTSGPNPESFSYDWNSQAVPNPVDSVNTVNSVNLVNAINSVNTINPVSPVISVSPVISVNPISQELVEAISTTDNNNSITYMTPSTSPAYTPVFTGTVASPKNDNYDNSSSTFPPTVITNDFITNISDEEYGFILSLIDHNKNNNKNNNNNNLQNVSGQEGQDELGIWNYSNYSASTTPLRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.21
4 0.23
5 0.24
6 0.23
7 0.24
8 0.21
9 0.18
10 0.16
11 0.17
12 0.18
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.22
17 0.21
18 0.25
19 0.25
20 0.24
21 0.25
22 0.29
23 0.28
24 0.3
25 0.3
26 0.27
27 0.26
28 0.27
29 0.28
30 0.28
31 0.34
32 0.28
33 0.29
34 0.29
35 0.31
36 0.3
37 0.28
38 0.27
39 0.19
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.2
44 0.25
45 0.25
46 0.23
47 0.25
48 0.31
49 0.37
50 0.38
51 0.43
52 0.43
53 0.49
54 0.5
55 0.51
56 0.51
57 0.48
58 0.47
59 0.37
60 0.35
61 0.28
62 0.24
63 0.23
64 0.17
65 0.14
66 0.12
67 0.13
68 0.1
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.22
76 0.25
77 0.24
78 0.33
79 0.37
80 0.44
81 0.48
82 0.55
83 0.56
84 0.53
85 0.5
86 0.44
87 0.43
88 0.36
89 0.33
90 0.3
91 0.26
92 0.27
93 0.26
94 0.25
95 0.22
96 0.27
97 0.34
98 0.36
99 0.4
100 0.44
101 0.44
102 0.46
103 0.45
104 0.46
105 0.4
106 0.34
107 0.33
108 0.31
109 0.32
110 0.29
111 0.28
112 0.21
113 0.19
114 0.19
115 0.13
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.12
120 0.14
121 0.14
122 0.16
123 0.18
124 0.18
125 0.19
126 0.2
127 0.23
128 0.26
129 0.28
130 0.33
131 0.36
132 0.41
133 0.41
134 0.44
135 0.42
136 0.45
137 0.51
138 0.52
139 0.49
140 0.44
141 0.44
142 0.44
143 0.43
144 0.36
145 0.34
146 0.34
147 0.37
148 0.47
149 0.52
150 0.56
151 0.64
152 0.74
153 0.77
154 0.8
155 0.85
156 0.85
157 0.89
158 0.86
159 0.8
160 0.71
161 0.69
162 0.59
163 0.49
164 0.39
165 0.3
166 0.24
167 0.23
168 0.23
169 0.17
170 0.22
171 0.24
172 0.29
173 0.34
174 0.43
175 0.48
176 0.55
177 0.59
178 0.58
179 0.62
180 0.63
181 0.62
182 0.54
183 0.51
184 0.44
185 0.4
186 0.35
187 0.29
188 0.22
189 0.16
190 0.14
191 0.12
192 0.11
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.08
200 0.09
201 0.11
202 0.13
203 0.15
204 0.17
205 0.22
206 0.24
207 0.28
208 0.35
209 0.41
210 0.42
211 0.46
212 0.48
213 0.51
214 0.51
215 0.56
216 0.56
217 0.54
218 0.57
219 0.59
220 0.57
221 0.51
222 0.5
223 0.43
224 0.39
225 0.37
226 0.39
227 0.36
228 0.33
229 0.33
230 0.31
231 0.28
232 0.24
233 0.2
234 0.13
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.16
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.19
323 0.2
324 0.19
325 0.19
326 0.16
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.13
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.15
337 0.17
338 0.18
339 0.2
340 0.2
341 0.21
342 0.2
343 0.22
344 0.22
345 0.21
346 0.2
347 0.18
348 0.18
349 0.16
350 0.2
351 0.21
352 0.18
353 0.17
354 0.18
355 0.17
356 0.17
357 0.17
358 0.15
359 0.12
360 0.14
361 0.13
362 0.11
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.1
367 0.09
368 0.07
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.09
399 0.1
400 0.09
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.14
414 0.14
415 0.13
416 0.13
417 0.15
418 0.17
419 0.17
420 0.16
421 0.16
422 0.19
423 0.18
424 0.18
425 0.18
426 0.17
427 0.16
428 0.18
429 0.16
430 0.19
431 0.19
432 0.2
433 0.2
434 0.2
435 0.25
436 0.26
437 0.27
438 0.27
439 0.32
440 0.33
441 0.33
442 0.35
443 0.31
444 0.31
445 0.31
446 0.23
447 0.19
448 0.18
449 0.2
450 0.2
451 0.21
452 0.2
453 0.2
454 0.21
455 0.21
456 0.2
457 0.17
458 0.15
459 0.14
460 0.12
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.1
465 0.09
466 0.09
467 0.07
468 0.07
469 0.11
470 0.14
471 0.17
472 0.19
473 0.26
474 0.34
475 0.43
476 0.52
477 0.58
478 0.62
479 0.68
480 0.76
481 0.79
482 0.79
483 0.76
484 0.72
485 0.65
486 0.58
487 0.5
488 0.42
489 0.37
490 0.32
491 0.27
492 0.22
493 0.19
494 0.18
495 0.17
496 0.16
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.11
502 0.12
503 0.12
504 0.13
505 0.13
506 0.14
507 0.14
508 0.17