Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397ITA0

Protein Details
Accession A0A397ITA0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-312TMELLKKKKSLNKVNERIANIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 11.333, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041078  Plavaka  
Pfam View protein in Pfam  
PF18759  Plavaka  
Amino Acid Sequences MDKMNISQLSYSKYCVLTHNSQDYFVHYRPIKNCIKNLLSNPDILKNLMFRYENSKIEDEKSYGEQNSGNWWKRAERSISNYANILSIILYSDATTTDTLGKSSLHPIYVSLGNIPTWRRNKEDAKQLLGYLPILSAKNEKEKKSSEFKELARETFHNSIKFLLDPLFQGDGVDFNIDDKDIWFFPRISTIICDWPEACTFLLTYKSANSNYPCHFCLVQREDLIDIRKEVILRNHVNMKEYFDSNTSNLAGLEQVNNYFWSILNLNIYAATVPDRMHHLDLGLFKYQIEFTMELLKKKKSLNKVNERIANIPRHSQLKRYDEDHGVCGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.36
4 0.37
5 0.43
6 0.5
7 0.46
8 0.47
9 0.45
10 0.46
11 0.46
12 0.38
13 0.39
14 0.33
15 0.4
16 0.41
17 0.49
18 0.53
19 0.52
20 0.56
21 0.56
22 0.59
23 0.58
24 0.62
25 0.61
26 0.53
27 0.51
28 0.48
29 0.44
30 0.4
31 0.34
32 0.29
33 0.23
34 0.23
35 0.24
36 0.23
37 0.2
38 0.27
39 0.32
40 0.35
41 0.36
42 0.39
43 0.35
44 0.38
45 0.39
46 0.32
47 0.29
48 0.29
49 0.29
50 0.26
51 0.26
52 0.23
53 0.21
54 0.29
55 0.35
56 0.35
57 0.32
58 0.34
59 0.36
60 0.39
61 0.45
62 0.42
63 0.39
64 0.43
65 0.51
66 0.52
67 0.49
68 0.46
69 0.4
70 0.34
71 0.27
72 0.2
73 0.1
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.16
91 0.16
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.16
96 0.17
97 0.16
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.14
102 0.15
103 0.19
104 0.24
105 0.26
106 0.3
107 0.36
108 0.43
109 0.47
110 0.55
111 0.52
112 0.51
113 0.49
114 0.45
115 0.39
116 0.33
117 0.26
118 0.16
119 0.12
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.11
124 0.12
125 0.21
126 0.26
127 0.28
128 0.3
129 0.34
130 0.38
131 0.44
132 0.46
133 0.43
134 0.43
135 0.43
136 0.48
137 0.46
138 0.42
139 0.35
140 0.33
141 0.31
142 0.31
143 0.33
144 0.25
145 0.23
146 0.23
147 0.21
148 0.2
149 0.17
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.06
168 0.06
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.17
179 0.18
180 0.18
181 0.15
182 0.17
183 0.16
184 0.16
185 0.14
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.14
194 0.15
195 0.19
196 0.2
197 0.24
198 0.27
199 0.3
200 0.29
201 0.28
202 0.28
203 0.25
204 0.31
205 0.3
206 0.31
207 0.28
208 0.28
209 0.27
210 0.29
211 0.31
212 0.22
213 0.18
214 0.15
215 0.16
216 0.16
217 0.17
218 0.19
219 0.24
220 0.26
221 0.29
222 0.35
223 0.34
224 0.37
225 0.35
226 0.35
227 0.31
228 0.29
229 0.27
230 0.22
231 0.24
232 0.21
233 0.23
234 0.18
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.11
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.14
263 0.17
264 0.18
265 0.18
266 0.17
267 0.19
268 0.22
269 0.24
270 0.22
271 0.19
272 0.18
273 0.19
274 0.19
275 0.17
276 0.18
277 0.15
278 0.13
279 0.24
280 0.26
281 0.31
282 0.35
283 0.36
284 0.37
285 0.44
286 0.5
287 0.51
288 0.59
289 0.65
290 0.72
291 0.78
292 0.83
293 0.83
294 0.79
295 0.74
296 0.71
297 0.68
298 0.6
299 0.57
300 0.53
301 0.54
302 0.52
303 0.53
304 0.55
305 0.55
306 0.57
307 0.54
308 0.56
309 0.55
310 0.57