Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397J4C2

Protein Details
Accession A0A397J4C2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
380-404GRSISKGRKERLRRFHQMRKRAFQGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
384-399SKGRKERLRRFHQMRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MEHLHSSSHKRPILDDSSETAPPLPDHQTKRMRLTLPPISATLNPSSSFPSFQLPIPPLEPNSGSLPILPPISATDSPVLPISSPRSLSGQQHHELPHIDSLGPLPPIPQNPHFLSSTPSKSMSISSILSNNEDDPFIKRLNMNIKEMDIGNGSNHQHLNNTLDYNNHHHLSHIVKSPLHHTSVDNFINLENIDKNVRENELNEINEDDQDDEFSLDRSLFEGLYLQREPHLIVKNDDSLNMEGREEHHLGHVIYDPNKILPPLEFHENGILEVWVSSKHLTWNNKKVRSRFLWGTDIYTDDSDVVAVLIHTGYFIPLISKWSSNPPNHDLCVTIRVLPKLVQYTATVRNQYQSRPWGNHHGVSYKIEKICEMKNGEAIGRSISKGRKERLRRFHQMRKRAFQGTEYDRGDESIIVFNNDGDPCLKYNLLLMSNDEHIKEKLRNEVLYLENDEERFEISYDETRDKYRFAIVSSATYLGLSAISKNNQESDDNRPNFPLDESHLEETIRDDLDFHEMSWNILGVIVEDKIDSSRSLLCILKRIFWRSRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.4
4 0.41
5 0.41
6 0.39
7 0.31
8 0.25
9 0.22
10 0.23
11 0.26
12 0.3
13 0.35
14 0.44
15 0.53
16 0.57
17 0.64
18 0.67
19 0.63
20 0.6
21 0.63
22 0.62
23 0.56
24 0.52
25 0.46
26 0.42
27 0.41
28 0.39
29 0.34
30 0.28
31 0.24
32 0.23
33 0.26
34 0.25
35 0.25
36 0.23
37 0.24
38 0.23
39 0.24
40 0.3
41 0.27
42 0.29
43 0.29
44 0.31
45 0.27
46 0.29
47 0.29
48 0.24
49 0.26
50 0.25
51 0.23
52 0.21
53 0.21
54 0.19
55 0.19
56 0.16
57 0.13
58 0.13
59 0.19
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.18
64 0.19
65 0.2
66 0.18
67 0.12
68 0.16
69 0.18
70 0.2
71 0.21
72 0.22
73 0.25
74 0.29
75 0.35
76 0.39
77 0.41
78 0.39
79 0.43
80 0.43
81 0.41
82 0.39
83 0.35
84 0.3
85 0.24
86 0.23
87 0.18
88 0.18
89 0.18
90 0.17
91 0.14
92 0.13
93 0.15
94 0.19
95 0.25
96 0.26
97 0.29
98 0.32
99 0.35
100 0.34
101 0.31
102 0.31
103 0.32
104 0.34
105 0.31
106 0.3
107 0.27
108 0.27
109 0.28
110 0.26
111 0.22
112 0.18
113 0.17
114 0.19
115 0.19
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.16
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.17
127 0.21
128 0.31
129 0.34
130 0.34
131 0.32
132 0.32
133 0.32
134 0.31
135 0.27
136 0.18
137 0.15
138 0.12
139 0.15
140 0.15
141 0.17
142 0.17
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.2
147 0.18
148 0.19
149 0.16
150 0.17
151 0.2
152 0.25
153 0.28
154 0.26
155 0.23
156 0.22
157 0.24
158 0.26
159 0.28
160 0.27
161 0.26
162 0.25
163 0.26
164 0.31
165 0.3
166 0.29
167 0.25
168 0.21
169 0.21
170 0.27
171 0.27
172 0.23
173 0.2
174 0.18
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.18
188 0.21
189 0.21
190 0.21
191 0.2
192 0.19
193 0.18
194 0.18
195 0.13
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.08
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.13
217 0.16
218 0.21
219 0.19
220 0.2
221 0.22
222 0.26
223 0.26
224 0.25
225 0.22
226 0.17
227 0.18
228 0.17
229 0.15
230 0.11
231 0.12
232 0.16
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.1
248 0.08
249 0.1
250 0.11
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.17
255 0.17
256 0.16
257 0.13
258 0.11
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.09
267 0.15
268 0.22
269 0.29
270 0.39
271 0.47
272 0.55
273 0.59
274 0.59
275 0.61
276 0.58
277 0.58
278 0.52
279 0.47
280 0.44
281 0.4
282 0.38
283 0.31
284 0.28
285 0.22
286 0.18
287 0.14
288 0.09
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.04
304 0.04
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.19
310 0.26
311 0.27
312 0.32
313 0.35
314 0.36
315 0.37
316 0.36
317 0.29
318 0.24
319 0.25
320 0.2
321 0.2
322 0.19
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.16
330 0.15
331 0.19
332 0.25
333 0.27
334 0.27
335 0.25
336 0.29
337 0.3
338 0.3
339 0.31
340 0.33
341 0.34
342 0.36
343 0.39
344 0.43
345 0.45
346 0.46
347 0.43
348 0.37
349 0.34
350 0.34
351 0.34
352 0.29
353 0.28
354 0.24
355 0.24
356 0.24
357 0.25
358 0.28
359 0.27
360 0.23
361 0.24
362 0.25
363 0.24
364 0.22
365 0.2
366 0.16
367 0.14
368 0.14
369 0.17
370 0.2
371 0.27
372 0.32
373 0.38
374 0.46
375 0.55
376 0.65
377 0.7
378 0.76
379 0.79
380 0.82
381 0.86
382 0.86
383 0.86
384 0.85
385 0.81
386 0.78
387 0.73
388 0.65
389 0.58
390 0.57
391 0.52
392 0.52
393 0.45
394 0.41
395 0.35
396 0.35
397 0.32
398 0.23
399 0.19
400 0.15
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.15
406 0.15
407 0.14
408 0.11
409 0.12
410 0.12
411 0.15
412 0.14
413 0.11
414 0.14
415 0.17
416 0.18
417 0.17
418 0.17
419 0.18
420 0.21
421 0.22
422 0.2
423 0.19
424 0.18
425 0.22
426 0.24
427 0.25
428 0.3
429 0.34
430 0.33
431 0.32
432 0.37
433 0.35
434 0.34
435 0.34
436 0.27
437 0.25
438 0.24
439 0.23
440 0.18
441 0.17
442 0.14
443 0.12
444 0.1
445 0.11
446 0.16
447 0.19
448 0.22
449 0.23
450 0.26
451 0.27
452 0.28
453 0.27
454 0.27
455 0.25
456 0.24
457 0.28
458 0.25
459 0.27
460 0.28
461 0.27
462 0.21
463 0.2
464 0.18
465 0.12
466 0.11
467 0.09
468 0.09
469 0.13
470 0.16
471 0.18
472 0.2
473 0.22
474 0.23
475 0.26
476 0.27
477 0.32
478 0.4
479 0.41
480 0.41
481 0.4
482 0.39
483 0.37
484 0.36
485 0.29
486 0.24
487 0.28
488 0.32
489 0.33
490 0.33
491 0.31
492 0.3
493 0.29
494 0.26
495 0.21
496 0.15
497 0.13
498 0.13
499 0.19
500 0.19
501 0.17
502 0.2
503 0.19
504 0.2
505 0.2
506 0.19
507 0.13
508 0.14
509 0.13
510 0.08
511 0.1
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.11
518 0.1
519 0.11
520 0.14
521 0.15
522 0.19
523 0.23
524 0.24
525 0.32
526 0.33
527 0.38
528 0.42
529 0.48