Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397UJU4

Protein Details
Accession A0A397UJU4    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
503-523SESKKQYQRGQQPPNKRRRVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-371RKGKK
518-520KRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MTSVTTNLPLQYQREILDEILAEDGFLILSRGLGLRSIICALLKIYSHTNHLVILLNTPANEEIIIKEELAEMGVRKPGLRVVNNEMGAKERSELYLSGGILSITSRILIVDLLTKRIPSYLITGILVNHAEKVNETSIEAFILRVYKEENQEGFIKAFSDSPESFTGFSPLQTTVQYLQLRKVFLWPRFHMTIRECLEERKVEVIELYQPLSNSMNDIQSAILECIEACVAELRKTNIAWLDIEDLTVEQAFFRSFDHIIRQQLDPVWHRVGQKTKLLIGDLTMLRKLLTYLVSYDCVTFHSFLETILASQTPSSKLSQQQQSPWIFMDAGNTIFSVAKSRVYLRETQKNIVECDDDDGNGDNDKRKGKKPDKLGYPPGIVPVLEELPKWGLLAEIVNEIELEIESLSGLPPSDEEESNNIILIMAENERECSQLREYLSTMHKGLEEGQGRGGPLLRRLLQNYFKWKGDITKVSENLFNSSKNSVQSEDSPESSNKKATSSESKKQYQRGQQPPNKRRRVRGGSVAAAASSTRTTVSIIEEEAKEIANFINSNITSFATSSVQKEASKTNEIYDDDEFDAKAFSTYFGLLPLQSLVIIRPISGDDDRMLEALKPKYIIIYHPDQRFVRRVEMFRAIHPGISCKVYFMIYENSVEEQRYLSVIRKEKEAFEKLIYEKSVMAIPLGKPKIISRNPADMFLRTTNTRIAGGREIVQPIAHKIIVDIREFRSSLPSLLHAHGIEILPCTLKVGDYILSPDICVERKSISDLIGSFISGRLYTQCETMSIYYKQPVLLIEFEQNQTFTLQAINDLKSDININDISSKLVLLTLTFPRVKIIWSSSPHATVQIFEDLKESRDEPELETAQSIGIENEDFPDYNLSPQDILRALPGITAKNYKHVMSKVENLRELTELSLRELQILIGVENGKKLYEFLERNVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.25
4 0.23
5 0.21
6 0.17
7 0.16
8 0.15
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.04
16 0.05
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.11
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.15
30 0.14
31 0.15
32 0.2
33 0.21
34 0.25
35 0.27
36 0.27
37 0.25
38 0.26
39 0.27
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.17
47 0.14
48 0.14
49 0.12
50 0.1
51 0.13
52 0.14
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.09
60 0.11
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.2
66 0.27
67 0.29
68 0.33
69 0.38
70 0.45
71 0.47
72 0.48
73 0.42
74 0.38
75 0.35
76 0.31
77 0.24
78 0.17
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.18
83 0.21
84 0.2
85 0.19
86 0.18
87 0.16
88 0.14
89 0.14
90 0.1
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.13
99 0.14
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.14
107 0.18
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.19
113 0.21
114 0.2
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.1
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.13
134 0.17
135 0.22
136 0.27
137 0.27
138 0.28
139 0.3
140 0.31
141 0.28
142 0.24
143 0.2
144 0.15
145 0.16
146 0.14
147 0.18
148 0.16
149 0.19
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.21
154 0.23
155 0.18
156 0.18
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.17
162 0.15
163 0.22
164 0.26
165 0.25
166 0.3
167 0.32
168 0.33
169 0.3
170 0.37
171 0.37
172 0.39
173 0.46
174 0.43
175 0.47
176 0.5
177 0.51
178 0.49
179 0.44
180 0.47
181 0.42
182 0.43
183 0.37
184 0.36
185 0.39
186 0.35
187 0.33
188 0.28
189 0.25
190 0.2
191 0.2
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.15
197 0.14
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.12
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.04
217 0.08
218 0.09
219 0.12
220 0.15
221 0.16
222 0.19
223 0.19
224 0.21
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.17
229 0.18
230 0.16
231 0.16
232 0.13
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.08
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.18
246 0.21
247 0.25
248 0.28
249 0.27
250 0.27
251 0.28
252 0.32
253 0.29
254 0.3
255 0.29
256 0.3
257 0.31
258 0.34
259 0.39
260 0.38
261 0.41
262 0.38
263 0.37
264 0.35
265 0.34
266 0.29
267 0.22
268 0.23
269 0.19
270 0.18
271 0.16
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.09
301 0.11
302 0.12
303 0.15
304 0.2
305 0.28
306 0.35
307 0.37
308 0.4
309 0.46
310 0.46
311 0.43
312 0.38
313 0.32
314 0.25
315 0.21
316 0.19
317 0.12
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.13
329 0.17
330 0.19
331 0.27
332 0.31
333 0.39
334 0.41
335 0.43
336 0.45
337 0.43
338 0.41
339 0.35
340 0.3
341 0.21
342 0.21
343 0.18
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.15
352 0.21
353 0.24
354 0.29
355 0.4
356 0.47
357 0.53
358 0.61
359 0.66
360 0.7
361 0.73
362 0.74
363 0.67
364 0.61
365 0.54
366 0.45
367 0.37
368 0.27
369 0.19
370 0.14
371 0.11
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.07
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.06
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.12
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.11
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.1
421 0.1
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.15
426 0.19
427 0.21
428 0.2
429 0.2
430 0.17
431 0.16
432 0.15
433 0.16
434 0.17
435 0.17
436 0.15
437 0.16
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.1
443 0.1
444 0.13
445 0.14
446 0.15
447 0.17
448 0.22
449 0.26
450 0.29
451 0.34
452 0.34
453 0.33
454 0.32
455 0.31
456 0.29
457 0.28
458 0.29
459 0.26
460 0.29
461 0.3
462 0.31
463 0.32
464 0.29
465 0.28
466 0.24
467 0.2
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.15
474 0.15
475 0.16
476 0.21
477 0.21
478 0.21
479 0.21
480 0.21
481 0.23
482 0.23
483 0.23
484 0.18
485 0.17
486 0.17
487 0.19
488 0.29
489 0.33
490 0.4
491 0.44
492 0.51
493 0.54
494 0.59
495 0.62
496 0.6
497 0.63
498 0.66
499 0.69
500 0.69
501 0.76
502 0.79
503 0.83
504 0.84
505 0.78
506 0.74
507 0.74
508 0.75
509 0.69
510 0.69
511 0.63
512 0.55
513 0.52
514 0.45
515 0.34
516 0.26
517 0.21
518 0.12
519 0.07
520 0.05
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.06
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.08
534 0.08
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.11
543 0.12
544 0.11
545 0.11
546 0.12
547 0.1
548 0.11
549 0.11
550 0.13
551 0.15
552 0.15
553 0.16
554 0.18
555 0.2
556 0.24
557 0.23
558 0.22
559 0.24
560 0.24
561 0.25
562 0.22
563 0.2
564 0.17
565 0.17
566 0.16
567 0.11
568 0.11
569 0.08
570 0.08
571 0.06
572 0.05
573 0.06
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.08
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.08
586 0.08
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.11
591 0.11
592 0.12
593 0.09
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.09
599 0.15
600 0.15
601 0.15
602 0.14
603 0.14
604 0.16
605 0.16
606 0.17
607 0.16
608 0.23
609 0.29
610 0.3
611 0.36
612 0.35
613 0.38
614 0.41
615 0.39
616 0.38
617 0.36
618 0.36
619 0.36
620 0.44
621 0.41
622 0.37
623 0.41
624 0.34
625 0.31
626 0.29
627 0.27
628 0.2
629 0.21
630 0.2
631 0.14
632 0.14
633 0.13
634 0.13
635 0.13
636 0.16
637 0.14
638 0.16
639 0.16
640 0.16
641 0.17
642 0.17
643 0.14
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.13
649 0.2
650 0.26
651 0.27
652 0.31
653 0.33
654 0.36
655 0.42
656 0.42
657 0.37
658 0.33
659 0.36
660 0.33
661 0.35
662 0.31
663 0.25
664 0.21
665 0.19
666 0.19
667 0.14
668 0.13
669 0.12
670 0.13
671 0.21
672 0.21
673 0.2
674 0.2
675 0.23
676 0.32
677 0.33
678 0.39
679 0.35
680 0.44
681 0.45
682 0.48
683 0.47
684 0.38
685 0.39
686 0.34
687 0.33
688 0.24
689 0.25
690 0.23
691 0.22
692 0.23
693 0.2
694 0.2
695 0.2
696 0.21
697 0.22
698 0.22
699 0.22
700 0.21
701 0.2
702 0.18
703 0.17
704 0.18
705 0.15
706 0.13
707 0.12
708 0.18
709 0.2
710 0.21
711 0.23
712 0.22
713 0.26
714 0.26
715 0.26
716 0.25
717 0.23
718 0.22
719 0.2
720 0.21
721 0.21
722 0.22
723 0.24
724 0.18
725 0.18
726 0.19
727 0.18
728 0.15
729 0.13
730 0.12
731 0.1
732 0.1
733 0.11
734 0.09
735 0.08
736 0.08
737 0.09
738 0.09
739 0.09
740 0.12
741 0.13
742 0.13
743 0.13
744 0.13
745 0.14
746 0.14
747 0.14
748 0.13
749 0.13
750 0.14
751 0.18
752 0.19
753 0.17
754 0.19
755 0.18
756 0.2
757 0.18
758 0.18
759 0.13
760 0.13
761 0.12
762 0.1
763 0.1
764 0.09
765 0.13
766 0.13
767 0.15
768 0.14
769 0.14
770 0.17
771 0.19
772 0.22
773 0.21
774 0.22
775 0.24
776 0.25
777 0.24
778 0.23
779 0.22
780 0.19
781 0.19
782 0.19
783 0.2
784 0.22
785 0.23
786 0.23
787 0.22
788 0.19
789 0.18
790 0.16
791 0.11
792 0.1
793 0.09
794 0.14
795 0.17
796 0.18
797 0.18
798 0.19
799 0.18
800 0.17
801 0.2
802 0.14
803 0.14
804 0.14
805 0.14
806 0.15
807 0.16
808 0.16
809 0.14
810 0.14
811 0.1
812 0.1
813 0.09
814 0.08
815 0.12
816 0.14
817 0.19
818 0.2
819 0.2
820 0.22
821 0.22
822 0.23
823 0.23
824 0.26
825 0.28
826 0.32
827 0.37
828 0.37
829 0.4
830 0.39
831 0.38
832 0.32
833 0.26
834 0.24
835 0.27
836 0.24
837 0.22
838 0.25
839 0.22
840 0.23
841 0.25
842 0.23
843 0.17
844 0.22
845 0.23
846 0.22
847 0.29
848 0.29
849 0.27
850 0.27
851 0.24
852 0.2
853 0.19
854 0.16
855 0.09
856 0.08
857 0.08
858 0.08
859 0.1
860 0.12
861 0.11
862 0.12
863 0.17
864 0.16
865 0.18
866 0.2
867 0.19
868 0.19
869 0.19
870 0.22
871 0.18
872 0.18
873 0.16
874 0.16
875 0.15
876 0.16
877 0.18
878 0.17
879 0.2
880 0.27
881 0.26
882 0.32
883 0.36
884 0.35
885 0.39
886 0.4
887 0.43
888 0.42
889 0.51
890 0.52
891 0.57
892 0.59
893 0.54
894 0.52
895 0.46
896 0.41
897 0.35
898 0.3
899 0.23
900 0.24
901 0.27
902 0.25
903 0.25
904 0.24
905 0.21
906 0.2
907 0.2
908 0.15
909 0.13
910 0.16
911 0.15
912 0.17
913 0.18
914 0.15
915 0.15
916 0.15
917 0.15
918 0.22
919 0.25
920 0.29