Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397UJU4

Protein Details
Accession A0A397UJU4    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
503-523SESKKQYQRGQQPPNKRRRVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-371RKGKK
518-520KRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MTSVTTNLPLQYQREILDEILAEDGFLILSRGLGLRSIICALLKIYSHTNHLVILLNTPANEEIIIKEELAEMGVRKPGLRVVNNEMGAKERSELYLSGGILSITSRILIVDLLTKRIPSYLITGILVNHAEKVNETSIEAFILRVYKEENQEGFIKAFSDSPESFTGFSPLQTTVQYLQLRKVFLWPRFHMTIRECLEERKVEVIELYQPLSNSMNDIQSAILECIEACVAELRKTNIAWLDIEDLTVEQAFFRSFDHIIRQQLDPVWHRVGQKTKLLIGDLTMLRKLLTYLVSYDCVTFHSFLETILASQTPSSKLSQQQQSPWIFMDAGNTIFSVAKSRVYLRETQKNIVECDDDDGNGDNDKRKGKKPDKLGYPPGIVPVLEELPKWGLLAEIVNEIELEIESLSGLPPSDEEESNNIILIMAENERECSQLREYLSTMHKGLEEGQGRGGPLLRRLLQNYFKWKGDITKVSENLFNSSKNSVQSEDSPESSNKKATSSESKKQYQRGQQPPNKRRRVRGGSVAAAASSTRTTVSIIEEEAKEIANFINSNITSFATSSVQKEASKTNEIYDDDEFDAKAFSTYFGLLPLQSLVIIRPISGDDDRMLEALKPKYIIIYHPDQRFVRRVEMFRAIHPGISCKVYFMIYENSVEEQRYLSVIRKEKEAFEKLIYEKSVMAIPLGKPKIISRNPADMFLRTTNTRIAGGREIVQPIAHKIIVDIREFRSSLPSLLHAHGIEILPCTLKVGDYILSPDICVERKSISDLIGSFISGRLYTQCETMSIYYKQPVLLIEFEQNQTFTLQAINDLKSDININDISSKLVLLTLTFPRVKIIWSSSPHATVQIFEDLKESRDEPELETAQSIGIENEDFPDYNLSPQDILRALPGITAKNYKHVMSKVENLRELTELSLRELQILIGVENGKKLYEFLERNVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.25
4 0.23
5 0.21
6 0.17
7 0.16
8 0.15
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.04
16 0.05
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.11
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.15
30 0.14
31 0.15
32 0.2
33 0.21
34 0.25
35 0.27
36 0.27
37 0.25
38 0.26
39 0.27
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.17
47 0.14
48 0.14
49 0.12
50 0.1
51 0.13
52 0.14
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.09
60 0.11
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.2
66 0.27
67 0.29
68 0.33
69 0.38
70 0.45
71 0.47
72 0.48
73 0.42
74 0.38
75 0.35
76 0.31
77 0.24
78 0.17
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.18
83 0.21
84 0.2
85 0.19
86 0.18
87 0.16
88 0.14
89 0.14
90 0.1
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.13
99 0.14
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.14
107 0.18
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.19
113 0.21
114 0.2
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.1
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.13
134 0.17
135 0.22
136 0.27
137 0.27
138 0.28
139 0.3
140 0.31
141 0.28
142 0.24
143 0.2
144 0.15
145 0.16
146 0.14
147 0.18
148 0.16
149 0.19
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.21
154 0.23
155 0.18
156 0.18
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.17
162 0.15
163 0.22
164 0.26
165 0.25
166 0.3
167 0.32
168 0.33
169 0.3
170 0.37
171 0.37
172 0.39
173 0.46
174 0.43
175 0.47
176 0.5
177 0.51
178 0.49
179 0.44
180 0.47
181 0.42
182 0.43
183 0.37
184 0.36
185 0.39
186 0.35
187 0.33
188 0.28
189 0.25
190 0.2
191 0.2
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.15
197 0.14
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.12
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.04
217 0.08
218 0.09
219 0.12
220 0.15
221 0.16
222 0.19
223 0.19
224 0.21
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.17
229 0.18
230 0.16
231 0.16
232 0.13
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.08
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.18
246 0.21
247 0.25
248 0.28
249 0.27
250 0.27
251 0.28
252 0.32
253 0.29
254 0.3
255 0.29
256 0.3
257 0.31
258 0.34
259 0.39
260 0.38
261 0.41
262 0.38
263 0.37
264 0.35
265 0.34
266 0.29
267 0.22
268 0.23
269 0.19
270 0.18
271 0.16
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.09
301 0.11
302 0.12
303 0.15
304 0.2
305 0.28
306 0.35
307 0.37
308 0.4
309 0.46
310 0.46
311 0.43
312 0.38
313 0.32
314 0.25
315 0.21
316 0.19
317 0.12
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.13
329 0.17
330 0.19
331 0.27
332 0.31
333 0.39
334 0.41
335 0.43
336 0.45
337 0.43
338 0.41
339 0.35
340 0.3
341 0.21
342 0.21
343 0.18
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.15
352 0.21
353 0.24
354 0.29
355 0.4
356 0.47
357 0.53
358 0.61
359 0.66
360 0.7
361 0.73
362 0.74
363 0.67
364 0.61
365 0.54
366 0.45
367 0.37
368 0.27
369 0.19
370 0.14
371 0.11
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.07
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.06
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.12
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.11
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.1
421 0.1
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.15
426 0.19
427 0.21
428 0.2
429 0.2
430 0.17
431 0.16
432 0.15
433 0.16
434 0.17
435 0.17
436 0.15
437 0.16
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.1
443 0.1
444 0.13
445 0.14
446 0.15
447 0.17
448 0.22
449 0.26
450 0.29
451 0.34
452 0.34
453 0.33
454 0.32
455 0.31
456 0.29
457 0.28
458 0.29
459 0.26
460 0.29
461 0.3
462 0.31
463 0.32
464 0.29
465 0.28
466 0.24
467 0.2
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.15
474 0.15
475 0.16
476 0.21
477 0.21
478 0.21
479 0.21
480 0.21
481 0.23
482 0.23
483 0.23
484 0.18
485 0.17
486 0.17
487 0.19
488 0.29
489 0.33
490 0.4
491 0.44
492 0.51
493 0.54
494 0.59
495 0.62
496 0.6
497 0.63
498 0.66
499 0.69
500 0.69
501 0.76
502 0.79
503 0.83
504 0.84
505 0.78
506 0.74
507 0.74
508 0.75
509 0.69
510 0.69
511 0.63
512 0.55
513 0.52
514 0.45
515 0.34
516 0.26
517 0.21
518 0.12
519 0.07
520 0.05
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.06
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.08
534 0.08
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.11
543 0.12
544 0.11
545 0.11
546 0.12
547 0.1
548 0.11
549 0.11
550 0.13
551 0.15
552 0.15
553 0.16
554 0.18
555 0.2
556 0.24
557 0.23
558 0.22
559 0.24
560 0.24
561 0.25
562 0.22
563 0.2
564 0.17
565 0.17
566 0.16
567 0.11
568 0.11
569 0.08
570 0.08
571 0.06
572 0.05
573 0.06
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.08
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.08
586 0.08
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.11
591 0.11
592 0.12
593 0.09
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.09
599 0.15
600 0.15
601 0.15
602 0.14
603 0.14
604 0.16
605 0.16
606 0.17
607 0.16
608 0.23
609 0.29
610 0.3
611 0.36
612 0.35
613 0.38
614 0.41
615 0.39
616 0.38
617 0.36
618 0.36
619 0.36
620 0.44
621 0.41
622 0.37
623 0.41
624 0.34
625 0.31
626 0.29
627 0.27
628 0.2
629 0.21
630 0.2
631 0.14
632 0.14
633 0.13
634 0.13
635 0.13
636 0.16
637 0.14
638 0.16
639 0.16
640 0.16
641 0.17
642 0.17
643 0.14
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.13
649 0.2
650 0.26
651 0.27
652 0.31
653 0.33
654 0.36
655 0.42
656 0.42
657 0.37
658 0.33
659 0.36
660 0.33
661 0.35
662 0.31
663 0.25
664 0.21
665 0.19
666 0.19
667 0.14
668 0.13
669 0.12
670 0.13
671 0.21
672 0.21
673 0.2
674 0.2
675 0.23
676 0.32
677 0.33
678 0.39
679 0.35
680 0.44
681 0.45
682 0.48
683 0.47
684 0.38
685 0.39
686 0.34
687 0.33
688 0.24
689 0.25
690 0.23
691 0.22
692 0.23
693 0.2
694 0.2
695 0.2
696 0.21
697 0.22
698 0.22
699 0.22
700 0.21
701 0.2
702 0.18
703 0.17
704 0.18
705 0.15
706 0.13
707 0.12
708 0.18
709 0.2
710 0.21
711 0.23
712 0.22
713 0.26
714 0.26
715 0.26
716 0.25
717 0.23
718 0.22
719 0.2
720 0.21
721 0.21
722 0.22
723 0.24
724 0.18
725 0.18
726 0.19
727 0.18
728 0.15
729 0.13
730 0.12
731 0.1
732 0.1
733 0.11
734 0.09
735 0.08
736 0.08
737 0.09
738 0.09
739 0.09
740 0.12
741 0.13
742 0.13
743 0.13
744 0.13
745 0.14
746 0.14
747 0.14
748 0.13
749 0.13
750 0.14
751 0.18
752 0.19
753 0.17
754 0.19
755 0.18
756 0.2
757 0.18
758 0.18
759 0.13
760 0.13
761 0.12
762 0.1
763 0.1
764 0.09
765 0.13
766 0.13
767 0.15
768 0.14
769 0.14
770 0.17
771 0.19
772 0.22
773 0.21
774 0.22
775 0.24
776 0.25
777 0.24
778 0.23
779 0.22
780 0.19
781 0.19
782 0.19
783 0.2
784 0.22
785 0.23
786 0.23
787 0.22
788 0.19
789 0.18
790 0.16
791 0.11
792 0.1
793 0.09
794 0.14
795 0.17
796 0.18
797 0.18
798 0.19
799 0.18
800 0.17
801 0.2
802 0.14
803 0.14
804 0.14
805 0.14
806 0.15
807 0.16
808 0.16
809 0.14
810 0.14
811 0.1
812 0.1
813 0.09
814 0.08
815 0.12
816 0.14
817 0.19
818 0.2
819 0.2
820 0.22
821 0.22
822 0.23
823 0.23
824 0.26
825 0.28
826 0.32
827 0.37
828 0.37
829 0.4
830 0.39
831 0.38
832 0.32
833 0.26
834 0.24
835 0.27
836 0.24
837 0.22
838 0.25
839 0.22
840 0.23
841 0.25
842 0.23
843 0.17
844 0.22
845 0.23
846 0.22
847 0.29
848 0.29
849 0.27
850 0.27
851 0.24
852 0.2
853 0.19
854 0.16
855 0.09
856 0.08
857 0.08
858 0.08
859 0.1
860 0.12
861 0.11
862 0.12
863 0.17
864 0.16
865 0.18
866 0.2
867 0.19
868 0.19
869 0.19
870 0.22
871 0.18
872 0.18
873 0.16
874 0.16
875 0.15
876 0.16
877 0.18
878 0.17
879 0.2
880 0.27
881 0.26
882 0.32
883 0.36
884 0.35
885 0.39
886 0.4
887 0.43
888 0.42
889 0.51
890 0.52
891 0.57
892 0.59
893 0.54
894 0.52
895 0.46
896 0.41
897 0.35
898 0.3
899 0.23
900 0.24
901 0.27
902 0.25
903 0.25
904 0.24
905 0.21
906 0.2
907 0.2
908 0.15
909 0.13
910 0.16
911 0.15
912 0.17
913 0.18
914 0.15
915 0.15
916 0.15
917 0.15
918 0.22
919 0.25
920 0.29