Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397UY47

Protein Details
Accession A0A397UY47    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-228DEQAKEVNSKRKRRKGSKNQSEGIRQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-220KRKRRKGSK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 12, mito 3.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MMSPRSLQFLSDSGFDFNKQIRRGIPYTPGRDPTSVNSNDPNAILRSIFFHILTRNVPIIVHNGFLDLIYIYYSFYAELPEKLSTFIADLTEMFPAGIVDTKYIADYVTREKSSFLAYLFRKYEREQVDHKNAGDKNYLLIRIQKGCDNSQWTNMDVYEKTHTDVISTKRPLEQRYCEQYAMHGFCSQRMRCGNSHDLDFILDEQAKEVNSKRKRRKGSKNQSEGIRQDEESSNNSIEHVSASMPPTVIPSTKPDQYYNYHSAHFDAYMTGFIFARQLMKYTSATVMNEYKNKLYLISKNIPLLVEKSQFSKTSIGHQEKQKSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.22
4 0.24
5 0.3
6 0.29
7 0.32
8 0.33
9 0.39
10 0.41
11 0.42
12 0.46
13 0.48
14 0.53
15 0.55
16 0.57
17 0.53
18 0.52
19 0.5
20 0.46
21 0.46
22 0.42
23 0.39
24 0.37
25 0.36
26 0.35
27 0.33
28 0.31
29 0.23
30 0.21
31 0.18
32 0.15
33 0.16
34 0.17
35 0.18
36 0.16
37 0.17
38 0.17
39 0.21
40 0.22
41 0.21
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.19
47 0.17
48 0.17
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.06
93 0.08
94 0.13
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.22
101 0.22
102 0.16
103 0.19
104 0.19
105 0.25
106 0.26
107 0.27
108 0.27
109 0.27
110 0.35
111 0.31
112 0.35
113 0.35
114 0.41
115 0.47
116 0.47
117 0.46
118 0.45
119 0.42
120 0.4
121 0.36
122 0.28
123 0.22
124 0.21
125 0.22
126 0.15
127 0.18
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.21
132 0.21
133 0.22
134 0.24
135 0.27
136 0.25
137 0.27
138 0.27
139 0.25
140 0.23
141 0.22
142 0.21
143 0.15
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.16
152 0.18
153 0.22
154 0.23
155 0.23
156 0.26
157 0.3
158 0.32
159 0.34
160 0.36
161 0.36
162 0.42
163 0.44
164 0.4
165 0.37
166 0.36
167 0.36
168 0.32
169 0.25
170 0.21
171 0.18
172 0.22
173 0.29
174 0.27
175 0.27
176 0.28
177 0.31
178 0.29
179 0.36
180 0.38
181 0.32
182 0.33
183 0.28
184 0.26
185 0.22
186 0.21
187 0.15
188 0.11
189 0.1
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.14
196 0.22
197 0.3
198 0.4
199 0.5
200 0.59
201 0.69
202 0.78
203 0.86
204 0.88
205 0.91
206 0.91
207 0.9
208 0.86
209 0.81
210 0.78
211 0.68
212 0.61
213 0.52
214 0.42
215 0.36
216 0.33
217 0.29
218 0.25
219 0.25
220 0.21
221 0.19
222 0.19
223 0.16
224 0.13
225 0.12
226 0.1
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.17
238 0.21
239 0.25
240 0.28
241 0.28
242 0.31
243 0.35
244 0.42
245 0.42
246 0.4
247 0.37
248 0.35
249 0.34
250 0.31
251 0.26
252 0.19
253 0.14
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.12
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.16
267 0.17
268 0.19
269 0.21
270 0.21
271 0.22
272 0.24
273 0.29
274 0.31
275 0.35
276 0.35
277 0.34
278 0.33
279 0.33
280 0.31
281 0.31
282 0.33
283 0.37
284 0.41
285 0.42
286 0.43
287 0.44
288 0.41
289 0.38
290 0.34
291 0.32
292 0.3
293 0.27
294 0.28
295 0.31
296 0.32
297 0.32
298 0.35
299 0.3
300 0.35
301 0.44
302 0.49
303 0.52
304 0.59