Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397W2F3

Protein Details
Accession A0A397W2F3    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-59SDNERSVTTQKLKKKSHRERSSSPVPSPHydrophilic
78-112EVYVAQPIKRKQRKFEKKRKVRRKKGRDEIRDGEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-104KRKQRKFEKKRKVRRKKGR
142-149KKKGRSKS
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSRQKDYEELFGDGSAELSDVADYLSDFEDASDNERSVTTQKLKKKSHRERSSSPVPSPSPYRHDDRSTPEGDRDEDEVYVAQPIKRKQRKFEKKRKVRRKKGRDEIRDGEEDNVREGSRELAPLMESKMIVEKLFDELMPKKKGRSKSKGIDLEKEHDVTADRLYQRMMKLADDDVNNCQNRKPASRKLDNLESIVRELSKTYMVDALLDNNILDAIRYWLEPLPDRSLPSITLQEQLLNVLDKYPINIEQLLHSKIGRIVFFYQESPRSTEHVKKMATNLVNKWGQPILGISVNYKDRQLPRVEYDPEQMRPPIHHHTMELLTKSQHFSAVEERQPLQSTSSLVRARIPQPAAFDYDVLPQSRIQMARSKKTDDPYRHLKQTMARMRRTRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.12
3 0.09
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.06
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.1
17 0.1
18 0.14
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.17
24 0.17
25 0.24
26 0.29
27 0.34
28 0.43
29 0.53
30 0.62
31 0.71
32 0.8
33 0.84
34 0.86
35 0.89
36 0.89
37 0.86
38 0.86
39 0.86
40 0.81
41 0.73
42 0.7
43 0.61
44 0.57
45 0.55
46 0.52
47 0.47
48 0.45
49 0.48
50 0.47
51 0.5
52 0.52
53 0.53
54 0.54
55 0.52
56 0.5
57 0.47
58 0.44
59 0.4
60 0.37
61 0.31
62 0.26
63 0.22
64 0.2
65 0.16
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.18
71 0.24
72 0.35
73 0.44
74 0.49
75 0.56
76 0.65
77 0.75
78 0.81
79 0.87
80 0.87
81 0.89
82 0.95
83 0.97
84 0.96
85 0.96
86 0.96
87 0.96
88 0.96
89 0.96
90 0.95
91 0.93
92 0.91
93 0.86
94 0.8
95 0.71
96 0.61
97 0.53
98 0.45
99 0.36
100 0.29
101 0.24
102 0.18
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.12
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.16
126 0.23
127 0.28
128 0.28
129 0.31
130 0.37
131 0.47
132 0.54
133 0.58
134 0.6
135 0.63
136 0.73
137 0.77
138 0.74
139 0.71
140 0.64
141 0.6
142 0.52
143 0.44
144 0.34
145 0.26
146 0.24
147 0.17
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.14
153 0.16
154 0.16
155 0.19
156 0.18
157 0.13
158 0.15
159 0.16
160 0.18
161 0.16
162 0.17
163 0.17
164 0.22
165 0.22
166 0.21
167 0.21
168 0.21
169 0.23
170 0.29
171 0.33
172 0.36
173 0.44
174 0.5
175 0.53
176 0.55
177 0.58
178 0.53
179 0.48
180 0.41
181 0.32
182 0.26
183 0.22
184 0.17
185 0.11
186 0.1
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.14
212 0.17
213 0.18
214 0.19
215 0.19
216 0.19
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.15
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.12
227 0.1
228 0.09
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.14
239 0.18
240 0.19
241 0.18
242 0.17
243 0.16
244 0.18
245 0.2
246 0.17
247 0.15
248 0.16
249 0.17
250 0.19
251 0.2
252 0.21
253 0.22
254 0.24
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.27
259 0.33
260 0.35
261 0.38
262 0.38
263 0.37
264 0.39
265 0.43
266 0.43
267 0.41
268 0.37
269 0.38
270 0.39
271 0.37
272 0.36
273 0.29
274 0.24
275 0.2
276 0.19
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.13
281 0.17
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.24
286 0.24
287 0.3
288 0.34
289 0.34
290 0.36
291 0.43
292 0.46
293 0.42
294 0.46
295 0.46
296 0.43
297 0.41
298 0.37
299 0.31
300 0.3
301 0.33
302 0.34
303 0.34
304 0.33
305 0.31
306 0.34
307 0.38
308 0.39
309 0.36
310 0.3
311 0.27
312 0.28
313 0.29
314 0.25
315 0.23
316 0.2
317 0.2
318 0.26
319 0.32
320 0.34
321 0.35
322 0.36
323 0.36
324 0.38
325 0.36
326 0.3
327 0.24
328 0.23
329 0.22
330 0.29
331 0.28
332 0.27
333 0.3
334 0.34
335 0.34
336 0.39
337 0.4
338 0.34
339 0.37
340 0.38
341 0.39
342 0.34
343 0.32
344 0.25
345 0.28
346 0.29
347 0.26
348 0.24
349 0.2
350 0.23
351 0.27
352 0.27
353 0.24
354 0.29
355 0.36
356 0.45
357 0.49
358 0.52
359 0.52
360 0.6
361 0.68
362 0.68
363 0.68
364 0.68
365 0.72
366 0.73
367 0.7
368 0.65
369 0.62
370 0.65
371 0.67
372 0.66
373 0.66