Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VDF5

Protein Details
Accession A0A397VDF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-322INTSHRKFADKDKHKRNRRIPFSAIQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-313KHKRN
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019510  AKAP7-like_phosphoesterase  
IPR009210  ASCC1  
IPR009097  Cyclic_Pdiesterase  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10469  AKAP7_NLS  
PF00013  KH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
Amino Acid Sequences METSGHSTTSTHRCMRGITLIHVGKRIYRVPTASIPKNTITNHTMLARQFSAIEDSEAKEETRGEAVDDKNKILSDTSPEITINLTYPQHLQKFIFGKNGSTLYQIQRDSKTTITINRGDDNVVIKGTKENAEKAKKRIENVVKWGIDKLQPTHFISLPLTDLLLQQKVAGFQSAIASLDIPNIDKTIFIRPNSLHLTMGVLNLHMKEDIEGAVQLLKSLSADIYDLVGTRSVVAKLLGIAIMENNPEKANVLYAKVEESEERDVIIKIAEFLISKFTEAGYMKKENRPFKLHATLINTSHRKFADKDKHKRNRRIPFSAIQILNKYADFEYGASRIEKIHISKIGAYDESGMHRSEGHIILP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.44
3 0.44
4 0.39
5 0.36
6 0.4
7 0.42
8 0.42
9 0.43
10 0.4
11 0.35
12 0.37
13 0.38
14 0.33
15 0.33
16 0.34
17 0.36
18 0.44
19 0.49
20 0.52
21 0.51
22 0.51
23 0.48
24 0.52
25 0.48
26 0.45
27 0.4
28 0.34
29 0.33
30 0.31
31 0.33
32 0.28
33 0.32
34 0.26
35 0.23
36 0.22
37 0.2
38 0.21
39 0.17
40 0.19
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.18
45 0.17
46 0.15
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.18
53 0.21
54 0.27
55 0.28
56 0.27
57 0.27
58 0.27
59 0.26
60 0.21
61 0.19
62 0.19
63 0.22
64 0.22
65 0.21
66 0.21
67 0.21
68 0.2
69 0.19
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.16
75 0.21
76 0.23
77 0.25
78 0.24
79 0.27
80 0.31
81 0.32
82 0.36
83 0.31
84 0.3
85 0.31
86 0.32
87 0.27
88 0.25
89 0.26
90 0.23
91 0.28
92 0.29
93 0.29
94 0.3
95 0.32
96 0.31
97 0.28
98 0.28
99 0.25
100 0.28
101 0.3
102 0.32
103 0.32
104 0.31
105 0.3
106 0.27
107 0.26
108 0.23
109 0.19
110 0.15
111 0.12
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.16
116 0.16
117 0.19
118 0.27
119 0.37
120 0.41
121 0.44
122 0.52
123 0.5
124 0.5
125 0.55
126 0.55
127 0.51
128 0.54
129 0.57
130 0.48
131 0.46
132 0.45
133 0.38
134 0.32
135 0.28
136 0.24
137 0.2
138 0.23
139 0.24
140 0.26
141 0.24
142 0.23
143 0.22
144 0.19
145 0.16
146 0.12
147 0.11
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.07
174 0.14
175 0.17
176 0.17
177 0.2
178 0.2
179 0.25
180 0.28
181 0.28
182 0.2
183 0.17
184 0.19
185 0.16
186 0.17
187 0.12
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.12
246 0.14
247 0.16
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.14
266 0.15
267 0.18
268 0.19
269 0.26
270 0.31
271 0.37
272 0.45
273 0.48
274 0.54
275 0.57
276 0.56
277 0.56
278 0.6
279 0.56
280 0.54
281 0.53
282 0.51
283 0.48
284 0.53
285 0.5
286 0.42
287 0.45
288 0.41
289 0.37
290 0.36
291 0.43
292 0.45
293 0.51
294 0.61
295 0.67
296 0.77
297 0.84
298 0.92
299 0.92
300 0.92
301 0.9
302 0.88
303 0.83
304 0.79
305 0.76
306 0.75
307 0.67
308 0.6
309 0.53
310 0.47
311 0.42
312 0.35
313 0.3
314 0.21
315 0.19
316 0.17
317 0.15
318 0.16
319 0.16
320 0.18
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.17
325 0.22
326 0.21
327 0.27
328 0.29
329 0.31
330 0.34
331 0.36
332 0.37
333 0.32
334 0.3
335 0.25
336 0.23
337 0.25
338 0.23
339 0.21
340 0.18
341 0.18
342 0.18
343 0.21