Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VCH6

Protein Details
Accession A0A397VCH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-87DRFFYKKAKSSDKPARPPNKFFIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MPQIKQQKDNQDRQSKSPGNGRVLSNGDVVQAHLDARGDRLKVVVKLNDGVQIDFPVPTSKEVRDRFFYKKAKSSDKPARPPNKFFIFRTMFQGAVDTFKLQVPIVSGIASEVWRKSSVEVKEVFTRLSNIAKTEHGEINPGYVYKPHRKQSQDTANKFDIVSHDTVDDDSTGSSPSPCPSTPSSPCTPTLPLWASTFPTKNPESLPLSNFSMQQIPNFNVTPFTLNDLSQNSDSYPATFIQPQQLTYLSFGDTTIQQFIPQPMLQPRSNSSIDQIPFISPPDSFQFYQFSTSNSSTYSLTSDGLVDQNCPFKLQPSDYNNEGDSVMRSVPLPYSTGYFNPMHHEMTHINDDPITQSSQFPQFPQFPQQNFTDIVPGSSIIPCRQHTNEVVSRPQEQIQLELPTINFSQNIPSTISQTSQYNNTLLHGGLFPDAMDDDEIVIKNLKEEDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.74
3 0.69
4 0.68
5 0.65
6 0.62
7 0.63
8 0.59
9 0.54
10 0.52
11 0.48
12 0.41
13 0.34
14 0.28
15 0.23
16 0.22
17 0.17
18 0.14
19 0.12
20 0.11
21 0.12
22 0.1
23 0.14
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.2
28 0.24
29 0.27
30 0.33
31 0.33
32 0.31
33 0.33
34 0.33
35 0.36
36 0.32
37 0.29
38 0.23
39 0.21
40 0.19
41 0.17
42 0.17
43 0.15
44 0.15
45 0.18
46 0.2
47 0.23
48 0.32
49 0.37
50 0.41
51 0.44
52 0.48
53 0.52
54 0.58
55 0.63
56 0.61
57 0.64
58 0.66
59 0.69
60 0.69
61 0.73
62 0.74
63 0.76
64 0.78
65 0.8
66 0.83
67 0.8
68 0.81
69 0.8
70 0.79
71 0.73
72 0.65
73 0.65
74 0.6
75 0.54
76 0.55
77 0.48
78 0.39
79 0.33
80 0.34
81 0.24
82 0.21
83 0.2
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.15
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.09
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.2
105 0.21
106 0.25
107 0.27
108 0.29
109 0.33
110 0.34
111 0.33
112 0.26
113 0.27
114 0.23
115 0.24
116 0.22
117 0.18
118 0.19
119 0.19
120 0.21
121 0.22
122 0.23
123 0.19
124 0.21
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.17
129 0.13
130 0.13
131 0.19
132 0.27
133 0.34
134 0.4
135 0.47
136 0.51
137 0.56
138 0.63
139 0.68
140 0.69
141 0.65
142 0.65
143 0.58
144 0.55
145 0.49
146 0.4
147 0.31
148 0.24
149 0.21
150 0.15
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.1
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.11
165 0.1
166 0.14
167 0.17
168 0.24
169 0.27
170 0.32
171 0.35
172 0.34
173 0.35
174 0.34
175 0.33
176 0.27
177 0.28
178 0.24
179 0.23
180 0.22
181 0.21
182 0.2
183 0.21
184 0.22
185 0.17
186 0.2
187 0.19
188 0.19
189 0.19
190 0.22
191 0.24
192 0.25
193 0.26
194 0.24
195 0.26
196 0.26
197 0.25
198 0.21
199 0.19
200 0.17
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.17
205 0.17
206 0.16
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.11
211 0.14
212 0.12
213 0.12
214 0.14
215 0.14
216 0.15
217 0.14
218 0.14
219 0.1
220 0.12
221 0.12
222 0.1
223 0.11
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.17
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.12
249 0.14
250 0.17
251 0.22
252 0.23
253 0.24
254 0.25
255 0.28
256 0.29
257 0.27
258 0.24
259 0.25
260 0.25
261 0.24
262 0.22
263 0.17
264 0.16
265 0.17
266 0.16
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.17
271 0.16
272 0.17
273 0.19
274 0.19
275 0.23
276 0.21
277 0.19
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.19
282 0.2
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.15
296 0.15
297 0.16
298 0.15
299 0.17
300 0.2
301 0.23
302 0.3
303 0.32
304 0.37
305 0.37
306 0.39
307 0.36
308 0.33
309 0.29
310 0.21
311 0.16
312 0.13
313 0.11
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.22
328 0.24
329 0.23
330 0.22
331 0.25
332 0.21
333 0.25
334 0.3
335 0.25
336 0.23
337 0.21
338 0.22
339 0.2
340 0.21
341 0.18
342 0.13
343 0.13
344 0.16
345 0.22
346 0.23
347 0.23
348 0.27
349 0.29
350 0.31
351 0.39
352 0.43
353 0.39
354 0.41
355 0.41
356 0.39
357 0.36
358 0.33
359 0.3
360 0.22
361 0.21
362 0.18
363 0.17
364 0.15
365 0.15
366 0.17
367 0.15
368 0.2
369 0.21
370 0.27
371 0.29
372 0.32
373 0.33
374 0.4
375 0.43
376 0.43
377 0.48
378 0.45
379 0.45
380 0.43
381 0.42
382 0.39
383 0.33
384 0.32
385 0.3
386 0.29
387 0.27
388 0.26
389 0.23
390 0.22
391 0.22
392 0.19
393 0.16
394 0.13
395 0.19
396 0.19
397 0.21
398 0.22
399 0.22
400 0.25
401 0.25
402 0.27
403 0.23
404 0.24
405 0.25
406 0.26
407 0.28
408 0.26
409 0.25
410 0.25
411 0.24
412 0.21
413 0.2
414 0.15
415 0.14
416 0.13
417 0.12
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.09
425 0.12
426 0.13
427 0.13
428 0.15
429 0.14
430 0.16