Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VBG6

Protein Details
Accession A0A397VBG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-96KTEYFKAKYIKRKESKSSRVFTHydrophilic
260-281KTEYFKAKYIKRKESKSSRVFTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MNDIIGKPFGHSYEIYDSDKIKVIRNIAFYEVETIDDPFKQKLSYQDIEQLKKDRMEGQDIIKKVIESHLLFDRKTEYFKAKYIKRKESKSSRVFTPARPMLYSVWEYFFAKNPSKIRYTLSNVNVIKCKPYAKLLVVDDTQGLLITGVMERLGANYEKVQKARKILWKGGFDGTVSLGKFGTFYMNDIIGKPFGHSYEIYDSDKIKVIRNIAFYEVETIDDPFKQKLSYQDIEQLKKDRMEGQDIIKKVIESHLLFDRKTEYFKAKYIKRKESKSSRVFTPARPMLYSVWEYFFAKNPSKIRYTLSNVNVIKCKPYAKLLVVDDTQGLLITGVMERLGGSIKLCNFIGNEQST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.32
4 0.32
5 0.31
6 0.37
7 0.33
8 0.32
9 0.32
10 0.35
11 0.37
12 0.4
13 0.4
14 0.37
15 0.37
16 0.32
17 0.31
18 0.26
19 0.23
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.19
25 0.16
26 0.17
27 0.16
28 0.18
29 0.24
30 0.31
31 0.33
32 0.33
33 0.41
34 0.47
35 0.5
36 0.52
37 0.49
38 0.45
39 0.43
40 0.43
41 0.4
42 0.36
43 0.38
44 0.37
45 0.4
46 0.42
47 0.41
48 0.42
49 0.36
50 0.33
51 0.27
52 0.27
53 0.25
54 0.2
55 0.23
56 0.28
57 0.3
58 0.3
59 0.3
60 0.31
61 0.27
62 0.29
63 0.3
64 0.28
65 0.28
66 0.34
67 0.42
68 0.45
69 0.54
70 0.6
71 0.67
72 0.69
73 0.74
74 0.79
75 0.81
76 0.84
77 0.83
78 0.78
79 0.71
80 0.72
81 0.67
82 0.59
83 0.59
84 0.53
85 0.46
86 0.41
87 0.39
88 0.31
89 0.32
90 0.32
91 0.22
92 0.2
93 0.2
94 0.21
95 0.2
96 0.23
97 0.24
98 0.25
99 0.29
100 0.31
101 0.33
102 0.35
103 0.35
104 0.34
105 0.35
106 0.38
107 0.41
108 0.4
109 0.44
110 0.43
111 0.44
112 0.44
113 0.38
114 0.34
115 0.27
116 0.27
117 0.2
118 0.22
119 0.24
120 0.22
121 0.27
122 0.26
123 0.28
124 0.26
125 0.25
126 0.21
127 0.17
128 0.15
129 0.09
130 0.08
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.09
144 0.14
145 0.16
146 0.19
147 0.23
148 0.24
149 0.27
150 0.33
151 0.38
152 0.39
153 0.43
154 0.48
155 0.45
156 0.45
157 0.43
158 0.37
159 0.29
160 0.24
161 0.18
162 0.14
163 0.12
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.15
183 0.15
184 0.19
185 0.26
186 0.31
187 0.32
188 0.32
189 0.32
190 0.31
191 0.37
192 0.33
193 0.32
194 0.32
195 0.35
196 0.37
197 0.4
198 0.4
199 0.37
200 0.37
201 0.32
202 0.31
203 0.26
204 0.23
205 0.19
206 0.18
207 0.17
208 0.17
209 0.19
210 0.16
211 0.17
212 0.16
213 0.18
214 0.24
215 0.31
216 0.33
217 0.33
218 0.41
219 0.47
220 0.5
221 0.52
222 0.49
223 0.45
224 0.43
225 0.43
226 0.4
227 0.36
228 0.38
229 0.37
230 0.4
231 0.42
232 0.41
233 0.42
234 0.36
235 0.33
236 0.27
237 0.27
238 0.25
239 0.2
240 0.23
241 0.28
242 0.3
243 0.3
244 0.3
245 0.31
246 0.27
247 0.29
248 0.3
249 0.28
250 0.28
251 0.34
252 0.42
253 0.45
254 0.54
255 0.6
256 0.67
257 0.69
258 0.74
259 0.79
260 0.81
261 0.84
262 0.83
263 0.78
264 0.71
265 0.72
266 0.67
267 0.59
268 0.59
269 0.53
270 0.46
271 0.41
272 0.39
273 0.31
274 0.32
275 0.32
276 0.22
277 0.2
278 0.2
279 0.21
280 0.2
281 0.23
282 0.24
283 0.25
284 0.29
285 0.31
286 0.33
287 0.35
288 0.35
289 0.34
290 0.35
291 0.38
292 0.41
293 0.4
294 0.44
295 0.43
296 0.44
297 0.44
298 0.38
299 0.34
300 0.27
301 0.27
302 0.2
303 0.22
304 0.24
305 0.22
306 0.27
307 0.26
308 0.28
309 0.26
310 0.25
311 0.21
312 0.17
313 0.15
314 0.09
315 0.08
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.04
324 0.05
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.14
329 0.15
330 0.19
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.22