Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VLW9

Protein Details
Accession A0A397VLW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-366ILKNLKELKKAEKRKQQEEKRKSLIVKKQEKKSEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
334-363KNLKELKKAEKRKQQEEKRKSLIVKKQEKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038175  CBM21_dom_sf  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MDNGVSVESIRVVSEIDDLVNLEGKIVMHKVTPVGKKVSVDYTTDLWETYYNILAKRSCSLSSEKDLYLFELSTFKKPNAPLYLEFAVKCDFEGSVFWTNGYQFIYDEDSQKEFFFNEFQPSSPSSPIDNEKECILCIEEVNSNEFVKVTDQCNHENDICKKCIRKHVKNEILDNELLNKGNLDILCPDDDCCAVLQEQDVKKFVTEKMFIRYEQLKLNLTLSLIPNFYRCTNQDCDSGQIHEEGDTSPIMTCINCKQKSCVVHNLLIDNTQLNCPECEPVSPSTPSNEAEGTVVKTKRSSFWKRLIPDKKNDELSPTLRKIEIEKENTKLILKNLKELKKAEKRKQQEEKRKSLIVKKQEKKSEDYIRRLKQCPACKSSIQKSGGSDKMICGNPRCRHEFCWMIFKRFNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.09
5 0.1
6 0.11
7 0.13
8 0.12
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.12
16 0.13
17 0.18
18 0.24
19 0.3
20 0.32
21 0.36
22 0.38
23 0.39
24 0.41
25 0.43
26 0.38
27 0.35
28 0.34
29 0.3
30 0.31
31 0.29
32 0.26
33 0.19
34 0.18
35 0.16
36 0.15
37 0.18
38 0.17
39 0.18
40 0.22
41 0.23
42 0.24
43 0.26
44 0.27
45 0.24
46 0.24
47 0.29
48 0.31
49 0.36
50 0.39
51 0.35
52 0.34
53 0.34
54 0.33
55 0.29
56 0.23
57 0.17
58 0.19
59 0.21
60 0.25
61 0.27
62 0.26
63 0.29
64 0.31
65 0.37
66 0.37
67 0.4
68 0.36
69 0.4
70 0.42
71 0.39
72 0.37
73 0.31
74 0.27
75 0.22
76 0.2
77 0.14
78 0.11
79 0.09
80 0.1
81 0.13
82 0.16
83 0.16
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.18
88 0.18
89 0.14
90 0.09
91 0.1
92 0.16
93 0.16
94 0.18
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.15
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.21
108 0.23
109 0.25
110 0.23
111 0.23
112 0.18
113 0.21
114 0.26
115 0.28
116 0.27
117 0.25
118 0.25
119 0.25
120 0.23
121 0.2
122 0.16
123 0.12
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.14
137 0.18
138 0.21
139 0.24
140 0.26
141 0.28
142 0.28
143 0.33
144 0.36
145 0.35
146 0.35
147 0.36
148 0.39
149 0.41
150 0.49
151 0.52
152 0.56
153 0.62
154 0.7
155 0.76
156 0.76
157 0.76
158 0.68
159 0.61
160 0.51
161 0.41
162 0.32
163 0.24
164 0.2
165 0.14
166 0.11
167 0.08
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.12
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.17
191 0.19
192 0.16
193 0.18
194 0.18
195 0.22
196 0.24
197 0.24
198 0.26
199 0.26
200 0.24
201 0.24
202 0.25
203 0.21
204 0.2
205 0.2
206 0.17
207 0.15
208 0.15
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.17
219 0.21
220 0.23
221 0.25
222 0.24
223 0.27
224 0.26
225 0.25
226 0.21
227 0.18
228 0.15
229 0.12
230 0.12
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.13
241 0.23
242 0.25
243 0.26
244 0.29
245 0.34
246 0.41
247 0.44
248 0.47
249 0.41
250 0.43
251 0.43
252 0.42
253 0.37
254 0.32
255 0.27
256 0.18
257 0.15
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.12
262 0.11
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.14
267 0.15
268 0.18
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.22
273 0.22
274 0.21
275 0.18
276 0.15
277 0.14
278 0.15
279 0.15
280 0.19
281 0.2
282 0.18
283 0.2
284 0.21
285 0.26
286 0.35
287 0.41
288 0.43
289 0.51
290 0.58
291 0.6
292 0.7
293 0.74
294 0.72
295 0.72
296 0.72
297 0.7
298 0.66
299 0.62
300 0.57
301 0.52
302 0.5
303 0.49
304 0.43
305 0.39
306 0.35
307 0.35
308 0.33
309 0.36
310 0.4
311 0.39
312 0.41
313 0.41
314 0.43
315 0.44
316 0.43
317 0.37
318 0.34
319 0.35
320 0.32
321 0.37
322 0.44
323 0.49
324 0.52
325 0.53
326 0.58
327 0.6
328 0.7
329 0.72
330 0.73
331 0.75
332 0.81
333 0.88
334 0.89
335 0.89
336 0.89
337 0.89
338 0.85
339 0.83
340 0.79
341 0.78
342 0.76
343 0.76
344 0.76
345 0.76
346 0.78
347 0.8
348 0.77
349 0.74
350 0.75
351 0.75
352 0.73
353 0.74
354 0.75
355 0.75
356 0.8
357 0.77
358 0.76
359 0.74
360 0.74
361 0.73
362 0.7
363 0.67
364 0.65
365 0.71
366 0.71
367 0.71
368 0.65
369 0.59
370 0.57
371 0.6
372 0.58
373 0.52
374 0.45
375 0.38
376 0.41
377 0.43
378 0.43
379 0.41
380 0.47
381 0.5
382 0.57
383 0.62
384 0.58
385 0.58
386 0.62
387 0.63
388 0.57
389 0.61
390 0.58
391 0.59