Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VDA0

Protein Details
Accession A0A397VDA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
251-301SNWGYRSRSKYSQQKRKRYSSPSSDSERGEFYKKGKKRDKRSYSFRGKESFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-291KKGKKRDKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF18953  SAP_new25  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50800  SAP  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSVVSWTKLTLSELKDLCVACNLSDKGSKEELSERLHAYFEKRKGKQPSTPSGKTVGETDGGNEKPKVDIGVDNGDDFDVEWFVDLEGDDIDAESQEADGKVRDEFASRFPGKGKVESVPVDIFLSALGNLEKKLDRSFSALHNEIEEGEVLDAAWPKVRLSKPRDQHEYDFLTKIGRRLDRAIRMLSSSLRKDFVDIRDEVEARVVTLRLADNKGWSAALQIVGSNDKMMEKYKDRIPLAGQAETMFRTSNWGYRSRSKYSQQKRKRYSSPSSDSERGEFYKKGKKRDKRSYSFRGKESFNFAERRGAITCFNCGGVGHIASGCPSSGSKAVSKSRNED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.33
4 0.3
5 0.29
6 0.26
7 0.19
8 0.26
9 0.26
10 0.25
11 0.3
12 0.32
13 0.32
14 0.35
15 0.35
16 0.3
17 0.35
18 0.37
19 0.37
20 0.39
21 0.35
22 0.32
23 0.33
24 0.32
25 0.33
26 0.36
27 0.4
28 0.46
29 0.48
30 0.56
31 0.64
32 0.7
33 0.71
34 0.71
35 0.74
36 0.73
37 0.73
38 0.66
39 0.62
40 0.56
41 0.49
42 0.42
43 0.32
44 0.25
45 0.21
46 0.21
47 0.22
48 0.21
49 0.23
50 0.22
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.19
55 0.14
56 0.15
57 0.16
58 0.22
59 0.22
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.17
64 0.15
65 0.12
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.23
95 0.22
96 0.23
97 0.24
98 0.3
99 0.3
100 0.31
101 0.31
102 0.24
103 0.27
104 0.27
105 0.29
106 0.22
107 0.2
108 0.18
109 0.15
110 0.13
111 0.09
112 0.08
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.15
125 0.17
126 0.19
127 0.25
128 0.25
129 0.24
130 0.23
131 0.22
132 0.19
133 0.17
134 0.13
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.13
146 0.16
147 0.23
148 0.29
149 0.38
150 0.44
151 0.52
152 0.58
153 0.56
154 0.56
155 0.54
156 0.52
157 0.46
158 0.39
159 0.31
160 0.27
161 0.24
162 0.23
163 0.23
164 0.19
165 0.19
166 0.23
167 0.28
168 0.31
169 0.33
170 0.32
171 0.27
172 0.27
173 0.26
174 0.25
175 0.24
176 0.21
177 0.19
178 0.19
179 0.19
180 0.2
181 0.23
182 0.23
183 0.22
184 0.2
185 0.21
186 0.22
187 0.22
188 0.21
189 0.18
190 0.15
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.1
206 0.09
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.11
218 0.15
219 0.17
220 0.22
221 0.26
222 0.34
223 0.34
224 0.35
225 0.34
226 0.37
227 0.37
228 0.33
229 0.29
230 0.22
231 0.23
232 0.21
233 0.2
234 0.13
235 0.09
236 0.13
237 0.14
238 0.17
239 0.19
240 0.25
241 0.29
242 0.38
243 0.44
244 0.46
245 0.52
246 0.57
247 0.65
248 0.7
249 0.76
250 0.77
251 0.82
252 0.85
253 0.87
254 0.88
255 0.86
256 0.84
257 0.84
258 0.81
259 0.76
260 0.75
261 0.7
262 0.63
263 0.56
264 0.5
265 0.43
266 0.39
267 0.35
268 0.33
269 0.39
270 0.42
271 0.51
272 0.58
273 0.65
274 0.72
275 0.81
276 0.86
277 0.86
278 0.9
279 0.91
280 0.91
281 0.89
282 0.84
283 0.78
284 0.72
285 0.66
286 0.64
287 0.59
288 0.53
289 0.49
290 0.44
291 0.46
292 0.43
293 0.42
294 0.36
295 0.32
296 0.32
297 0.3
298 0.32
299 0.25
300 0.25
301 0.22
302 0.19
303 0.21
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.12
312 0.1
313 0.1
314 0.12
315 0.15
316 0.18
317 0.21
318 0.28
319 0.37
320 0.43