Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R7A7

Protein Details
Accession C4R7A7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
547-570PISTRGVHSKPPKRQQYNNSIVFVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043154  Sec-1-like_dom1  
IPR043127  Sec-1-like_dom3a  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG ppa:PAS_chr4_0251  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00995  Sec1  
Amino Acid Sequences MLHLNEPIVDNGSDIQAELTWKVLILDSRSTAIVSSVLRVNDLLSSGITMHSNIRSKRAALPDVPVIYFVEPNAENINFIIDDLERDQYAHFYINFTSSLNRDLLEEFAKKVATIGKSYKIKQVYDQYLDYIVTEPNLFSLDLVNIYSQLNNPNSLEDEINKVADKISNGIFAAILTMNGIPTIRCCRGGPAELIASKLDQKLRDHVINTKSSASFTNSKLVLILLDRNIDLASMFAHSWIYQCMVSDVFELKRNTIKIPSQKPNESTKEYDIDPKDFFWAANNSLPFPDAVENVENELSRYKADAAELTRKTGVSSLQDIDPNAITDTTDIQLAVKSLPELAFRKSILDMHMKVLASLLQELESKSLDSYFEIEQNYKDPKNQKQFISILNNGNEHTLNDKLRTYIMLYLLTDLPGSFVEECEEYFKKNSAELGSLSYIKRAKEVIKLSNYELSMSIDASHSTTSGLVNEAQKSALFQGLSSKLYGLTDGGSRLTEGVGSLITGLKNLLPDKKQLPITNIVESIMEPSLATQESIKLTDDYLYFDPISTRGVHSKPPKRQQYNNSIVFVVGGGNYLEYQNLQEWVTKTNTSNVNGTKSVIYGSTSIVTANEFLKECSLLGAEAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.09
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.12
11 0.14
12 0.16
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.17
20 0.16
21 0.13
22 0.15
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.15
29 0.15
30 0.13
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.13
38 0.19
39 0.26
40 0.27
41 0.32
42 0.34
43 0.36
44 0.42
45 0.47
46 0.46
47 0.41
48 0.44
49 0.45
50 0.44
51 0.42
52 0.35
53 0.29
54 0.25
55 0.23
56 0.18
57 0.16
58 0.14
59 0.16
60 0.19
61 0.17
62 0.16
63 0.16
64 0.18
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.08
69 0.1
70 0.12
71 0.14
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.17
92 0.19
93 0.19
94 0.17
95 0.18
96 0.18
97 0.17
98 0.17
99 0.2
100 0.18
101 0.22
102 0.25
103 0.32
104 0.38
105 0.4
106 0.46
107 0.46
108 0.44
109 0.46
110 0.52
111 0.5
112 0.49
113 0.48
114 0.42
115 0.38
116 0.37
117 0.3
118 0.22
119 0.15
120 0.11
121 0.11
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.15
137 0.16
138 0.17
139 0.17
140 0.18
141 0.19
142 0.2
143 0.2
144 0.15
145 0.19
146 0.18
147 0.19
148 0.18
149 0.16
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.1
160 0.11
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.04
169 0.07
170 0.14
171 0.14
172 0.16
173 0.17
174 0.21
175 0.25
176 0.28
177 0.26
178 0.23
179 0.25
180 0.24
181 0.24
182 0.21
183 0.17
184 0.17
185 0.18
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.24
190 0.29
191 0.31
192 0.31
193 0.35
194 0.37
195 0.37
196 0.36
197 0.34
198 0.29
199 0.27
200 0.27
201 0.25
202 0.24
203 0.23
204 0.27
205 0.24
206 0.24
207 0.23
208 0.21
209 0.17
210 0.14
211 0.14
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.2
241 0.21
242 0.21
243 0.23
244 0.28
245 0.31
246 0.39
247 0.47
248 0.49
249 0.52
250 0.55
251 0.58
252 0.58
253 0.54
254 0.48
255 0.42
256 0.38
257 0.35
258 0.38
259 0.32
260 0.3
261 0.26
262 0.23
263 0.22
264 0.2
265 0.19
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.17
270 0.17
271 0.15
272 0.15
273 0.16
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.12
294 0.2
295 0.2
296 0.21
297 0.2
298 0.2
299 0.2
300 0.18
301 0.17
302 0.11
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.11
311 0.09
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.09
328 0.11
329 0.12
330 0.14
331 0.14
332 0.15
333 0.15
334 0.16
335 0.15
336 0.19
337 0.18
338 0.18
339 0.21
340 0.19
341 0.19
342 0.17
343 0.16
344 0.11
345 0.1
346 0.09
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.09
358 0.09
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.13
363 0.16
364 0.2
365 0.19
366 0.23
367 0.26
368 0.34
369 0.44
370 0.49
371 0.47
372 0.48
373 0.5
374 0.52
375 0.52
376 0.48
377 0.43
378 0.39
379 0.38
380 0.33
381 0.31
382 0.25
383 0.18
384 0.16
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.16
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.15
393 0.14
394 0.14
395 0.13
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.13
400 0.12
401 0.09
402 0.08
403 0.07
404 0.08
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.08
409 0.08
410 0.12
411 0.13
412 0.13
413 0.15
414 0.17
415 0.17
416 0.17
417 0.2
418 0.17
419 0.18
420 0.17
421 0.19
422 0.18
423 0.2
424 0.19
425 0.21
426 0.22
427 0.2
428 0.21
429 0.21
430 0.21
431 0.26
432 0.32
433 0.35
434 0.38
435 0.4
436 0.41
437 0.42
438 0.4
439 0.33
440 0.28
441 0.23
442 0.18
443 0.15
444 0.14
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.09
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.09
455 0.11
456 0.13
457 0.15
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.14
462 0.14
463 0.14
464 0.11
465 0.1
466 0.16
467 0.18
468 0.19
469 0.18
470 0.17
471 0.15
472 0.16
473 0.16
474 0.1
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.11
495 0.14
496 0.19
497 0.19
498 0.25
499 0.27
500 0.33
501 0.38
502 0.38
503 0.4
504 0.43
505 0.45
506 0.43
507 0.41
508 0.35
509 0.29
510 0.26
511 0.24
512 0.16
513 0.12
514 0.08
515 0.08
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.08
520 0.11
521 0.13
522 0.15
523 0.16
524 0.14
525 0.14
526 0.17
527 0.17
528 0.19
529 0.18
530 0.2
531 0.18
532 0.18
533 0.18
534 0.16
535 0.18
536 0.15
537 0.17
538 0.2
539 0.22
540 0.31
541 0.4
542 0.49
543 0.58
544 0.67
545 0.75
546 0.77
547 0.85
548 0.86
549 0.87
550 0.87
551 0.83
552 0.75
553 0.64
554 0.55
555 0.45
556 0.35
557 0.25
558 0.15
559 0.09
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.07
566 0.09
567 0.1
568 0.12
569 0.12
570 0.17
571 0.18
572 0.21
573 0.25
574 0.26
575 0.26
576 0.31
577 0.37
578 0.35
579 0.41
580 0.41
581 0.43
582 0.41
583 0.41
584 0.35
585 0.29
586 0.28
587 0.21
588 0.19
589 0.14
590 0.15
591 0.15
592 0.14
593 0.14
594 0.13
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.15
599 0.14
600 0.15
601 0.17
602 0.17
603 0.16
604 0.16
605 0.15