Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VHQ0

Protein Details
Accession A0A397VHQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-255KLTNRPCHNNQSKSKKRGRPRNSVSNNSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-245KKRGR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
IPR046360  T-box_DNA-bd  
IPR036960  T-box_sf  
IPR001699  TF_T-box  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00907  T-box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50252  TBOX_3  
Amino Acid Sequences MNIHRLLDNSEEVYSSVVFNKEFDEDNNQEYNNQEKSTENNKVGTDFIFDGNLSTFDHFTSHDNQNSSGHTSSPSLPSFIRPYEFSPLSTPTTNKDKNIYYEPREKLLLDCADLWSQFYRVENEMIITKSGRCMFPLLKYKPLNLDPSAKYSFIVDFIQVSPTRFRFKKGSWVSIGIDKRKFSLNNLNNRNGRIKTGMVGGRPFTHPDSPQSGAYWMDCGVNFPKIKLTNRPCHNNQSKSKKRGRPRNSVSNNSSSLPDGHFCLTSFHKYQPRVKMIKHSTDINDHDQEITTAFQETTFIAVTHYQNDAVNFLKKNYNPHAKGFKDMESKDLNYDQLYCSDDTETSDDESQNEIDSDFDFYHNDYRAKFTKLSSKDRNQGHVISENTIPGHETHNWLDLNINSNLKNSKYRPKLDKSISMPSFKFFDPLNKSLITPISPYKIDKQSTTIGFPWITKHTNNEYDRDINMTQRQFKLNAFQPKDGSKVGSKDESDDELLKQHASYQNTSQWTFPITPPTPISPNSTPINPYLSRLERAENENMKLREFIRERYGIEAEKEADAVVALGRNSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.17
8 0.18
9 0.18
10 0.2
11 0.25
12 0.26
13 0.3
14 0.33
15 0.31
16 0.3
17 0.31
18 0.34
19 0.3
20 0.28
21 0.25
22 0.23
23 0.3
24 0.37
25 0.44
26 0.4
27 0.4
28 0.4
29 0.4
30 0.4
31 0.34
32 0.29
33 0.22
34 0.2
35 0.17
36 0.16
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.13
45 0.13
46 0.15
47 0.21
48 0.27
49 0.3
50 0.31
51 0.33
52 0.34
53 0.36
54 0.37
55 0.31
56 0.25
57 0.22
58 0.23
59 0.25
60 0.28
61 0.26
62 0.24
63 0.24
64 0.27
65 0.3
66 0.3
67 0.29
68 0.26
69 0.28
70 0.34
71 0.35
72 0.32
73 0.3
74 0.31
75 0.33
76 0.34
77 0.31
78 0.28
79 0.37
80 0.4
81 0.39
82 0.41
83 0.4
84 0.43
85 0.51
86 0.54
87 0.51
88 0.56
89 0.56
90 0.54
91 0.52
92 0.47
93 0.39
94 0.38
95 0.33
96 0.25
97 0.23
98 0.22
99 0.23
100 0.22
101 0.22
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.16
107 0.16
108 0.18
109 0.16
110 0.16
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.15
115 0.14
116 0.17
117 0.2
118 0.19
119 0.17
120 0.21
121 0.22
122 0.29
123 0.39
124 0.37
125 0.43
126 0.45
127 0.46
128 0.48
129 0.5
130 0.47
131 0.4
132 0.44
133 0.37
134 0.42
135 0.42
136 0.35
137 0.31
138 0.27
139 0.25
140 0.19
141 0.18
142 0.12
143 0.11
144 0.12
145 0.16
146 0.15
147 0.17
148 0.19
149 0.21
150 0.28
151 0.27
152 0.31
153 0.33
154 0.34
155 0.44
156 0.45
157 0.5
158 0.45
159 0.48
160 0.45
161 0.46
162 0.5
163 0.45
164 0.42
165 0.36
166 0.34
167 0.36
168 0.35
169 0.32
170 0.38
171 0.39
172 0.46
173 0.52
174 0.59
175 0.56
176 0.58
177 0.58
178 0.48
179 0.43
180 0.35
181 0.29
182 0.23
183 0.27
184 0.26
185 0.22
186 0.23
187 0.22
188 0.21
189 0.22
190 0.23
191 0.2
192 0.21
193 0.2
194 0.22
195 0.26
196 0.26
197 0.26
198 0.24
199 0.22
200 0.19
201 0.18
202 0.15
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.19
212 0.22
213 0.25
214 0.33
215 0.4
216 0.44
217 0.51
218 0.58
219 0.57
220 0.63
221 0.69
222 0.68
223 0.7
224 0.72
225 0.75
226 0.77
227 0.83
228 0.8
229 0.82
230 0.84
231 0.83
232 0.83
233 0.82
234 0.83
235 0.8
236 0.8
237 0.74
238 0.68
239 0.62
240 0.51
241 0.44
242 0.33
243 0.27
244 0.2
245 0.16
246 0.13
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.12
251 0.13
252 0.16
253 0.17
254 0.21
255 0.26
256 0.3
257 0.37
258 0.42
259 0.48
260 0.49
261 0.48
262 0.53
263 0.52
264 0.54
265 0.5
266 0.45
267 0.38
268 0.39
269 0.41
270 0.36
271 0.31
272 0.25
273 0.24
274 0.2
275 0.19
276 0.14
277 0.11
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.09
289 0.09
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.14
298 0.13
299 0.14
300 0.18
301 0.19
302 0.25
303 0.31
304 0.39
305 0.38
306 0.43
307 0.5
308 0.46
309 0.5
310 0.46
311 0.44
312 0.41
313 0.39
314 0.38
315 0.32
316 0.32
317 0.3
318 0.28
319 0.23
320 0.17
321 0.18
322 0.14
323 0.12
324 0.14
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.13
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.13
349 0.15
350 0.17
351 0.15
352 0.2
353 0.23
354 0.26
355 0.26
356 0.25
357 0.31
358 0.37
359 0.46
360 0.5
361 0.54
362 0.59
363 0.61
364 0.63
365 0.58
366 0.53
367 0.46
368 0.43
369 0.37
370 0.31
371 0.28
372 0.24
373 0.21
374 0.18
375 0.16
376 0.11
377 0.14
378 0.12
379 0.16
380 0.16
381 0.2
382 0.2
383 0.2
384 0.21
385 0.18
386 0.21
387 0.2
388 0.21
389 0.16
390 0.19
391 0.21
392 0.22
393 0.28
394 0.28
395 0.36
396 0.42
397 0.5
398 0.57
399 0.62
400 0.69
401 0.68
402 0.72
403 0.67
404 0.69
405 0.65
406 0.61
407 0.54
408 0.46
409 0.43
410 0.35
411 0.31
412 0.22
413 0.27
414 0.29
415 0.31
416 0.32
417 0.29
418 0.3
419 0.3
420 0.31
421 0.24
422 0.19
423 0.2
424 0.21
425 0.22
426 0.24
427 0.29
428 0.35
429 0.36
430 0.34
431 0.35
432 0.38
433 0.39
434 0.4
435 0.34
436 0.3
437 0.29
438 0.28
439 0.27
440 0.26
441 0.27
442 0.24
443 0.29
444 0.33
445 0.42
446 0.43
447 0.43
448 0.43
449 0.43
450 0.42
451 0.41
452 0.35
453 0.31
454 0.35
455 0.38
456 0.39
457 0.39
458 0.42
459 0.39
460 0.39
461 0.42
462 0.44
463 0.49
464 0.47
465 0.48
466 0.48
467 0.49
468 0.51
469 0.44
470 0.4
471 0.34
472 0.33
473 0.34
474 0.36
475 0.34
476 0.33
477 0.35
478 0.34
479 0.32
480 0.3
481 0.26
482 0.23
483 0.24
484 0.21
485 0.17
486 0.21
487 0.23
488 0.25
489 0.28
490 0.31
491 0.36
492 0.41
493 0.42
494 0.36
495 0.32
496 0.32
497 0.32
498 0.28
499 0.31
500 0.28
501 0.32
502 0.34
503 0.37
504 0.37
505 0.37
506 0.43
507 0.36
508 0.39
509 0.39
510 0.38
511 0.36
512 0.34
513 0.39
514 0.32
515 0.32
516 0.35
517 0.36
518 0.37
519 0.37
520 0.4
521 0.38
522 0.43
523 0.49
524 0.46
525 0.46
526 0.51
527 0.49
528 0.45
529 0.44
530 0.39
531 0.4
532 0.38
533 0.39
534 0.39
535 0.42
536 0.42
537 0.44
538 0.47
539 0.4
540 0.39
541 0.38
542 0.32
543 0.28
544 0.27
545 0.21
546 0.17
547 0.14
548 0.12
549 0.09
550 0.09