Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VPS4

Protein Details
Accession A0A397VPS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
205-239EKINSKFRSIKSKDRKKKDSNKKRKIDQVYKSDNPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-229KFRSIKSKDRKKKDSNKKRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015797  NUDIX_hydrolase-like_dom_sf  
IPR020084  NUDIX_hydrolase_CS  
IPR000086  NUDIX_hydrolase_dom  
Gene Ontology GO:0016787  F:hydrolase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00293  NUDIX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51462  NUDIX  
PS00893  NUDIX_BOX  
CDD cd02883  Nudix_Hydrolase  
Amino Acid Sequences MEDQYNNFKREFTIISDHINEYESFIQMLNKMRTYRFSVDQLVNQVNPHIEVNKNLQNQLKQNIQSYENDLREFTICILVDNEKRIYLSRRNNPTKDFYGKYQVPGGGKKNNESYDQCAKRETKEETDVEIHELDLVTIHQGFRVFPDGKECMFKCAIYFALIGNQIPKQVEASNNDEWFSVELRDLGKYDLTDSLKEFKSIIVEKINSKFRSIKSKDRKKKDSNKKRKIDQVYKSDNPSIVPSEDEIEILNRPSEEEILDNISKLVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.37
4 0.36
5 0.33
6 0.32
7 0.27
8 0.22
9 0.22
10 0.17
11 0.14
12 0.14
13 0.15
14 0.17
15 0.24
16 0.24
17 0.27
18 0.29
19 0.31
20 0.34
21 0.4
22 0.42
23 0.39
24 0.39
25 0.41
26 0.42
27 0.44
28 0.45
29 0.41
30 0.36
31 0.32
32 0.29
33 0.23
34 0.21
35 0.19
36 0.17
37 0.15
38 0.17
39 0.23
40 0.29
41 0.31
42 0.33
43 0.36
44 0.38
45 0.42
46 0.44
47 0.45
48 0.4
49 0.42
50 0.42
51 0.39
52 0.36
53 0.38
54 0.4
55 0.35
56 0.33
57 0.29
58 0.27
59 0.25
60 0.24
61 0.18
62 0.14
63 0.12
64 0.12
65 0.14
66 0.16
67 0.17
68 0.19
69 0.19
70 0.16
71 0.16
72 0.18
73 0.22
74 0.27
75 0.35
76 0.41
77 0.51
78 0.59
79 0.62
80 0.63
81 0.64
82 0.61
83 0.58
84 0.51
85 0.44
86 0.44
87 0.42
88 0.4
89 0.36
90 0.33
91 0.29
92 0.31
93 0.32
94 0.29
95 0.29
96 0.3
97 0.33
98 0.32
99 0.34
100 0.31
101 0.33
102 0.37
103 0.39
104 0.37
105 0.36
106 0.36
107 0.34
108 0.37
109 0.35
110 0.29
111 0.31
112 0.31
113 0.3
114 0.3
115 0.29
116 0.25
117 0.21
118 0.16
119 0.11
120 0.1
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.23
138 0.22
139 0.2
140 0.2
141 0.2
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.12
146 0.12
147 0.08
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.14
159 0.17
160 0.22
161 0.25
162 0.25
163 0.25
164 0.24
165 0.22
166 0.2
167 0.17
168 0.12
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.17
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.16
187 0.21
188 0.22
189 0.23
190 0.23
191 0.25
192 0.28
193 0.35
194 0.43
195 0.38
196 0.4
197 0.43
198 0.41
199 0.5
200 0.51
201 0.56
202 0.58
203 0.69
204 0.76
205 0.81
206 0.87
207 0.87
208 0.92
209 0.93
210 0.93
211 0.93
212 0.94
213 0.93
214 0.91
215 0.91
216 0.91
217 0.89
218 0.87
219 0.86
220 0.84
221 0.8
222 0.77
223 0.7
224 0.6
225 0.51
226 0.45
227 0.38
228 0.29
229 0.25
230 0.21
231 0.2
232 0.19
233 0.18
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.2
247 0.2
248 0.19