Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TT29

Protein Details
Accession A0A397TT29    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-273PLIKIVKKWKHNPPDHLPETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR021850  Symplekin/Pta1  
IPR032460  Symplekin/Pta1_N  
IPR022075  Symplekin_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF11935  SYMPK_PTA1_N  
PF12295  Symplekin_C  
Amino Acid Sequences MDIQYSIQDNRINVLFDRASDNKKDQQLRIEALISFQQIIENEKHLLEPGLFQIICGFLKDSMFEIREWTIDFLEYAFTTCGLNRSLLKDSLGKIIPAVGYTVSFEESTNIVKKAILWNAGVYPLIYERVCENAYDAEHLWTTSTSIKSQIMRYFDSPGTKQGIKICAVKYLQSVIKVQSRHVHDSQVVPQNDISLALCPPSHPILNPLMLEKEAIAIINGLYNLFNKESSIVITAIINALGPVFRSRPQYIYPLIKIVKKWKHNPPDHLPETPLKSAKKAIKIQLTSLLRIPVFESSSFANEIFDAILILGGKNDPMKFPRQYRRLLQQKDGIEDGTRQKVYGAQGSSMLPIDPTQFALPFVVDVIHLALQSIPQERLNQAKQVLQQREARLAALRTLPTPPPTNKQERRSRKTLDPRLEFVREATPKSPSPPPVVMTEDEMTLIKTESSNSTQSEESTTKREFSPPNLYDDDMEIDDAATVDIEVPQDQQMDILEAENKVDSKPEPEPEPEQQPLPPPVPTFKFQPYALPPPETLSDDQCHSFIRNALKNILEIDAMLSPDTKGKRSDVVLTTLSNGKRMSKNQLHMMASRLLTRGLDLSSEKSKKTCDELREMIIQYILEDFKNRTDFALTWFDEEWYHDSIMLSEDPSYKPNYVIWLNRLLDRIMPTLEDRIFFTQFLLNVPELQEDIVDRIKIFLNDPDRMSLGLYTISELINQRPPSRPFCMKILLAYCLHKDIRTRGSAISTANKWFPDHPTIGPNIESFALQSIKQLCDECPPPLFDYHYHVDNVNDPKMIEDENELMKWNNNDVERHLDLFLSICSKKNELFDQLLSIYVKTPESMQMLIRKNAPKMVETVGINGLLNLFLTFPEGAEDFVLKMLVVYTNKQVTPPAQLVNTAKTVIMERNLEGRFLFPIIAFFEKGEIIRNLPKVIATLDATDKQRDIVKKVFLKILTPPPNGTAPITPSELLVSLHQMDKAGISLKQSVEAIHICFLLPNIFNQQTLGTVLQQLFIQSELPTTFMRTVTLAVRAYHALGGFVNEMLSRHISQIWENDVLRKGFILYVTEFCLKVQPNNFRFLLQLPKEKILDILKQRDQTLSKALKKYIENLKPEQKRTIPQFLFESLEIGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.24
3 0.23
4 0.29
5 0.31
6 0.34
7 0.38
8 0.43
9 0.44
10 0.53
11 0.59
12 0.56
13 0.59
14 0.61
15 0.59
16 0.57
17 0.51
18 0.43
19 0.37
20 0.37
21 0.29
22 0.22
23 0.18
24 0.17
25 0.16
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.2
30 0.2
31 0.2
32 0.19
33 0.2
34 0.16
35 0.15
36 0.15
37 0.2
38 0.19
39 0.19
40 0.19
41 0.2
42 0.19
43 0.19
44 0.18
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.15
49 0.19
50 0.2
51 0.18
52 0.2
53 0.2
54 0.21
55 0.22
56 0.22
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.13
61 0.14
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.13
70 0.16
71 0.17
72 0.21
73 0.26
74 0.27
75 0.28
76 0.3
77 0.3
78 0.35
79 0.34
80 0.29
81 0.24
82 0.26
83 0.23
84 0.19
85 0.18
86 0.11
87 0.1
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.13
95 0.17
96 0.19
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.2
101 0.25
102 0.29
103 0.27
104 0.25
105 0.26
106 0.26
107 0.27
108 0.25
109 0.18
110 0.14
111 0.12
112 0.15
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.2
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.17
128 0.13
129 0.14
130 0.16
131 0.18
132 0.16
133 0.2
134 0.24
135 0.26
136 0.32
137 0.35
138 0.35
139 0.37
140 0.37
141 0.39
142 0.38
143 0.4
144 0.36
145 0.35
146 0.37
147 0.34
148 0.35
149 0.35
150 0.37
151 0.34
152 0.39
153 0.35
154 0.36
155 0.36
156 0.35
157 0.31
158 0.33
159 0.31
160 0.28
161 0.3
162 0.28
163 0.33
164 0.32
165 0.33
166 0.34
167 0.38
168 0.43
169 0.42
170 0.41
171 0.38
172 0.42
173 0.47
174 0.48
175 0.42
176 0.37
177 0.35
178 0.32
179 0.29
180 0.26
181 0.18
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.13
188 0.15
189 0.16
190 0.14
191 0.18
192 0.21
193 0.24
194 0.24
195 0.22
196 0.21
197 0.2
198 0.2
199 0.16
200 0.13
201 0.1
202 0.09
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.07
231 0.09
232 0.12
233 0.19
234 0.21
235 0.24
236 0.27
237 0.31
238 0.35
239 0.39
240 0.38
241 0.39
242 0.4
243 0.4
244 0.41
245 0.46
246 0.49
247 0.51
248 0.59
249 0.62
250 0.7
251 0.74
252 0.79
253 0.79
254 0.8
255 0.75
256 0.68
257 0.62
258 0.56
259 0.53
260 0.49
261 0.46
262 0.36
263 0.35
264 0.4
265 0.43
266 0.46
267 0.48
268 0.5
269 0.53
270 0.53
271 0.53
272 0.55
273 0.51
274 0.44
275 0.39
276 0.35
277 0.26
278 0.25
279 0.24
280 0.17
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.13
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.06
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.13
305 0.19
306 0.25
307 0.34
308 0.44
309 0.48
310 0.54
311 0.58
312 0.65
313 0.7
314 0.69
315 0.65
316 0.62
317 0.58
318 0.55
319 0.5
320 0.4
321 0.31
322 0.29
323 0.28
324 0.27
325 0.24
326 0.21
327 0.2
328 0.23
329 0.24
330 0.26
331 0.23
332 0.17
333 0.19
334 0.19
335 0.2
336 0.17
337 0.14
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.06
359 0.08
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.13
364 0.14
365 0.21
366 0.22
367 0.24
368 0.24
369 0.26
370 0.31
371 0.38
372 0.4
373 0.38
374 0.42
375 0.4
376 0.43
377 0.39
378 0.34
379 0.28
380 0.25
381 0.22
382 0.2
383 0.19
384 0.15
385 0.17
386 0.18
387 0.19
388 0.23
389 0.24
390 0.28
391 0.34
392 0.44
393 0.49
394 0.57
395 0.65
396 0.71
397 0.75
398 0.76
399 0.75
400 0.74
401 0.77
402 0.78
403 0.76
404 0.7
405 0.66
406 0.64
407 0.6
408 0.5
409 0.41
410 0.39
411 0.31
412 0.29
413 0.27
414 0.26
415 0.24
416 0.28
417 0.31
418 0.26
419 0.29
420 0.29
421 0.29
422 0.28
423 0.3
424 0.27
425 0.25
426 0.23
427 0.18
428 0.16
429 0.15
430 0.12
431 0.1
432 0.09
433 0.06
434 0.05
435 0.06
436 0.09
437 0.11
438 0.14
439 0.14
440 0.16
441 0.16
442 0.17
443 0.2
444 0.19
445 0.18
446 0.21
447 0.21
448 0.2
449 0.2
450 0.26
451 0.23
452 0.27
453 0.36
454 0.32
455 0.36
456 0.36
457 0.35
458 0.3
459 0.29
460 0.25
461 0.15
462 0.13
463 0.08
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.05
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.1
492 0.12
493 0.14
494 0.16
495 0.19
496 0.23
497 0.25
498 0.29
499 0.27
500 0.25
501 0.23
502 0.25
503 0.25
504 0.22
505 0.2
506 0.16
507 0.19
508 0.21
509 0.22
510 0.22
511 0.23
512 0.25
513 0.24
514 0.27
515 0.29
516 0.33
517 0.33
518 0.31
519 0.27
520 0.26
521 0.27
522 0.24
523 0.21
524 0.16
525 0.16
526 0.15
527 0.16
528 0.14
529 0.14
530 0.12
531 0.12
532 0.13
533 0.18
534 0.2
535 0.21
536 0.23
537 0.22
538 0.22
539 0.22
540 0.19
541 0.12
542 0.09
543 0.08
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.06
548 0.05
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.12
554 0.14
555 0.15
556 0.2
557 0.18
558 0.21
559 0.2
560 0.19
561 0.2
562 0.22
563 0.21
564 0.18
565 0.17
566 0.17
567 0.2
568 0.22
569 0.29
570 0.31
571 0.34
572 0.37
573 0.42
574 0.4
575 0.37
576 0.37
577 0.31
578 0.26
579 0.24
580 0.19
581 0.14
582 0.12
583 0.11
584 0.1
585 0.07
586 0.08
587 0.07
588 0.1
589 0.16
590 0.18
591 0.18
592 0.18
593 0.2
594 0.2
595 0.26
596 0.28
597 0.25
598 0.3
599 0.32
600 0.34
601 0.36
602 0.35
603 0.29
604 0.24
605 0.2
606 0.13
607 0.12
608 0.1
609 0.06
610 0.07
611 0.08
612 0.1
613 0.12
614 0.12
615 0.11
616 0.12
617 0.12
618 0.16
619 0.22
620 0.19
621 0.19
622 0.19
623 0.19
624 0.18
625 0.19
626 0.17
627 0.12
628 0.12
629 0.11
630 0.1
631 0.1
632 0.11
633 0.1
634 0.08
635 0.07
636 0.09
637 0.09
638 0.11
639 0.13
640 0.12
641 0.12
642 0.12
643 0.15
644 0.17
645 0.19
646 0.2
647 0.25
648 0.25
649 0.27
650 0.27
651 0.23
652 0.21
653 0.21
654 0.2
655 0.13
656 0.13
657 0.12
658 0.14
659 0.14
660 0.13
661 0.13
662 0.15
663 0.15
664 0.15
665 0.15
666 0.13
667 0.13
668 0.13
669 0.14
670 0.11
671 0.11
672 0.11
673 0.1
674 0.09
675 0.08
676 0.07
677 0.05
678 0.07
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.08
683 0.1
684 0.1
685 0.11
686 0.14
687 0.17
688 0.2
689 0.2
690 0.2
691 0.2
692 0.19
693 0.19
694 0.14
695 0.1
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.08
702 0.09
703 0.11
704 0.16
705 0.18
706 0.19
707 0.25
708 0.29
709 0.33
710 0.38
711 0.41
712 0.37
713 0.4
714 0.42
715 0.36
716 0.36
717 0.32
718 0.29
719 0.26
720 0.25
721 0.22
722 0.21
723 0.21
724 0.19
725 0.2
726 0.22
727 0.26
728 0.26
729 0.27
730 0.24
731 0.26
732 0.27
733 0.26
734 0.26
735 0.23
736 0.23
737 0.23
738 0.23
739 0.22
740 0.22
741 0.24
742 0.24
743 0.24
744 0.23
745 0.25
746 0.26
747 0.26
748 0.25
749 0.2
750 0.17
751 0.14
752 0.13
753 0.1
754 0.1
755 0.1
756 0.09
757 0.12
758 0.14
759 0.15
760 0.16
761 0.17
762 0.16
763 0.2
764 0.22
765 0.2
766 0.19
767 0.2
768 0.2
769 0.21
770 0.22
771 0.19
772 0.22
773 0.23
774 0.23
775 0.22
776 0.21
777 0.21
778 0.25
779 0.28
780 0.23
781 0.21
782 0.19
783 0.19
784 0.19
785 0.19
786 0.14
787 0.11
788 0.12
789 0.14
790 0.14
791 0.14
792 0.14
793 0.15
794 0.16
795 0.16
796 0.17
797 0.17
798 0.18
799 0.2
800 0.26
801 0.25
802 0.26
803 0.24
804 0.2
805 0.18
806 0.17
807 0.16
808 0.14
809 0.13
810 0.15
811 0.16
812 0.18
813 0.2
814 0.23
815 0.26
816 0.26
817 0.28
818 0.25
819 0.26
820 0.24
821 0.24
822 0.21
823 0.18
824 0.15
825 0.13
826 0.13
827 0.11
828 0.11
829 0.12
830 0.14
831 0.15
832 0.17
833 0.24
834 0.28
835 0.3
836 0.35
837 0.36
838 0.35
839 0.38
840 0.36
841 0.29
842 0.28
843 0.28
844 0.27
845 0.23
846 0.24
847 0.21
848 0.2
849 0.19
850 0.16
851 0.13
852 0.08
853 0.08
854 0.06
855 0.05
856 0.04
857 0.06
858 0.06
859 0.06
860 0.07
861 0.08
862 0.08
863 0.08
864 0.09
865 0.07
866 0.07
867 0.07
868 0.06
869 0.05
870 0.06
871 0.09
872 0.1
873 0.11
874 0.16
875 0.2
876 0.2
877 0.21
878 0.23
879 0.21
880 0.25
881 0.26
882 0.24
883 0.21
884 0.25
885 0.27
886 0.28
887 0.28
888 0.23
889 0.2
890 0.18
891 0.19
892 0.17
893 0.19
894 0.17
895 0.17
896 0.23
897 0.24
898 0.24
899 0.21
900 0.2
901 0.17
902 0.16
903 0.16
904 0.09
905 0.1
906 0.12
907 0.14
908 0.14
909 0.12
910 0.13
911 0.13
912 0.14
913 0.16
914 0.15
915 0.16
916 0.21
917 0.23
918 0.23
919 0.22
920 0.22
921 0.19
922 0.19
923 0.18
924 0.14
925 0.15
926 0.18
927 0.22
928 0.24
929 0.25
930 0.24
931 0.23
932 0.28
933 0.29
934 0.31
935 0.32
936 0.38
937 0.42
938 0.45
939 0.49
940 0.44
941 0.42
942 0.44
943 0.48
944 0.49
945 0.45
946 0.43
947 0.41
948 0.42
949 0.42
950 0.37
951 0.29
952 0.23
953 0.24
954 0.25
955 0.22
956 0.2
957 0.2
958 0.18
959 0.16
960 0.14
961 0.14
962 0.13
963 0.15
964 0.15
965 0.14
966 0.14
967 0.13
968 0.14
969 0.13
970 0.12
971 0.14
972 0.18
973 0.17
974 0.19
975 0.19
976 0.18
977 0.2
978 0.21
979 0.2
980 0.17
981 0.17
982 0.14
983 0.14
984 0.15
985 0.14
986 0.13
987 0.13
988 0.19
989 0.2
990 0.2
991 0.21
992 0.2
993 0.18
994 0.2
995 0.19
996 0.13
997 0.16
998 0.16
999 0.16
1000 0.16
1001 0.15
1002 0.13
1003 0.12
1004 0.12
1005 0.08
1006 0.11
1007 0.1
1008 0.13
1009 0.12
1010 0.15
1011 0.16
1012 0.16
1013 0.17
1014 0.15
1015 0.17
1016 0.17
1017 0.22
1018 0.21
1019 0.19
1020 0.22
1021 0.21
1022 0.22
1023 0.21
1024 0.19
1025 0.14
1026 0.12
1027 0.14
1028 0.12
1029 0.11
1030 0.11
1031 0.09
1032 0.1
1033 0.11
1034 0.15
1035 0.14
1036 0.15
1037 0.17
1038 0.18
1039 0.2
1040 0.25
1041 0.27
1042 0.29
1043 0.29
1044 0.33
1045 0.35
1046 0.35
1047 0.32
1048 0.28
1049 0.24
1050 0.2
1051 0.2
1052 0.19
1053 0.17
1054 0.18
1055 0.22
1056 0.24
1057 0.23
1058 0.22
1059 0.27
1060 0.25
1061 0.29
1062 0.36
1063 0.42
1064 0.43
1065 0.49
1066 0.5
1067 0.44
1068 0.44
1069 0.41
1070 0.43
1071 0.39
1072 0.45
1073 0.43
1074 0.48
1075 0.48
1076 0.46
1077 0.48
1078 0.42
1079 0.44
1080 0.44
1081 0.49
1082 0.5
1083 0.53
1084 0.55
1085 0.56
1086 0.53
1087 0.48
1088 0.5
1089 0.5
1090 0.52
1091 0.54
1092 0.56
1093 0.56
1094 0.56
1095 0.61
1096 0.62
1097 0.6
1098 0.58
1099 0.61
1100 0.68
1101 0.7
1102 0.72
1103 0.73
1104 0.68
1105 0.69
1106 0.71
1107 0.73
1108 0.64
1109 0.6
1110 0.59
1111 0.53
1112 0.51
1113 0.42