Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VN66

Protein Details
Accession A0A397VN66    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-301YIKNSLTKKNFKKTSHKKYGLSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR007560  Restrct_endonuc_IV_Mrr  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR001876  Znf_RanBP2  
IPR036443  Znf_RanBP2_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0009307  P:DNA restriction-modification system  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF04471  Mrr_cat  
PF00641  zf-RanBP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01358  ZF_RANBP2_1  
PS50199  ZF_RANBP2_2  
Amino Acid Sequences MSLSKQTDYGTGHNFEEFIEELLNQNGIHANVVSYKQGDNGIDIIATFNRQIILIQCKNTGKPIDANIIKNFQASVYRFGEPILSIIVYNSEKLKNYNCPLTKSARLWWKAVCPEIQIASEKMIVTCIQKILQSEESELNFESLKLDSESEELSELEQEQLYSVEKSHSVKPTCYKSDDDFKFQIENLLSGNRILVNSFNSRKDKIDIIATFNRQIILIHLSNSSDVNTFKGLQTSVYRFGEGILSIIVQNSENFNNPSIKNERSYRKIKIITEKKIVNYIKNSLTKKNFKKTSHKKYGLSANAIERRDNDVWSCSKQISDKVSWICPECTYINNPLMPDCEMCSTARTAKNNFIEEINTINQLENQDYISTARPAKNRFIEEINTMNQLVNQDYSFLEPMVAKISKNKNLCLEQWDCPDCTLINESDVVMCIACGYIKDNSIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.25
3 0.24
4 0.19
5 0.14
6 0.12
7 0.11
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.13
16 0.11
17 0.11
18 0.14
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.2
25 0.2
26 0.18
27 0.17
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.14
40 0.23
41 0.26
42 0.29
43 0.34
44 0.37
45 0.38
46 0.42
47 0.4
48 0.33
49 0.33
50 0.35
51 0.39
52 0.4
53 0.44
54 0.42
55 0.43
56 0.4
57 0.36
58 0.32
59 0.23
60 0.25
61 0.23
62 0.26
63 0.26
64 0.27
65 0.26
66 0.26
67 0.27
68 0.2
69 0.18
70 0.13
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.13
75 0.12
76 0.13
77 0.15
78 0.16
79 0.17
80 0.2
81 0.25
82 0.29
83 0.34
84 0.42
85 0.42
86 0.44
87 0.47
88 0.51
89 0.53
90 0.47
91 0.49
92 0.49
93 0.48
94 0.46
95 0.45
96 0.45
97 0.43
98 0.43
99 0.37
100 0.3
101 0.3
102 0.29
103 0.27
104 0.22
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.16
109 0.14
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.19
119 0.21
120 0.2
121 0.21
122 0.23
123 0.23
124 0.23
125 0.22
126 0.18
127 0.14
128 0.13
129 0.11
130 0.08
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.1
153 0.13
154 0.18
155 0.24
156 0.25
157 0.28
158 0.34
159 0.4
160 0.42
161 0.42
162 0.4
163 0.37
164 0.45
165 0.44
166 0.44
167 0.38
168 0.35
169 0.33
170 0.3
171 0.3
172 0.2
173 0.18
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.09
184 0.14
185 0.17
186 0.22
187 0.24
188 0.26
189 0.27
190 0.28
191 0.27
192 0.23
193 0.27
194 0.22
195 0.25
196 0.28
197 0.28
198 0.27
199 0.26
200 0.25
201 0.19
202 0.18
203 0.13
204 0.14
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.13
222 0.14
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.16
227 0.17
228 0.16
229 0.13
230 0.1
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.12
243 0.15
244 0.15
245 0.2
246 0.22
247 0.23
248 0.26
249 0.32
250 0.37
251 0.4
252 0.46
253 0.45
254 0.49
255 0.53
256 0.53
257 0.57
258 0.6
259 0.6
260 0.61
261 0.59
262 0.52
263 0.55
264 0.53
265 0.46
266 0.4
267 0.38
268 0.38
269 0.42
270 0.44
271 0.43
272 0.5
273 0.55
274 0.6
275 0.66
276 0.67
277 0.67
278 0.76
279 0.79
280 0.82
281 0.83
282 0.82
283 0.75
284 0.72
285 0.75
286 0.69
287 0.61
288 0.53
289 0.49
290 0.49
291 0.47
292 0.42
293 0.34
294 0.36
295 0.33
296 0.31
297 0.25
298 0.23
299 0.25
300 0.27
301 0.27
302 0.21
303 0.21
304 0.23
305 0.27
306 0.28
307 0.27
308 0.31
309 0.32
310 0.34
311 0.35
312 0.36
313 0.32
314 0.26
315 0.28
316 0.23
317 0.22
318 0.23
319 0.25
320 0.26
321 0.26
322 0.26
323 0.23
324 0.24
325 0.23
326 0.2
327 0.16
328 0.15
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.16
333 0.22
334 0.27
335 0.3
336 0.31
337 0.38
338 0.44
339 0.44
340 0.43
341 0.37
342 0.33
343 0.29
344 0.3
345 0.23
346 0.19
347 0.17
348 0.16
349 0.17
350 0.17
351 0.17
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.14
358 0.17
359 0.2
360 0.25
361 0.3
362 0.34
363 0.42
364 0.47
365 0.48
366 0.48
367 0.47
368 0.45
369 0.44
370 0.44
371 0.38
372 0.33
373 0.3
374 0.27
375 0.23
376 0.22
377 0.19
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.13
382 0.16
383 0.15
384 0.14
385 0.13
386 0.12
387 0.12
388 0.17
389 0.18
390 0.16
391 0.24
392 0.33
393 0.39
394 0.43
395 0.47
396 0.49
397 0.53
398 0.55
399 0.54
400 0.5
401 0.48
402 0.53
403 0.52
404 0.45
405 0.4
406 0.39
407 0.32
408 0.3
409 0.27
410 0.2
411 0.18
412 0.18
413 0.18
414 0.16
415 0.17
416 0.14
417 0.1
418 0.09
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.09
424 0.12