Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TS72

Protein Details
Accession A0A397TS72    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
337-364GTKFRIVYPNERKRPKRTKEFKFSSQQLHydrophilic
612-639IDKIEKDRERDARRKRRQTRGRRGVILPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-353KRPKR
618-635DRERDARRKRRQTRGRRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF04855  SNF5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MDSYPSLPNISQQQQQAGYNNNSLGLPTNPTLLQQSQSQQYANNFASQHPANQRAMNTGIVQQSQQQANFGSTNNQNIQQLGGLGGENNSSLSNPYVFQNHQSLPVTSPTPIPSMSAINNSVYGNQGNINGMGMDVFRPGFNRTIGQMVAAPRQNLLPLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLQNQQQQLARQRAQMQQRLAQQAQQAQQAQSQQQMMLQQMRRPVQNTAPSQNVHRPSNNQKQTNDSNSKKPQQQTVKPYEPAPDLTPVQKEYLDQYVRRDTLYQKALDLQHRRQMAIINEKRKEIAQAEQRYQYRSSPFVFGPGYQGYGNGITGTKFRIVYPNERKRPKRTKEFKFSSQQLRDIAQKEDILVPIRLEIDGTDGFKLRDTFTWNMNETYITPEHFAEVLCDDLHFPPSQFAPIIVKQIRDQLQGYIIHPLSSTDPSQPTLTAEVFSALKNSTEDTIEIKEENEIISLNSFMDGNMDDQNSCEELRILIKIDVTVGNISLVDQFEWDINCQKNDPEVFADILTTELGLGGEFKTAIAHSIREQIQIYVKSLILVGHPFDGSPIQDDDLRQNFLPPVTNIIRREDAVEQHTPLLVELTEAEIDKIEKDRERDARRKRRQTRGRRGVILPDREPPKTHRTLLHNTTVVQDPADENVFLTVPSSGMPPVLRKASSMGYDNYTAISEKSLAPGKMRGRGRATVGGTNIGNNLRGGTPVNSLDSDANTPEGAKKLNRRLTNKDLDEWHCHGCGCPSTSTPLLRKGPNGEKTLCNACGLYFQKNNSLRPNPLNLNDLGTNSPFMENNPSSIDPFSKKGPQHIESYHQNLPSMSITNTSLEVKQQSNTLVKREINAQDNQNLTDSQGITLNTVVSEGLVSAPLIQPVPSIMTATSIPPTSTSHAIASTSANDLPMSTTSSTITVPNALPSNRPVLPEWIIQQRDQLKRKYPRDLFDIIQRPNHHPTEFRIKCSDCPGKLYQPGPELTLGNFEIHLKNKSHRMAVEKRWNPQLAASLLNNETIGNSSSNTNTIPGYGHADGASATISVGDIGDHGTNSFLGSGTGGTKEIGGTGTPSDISDNVRVYDLNNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.45
3 0.45
4 0.44
5 0.44
6 0.42
7 0.39
8 0.34
9 0.31
10 0.27
11 0.26
12 0.2
13 0.2
14 0.17
15 0.2
16 0.19
17 0.2
18 0.25
19 0.24
20 0.24
21 0.24
22 0.29
23 0.32
24 0.35
25 0.35
26 0.34
27 0.35
28 0.41
29 0.37
30 0.36
31 0.31
32 0.29
33 0.35
34 0.32
35 0.36
36 0.36
37 0.41
38 0.39
39 0.42
40 0.42
41 0.4
42 0.41
43 0.35
44 0.3
45 0.29
46 0.29
47 0.26
48 0.26
49 0.26
50 0.31
51 0.33
52 0.31
53 0.28
54 0.26
55 0.28
56 0.29
57 0.25
58 0.25
59 0.24
60 0.3
61 0.32
62 0.33
63 0.31
64 0.3
65 0.3
66 0.24
67 0.21
68 0.15
69 0.13
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.14
83 0.18
84 0.19
85 0.23
86 0.29
87 0.28
88 0.33
89 0.34
90 0.34
91 0.31
92 0.33
93 0.31
94 0.25
95 0.27
96 0.23
97 0.22
98 0.21
99 0.2
100 0.18
101 0.2
102 0.21
103 0.23
104 0.23
105 0.21
106 0.23
107 0.22
108 0.21
109 0.19
110 0.18
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.13
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.12
127 0.14
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.21
136 0.26
137 0.27
138 0.26
139 0.23
140 0.23
141 0.23
142 0.21
143 0.22
144 0.24
145 0.26
146 0.31
147 0.37
148 0.42
149 0.47
150 0.55
151 0.6
152 0.58
153 0.61
154 0.64
155 0.66
156 0.7
157 0.72
158 0.71
159 0.71
160 0.73
161 0.73
162 0.73
163 0.73
164 0.73
165 0.71
166 0.71
167 0.7
168 0.68
169 0.66
170 0.67
171 0.67
172 0.65
173 0.61
174 0.58
175 0.52
176 0.53
177 0.55
178 0.54
179 0.49
180 0.46
181 0.5
182 0.52
183 0.59
184 0.59
185 0.54
186 0.52
187 0.56
188 0.58
189 0.53
190 0.49
191 0.44
192 0.44
193 0.43
194 0.42
195 0.38
196 0.32
197 0.34
198 0.35
199 0.33
200 0.3
201 0.28
202 0.22
203 0.21
204 0.22
205 0.23
206 0.26
207 0.27
208 0.26
209 0.32
210 0.35
211 0.36
212 0.36
213 0.37
214 0.36
215 0.42
216 0.45
217 0.43
218 0.45
219 0.43
220 0.46
221 0.49
222 0.48
223 0.44
224 0.43
225 0.45
226 0.5
227 0.6
228 0.65
229 0.63
230 0.59
231 0.62
232 0.66
233 0.68
234 0.68
235 0.61
236 0.62
237 0.64
238 0.7
239 0.7
240 0.66
241 0.66
242 0.66
243 0.71
244 0.71
245 0.72
246 0.71
247 0.66
248 0.64
249 0.59
250 0.5
251 0.44
252 0.37
253 0.31
254 0.26
255 0.27
256 0.28
257 0.25
258 0.24
259 0.22
260 0.2
261 0.19
262 0.25
263 0.27
264 0.25
265 0.29
266 0.34
267 0.34
268 0.35
269 0.34
270 0.29
271 0.33
272 0.37
273 0.32
274 0.26
275 0.31
276 0.35
277 0.4
278 0.45
279 0.41
280 0.42
281 0.43
282 0.42
283 0.38
284 0.38
285 0.36
286 0.39
287 0.42
288 0.45
289 0.46
290 0.46
291 0.46
292 0.42
293 0.4
294 0.31
295 0.31
296 0.32
297 0.37
298 0.4
299 0.46
300 0.48
301 0.47
302 0.46
303 0.42
304 0.36
305 0.33
306 0.31
307 0.28
308 0.26
309 0.27
310 0.26
311 0.22
312 0.23
313 0.2
314 0.2
315 0.16
316 0.16
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.08
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.18
329 0.21
330 0.32
331 0.42
332 0.51
333 0.58
334 0.67
335 0.72
336 0.76
337 0.83
338 0.83
339 0.83
340 0.83
341 0.84
342 0.86
343 0.87
344 0.85
345 0.83
346 0.8
347 0.79
348 0.72
349 0.65
350 0.56
351 0.51
352 0.48
353 0.41
354 0.36
355 0.28
356 0.24
357 0.22
358 0.21
359 0.2
360 0.17
361 0.15
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.11
377 0.12
378 0.17
379 0.18
380 0.21
381 0.25
382 0.25
383 0.25
384 0.24
385 0.23
386 0.18
387 0.21
388 0.18
389 0.14
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.09
396 0.08
397 0.09
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.09
409 0.1
410 0.12
411 0.13
412 0.2
413 0.2
414 0.21
415 0.21
416 0.27
417 0.29
418 0.27
419 0.26
420 0.2
421 0.22
422 0.23
423 0.22
424 0.21
425 0.19
426 0.17
427 0.16
428 0.16
429 0.14
430 0.15
431 0.15
432 0.13
433 0.14
434 0.15
435 0.16
436 0.15
437 0.14
438 0.15
439 0.14
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.09
461 0.07
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.04
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.1
506 0.11
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.15
511 0.15
512 0.15
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.11
518 0.08
519 0.08
520 0.06
521 0.05
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.04
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.06
536 0.07
537 0.12
538 0.13
539 0.15
540 0.15
541 0.15
542 0.18
543 0.18
544 0.19
545 0.14
546 0.14
547 0.12
548 0.12
549 0.12
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.08
563 0.09
564 0.13
565 0.14
566 0.16
567 0.14
568 0.15
569 0.14
570 0.14
571 0.15
572 0.11
573 0.15
574 0.16
575 0.21
576 0.21
577 0.23
578 0.24
579 0.23
580 0.25
581 0.21
582 0.2
583 0.2
584 0.2
585 0.18
586 0.17
587 0.17
588 0.14
589 0.12
590 0.1
591 0.06
592 0.05
593 0.04
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.08
602 0.09
603 0.11
604 0.13
605 0.2
606 0.28
607 0.36
608 0.45
609 0.54
610 0.63
611 0.71
612 0.8
613 0.83
614 0.86
615 0.89
616 0.91
617 0.92
618 0.91
619 0.87
620 0.81
621 0.73
622 0.71
623 0.68
624 0.62
625 0.51
626 0.47
627 0.44
628 0.39
629 0.4
630 0.35
631 0.36
632 0.35
633 0.37
634 0.36
635 0.4
636 0.47
637 0.49
638 0.51
639 0.44
640 0.4
641 0.39
642 0.35
643 0.28
644 0.2
645 0.16
646 0.1
647 0.11
648 0.11
649 0.08
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.06
654 0.06
655 0.05
656 0.04
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.06
661 0.07
662 0.08
663 0.11
664 0.13
665 0.13
666 0.13
667 0.15
668 0.16
669 0.18
670 0.19
671 0.18
672 0.18
673 0.19
674 0.18
675 0.17
676 0.15
677 0.13
678 0.1
679 0.09
680 0.09
681 0.08
682 0.11
683 0.14
684 0.14
685 0.15
686 0.22
687 0.24
688 0.3
689 0.32
690 0.34
691 0.35
692 0.37
693 0.39
694 0.39
695 0.38
696 0.33
697 0.32
698 0.29
699 0.25
700 0.23
701 0.21
702 0.15
703 0.14
704 0.11
705 0.11
706 0.08
707 0.09
708 0.1
709 0.1
710 0.12
711 0.12
712 0.13
713 0.13
714 0.14
715 0.14
716 0.13
717 0.13
718 0.11
719 0.11
720 0.09
721 0.1
722 0.1
723 0.11
724 0.12
725 0.15
726 0.23
727 0.32
728 0.39
729 0.46
730 0.51
731 0.58
732 0.64
733 0.69
734 0.64
735 0.58
736 0.57
737 0.54
738 0.55
739 0.5
740 0.43
741 0.34
742 0.32
743 0.28
744 0.24
745 0.23
746 0.19
747 0.17
748 0.16
749 0.19
750 0.22
751 0.26
752 0.26
753 0.31
754 0.34
755 0.34
756 0.36
757 0.4
758 0.46
759 0.48
760 0.5
761 0.45
762 0.42
763 0.44
764 0.47
765 0.4
766 0.31
767 0.25
768 0.2
769 0.25
770 0.25
771 0.27
772 0.25
773 0.26
774 0.34
775 0.38
776 0.42
777 0.43
778 0.45
779 0.44
780 0.45
781 0.5
782 0.46
783 0.44
784 0.43
785 0.35
786 0.34
787 0.3
788 0.27
789 0.22
790 0.18
791 0.17
792 0.14
793 0.15
794 0.11
795 0.12
796 0.18
797 0.17
798 0.18
799 0.21
800 0.21
801 0.21
802 0.22
803 0.25
804 0.2
805 0.22
806 0.24
807 0.28
808 0.28
809 0.34
810 0.41
811 0.4
812 0.43
813 0.44
814 0.47
815 0.46
816 0.51
817 0.47
818 0.4
819 0.38
820 0.32
821 0.32
822 0.26
823 0.22
824 0.16
825 0.14
826 0.15
827 0.15
828 0.16
829 0.16
830 0.15
831 0.15
832 0.19
833 0.18
834 0.18
835 0.19
836 0.21
837 0.27
838 0.29
839 0.3
840 0.32
841 0.32
842 0.32
843 0.38
844 0.39
845 0.37
846 0.39
847 0.39
848 0.38
849 0.39
850 0.38
851 0.32
852 0.27
853 0.23
854 0.22
855 0.18
856 0.14
857 0.15
858 0.15
859 0.14
860 0.14
861 0.14
862 0.1
863 0.1
864 0.09
865 0.05
866 0.05
867 0.05
868 0.04
869 0.05
870 0.05
871 0.06
872 0.06
873 0.08
874 0.08
875 0.07
876 0.07
877 0.08
878 0.1
879 0.09
880 0.1
881 0.08
882 0.1
883 0.11
884 0.12
885 0.14
886 0.12
887 0.12
888 0.13
889 0.16
890 0.17
891 0.19
892 0.2
893 0.19
894 0.19
895 0.19
896 0.19
897 0.18
898 0.16
899 0.15
900 0.14
901 0.13
902 0.12
903 0.12
904 0.12
905 0.12
906 0.14
907 0.12
908 0.12
909 0.13
910 0.14
911 0.15
912 0.14
913 0.14
914 0.14
915 0.14
916 0.16
917 0.2
918 0.2
919 0.21
920 0.22
921 0.27
922 0.26
923 0.28
924 0.26
925 0.27
926 0.29
927 0.3
928 0.33
929 0.36
930 0.36
931 0.34
932 0.39
933 0.42
934 0.49
935 0.53
936 0.55
937 0.57
938 0.65
939 0.72
940 0.76
941 0.74
942 0.7
943 0.7
944 0.67
945 0.6
946 0.59
947 0.61
948 0.53
949 0.53
950 0.51
951 0.5
952 0.53
953 0.54
954 0.46
955 0.4
956 0.43
957 0.49
958 0.48
959 0.47
960 0.48
961 0.46
962 0.48
963 0.55
964 0.57
965 0.47
966 0.51
967 0.52
968 0.51
969 0.56
970 0.54
971 0.5
972 0.46
973 0.45
974 0.41
975 0.38
976 0.31
977 0.25
978 0.27
979 0.22
980 0.18
981 0.17
982 0.18
983 0.2
984 0.22
985 0.27
986 0.26
987 0.3
988 0.38
989 0.42
990 0.44
991 0.44
992 0.49
993 0.54
994 0.61
995 0.67
996 0.64
997 0.66
998 0.69
999 0.68
1000 0.59
1001 0.53
1002 0.49
1003 0.4
1004 0.39
1005 0.34
1006 0.3
1007 0.29
1008 0.29
1009 0.26
1010 0.19
1011 0.17
1012 0.14
1013 0.15
1014 0.11
1015 0.12
1016 0.13
1017 0.14
1018 0.16
1019 0.16
1020 0.16
1021 0.14
1022 0.14
1023 0.15
1024 0.14
1025 0.2
1026 0.18
1027 0.19
1028 0.17
1029 0.17
1030 0.16
1031 0.15
1032 0.14
1033 0.07
1034 0.06
1035 0.05
1036 0.05
1037 0.05
1038 0.05
1039 0.05
1040 0.04
1041 0.07
1042 0.08
1043 0.08
1044 0.08
1045 0.09
1046 0.09
1047 0.09
1048 0.09
1049 0.07
1050 0.07
1051 0.07
1052 0.08
1053 0.09
1054 0.1
1055 0.1
1056 0.1
1057 0.1
1058 0.1
1059 0.1
1060 0.1
1061 0.09
1062 0.09
1063 0.1
1064 0.11
1065 0.11
1066 0.12
1067 0.13
1068 0.13
1069 0.17
1070 0.2
1071 0.21
1072 0.21
1073 0.22
1074 0.21