Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VS49

Protein Details
Accession A0A397VS49    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-164KSSMNVKKLKEVKKKVERMAKTHydrophilic
187-211ATEKRPSAIKTAKKSTRKKRNKLELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-208KRPSAIKTAKKSTRKKRNK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013251  DASH_Spc19  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0042729  C:DASH complex  
GO:0005876  C:spindle microtubule  
GO:0008608  P:attachment of spindle microtubules to kinetochore  
Pfam View protein in Pfam  
PF08287  DASH_Spc19  
Amino Acid Sequences MTPRRTTTTTPPNIPTNYLHSLRECVQRLQDSSVKLQSSLNKLELSNFSRIKKLICCKRVYELVTEAEICEQLEPRVKNLLSKAEYMLRELEKKEDMLQEEADQLERELDVELKKAQLDSTFPLLLAEHCRESLSSSKNGNAKSSMNVKKLKEVKKKVERMAKTVAQLEEEYNQKETELQLQKQRVATEKRPSAIKTAKKSTRKKRNKLEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.5
3 0.45
4 0.44
5 0.41
6 0.38
7 0.34
8 0.36
9 0.37
10 0.43
11 0.39
12 0.36
13 0.39
14 0.42
15 0.42
16 0.44
17 0.43
18 0.37
19 0.39
20 0.41
21 0.35
22 0.31
23 0.32
24 0.32
25 0.34
26 0.35
27 0.33
28 0.29
29 0.29
30 0.31
31 0.34
32 0.32
33 0.34
34 0.34
35 0.33
36 0.35
37 0.35
38 0.35
39 0.37
40 0.43
41 0.45
42 0.48
43 0.5
44 0.5
45 0.54
46 0.58
47 0.52
48 0.45
49 0.38
50 0.33
51 0.31
52 0.28
53 0.23
54 0.17
55 0.15
56 0.11
57 0.09
58 0.07
59 0.07
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.2
64 0.2
65 0.22
66 0.24
67 0.3
68 0.26
69 0.26
70 0.27
71 0.26
72 0.26
73 0.25
74 0.25
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.2
79 0.16
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.12
90 0.09
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.09
106 0.1
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.14
114 0.14
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.13
120 0.18
121 0.18
122 0.21
123 0.22
124 0.26
125 0.3
126 0.31
127 0.3
128 0.27
129 0.25
130 0.24
131 0.33
132 0.35
133 0.38
134 0.43
135 0.42
136 0.48
137 0.56
138 0.62
139 0.63
140 0.65
141 0.7
142 0.74
143 0.82
144 0.81
145 0.82
146 0.75
147 0.7
148 0.69
149 0.61
150 0.54
151 0.51
152 0.43
153 0.36
154 0.33
155 0.29
156 0.25
157 0.25
158 0.23
159 0.2
160 0.19
161 0.17
162 0.17
163 0.17
164 0.23
165 0.27
166 0.3
167 0.36
168 0.4
169 0.44
170 0.46
171 0.48
172 0.46
173 0.47
174 0.51
175 0.53
176 0.56
177 0.55
178 0.57
179 0.56
180 0.57
181 0.58
182 0.59
183 0.58
184 0.62
185 0.69
186 0.74
187 0.83
188 0.85
189 0.87
190 0.9
191 0.91