Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VWS0

Protein Details
Accession A0A397VWS0    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-76IFPSNSPRSKAKRKKQLKPPRPQNAWVLHydrophilic
131-154FAPDRSKKIEKSRRKKNQIIQFEFHydrophilic
163-182ENKAKDKQNAKPHCNKNRNIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-69RSKAKRKKQLKPPR
136-146SKKIEKSRRKK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MSSNMTGKIQFMTISPDERSYKSFNEDPSDDELLKNHPYPLAFTIEDLIFPSNSPRSKAKRKKQLKPPRPQNAWVLFLKNFIKLHQLEGKDNSSLASDAWNRQPPIVHKFFKLLEKKAKDKHNEDYPDYIFAPDRSKKIEKSRRKKNQIIQFEFPDQFSKILENKAKDKQNAKPHCNKNRNIQFESHESHNEVTMPKNALNVNSNNINFSVIDFSHYVEHPNDDHELISNSFFQQKIPDQIQTLNQDLFNQDLFSLYINVDMLDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.27
4 0.29
5 0.31
6 0.34
7 0.32
8 0.33
9 0.36
10 0.38
11 0.37
12 0.41
13 0.4
14 0.39
15 0.41
16 0.42
17 0.35
18 0.32
19 0.29
20 0.26
21 0.28
22 0.26
23 0.21
24 0.19
25 0.19
26 0.22
27 0.23
28 0.24
29 0.2
30 0.19
31 0.21
32 0.19
33 0.19
34 0.17
35 0.16
36 0.11
37 0.11
38 0.14
39 0.17
40 0.19
41 0.22
42 0.29
43 0.37
44 0.48
45 0.59
46 0.66
47 0.71
48 0.8
49 0.86
50 0.9
51 0.92
52 0.92
53 0.92
54 0.93
55 0.92
56 0.88
57 0.81
58 0.79
59 0.72
60 0.67
61 0.57
62 0.5
63 0.39
64 0.38
65 0.35
66 0.3
67 0.25
68 0.21
69 0.25
70 0.22
71 0.26
72 0.28
73 0.29
74 0.28
75 0.32
76 0.33
77 0.27
78 0.26
79 0.22
80 0.16
81 0.14
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.14
86 0.19
87 0.24
88 0.23
89 0.24
90 0.27
91 0.26
92 0.32
93 0.37
94 0.33
95 0.3
96 0.32
97 0.34
98 0.39
99 0.41
100 0.39
101 0.41
102 0.44
103 0.5
104 0.54
105 0.59
106 0.58
107 0.57
108 0.58
109 0.57
110 0.56
111 0.52
112 0.49
113 0.42
114 0.38
115 0.33
116 0.27
117 0.19
118 0.16
119 0.19
120 0.17
121 0.18
122 0.21
123 0.23
124 0.27
125 0.37
126 0.47
127 0.53
128 0.6
129 0.71
130 0.76
131 0.83
132 0.86
133 0.84
134 0.84
135 0.83
136 0.8
137 0.73
138 0.65
139 0.6
140 0.52
141 0.44
142 0.36
143 0.26
144 0.2
145 0.16
146 0.16
147 0.14
148 0.19
149 0.23
150 0.24
151 0.28
152 0.36
153 0.41
154 0.43
155 0.47
156 0.48
157 0.55
158 0.62
159 0.64
160 0.67
161 0.72
162 0.77
163 0.81
164 0.77
165 0.77
166 0.77
167 0.77
168 0.7
169 0.63
170 0.56
171 0.53
172 0.52
173 0.44
174 0.37
175 0.31
176 0.29
177 0.26
178 0.23
179 0.19
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.2
185 0.2
186 0.21
187 0.25
188 0.24
189 0.24
190 0.28
191 0.28
192 0.26
193 0.25
194 0.24
195 0.19
196 0.18
197 0.17
198 0.11
199 0.14
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.16
204 0.18
205 0.15
206 0.18
207 0.16
208 0.18
209 0.19
210 0.16
211 0.17
212 0.15
213 0.17
214 0.16
215 0.17
216 0.16
217 0.15
218 0.18
219 0.18
220 0.17
221 0.2
222 0.23
223 0.29
224 0.32
225 0.33
226 0.32
227 0.35
228 0.41
229 0.4
230 0.39
231 0.34
232 0.31
233 0.29
234 0.28
235 0.26
236 0.21
237 0.16
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.1
244 0.11
245 0.1