Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VPT4

Protein Details
Accession A0A397VPT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-88VRRRGTVFVLCKKNKKHKQRQGNAYPRDKLTHydrophilic
430-453DDFMHPKTKKRSLCFRINYRSMDRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR005121  Fdx_antiC-bd  
IPR036690  Fdx_antiC-bd_sf  
IPR004530  Phe-tRNA-synth_IIc_mito  
IPR002319  Phenylalanyl-tRNA_Synthase  
IPR000473  Ribosomal_L36  
IPR035977  Ribosomal_L36_sp  
Gene Ontology GO:0005759  C:mitochondrial matrix  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004826  F:phenylalanine-tRNA ligase activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0006432  P:phenylalanyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03147  FDX-ACB  
PF00444  Ribosomal_L36  
PF01409  tRNA-synt_2d  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
PS51447  FDX_ACB  
PS00828  RIBOSOMAL_L36  
CDD cd00496  PheRS_alpha_core  
Amino Acid Sequences MTFLTQPTRISSLRQLILPLINTTNITKNDSIINSIGLIRGMKVRSSVKKLCDGCYTVRRRGTVFVLCKKNKKHKQRQGNAYPRDKLTNVTPSILSKITRQLYLQQYHPISILRNRIESNFDKFHYFNSFNPIVTTIQNFDELGFPTNHPGRSTTDSYYINKSIMLRTHTSAHQRQALQTGAEKFLISADVYRRDEIDTCHYPVFHQMEGVQIFSINKAIEEIAYDMQISTSQQQQQHRHINTDDNTVISITNPIQSCHPIEIANAIISHLKYSLNELVKMLFIDEKNLQVRWVDAYFPFTSPSWEMEIFYQGKWLEVCGCGVIIQDILNNAGQPDKIGWAFGLGLERIAMVLFNIPDIRLFWSKDPRFINQFTSNEIIKFKPFSKYPSCIKDLSFWMNNDKEHEFHITNFCEIVRDIAEDLVEDVKLVDDFMHPKTKKRSLCFRINYRSMDRTCTNEEINGIQDKIRKSVAEKLDVTLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.36
4 0.39
5 0.36
6 0.3
7 0.24
8 0.22
9 0.23
10 0.24
11 0.27
12 0.26
13 0.29
14 0.27
15 0.27
16 0.31
17 0.31
18 0.31
19 0.25
20 0.24
21 0.2
22 0.2
23 0.19
24 0.15
25 0.14
26 0.12
27 0.16
28 0.17
29 0.16
30 0.21
31 0.29
32 0.35
33 0.44
34 0.49
35 0.49
36 0.57
37 0.59
38 0.58
39 0.56
40 0.52
41 0.5
42 0.54
43 0.57
44 0.55
45 0.57
46 0.55
47 0.5
48 0.51
49 0.49
50 0.48
51 0.5
52 0.51
53 0.57
54 0.62
55 0.68
56 0.74
57 0.79
58 0.8
59 0.83
60 0.85
61 0.85
62 0.9
63 0.92
64 0.93
65 0.93
66 0.94
67 0.92
68 0.89
69 0.83
70 0.74
71 0.68
72 0.58
73 0.49
74 0.45
75 0.44
76 0.37
77 0.34
78 0.33
79 0.29
80 0.32
81 0.31
82 0.26
83 0.2
84 0.27
85 0.27
86 0.28
87 0.27
88 0.32
89 0.38
90 0.41
91 0.41
92 0.4
93 0.39
94 0.38
95 0.38
96 0.31
97 0.26
98 0.28
99 0.33
100 0.28
101 0.3
102 0.31
103 0.31
104 0.36
105 0.36
106 0.38
107 0.34
108 0.33
109 0.33
110 0.32
111 0.34
112 0.35
113 0.33
114 0.28
115 0.31
116 0.32
117 0.28
118 0.28
119 0.28
120 0.22
121 0.21
122 0.21
123 0.15
124 0.14
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.17
134 0.21
135 0.21
136 0.2
137 0.21
138 0.23
139 0.27
140 0.31
141 0.28
142 0.3
143 0.32
144 0.34
145 0.37
146 0.33
147 0.28
148 0.26
149 0.24
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.21
154 0.22
155 0.25
156 0.27
157 0.34
158 0.35
159 0.36
160 0.38
161 0.36
162 0.36
163 0.36
164 0.33
165 0.26
166 0.26
167 0.24
168 0.2
169 0.19
170 0.18
171 0.14
172 0.13
173 0.13
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.16
178 0.18
179 0.18
180 0.18
181 0.19
182 0.2
183 0.2
184 0.24
185 0.21
186 0.22
187 0.22
188 0.22
189 0.21
190 0.26
191 0.26
192 0.18
193 0.16
194 0.13
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.11
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.09
219 0.13
220 0.17
221 0.24
222 0.29
223 0.37
224 0.45
225 0.45
226 0.44
227 0.41
228 0.43
229 0.38
230 0.37
231 0.3
232 0.21
233 0.2
234 0.17
235 0.16
236 0.1
237 0.1
238 0.06
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.13
246 0.14
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.1
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.16
268 0.13
269 0.1
270 0.08
271 0.11
272 0.12
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.11
282 0.1
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.16
287 0.14
288 0.15
289 0.15
290 0.17
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.14
295 0.19
296 0.18
297 0.17
298 0.18
299 0.15
300 0.16
301 0.15
302 0.15
303 0.11
304 0.1
305 0.11
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.03
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.13
347 0.14
348 0.16
349 0.21
350 0.31
351 0.33
352 0.4
353 0.42
354 0.43
355 0.46
356 0.46
357 0.48
358 0.46
359 0.45
360 0.42
361 0.42
362 0.38
363 0.34
364 0.34
365 0.28
366 0.23
367 0.25
368 0.24
369 0.26
370 0.27
371 0.33
372 0.38
373 0.43
374 0.49
375 0.52
376 0.54
377 0.5
378 0.49
379 0.48
380 0.45
381 0.46
382 0.43
383 0.37
384 0.4
385 0.42
386 0.41
387 0.4
388 0.37
389 0.31
390 0.28
391 0.33
392 0.27
393 0.26
394 0.32
395 0.3
396 0.28
397 0.28
398 0.25
399 0.21
400 0.2
401 0.19
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.12
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.09
418 0.12
419 0.16
420 0.26
421 0.27
422 0.34
423 0.44
424 0.52
425 0.57
426 0.63
427 0.7
428 0.69
429 0.79
430 0.81
431 0.82
432 0.83
433 0.82
434 0.8
435 0.76
436 0.76
437 0.67
438 0.64
439 0.57
440 0.53
441 0.52
442 0.5
443 0.45
444 0.38
445 0.38
446 0.32
447 0.34
448 0.31
449 0.26
450 0.24
451 0.28
452 0.28
453 0.3
454 0.31
455 0.29
456 0.29
457 0.37
458 0.42
459 0.45
460 0.44