FuNGI

A0A397W8Y3

Protein Details

Accession

A0A397W8Y3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
60-79	EDDTPKKPFKKLNRPIDSTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 6.5, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014839 Crt10 IPR000684 RNA_pol_II_repeat_euk IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08728 CRT10 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00115 RNA_POL_II_REPEAT PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MKEYHDLLVHTVYERHPISVEGCYPLRMNLTAVSNKFKDIFFVAIYDSIFAYRLNSYHDEDDTPKKPFKKLNRPIDSTSHDDEEQHIINAIKVGEIGYEEVLVSVDESGDIHVWYTSNLEKDPLHFKNDESTWSIALNGPRRLLAVSANSHEITIFNLQYGLQKLAKFSDSQDMSCKPKYSLRGHRHNIPNISFSSCGQFLVSCSIDKSCRIWNVNTGQTIVSQEVSSEWGWSVCFVSASNFKNANNTSRNFRTCKDVHDQSRSRVGRVYTGSESERDNELHSGMSTALRPAIRFLPLDTEYEDGYDESTEIRSLVYNDYGAIETIETEDEENDSNYSDAQITNNNNENISSDDSDHDHSSHTPIPDDMSDDEWSPSAETRDIYSNNLNVQNGDEISLSERTENGNTSTYSPRYPSPIVYVSHFPSTPIAQQILPEIYFSSNSPAYSPATPQYMLEPSSSTTSGLGPNPPHTPPTAYSPPQPTPSVNDIPTSQEHITTTFSSSPFNSEHIRSESPVYSPMSPEYSPINTNYAPESPHYDPMSPQYTPTSPSYNPTYARPRAQDFFEDVPDNSYGNEQFYRLFLNRKKIGMDRLEMHKTQKGRAPKISQDLVLFGTQHDLFLLDPKSGLSIMSSSLGVVCRNDPRRARHLDSNDRLNMVEWIPDLSLAIVASQKGKVALVRLLKGISVRGIEHYDLYDEKLIPQIPLPNAPLIGMFVVKNDNLQDPSLYFYNLYLIYADGSMYCYEIRRNEQTNDLRLDNIWI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.24
3	0.23
4	0.23
5	0.24
6	0.26
7	0.27
8	0.24
9	0.24
10	0.25
11	0.25
12	0.25
13	0.26
14	0.21
15	0.21
16	0.2
17	0.25
18	0.3
19	0.32
20	0.38
21	0.36
22	0.37
23	0.38
24	0.34
25	0.3
26	0.26
27	0.26
28	0.19
29	0.2
30	0.19
31	0.18
32	0.19
33	0.16
34	0.14
35	0.11
36	0.11
37	0.1
38	0.11
39	0.11
40	0.12
41	0.16
42	0.2
43	0.23
44	0.26
45	0.28
46	0.29
47	0.32
48	0.39
49	0.38
50	0.4
51	0.43
52	0.43
53	0.48
54	0.54
55	0.61
56	0.64
57	0.7
58	0.76
59	0.79
60	0.81
61	0.8
62	0.79
63	0.73
64	0.68
65	0.62
66	0.55
67	0.46
68	0.4
69	0.37
70	0.34
71	0.3
72	0.24
73	0.22
74	0.18
75	0.18
76	0.19
77	0.17
78	0.12
79	0.11
80	0.1
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.06
90	0.06
91	0.05
92	0.05
93	0.04
94	0.05
95	0.06
96	0.06
97	0.06
98	0.06
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.1
103	0.12
104	0.14
105	0.14
106	0.17
107	0.17
108	0.2
109	0.29
110	0.29
111	0.32
112	0.3
113	0.3
114	0.35
115	0.36
116	0.36
117	0.3
118	0.29
119	0.25
120	0.24
121	0.24
122	0.2
123	0.24
124	0.28
125	0.27
126	0.26
127	0.25
128	0.26
129	0.25
130	0.23
131	0.21
132	0.19
133	0.2
134	0.22
135	0.24
136	0.24
137	0.23
138	0.22
139	0.19
140	0.16
141	0.16
142	0.14
143	0.11
144	0.11
145	0.12
146	0.15
147	0.17
148	0.18
149	0.18
150	0.18
151	0.19
152	0.21
153	0.22
154	0.19
155	0.19
156	0.25
157	0.24
158	0.24
159	0.29
160	0.3
161	0.34
162	0.37
163	0.37
164	0.3
165	0.33
166	0.41
167	0.45
168	0.52
169	0.56
170	0.64
171	0.67
172	0.74
173	0.78
174	0.76
175	0.73
176	0.65
177	0.58
178	0.49
179	0.47
180	0.38
181	0.3
182	0.27
183	0.21
184	0.19
185	0.16
186	0.14
187	0.12
188	0.16
189	0.16
190	0.12
191	0.13
192	0.15
193	0.16
194	0.17
195	0.19
196	0.2
197	0.25
198	0.28
199	0.29
200	0.34
201	0.38
202	0.41
203	0.4
204	0.36
205	0.29
206	0.27
207	0.26
208	0.2
209	0.15
210	0.1
211	0.09
212	0.08
213	0.11
214	0.1
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.09
220	0.09
221	0.07
222	0.07
223	0.06
224	0.1
225	0.16
226	0.18
227	0.23
228	0.24
229	0.24
230	0.3
231	0.31
232	0.35
233	0.34
234	0.34
235	0.36
236	0.41
237	0.46
238	0.43
239	0.42
240	0.43
241	0.39
242	0.43
243	0.44
244	0.46
245	0.47
246	0.54
247	0.56
248	0.51
249	0.6
250	0.55
251	0.48
252	0.43
253	0.37
254	0.33
255	0.32
256	0.33
257	0.24
258	0.26
259	0.26
260	0.24
261	0.24
262	0.21
263	0.2
264	0.16
265	0.16
266	0.14
267	0.13
268	0.12
269	0.11
270	0.1
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.07
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.12
280	0.13
281	0.13
282	0.13
283	0.16
284	0.17
285	0.18
286	0.17
287	0.16
288	0.15
289	0.15
290	0.15
291	0.09
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.05
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.11
329	0.12
330	0.15
331	0.2
332	0.19
333	0.19
334	0.19
335	0.19
336	0.16
337	0.17
338	0.15
339	0.11
340	0.12
341	0.13
342	0.15
343	0.15
344	0.13
345	0.11
346	0.11
347	0.13
348	0.15
349	0.14
350	0.13
351	0.12
352	0.13
353	0.12
354	0.14
355	0.11
356	0.11
357	0.11
358	0.11
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.11
369	0.12
370	0.14
371	0.15
372	0.15
373	0.17
374	0.18
375	0.17
376	0.14
377	0.14
378	0.12
379	0.11
380	0.1
381	0.08
382	0.06
383	0.08
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.09
390	0.1
391	0.1
392	0.11
393	0.11
394	0.14
395	0.17
396	0.17
397	0.17
398	0.18
399	0.17
400	0.2
401	0.21
402	0.18
403	0.19
404	0.22
405	0.22
406	0.22
407	0.24
408	0.22
409	0.23
410	0.22
411	0.18
412	0.15
413	0.16
414	0.15
415	0.13
416	0.13
417	0.11
418	0.11
419	0.13
420	0.12
421	0.11
422	0.1
423	0.09
424	0.08
425	0.09
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.12
432	0.13
433	0.13
434	0.14
435	0.13
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.15
440	0.15
441	0.15
442	0.14
443	0.13
444	0.12
445	0.14
446	0.14
447	0.12
448	0.1
449	0.11
450	0.12
451	0.13
452	0.15
453	0.14
454	0.16
455	0.19
456	0.19
457	0.19
458	0.18
459	0.19
460	0.18
461	0.24
462	0.28
463	0.27
464	0.31
465	0.36
466	0.38
467	0.39
468	0.39
469	0.32
470	0.31
471	0.35
472	0.34
473	0.29
474	0.28
475	0.25
476	0.27
477	0.27
478	0.26
479	0.2
480	0.17
481	0.17
482	0.17
483	0.18
484	0.16
485	0.18
486	0.15
487	0.15
488	0.16
489	0.16
490	0.18
491	0.16
492	0.18
493	0.19
494	0.18
495	0.21
496	0.24
497	0.25
498	0.23
499	0.26
500	0.24
501	0.22
502	0.24
503	0.23
504	0.18
505	0.18
506	0.19
507	0.19
508	0.18
509	0.18
510	0.18
511	0.18
512	0.19
513	0.19
514	0.22
515	0.18
516	0.19
517	0.2
518	0.18
519	0.17
520	0.17
521	0.22
522	0.2
523	0.25
524	0.26
525	0.25
526	0.24
527	0.29
528	0.32
529	0.25
530	0.24
531	0.23
532	0.22
533	0.24
534	0.26
535	0.26
536	0.22
537	0.26
538	0.31
539	0.31
540	0.32
541	0.35
542	0.41
543	0.41
544	0.45
545	0.46
546	0.45
547	0.44
548	0.44
549	0.41
550	0.38
551	0.35
552	0.33
553	0.31
554	0.26
555	0.25
556	0.24
557	0.21
558	0.16
559	0.16
560	0.13
561	0.14
562	0.14
563	0.12
564	0.12
565	0.13
566	0.17
567	0.17
568	0.25
569	0.27
570	0.36
571	0.4
572	0.41
573	0.44
574	0.43
575	0.49
576	0.45
577	0.45
578	0.41
579	0.44
580	0.48
581	0.46
582	0.45
583	0.42
584	0.39
585	0.39
586	0.39
587	0.42
588	0.43
589	0.5
590	0.53
591	0.56
592	0.61
593	0.6
594	0.56
595	0.48
596	0.42
597	0.35
598	0.3
599	0.23
600	0.15
601	0.17
602	0.14
603	0.13
604	0.11
605	0.1
606	0.09
607	0.14
608	0.15
609	0.11
610	0.11
611	0.11
612	0.12
613	0.12
614	0.12
615	0.08
616	0.07
617	0.08
618	0.09
619	0.09
620	0.08
621	0.1
622	0.11
623	0.11
624	0.11
625	0.14
626	0.21
627	0.27
628	0.35
629	0.4
630	0.46
631	0.54
632	0.61
633	0.64
634	0.65
635	0.69
636	0.73
637	0.73
638	0.74
639	0.68
640	0.61
641	0.54
642	0.45
643	0.38
644	0.28
645	0.23
646	0.14
647	0.14
648	0.13
649	0.12
650	0.11
651	0.09
652	0.09
653	0.07
654	0.07
655	0.07
656	0.08
657	0.1
658	0.1
659	0.11
660	0.11
661	0.12
662	0.13
663	0.15
664	0.2
665	0.24
666	0.25
667	0.26
668	0.26
669	0.26
670	0.25
671	0.24
672	0.2
673	0.17
674	0.16
675	0.17
676	0.2
677	0.2
678	0.2
679	0.2
680	0.2
681	0.18
682	0.2
683	0.21
684	0.18
685	0.18
686	0.21
687	0.21
688	0.19
689	0.21
690	0.25
691	0.24
692	0.28
693	0.3
694	0.27
695	0.26
696	0.25
697	0.23
698	0.18
699	0.16
700	0.13
701	0.1
702	0.1
703	0.13
704	0.13
705	0.14
706	0.15
707	0.19
708	0.19
709	0.2
710	0.2
711	0.18
712	0.23
713	0.22
714	0.21
715	0.17
716	0.16
717	0.18
718	0.17
719	0.17
720	0.13
721	0.12
722	0.12
723	0.11
724	0.11
725	0.08
726	0.09
727	0.09
728	0.1
729	0.1
730	0.11
731	0.16
732	0.21
733	0.28
734	0.35
735	0.4
736	0.43
737	0.51
738	0.57
739	0.6
740	0.6
741	0.54
742	0.47

A0A397W8Y3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer